Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y5B0

CTDP1, RNA polymerase II subunit A C-terminal domain phosphatase, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 961 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTDP1Q9Y5B0 PAX1-205ENST00000613128 5352 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CTDP1Q9Y5B0 STK11-205ENST00000586243 2777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
CTDP1Q9Y5B0 UBE2N-201ENST00000318066 5186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CTDP1Q9Y5B0 SLC1A6-202ENST00000430939 1794 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
CTDP1Q9Y5B0 RYK-208ENST00000620660 2942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CTDP1Q9Y5B0 KCNQ5-203ENST00000355635 6623 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
CTDP1Q9Y5B0 IMPAD1-201ENST00000262644 7199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CTDP1Q9Y5B0 SLC25A15-201ENST00000338625 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CTDP1Q9Y5B0 LBX2-203ENST00000460508 1452 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CTDP1Q9Y5B0 DCAKD-208ENST00000614054 2054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
CTDP1Q9Y5B0 ACVR1B-201ENST00000257963 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CTDP1Q9Y5B0 STK25-204ENST00000405585 1643 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
CTDP1Q9Y5B0 ACOT2-205ENST00000622407 1604 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CTDP1Q9Y5B0 CLDND2-201ENST00000291715 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CTDP1Q9Y5B0 CAPN10-203ENST00000352879 862 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CTDP1Q9Y5B0 AC003005.1-201ENST00000601674 582 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
CTDP1Q9Y5B0 AC016737.2-201ENST00000609273 358 ntTSL 3 BASIC22.8■■□□□ 1.24
CTDP1Q9Y5B0 MAEA-208ENST00000505839 1444 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
CTDP1Q9Y5B0 TXNRD3-204ENST00000640433 1932 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CTDP1Q9Y5B0 SMG8-203ENST00000578922 2178 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
CTDP1Q9Y5B0 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CTDP1Q9Y5B0 NTMT1-209ENST00000611055 1562 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.8■■□□□ 1.24
CTDP1Q9Y5B0 AC009126.1-201ENST00000501338 2245 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
CTDP1Q9Y5B0 RIMKLB-202ENST00000357529 5830 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
CTDP1Q9Y5B0 SARDH-201ENST00000298628 1484 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CTDP1Q9Y5B0 KXD1-202ENST00000539106 1496 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
CTDP1Q9Y5B0 CSPG5-201ENST00000264723 4080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CTDP1Q9Y5B0 PHGDH-210ENST00000641115 1638 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
CTDP1Q9Y5B0 CCDC130-201ENST00000221554 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CTDP1Q9Y5B0 MFSD10-201ENST00000329687 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CTDP1Q9Y5B0 B4GALT1-202ENST00000535206 1535 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CTDP1Q9Y5B0 MEF2D-203ENST00000368240 1905 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CTDP1Q9Y5B0 MCAT-201ENST00000290429 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CTDP1Q9Y5B0 MPC2-201ENST00000271373 798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CTDP1Q9Y5B0 PMF1-BGLAP-202ENST00000368276 852 ntTSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
CTDP1Q9Y5B0 YBX1P10-201ENST00000444752 975 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
CTDP1Q9Y5B0 Z98884.1-201ENST00000451646 830 ntTSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
CTDP1Q9Y5B0 CHCHD10-202ENST00000484558 1171 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CTDP1Q9Y5B0 AC093752.1-201ENST00000511950 605 ntTSL 4 BASIC22.79■■□□□ 1.24
CTDP1Q9Y5B0 TESC-AS1-201ENST00000547006 1053 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
CTDP1Q9Y5B0 MAP4K4-204ENST00000350198 7316 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
CTDP1Q9Y5B0 RAB34-203ENST00000395243 1597 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CTDP1Q9Y5B0 TFP1-202ENST00000475455 1573 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
CTDP1Q9Y5B0 NOL3-204ENST00000564053 1592 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
CTDP1Q9Y5B0 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CTDP1Q9Y5B0 RASSF7-204ENST00000431809 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
CTDP1Q9Y5B0 CLN3-205ENST00000359984 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CTDP1Q9Y5B0 LINC02361-201ENST00000538731 1484 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
