Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y3T6

R3HCC1, R3H and coiled-coil domain-containing protein 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 440 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
R3HCC1Q9Y3T6 RAP1GAP-204ENST00000374761 3318 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
R3HCC1Q9Y3T6 TDRP-201ENST00000324079 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
R3HCC1Q9Y3T6 ZNF205-206ENST00000620094 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
R3HCC1Q9Y3T6 AL139099.2-201ENST00000555043 2469 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
R3HCC1Q9Y3T6 TMEM41B-205ENST00000533723 723 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
R3HCC1Q9Y3T6 LINC02091-201ENST00000576171 1185 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
R3HCC1Q9Y3T6 AC243732.1-201ENST00000612648 864 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
R3HCC1Q9Y3T6 FGF8-207ENST00000618991 856 ntTSL 3 BASIC22.45■■□□□ 1.18
R3HCC1Q9Y3T6 POU5F1-209ENST00000638788 369 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
R3HCC1Q9Y3T6 ARNTL-201ENST00000389707 2776 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
R3HCC1Q9Y3T6 PPCS-203ENST00000372561 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
R3HCC1Q9Y3T6 RBM17P2-201ENST00000616397 1405 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
R3HCC1Q9Y3T6 CARMIL2-201ENST00000334583 4687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
R3HCC1Q9Y3T6 ARL6IP4-220ENST00000543566 1591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
R3HCC1Q9Y3T6 TMEM204-201ENST00000253934 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
R3HCC1Q9Y3T6 CAMKK1-202ENST00000348335 3563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
R3HCC1Q9Y3T6 STIM2-202ENST00000465503 3613 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
R3HCC1Q9Y3T6 SAMD5-201ENST00000367474 6089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
R3HCC1Q9Y3T6 AKAP8L-201ENST00000397410 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
R3HCC1Q9Y3T6 SLC6A9-201ENST00000357730 2168 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
R3HCC1Q9Y3T6 LRWD1-201ENST00000292616 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
R3HCC1Q9Y3T6 NAP1L5-201ENST00000323061 2321 ntAPPRIS P1 BASIC22.45■■□□□ 1.18
R3HCC1Q9Y3T6 NOMO1-201ENST00000287667 4355 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
R3HCC1Q9Y3T6 ZNF12-204ENST00000405858 5051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
R3HCC1Q9Y3T6 TAF9-201ENST00000217893 1283 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
R3HCC1Q9Y3T6 GRIN3B-201ENST00000234389 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
R3HCC1Q9Y3T6 TBXA2R-202ENST00000411851 1494 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
R3HCC1Q9Y3T6 ZFP69B-202ENST00000411995 2109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
R3HCC1Q9Y3T6 ACHE-207ENST00000428317 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
R3HCC1Q9Y3T6 PTPRJ-202ENST00000440289 3158 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
R3HCC1Q9Y3T6 STAU2-229ENST00000524300 3065 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
R3HCC1Q9Y3T6 POLD3-203ENST00000527458 2122 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
R3HCC1Q9Y3T6 NDUFS3-207ENST00000529276 558 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
R3HCC1Q9Y3T6 BEAN1-202ENST00000536005 1988 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
R3HCC1Q9Y3T6 MAFF-207ENST00000538999 2365 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
R3HCC1Q9Y3T6 IL34-204ENST00000566361 1001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
R3HCC1Q9Y3T6 PTOV1-AS1-201ENST00000596521 2155 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
R3HCC1Q9Y3T6 PARD6A-203ENST00000602551 1171 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
R3HCC1Q9Y3T6 TMEM41B-207ENST00000611268 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
R3HCC1Q9Y3T6 CD99-212ENST00000624481 1089 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
R3HCC1Q9Y3T6 RELB-207ENST00000625761 2279 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
R3HCC1Q9Y3T6 PHF12-202ENST00000332830 4759 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
R3HCC1Q9Y3T6 PKN1-201ENST00000242783 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
R3HCC1Q9Y3T6 ZBTB46-203ENST00000395104 5198 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
R3HCC1Q9Y3T6 LRRC25-201ENST00000339007 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
R3HCC1Q9Y3T6 ENTPD8-201ENST00000344119 2111 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
R3HCC1Q9Y3T6 ZNF852-201ENST00000436261 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
R3HCC1Q9Y3T6 AC007128.1-201ENST00000424460 1853 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
R3HCC1Q9Y3T6 CXXC4-201ENST00000394767 5565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
