Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y2D1

ATF5, Cyclic AMP-dependent transcription factor ATF-5, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 282 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATF5Q9Y2D1 INSL3-201ENST00000317306 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
ATF5Q9Y2D1 SYCE1L-201ENST00000378644 858 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
ATF5Q9Y2D1 ST6GALNAC4P1-201ENST00000435385 499 ntBASIC24.88■■□□□ 1.57
ATF5Q9Y2D1 CMPK1-205ENST00000471289 816 ntTSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
ATF5Q9Y2D1 CNP-204ENST00000472031 1019 ntTSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
ATF5Q9Y2D1 CMTM3-210ENST00000565666 769 ntTSL 3 BASIC24.88■■□□□ 1.57
ATF5Q9Y2D1 LAT-211ENST00000566177 786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
ATF5Q9Y2D1 ZNF667-AS1-208ENST00000594783 475 ntTSL 3 BASIC24.88■■□□□ 1.57
ATF5Q9Y2D1 GPSM1-204ENST00000429455 2057 ntTSL 3 BASIC24.88■■□□□ 1.57
ATF5Q9Y2D1 BICDL2-201ENST00000389347 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
ATF5Q9Y2D1 HLA-G-205ENST00000428701 1578 ntAPPRIS P2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
ATF5Q9Y2D1 CELF2-211ENST00000632065 1952 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
ATF5Q9Y2D1 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
ATF5Q9Y2D1 AC012414.5-201ENST00000564214 1602 ntTSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
ATF5Q9Y2D1 GNGT2-201ENST00000300406 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
ATF5Q9Y2D1 AL445685.1-201ENST00000425802 762 ntTSL 3 BASIC24.87■■□□□ 1.57
ATF5Q9Y2D1 MRPL46-202ENST00000558531 1002 ntTSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
ATF5Q9Y2D1 RPL28-210ENST00000560583 1204 ntTSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
ATF5Q9Y2D1 PDE10A-205ENST00000616273 2118 ntTSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
ATF5Q9Y2D1 EEFSEC-201ENST00000254730 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
ATF5Q9Y2D1 ANKRD19P-205ENST00000473204 2370 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
ATF5Q9Y2D1 ZNF467-201ENST00000302017 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
ATF5Q9Y2D1 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
ATF5Q9Y2D1 ASNS-206ENST00000437628 1638 ntTSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
ATF5Q9Y2D1 ATF5-202ENST00000595125 1637 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
ATF5Q9Y2D1 GPC1-202ENST00000420138 1835 ntTSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
ATF5Q9Y2D1 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
ATF5Q9Y2D1 GMDS-202ENST00000380815 1752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
ATF5Q9Y2D1 NAPRT-202ENST00000426292 1654 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
ATF5Q9Y2D1 CFL1-201ENST00000308162 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
ATF5Q9Y2D1 CR769775.1-204ENST00000439760 747 ntTSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
ATF5Q9Y2D1 DEF8-228ENST00000610455 816 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
ATF5Q9Y2D1 MIR2861-201ENST00000636310 90 ntBASIC24.86■■□□□ 1.57
ATF5Q9Y2D1 RNF187-203ENST00000639044 708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
ATF5Q9Y2D1 DMRT2-209ENST00000635183 2190 ntTSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
ATF5Q9Y2D1 AC011484.1-201ENST00000377652 1995 ntBASIC24.85■■□□□ 1.57
ATF5Q9Y2D1 RFXAP-201ENST00000255476 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
ATF5Q9Y2D1 EFCC1-201ENST00000436022 2691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
ATF5Q9Y2D1 GPAA1-202ENST00000361036 1840 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
ATF5Q9Y2D1 C1orf50-201ENST00000372525 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
ATF5Q9Y2D1 MPIG6B-205ENST00000375810 910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
ATF5Q9Y2D1 ZFAND2B-207ENST00000409412 569 ntTSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
ATF5Q9Y2D1 EMBP1-201ENST00000458200 901 ntBASIC24.85■■□□□ 1.57
ATF5Q9Y2D1 DIO1-206ENST00000525202 558 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
ATF5Q9Y2D1 AL512357.1-201ENST00000557687 518 ntTSL 4 BASIC24.85■■□□□ 1.57
ATF5Q9Y2D1 AC092068.1-201ENST00000592525 454 ntTSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
ATF5Q9Y2D1 CENPS-CORT-205ENST00000602787 571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.85■■□□□ 1.57
ATF5Q9Y2D1 ME2-206ENST00000638410 2289 ntTSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
