Protein–RNA interactions for Protein: P10071

GLI3, Transcriptional activator GLI3, humanhuman

Predictions only

Length 1,580 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GLI3P10071 NPHP3-AS1-202ENST00000504440 2507 ntTSL 1 (best) BASIC7.57□□□□□ -1.2
GLI3P10071 ADAM21-201ENST00000603540 2658 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.57□□□□□ -1.2
GLI3P10071 IGFN1-202ENST00000335211 11810 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC7.57□□□□□ -1.2
GLI3P10071 STK32A-202ENST00000397936 5393 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.57□□□□□ -1.2
GLI3P10071 PREPL-201ENST00000260648 3672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.57□□□□□ -1.2
GLI3P10071 RGS4-203ENST00000367909 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.57□□□□□ -1.2
GLI3P10071 AMD1-203ENST00000368882 3059 ntTSL 2 BASIC7.57□□□□□ -1.2
GLI3P10071 LY6G5C-210ENST00000383237 674 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.57□□□□□ -1.2
GLI3P10071 C6orf48-208ENST00000395788 815 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.57□□□□□ -1.2
GLI3P10071 OR6D1P-201ENST00000436165 939 ntBASIC7.57□□□□□ -1.2
GLI3P10071 AC068189.1-201ENST00000501164 2632 ntTSL 2 BASIC7.57□□□□□ -1.2
GLI3P10071 AC093909.2-201ENST00000505178 437 ntTSL 3 BASIC7.57□□□□□ -1.2
GLI3P10071 RAB9BP1-201ENST00000519581 626 ntBASIC7.57□□□□□ -1.2
GLI3P10071 AP003028.1-203ENST00000525832 444 ntTSL 3 BASIC7.57□□□□□ -1.2
GLI3P10071 AL133406.3-201ENST00000606817 541 ntBASIC7.57□□□□□ -1.2
GLI3P10071 MOSPD2-201ENST00000380492 4163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.57□□□□□ -1.2
GLI3P10071 CD200R1-201ENST00000295863 1692 ntTSL 2 BASIC7.57□□□□□ -1.2
GLI3P10071 CLASP1-215ENST00000541377 7909 ntTSL 5 BASIC7.57□□□□□ -1.2
GLI3P10071 TSC1-203ENST00000440111 8463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.57□□□□□ -1.2
GLI3P10071 GABRR1-203ENST00000454853 2820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.57□□□□□ -1.2
GLI3P10071 UGT2A1-206ENST00000514019 2376 ntTSL 2 BASIC7.57□□□□□ -1.2
GLI3P10071 ITCH-201ENST00000262650 3089 ntTSL 1 (best) BASIC7.57□□□□□ -1.2
GLI3P10071 LRRC36-202ENST00000435835 1765 ntTSL 2 BASIC7.57□□□□□ -1.2
GLI3P10071 LIN7A-204ENST00000552864 6112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.56□□□□□ -1.2
GLI3P10071 NDST4-204ENST00000613194 3439 ntTSL 5 BASIC7.56□□□□□ -1.2
GLI3P10071 ST6GAL1-211ENST00000448044 4302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.56□□□□□ -1.2
GLI3P10071 ZNF549-204ENST00000602149 5505 ntTSL 1 (best) BASIC7.56□□□□□ -1.2
GLI3P10071 DEFB113-201ENST00000398718 249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.56□□□□□ -1.2
GLI3P10071 AL353626.3-201ENST00000413399 657 ntBASIC7.56□□□□□ -1.2
GLI3P10071 AC011742.2-201ENST00000443818 352 ntBASIC7.56□□□□□ -1.2
GLI3P10071 C10orf128-207ENST00000474718 614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.56□□□□□ -1.2
