Protein–RNA interactions for Protein: Q12792

TWF1, Twinfilin-1, humanhuman

Predictions only

Length 350 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TWF1Q12792 MOB1B-201ENST00000309395 6963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.25□□□□□ -1.41
TWF1Q12792 FCGR1B-209ENST00000616817 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.25□□□□□ -1.41
TWF1Q12792 OR5AS1-202ENST00000641320 7860 ntAPPRIS P1 BASIC6.25□□□□□ -1.41
TWF1Q12792 SLC24A5-204ENST00000482911 2984 ntTSL 2 BASIC6.25□□□□□ -1.41
TWF1Q12792 IGIP-201ENST00000333305 3458 ntAPPRIS P1 BASIC6.25□□□□□ -1.41
TWF1Q12792 C1orf27-202ENST00000367470 3754 ntTSL 5 BASIC6.25□□□□□ -1.41
TWF1Q12792 AC087516.2-201ENST00000558963 3042 ntTSL 3 BASIC6.25□□□□□ -1.41
TWF1Q12792 AC016583.1-201ENST00000624221 2431 ntBASIC6.25□□□□□ -1.41
TWF1Q12792 TRIP12-204ENST00000389045 5355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.25□□□□□ -1.41
TWF1Q12792 LGI1-219ENST00000636155 1618 ntTSL 5 BASIC6.25□□□□□ -1.41
TWF1Q12792 SHQ1P1-201ENST00000437111 1544 ntBASIC6.25□□□□□ -1.41
TWF1Q12792 KIAA0586-203ENST00000423743 5339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.24□□□□□ -1.41
TWF1Q12792 STRBP-204ENST00000447404 6161 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.24□□□□□ -1.41
TWF1Q12792 SLC12A6-218ENST00000560611 4239 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC6.24□□□□□ -1.41
TWF1Q12792 NDUFS1-205ENST00000449699 2371 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.24□□□□□ -1.41
TWF1Q12792 C17orf78-203ENST00000611038 1675 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6.24□□□□□ -1.41
TWF1Q12792 ARHGAP29-201ENST00000260526 6087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.24□□□□□ -1.41
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TWF1Q12792 CCR6-201ENST00000341935 4018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.24□□□□□ -1.41
TWF1Q12792 AC004852.2-201ENST00000614289 2218 ntTSL 1 (best) BASIC6.24□□□□□ -1.41
TWF1Q12792 SSX3-201ENST00000298396 1232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.24□□□□□ -1.41
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TWF1Q12792 OSBPL10-AS1-202ENST00000418728 458 ntTSL 5 BASIC6.24□□□□□ -1.41
TWF1Q12792 AL513188.1-201ENST00000421167 614 ntTSL 3 BASIC6.24□□□□□ -1.41
TWF1Q12792 LINC01760-201ENST00000423410 382 ntTSL 2 BASIC6.24□□□□□ -1.41
TWF1Q12792 MOB4-207ENST00000448447 1021 ntTSL 2 BASIC6.24□□□□□ -1.41
TWF1Q12792 AC093166.4-201ENST00000457867 318 ntBASIC6.24□□□□□ -1.41
TWF1Q12792 AL136038.1-201ENST00000497246 351 ntBASIC6.24□□□□□ -1.41
TWF1Q12792 AC008592.4-201ENST00000509999 450 ntTSL 3 BASIC6.24□□□□□ -1.41
TWF1Q12792 LINC01598-206ENST00000513381 499 ntTSL 4 BASIC6.24□□□□□ -1.41
TWF1Q12792 AC018793.4-201ENST00000524542 585 ntAPPRIS P1 BASIC6.24□□□□□ -1.41
TWF1Q12792 HMGN2P36-201ENST00000529541 409 ntBASIC6.24□□□□□ -1.41
TWF1Q12792 KLRD1-209ENST00000543420 802 ntTSL 5 BASIC6.24□□□□□ -1.41
TWF1Q12792 AC027667.1-201ENST00000545814 304 ntBASIC6.24□□□□□ -1.41
TWF1Q12792 AC022404.1-201ENST00000555320 273 ntBASIC6.24□□□□□ -1.41
TWF1Q12792 AC091078.2-201ENST00000557145 559 ntBASIC6.24□□□□□ -1.41