ATF5Q9Y2D1 ME2-210ENST00000639255 2262 ntTSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
ATF5Q9Y2D1 ANKRD44-204ENST00000409919 1622 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
ATF5Q9Y2D1 ZNF582-202ENST00000586929 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
ATF5Q9Y2D1 PNKP-224ENST00000631020 1545 ntTSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
ATF5Q9Y2D1 ABHD6-201ENST00000295962 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
ATF5Q9Y2D1 TPRN-202ENST00000409012 2718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
ATF5Q9Y2D1 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
ATF5Q9Y2D1 NRN1-203ENST00000616243 1556 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.84■■□□□ 1.57
ATF5Q9Y2D1 ASRGL1-201ENST00000301776 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
ATF5Q9Y2D1 C7orf26-201ENST00000344417 2182 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
ATF5Q9Y2D1 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
ATF5Q9Y2D1 DBX1-201ENST00000524983 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
ATF5Q9Y2D1 PAX1-202ENST00000444366 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
ATF5Q9Y2D1 FCN3-201ENST00000270879 1030 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
ATF5Q9Y2D1 FAM187B-201ENST00000324675 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
ATF5Q9Y2D1 FCN3-202ENST00000354982 997 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
ATF5Q9Y2D1 Telomerase-vert.1-201ENST00000363312 438 ntBASIC24.84■■□□□ 1.57
ATF5Q9Y2D1 C21orf91-202ENST00000400558 1090 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
ATF5Q9Y2D1 TUBB8P6-201ENST00000436895 1288 ntBASIC24.84■■□□□ 1.57
ATF5Q9Y2D1 LINC01024-205ENST00000521563 939 ntTSL 3 BASIC24.84■■□□□ 1.57
ATF5Q9Y2D1 PALM-207ENST00000590161 2137 ntTSL 4 BASIC24.84■■□□□ 1.57
ATF5Q9Y2D1 AP000547.2-201ENST00000609641 661 ntTSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
ATF5Q9Y2D1 AL031008.1-201ENST00000619963 541 ntBASIC24.84■■□□□ 1.57
ATF5Q9Y2D1 ALKBH6-213ENST00000486389 1525 ntTSL 3 BASIC24.84■■□□□ 1.57
ATF5Q9Y2D1 PPM1D-204ENST00000629650 1525 ntTSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
ATF5Q9Y2D1 GPRC5C-204ENST00000392629 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
ATF5Q9Y2D1 COLCA2-201ENST00000398035 1414 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
ATF5Q9Y2D1 KRT8P20-201ENST00000423953 1409 ntBASIC24.84■■□□□ 1.57
ATF5Q9Y2D1 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
ATF5Q9Y2D1 LINGO3-201ENST00000585527 2241 ntAPPRIS P1 BASIC24.84■■□□□ 1.57
ATF5Q9Y2D1 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
ATF5Q9Y2D1 POLR1D-203ENST00000399697 2036 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
ATF5Q9Y2D1 TMEM51-201ENST00000376008 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
ATF5Q9Y2D1 EXOSC3-202ENST00000396521 768 ntTSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
ATF5Q9Y2D1 LINC02247-201ENST00000417135 743 ntTSL 3 BASIC24.83■■□□□ 1.57
ATF5Q9Y2D1 AC010655.4-201ENST00000462662 707 ntTSL 4 BASIC24.83■■□□□ 1.57
ATF5Q9Y2D1 AC090142.2-201ENST00000483263 416 ntBASIC24.83■■□□□ 1.57
ATF5Q9Y2D1 AC104532.1-201ENST00000588891 580 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.83■■□□□ 1.57
ATF5Q9Y2D1 PPP1R7-207ENST00000407025 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
ATF5Q9Y2D1 SLC52A2-211ENST00000532887 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
ATF5Q9Y2D1 C19orf68-201ENST00000328759 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
ATF5Q9Y2D1 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
ATF5Q9Y2D1 RN7SL832P-201ENST00000607781 1756 ntBASIC24.82■■□□□ 1.56
ATF5Q9Y2D1 ANKHD1-221ENST00000616482 2064 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
ATF5Q9Y2D1 NRG2-201ENST00000289409 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
ATF5Q9Y2D1 STAC-204ENST00000457375 1366 ntTSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
ATF5Q9Y2D1 PCDHB12-203ENST00000624949 1963 ntTSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
ATF5Q9Y2D1 CD70-201ENST00000245903 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
ATF5Q9Y2D1 MTX1-201ENST00000316721 1441 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
ATF5Q9Y2D1 LCE1F-201ENST00000334371 357 ntAPPRIS P1 BASIC24.82■■□□□ 1.56
ATF5Q9Y2D1 PPIH-202ENST00000372549 327 ntTSL 3 BASIC24.82■■□□□ 1.56
ATF5Q9Y2D1 CHCHD1-201ENST00000372833 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.2 ms