Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y3B1

PRELID3B, PRELI domain containing protein 3B, humanhuman

Predictions only

Length 194 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRELID3BQ9Y3B1 FAM219A-205ENST00000379084 893 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
PRELID3BQ9Y3B1 KRTAP5-2-201ENST00000412090 1118 ntAPPRIS P1 BASIC16.54■□□□□ 0.24
PRELID3BQ9Y3B1 AC091799.1-201ENST00000422823 811 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
PRELID3BQ9Y3B1 RASGEF1B-208ENST00000510780 539 ntTSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
PRELID3BQ9Y3B1 RASGEF1B-209ENST00000512343 498 ntTSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
PRELID3BQ9Y3B1 CD44-222ENST00000526025 1052 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
PRELID3BQ9Y3B1 ABCC6P2-202ENST00000542005 706 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
PRELID3BQ9Y3B1 ABCC6-204ENST00000575728 714 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
PRELID3BQ9Y3B1 ANKRD6-202ENST00000369408 5258 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
PRELID3BQ9Y3B1 PAQR4-203ENST00000572687 2251 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
PRELID3BQ9Y3B1 AEBP1-206ENST00000450684 2571 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
PRELID3BQ9Y3B1 FAM198A-202ENST00000430121 3121 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
PRELID3BQ9Y3B1 NEURL3-204ENST00000451794 1461 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
PRELID3BQ9Y3B1 RBM45-201ENST00000286070 1785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
PRELID3BQ9Y3B1 LRRC4B-202ENST00000599957 3019 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
PRELID3BQ9Y3B1 SMARCB1-202ENST00000344921 1728 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
PRELID3BQ9Y3B1 UBR3-203ENST00000418381 7951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
PRELID3BQ9Y3B1 MME-202ENST00000382989 1319 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
PRELID3BQ9Y3B1 ARL6IP4-204ENST00000392435 1339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
PRELID3BQ9Y3B1 UMOD-201ENST00000302509 2477 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
PRELID3BQ9Y3B1 FLT1-201ENST00000282397 7092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
PRELID3BQ9Y3B1 TCTEX1D4-201ENST00000339355 763 ntAPPRIS P1 BASIC16.53■□□□□ 0.24
PRELID3BQ9Y3B1 TMEM54-202ENST00000373463 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
PRELID3BQ9Y3B1 ZNF292-204ENST00000392985 1096 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
PRELID3BQ9Y3B1 PGM5P4-201ENST00000421970 445 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
PRELID3BQ9Y3B1 AC097381.1-201ENST00000429019 1296 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
PRELID3BQ9Y3B1 SEC23A-213ENST00000557280 561 ntTSL 4 BASIC16.53■□□□□ 0.24
PRELID3BQ9Y3B1 GALNS-213ENST00000569433 723 ntTSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
PRELID3BQ9Y3B1 GPX1-204ENST00000620890 897 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
PRELID3BQ9Y3B1 MFSD1-219ENST00000622669 2361 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
PRELID3BQ9Y3B1 PKMYT1-204ENST00000440027 2061 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
PRELID3BQ9Y3B1 IL17RC-201ENST00000295981 2621 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
PRELID3BQ9Y3B1 PDE9A-212ENST00000398234 1783 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
PRELID3BQ9Y3B1 ZNF302-201ENST00000423823 2590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
PRELID3BQ9Y3B1 ACBD4-204ENST00000431281 2026 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
PRELID3BQ9Y3B1 GAS2L1P2-202ENST00000442849 2262 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
PRELID3BQ9Y3B1 RNF114-201ENST00000244061 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
PRELID3BQ9Y3B1 NOMO1-201ENST00000287667 4355 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
PRELID3BQ9Y3B1 PCDHB12-203ENST00000624949 1963 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
PRELID3BQ9Y3B1 AGAP2-201ENST00000257897 5388 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
PRELID3BQ9Y3B1 EPN3-216ENST00000537145 2223 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
PRELID3BQ9Y3B1 TYRO3-201ENST00000263798 8207 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
PRELID3BQ9Y3B1 THOP1-201ENST00000307741 4804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
PRELID3BQ9Y3B1 ALG1-202ENST00000544428 1419 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
PRELID3BQ9Y3B1 VRK2-207ENST00000440705 1676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
PRELID3BQ9Y3B1 TMEM51-201ENST00000376008 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
PRELID3BQ9Y3B1 CDKN1B-201ENST00000228872 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
PRELID3BQ9Y3B1 LMAN1L-201ENST00000309664 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
PRELID3BQ9Y3B1 SYNM-202ENST00000336292 7394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