TWF1Q12792 AC100821.2-201ENST00000565668 440 ntTSL 2 BASIC6.24□□□□□ -1.41
TWF1Q12792 AC007448.1-201ENST00000582714 234 ntBASIC6.24□□□□□ -1.41
TWF1Q12792 AP001885.1-201ENST00000621658 558 ntBASIC6.24□□□□□ -1.41
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TWF1Q12792 AC018793.2-201ENST00000639584 585 ntAPPRIS P1 BASIC6.24□□□□□ -1.41
TWF1Q12792 AC018793.3-201ENST00000640805 585 ntAPPRIS P1 BASIC6.24□□□□□ -1.41
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TWF1Q12792 ORC4-214ENST00000535373 6710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.24□□□□□ -1.41
TWF1Q12792 AP002004.1-201ENST00000532510 3530 ntTSL 1 (best) BASIC6.24□□□□□ -1.41
TWF1Q12792 LINC02141-201ENST00000568279 6586 ntTSL 1 (best) BASIC6.24□□□□□ -1.41
TWF1Q12792 AC022034.1-201ENST00000512867 2156 ntBASIC6.24□□□□□ -1.41
TWF1Q12792 LINC01920-201ENST00000441356 2528 ntTSL 1 (best) BASIC6.24□□□□□ -1.41
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TWF1Q12792 ZSCAN26-201ENST00000316606 2362 ntTSL 1 (best) BASIC6.23□□□□□ -1.41
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TWF1Q12792 PMCHL2-202ENST00000450213 1917 ntTSL 1 (best) BASIC6.23□□□□□ -1.41
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TWF1Q12792 ENTPD1-AS1-202ENST00000416301 4241 ntTSL 2 BASIC6.23□□□□□ -1.41
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TWF1Q12792 CHRDL1-202ENST00000372045 3860 ntTSL 1 (best) BASIC6.23□□□□□ -1.41
TWF1Q12792 TRRAP-204ENST00000446306 12492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.23□□□□□ -1.41
TWF1Q12792 FABP2-201ENST00000274024 2478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.23□□□□□ -1.41
TWF1Q12792 PLCZ1-201ENST00000266505 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.23□□□□□ -1.41
TWF1Q12792 USP9YP3-201ENST00000434481 1766 ntBASIC6.23□□□□□ -1.41
TWF1Q12792 TMED3-202ENST00000424155 16555 ntTSL 3 BASIC6.23□□□□□ -1.41
TWF1Q12792 CIR1P2-201ENST00000514821 1342 ntBASIC6.23□□□□□ -1.41
TWF1Q12792 TRAPPC2-203ENST00000380579 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.23□□□□□ -1.41
TWF1Q12792 ROR1-AS1-202ENST00000424995 2189 ntTSL 2 BASIC6.23□□□□□ -1.41
TWF1Q12792 AC130360.2-201ENST00000533477 1556 ntBASIC6.23□□□□□ -1.41
TWF1Q12792 ERC1-222ENST00000589028 9202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.23□□□□□ -1.41
TWF1Q12792 BPIFC-204ENST00000534972 1809 ntTSL 5 BASIC6.22□□□□□ -1.41
TWF1Q12792 SLC7A11-201ENST00000280612 9645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.22□□□□□ -1.41
TWF1Q12792 AC013268.3-201ENST00000262716 2324 ntBASIC6.22□□□□□ -1.41
TWF1Q12792 AC010099.4-201ENST00000424515 1453 ntTSL 5 BASIC6.22□□□□□ -1.41
TWF1Q12792 ETF1-203ENST00000503014 1736 ntTSL 2 BASIC6.22□□□□□ -1.41
TWF1Q12792 MARK2P4-201ENST00000503381 2380 ntBASIC6.22□□□□□ -1.41
TWF1Q12792 CDC5L-201ENST00000371477 6423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.22□□□□□ -1.41
TWF1Q12792 NFIA-204ENST00000371187 2683 ntTSL 1 (best) BASIC6.22□□□□□ -1.41
TWF1Q12792 AP003170.5-201ENST00000397185 335 ntBASIC6.22□□□□□ -1.41
TWF1Q12792 HMGB1P20-201ENST00000402555 677 ntBASIC6.22□□□□□ -1.41
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