CTDP1Q9Y5B0 SLC9A6-202ENST00000370698 4631 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CTDP1Q9Y5B0 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CTDP1Q9Y5B0 FAM3A-203ENST00000369641 1359 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
CTDP1Q9Y5B0 GGPS1-206ENST00000488594 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CTDP1Q9Y5B0 RTP5-201ENST00000343216 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CTDP1Q9Y5B0 CCNO-201ENST00000282572 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CTDP1Q9Y5B0 HCRT-201ENST00000293330 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CTDP1Q9Y5B0 VSIG2-202ENST00000403470 1191 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
CTDP1Q9Y5B0 ACP1-205ENST00000407983 703 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CTDP1Q9Y5B0 TUBB8P6-201ENST00000436895 1288 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
CTDP1Q9Y5B0 AC016582.3-201ENST00000589653 561 ntTSL 4 BASIC22.78■■□□□ 1.24
CTDP1Q9Y5B0 CROCCP2-205ENST00000639481 1296 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CTDP1Q9Y5B0 GTF2IRD2B-208ENST00000619142 1932 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CTDP1Q9Y5B0 SMTNL2-202ENST00000389313 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CTDP1Q9Y5B0 TMEM206-205ENST00000535273 2119 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
CTDP1Q9Y5B0 TMEM129-206ENST00000536901 2172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
CTDP1Q9Y5B0 HSD11B1L-204ENST00000411793 1362 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CTDP1Q9Y5B0 TUBA1A-201ENST00000295766 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
CTDP1Q9Y5B0 DDX55-205ENST00000538744 1735 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
CTDP1Q9Y5B0 WBP2-213ENST00000590221 1745 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
CTDP1Q9Y5B0 KCNN4-201ENST00000262888 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CTDP1Q9Y5B0 KANSL1-218ENST00000638275 5352 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
CTDP1Q9Y5B0 LRCH4-211ENST00000619071 2098 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
CTDP1Q9Y5B0 CCDC88B-202ENST00000356786 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CTDP1Q9Y5B0 POU2F2-215ENST00000560398 1788 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
CTDP1Q9Y5B0 MBD3-201ENST00000156825 5518 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CTDP1Q9Y5B0 PLPP2-201ENST00000269812 1228 ntTSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
CTDP1Q9Y5B0 TMEM223-201ENST00000307366 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CTDP1Q9Y5B0 C1orf50-201ENST00000372525 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CTDP1Q9Y5B0 RBM17P1-201ENST00000453646 1190 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
CTDP1Q9Y5B0 AZIN1-AS1-215ENST00000522939 644 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
CTDP1Q9Y5B0 KDM2B-217ENST00000543852 1188 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
CTDP1Q9Y5B0 ZNF599-203ENST00000588760 948 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
CTDP1Q9Y5B0 REXO1L10P-201ENST00000615707 1290 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
CTDP1Q9Y5B0 RALY-203ENST00000375114 6430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CTDP1Q9Y5B0 SGTA-201ENST00000221566 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CTDP1Q9Y5B0 HEMK1-206ENST00000455834 1499 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
CTDP1Q9Y5B0 CREB3-201ENST00000353704 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CTDP1Q9Y5B0 TMEM163-201ENST00000281924 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CTDP1Q9Y5B0 DGAT2-201ENST00000228027 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CTDP1Q9Y5B0 EPHA10-202ENST00000373048 5425 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
CTDP1Q9Y5B0 ATPAF2-206ENST00000474627 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CTDP1Q9Y5B0 ME2-216ENST00000639850 2331 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
CTDP1Q9Y5B0 KLHDC10-201ENST00000335420 6437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CTDP1Q9Y5B0 AGMAT-201ENST00000375826 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CTDP1Q9Y5B0 KIF2A-202ENST00000401507 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CTDP1Q9Y5B0 RABL2B-206ENST00000395598 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CTDP1Q9Y5B0 GALNT16-204ENST00000553669 1629 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CTDP1Q9Y5B0 RANBP10-201ENST00000317506 5341 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CTDP1Q9Y5B0 RANBP10-209ENST00000630626 5305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
CTDP1Q9Y5B0 PHF12-202ENST00000332830 4759 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
CTDP1Q9Y5B0 DAB1-202ENST00000371230 1150 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.3 ms