PRELID3BQ9Y3B1 ACAP3-202ENST00000354700 3896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
PRELID3BQ9Y3B1 HNF4A-205ENST00000443598 1603 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
PRELID3BQ9Y3B1 ESR1-210ENST00000456483 1368 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
PRELID3BQ9Y3B1 FAM167A-207ENST00000534308 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
PRELID3BQ9Y3B1 TFCP2-204ENST00000548115 1862 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
PRELID3BQ9Y3B1 TMC6-203ENST00000392467 2833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
PRELID3BQ9Y3B1 CDH6-205ENST00000514738 2569 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
PRELID3BQ9Y3B1 TMPRSS5-208ENST00000544476 1320 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
PRELID3BQ9Y3B1 RNF224-201ENST00000445101 1798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
PRELID3BQ9Y3B1 PMEPA1-202ENST00000341744 4845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
PRELID3BQ9Y3B1 GMPPA-201ENST00000313597 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
PRELID3BQ9Y3B1 GPR135-201ENST00000395116 4578 ntAPPRIS P1 BASIC16.52■□□□□ 0.24
PRELID3BQ9Y3B1 AL390879.2-201ENST00000424306 2222 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
PRELID3BQ9Y3B1 ZNF852-201ENST00000436261 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
PRELID3BQ9Y3B1 TMEM61-201ENST00000371268 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
PRELID3BQ9Y3B1 LBX2-202ENST00000377566 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
PRELID3BQ9Y3B1 SAPCD2P1-201ENST00000395413 1184 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
PRELID3BQ9Y3B1 EXD3-208ENST00000479452 962 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
PRELID3BQ9Y3B1 FEZ1-205ENST00000524435 750 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
PRELID3BQ9Y3B1 RPS15-210ENST00000592623 873 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
PRELID3BQ9Y3B1 F2RL3-202ENST00000599210 613 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
PRELID3BQ9Y3B1 IL11RA-201ENST00000318041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
PRELID3BQ9Y3B1 ADORA2A-201ENST00000337539 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
PRELID3BQ9Y3B1 SASH1-201ENST00000367467 7711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
PRELID3BQ9Y3B1 ARHGEF28-203ENST00000426542 6118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
PRELID3BQ9Y3B1 AIFM3-203ENST00000405089 2333 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.23
PRELID3BQ9Y3B1 PRKRIP1-208ENST00000496391 3430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.23
PRELID3BQ9Y3B1 THOP1-202ENST00000395212 1877 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.23
PRELID3BQ9Y3B1 NFATC4-218ENST00000554966 2506 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
PRELID3BQ9Y3B1 NFATC4-225ENST00000556169 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
PRELID3BQ9Y3B1 USP45-202ENST00000329966 1444 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
PRELID3BQ9Y3B1 MEF2B-203ENST00000410050 1429 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
PRELID3BQ9Y3B1 DCAF8-211ENST00000475733 1426 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
PRELID3BQ9Y3B1 LPAR2-203ENST00000586703 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
PRELID3BQ9Y3B1 C7orf43-206ENST00000456769 2046 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.23
PRELID3BQ9Y3B1 PLBD1-201ENST00000240617 2426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
PRELID3BQ9Y3B1 AC112907.3-201ENST00000577781 2400 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
PRELID3BQ9Y3B1 ARL5A-201ENST00000295087 5326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
PRELID3BQ9Y3B1 SNX27-203ENST00000368843 7197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
PRELID3BQ9Y3B1 WIPF1-203ENST00000392546 2180 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
PRELID3BQ9Y3B1 ACY1-207ENST00000476854 1319 ntTSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
PRELID3BQ9Y3B1 AC019069.1-201ENST00000610008 1333 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
PRELID3BQ9Y3B1 DDAH1-205ENST00000539042 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
PRELID3BQ9Y3B1 P2RY11-201ENST00000321826 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
PRELID3BQ9Y3B1 ZBTB7B-201ENST00000292176 2129 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
PRELID3BQ9Y3B1 EGLN2-201ENST00000303961 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
PRELID3BQ9Y3B1 ZCCHC24-202ENST00000372336 4933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
PRELID3BQ9Y3B1 AIRE-201ENST00000291582 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
PRELID3BQ9Y3B1 HENMT1-203ENST00000402983 1696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
PRELID3BQ9Y3B1 INTS11-205ENST00000429572 1104 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
PRELID3BQ9Y3B1 NEBL-AS1-202ENST00000439097 661 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.2 ms