GLI3P10071 AC018709.1-201ENST00000509111 700 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.56□□□□□ -1.2
GLI3P10071 AC122710.1-201ENST00000510622 553 ntTSL 5 BASIC7.56□□□□□ -1.2
GLI3P10071 AC004890.3-201ENST00000605566 1095 ntBASIC7.56□□□□□ -1.2
GLI3P10071 AC073869.10-201ENST00000642016 354 ntBASIC7.56□□□□□ -1.2
GLI3P10071 RGPD2-203ENST00000638730 5306 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.56□□□□□ -1.2
GLI3P10071 CCR2-201ENST00000292301 2671 ntTSL 5 BASIC7.56□□□□□ -1.2
GLI3P10071 VWA3A-202ENST00000389398 4600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC7.56□□□□□ -1.2
GLI3P10071 FNIP1-202ENST00000307968 6388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.56□□□□□ -1.2
GLI3P10071 CACNB4-239ENST00000636947 5575 ntTSL 1 (best) BASIC7.56□□□□□ -1.2
GLI3P10071 FANCD2-205ENST00000431693 2450 ntTSL 1 (best) BASIC7.56□□□□□ -1.2
GLI3P10071 ZNF733P-202ENST00000444809 1573 ntBASIC7.56□□□□□ -1.2
GLI3P10071 LINC01504-201ENST00000436054 2078 ntTSL 2 BASIC7.56□□□□□ -1.2
GLI3P10071 PLEKHH2-201ENST00000282406 6981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.56□□□□□ -1.2
GLI3P10071 PAQR5-201ENST00000340965 4943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.56□□□□□ -1.2
GLI3P10071 ATF7IP2-204ENST00000396560 3665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.56□□□□□ -1.2
GLI3P10071 TNC-202ENST00000350763 7641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.55□□□□□ -1.2
GLI3P10071 SHC4-202ENST00000396535 2799 ntTSL 1 (best) BASIC7.55□□□□□ -1.2
GLI3P10071 SEC31A-226ENST00000508479 3397 ntTSL 2 BASIC7.55□□□□□ -1.2
GLI3P10071 NRCAM-204ENST00000379028 6685 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.55□□□□□ -1.2
GLI3P10071 OR2J2-202ENST00000377167 1272 ntAPPRIS P1 BASIC7.55□□□□□ -1.2
GLI3P10071 AL139008.2-201ENST00000420315 395 ntTSL 3 BASIC7.55□□□□□ -1.2
GLI3P10071 C4BPAP2-201ENST00000428434 478 ntBASIC7.55□□□□□ -1.2
GLI3P10071 AC016712.1-201ENST00000431088 378 ntBASIC7.55□□□□□ -1.2
GLI3P10071 AC020937.1-201ENST00000519677 1013 ntBASIC7.55□□□□□ -1.2
GLI3P10071 AC007494.1-201ENST00000562293 760 ntBASIC7.55□□□□□ -1.2
GLI3P10071 CLEC2D-203ENST00000290855 5279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.55□□□□□ -1.2
GLI3P10071 UBE4B-202ENST00000343090 5267 ntTSL 1 (best) BASIC7.55□□□□□ -1.2
GLI3P10071 FBXL17-203ENST00000496714 3773 ntTSL 1 (best) BASIC7.55□□□□□ -1.2
GLI3P10071 ADA2-210ENST00000610390 4137 ntTSL 5 BASIC7.55□□□□□ -1.2
GLI3P10071 OR4K13-203ENST00000641904 5684 ntAPPRIS P1 BASIC7.55□□□□□ -1.2
GLI3P10071 PGAP1-201ENST00000354764 11114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.55□□□□□ -1.2
GLI3P10071 NDUFS1-207ENST00000455934 3361 ntTSL 2 BASIC7.55□□□□□ -1.2
GLI3P10071 ZNF83-203ENST00000541777 3743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.55□□□□□ -1.2
GLI3P10071 KCNA2-214ENST00000640774 6673 ntTSL 5 BASIC7.55□□□□□ -1.2
GLI3P10071 UNC79-206ENST00000621021 7377 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC7.55□□□□□ -1.2