R3HCC1Q9Y3T6 PKD2-201ENST00000237596 5056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
R3HCC1Q9Y3T6 MAPKAP1-205ENST00000373503 3045 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
R3HCC1Q9Y3T6 CFD-201ENST00000327726 1201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
R3HCC1Q9Y3T6 MOB2-201ENST00000329957 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
R3HCC1Q9Y3T6 ZNF451-202ENST00000370702 458 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
R3HCC1Q9Y3T6 PGPEP1L-201ENST00000378919 995 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
R3HCC1Q9Y3T6 CDCA4P2-201ENST00000441182 718 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
R3HCC1Q9Y3T6 AC006970.2-201ENST00000450065 779 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
R3HCC1Q9Y3T6 AC090192.1-201ENST00000517740 490 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
R3HCC1Q9Y3T6 MCCC1-215ENST00000629669 2316 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
R3HCC1Q9Y3T6 PNPO-201ENST00000225573 2256 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
R3HCC1Q9Y3T6 CPEB1-214ENST00000617522 2220 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
R3HCC1Q9Y3T6 AC005906.2-203ENST00000640962 2091 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
R3HCC1Q9Y3T6 RILPL2-201ENST00000280571 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
R3HCC1Q9Y3T6 ADAMTS9-202ENST00000459780 2871 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
R3HCC1Q9Y3T6 ZNF622-201ENST00000308683 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
R3HCC1Q9Y3T6 GGT2-201ENST00000401924 2366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
R3HCC1Q9Y3T6 STMN3-202ENST00000540534 2351 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
R3HCC1Q9Y3T6 FBLN7-202ENST00000331203 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
R3HCC1Q9Y3T6 KCTD12-201ENST00000377474 6225 ntAPPRIS P1 BASIC22.42■■□□□ 1.18
R3HCC1Q9Y3T6 C19orf73-201ENST00000408991 744 ntAPPRIS P1 BASIC22.42■■□□□ 1.18
R3HCC1Q9Y3T6 AC008694.1-202ENST00000636953 945 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
R3HCC1Q9Y3T6 FBXO24-201ENST00000241071 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
R3HCC1Q9Y3T6 GALNT14-202ENST00000349752 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
R3HCC1Q9Y3T6 CA7-201ENST00000338437 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
R3HCC1Q9Y3T6 IRAK3-203ENST00000545837 1579 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
R3HCC1Q9Y3T6 ANKRD9-201ENST00000286918 6727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
R3HCC1Q9Y3T6 FP700111.2-201ENST00000619190 1892 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
R3HCC1Q9Y3T6 GNB4-204ENST00000468623 1360 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
R3HCC1Q9Y3T6 C17orf62-204ENST00000437807 2242 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
R3HCC1Q9Y3T6 KANSL1-202ENST00000432791 5343 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
R3HCC1Q9Y3T6 WIPI2-203ENST00000401525 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
R3HCC1Q9Y3T6 BET1L-204ENST00000410108 637 ntTSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
R3HCC1Q9Y3T6 CDV3P1-201ENST00000471403 739 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
R3HCC1Q9Y3T6 AL591742.1-201ENST00000604433 565 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
R3HCC1Q9Y3T6 GGTLC3-201ENST00000619998 968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
R3HCC1Q9Y3T6 PARP1-210ENST00000629232 477 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
R3HCC1Q9Y3T6 KRT15-203ENST00000393976 2394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
R3HCC1Q9Y3T6 CPSF3-201ENST00000238112 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
R3HCC1Q9Y3T6 ADA-201ENST00000372874 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
R3HCC1Q9Y3T6 RBL2-201ENST00000262133 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
R3HCC1Q9Y3T6 IMPDH1-208ENST00000470772 1888 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
R3HCC1Q9Y3T6 DOK4-218ENST00000569548 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
R3HCC1Q9Y3T6 CIRBP-225ENST00000589710 1835 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
R3HCC1Q9Y3T6 MORF4L2-AS1-201ENST00000435306 2086 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
R3HCC1Q9Y3T6 S1PR5-204ENST00000617721 1698 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
R3HCC1Q9Y3T6 C4orf48-201ENST00000409248 433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
R3HCC1Q9Y3T6 AC007322.4-201ENST00000509611 723 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
R3HCC1Q9Y3T6 AC005181.1-201ENST00000604782 1256 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
R3HCC1Q9Y3T6 MAZ-216ENST00000616501 991 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
R3HCC1Q9Y3T6 GCGR-202ENST00000570996 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.7 ms