GLI3P10071 MIA3-201ENST00000340535 2735 ntTSL 1 (best) BASIC7.55□□□□□ -1.2
GLI3P10071 CLEC6A-201ENST00000382073 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.55□□□□□ -1.2
GLI3P10071 PKD1L1-201ENST00000289672 9092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.55□□□□□ -1.2
GLI3P10071 GOLGA6L6-201ENST00000619213 4013 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.55□□□□□ -1.2
GLI3P10071 PDE4DIP-205ENST00000369354 8262 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.54□□□□□ -1.2
GLI3P10071 LINC02532-206ENST00000433965 570 ntTSL 2 BASIC7.54□□□□□ -1.2
GLI3P10071 NDUFAF4P2-201ENST00000445374 520 ntBASIC7.54□□□□□ -1.2
GLI3P10071 AL162739.1-201ENST00000450606 307 ntBASIC7.54□□□□□ -1.2
GLI3P10071 LINC02218-201ENST00000503267 529 ntTSL 2 BASIC7.54□□□□□ -1.2
GLI3P10071 AC025366.1-201ENST00000523264 202 ntTSL 3 BASIC7.54□□□□□ -1.2
GLI3P10071 AC090109.1-201ENST00000548885 819 ntTSL 3 BASIC7.54□□□□□ -1.2
GLI3P10071 LINC02563-201ENST00000579474 277 ntTSL 3 BASIC7.54□□□□□ -1.2
GLI3P10071 MIR3934-201ENST00000579806 107 ntBASIC7.54□□□□□ -1.2
GLI3P10071 AC005757.1-201ENST00000591432 472 ntTSL 4 BASIC7.54□□□□□ -1.2
GLI3P10071 RDM1-215ENST00000612980 501 ntTSL 1 (best) BASIC7.54□□□□□ -1.2
GLI3P10071 WWOX-217ENST00000620008 450 ntTSL 2 BASIC7.54□□□□□ -1.2
GLI3P10071 AC087632.1-216ENST00000625619 487 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.54□□□□□ -1.2
GLI3P10071 MAPK10-350ENST00000641777 965 ntBASIC7.54□□□□□ -1.2
GLI3P10071 MAGT1-201ENST00000358075 4047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.54□□□□□ -1.2
GLI3P10071 LINC00861-201ENST00000500989 5330 ntTSL 1 (best) BASIC7.54□□□□□ -1.2
GLI3P10071 TSPAN6-204ENST00000612152 3796 ntTSL 5 BASIC7.54□□□□□ -1.2
GLI3P10071 ATM-215ENST00000530958 5718 ntTSL 2 BASIC7.54□□□□□ -1.2
GLI3P10071 FAM13C-219ENST00000621119 3400 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.54□□□□□ -1.2
GLI3P10071 OR2T5-201ENST00000641363 2525 ntAPPRIS P1 BASIC7.54□□□□□ -1.2
GLI3P10071 EPS15P1-202ENST00000459691 2071 ntBASIC7.54□□□□□ -1.2
GLI3P10071 AC093010.2-202ENST00000493033 3023 ntTSL 2 BASIC7.54□□□□□ -1.2
GLI3P10071 DNAH10-201ENST00000409039 14473 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.54□□□□□ -1.2
GLI3P10071 MAPK10-206ENST00000395161 4186 ntTSL 5 BASIC7.54□□□□□ -1.2
GLI3P10071 AK9-201ENST00000285397 2566 ntTSL 1 (best) BASIC7.54□□□□□ -1.2
GLI3P10071 ZNF484-202ENST00000375495 2867 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.54□□□□□ -1.2
GLI3P10071 CSMD1-206ENST00000520002 11740 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.54□□□□□ -1.2
GLI3P10071 CSMD1-216ENST00000602557 11740 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.54□□□□□ -1.2
GLI3P10071 ZNF37A-201ENST00000351773 7027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.54□□□□□ -1.2
GLI3P10071 RPGRIP1L-202ENST00000379925 5297 ntTSL 1 (best) BASIC7.54□□□□□ -1.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 91 ms