Protein–RNA interactions for Protein: Q9UN75

PCDHA12, Protocadherin alpha-12, humanhuman

Predictions only

Length 941 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCDHA12Q9UN75 JPT2-204ENST00000561516 1065 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
PCDHA12Q9UN75 FXYD1-204ENST00000588081 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
PCDHA12Q9UN75 CD24-208ENST00000622315 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
PCDHA12Q9UN75 AL023875.1-201ENST00000640777 796 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
PCDHA12Q9UN75 PSMD8-201ENST00000215071 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
PCDHA12Q9UN75 DTWD1-202ENST00000403028 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
PCDHA12Q9UN75 ACOT2-204ENST00000613168 1553 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
PCDHA12Q9UN75 NFE2L1-204ENST00000536222 2172 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
PCDHA12Q9UN75 SLC36A1-209ENST00000521925 1621 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
PCDHA12Q9UN75 STK16-201ENST00000396738 1673 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
PCDHA12Q9UN75 SYT5-202ENST00000537500 2612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
PCDHA12Q9UN75 RNH1-203ENST00000397604 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
PCDHA12Q9UN75 SMARCD2-203ENST00000448276 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
PCDHA12Q9UN75 PGAM5-203ENST00000498926 2834 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
PCDHA12Q9UN75 ALKBH6-213ENST00000486389 1525 ntTSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
PCDHA12Q9UN75 AP006587.1-201ENST00000534129 1502 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
PCDHA12Q9UN75 IRGQ-205ENST00000602269 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
PCDHA12Q9UN75 GLB1-201ENST00000307363 2616 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
PCDHA12Q9UN75 KRT16P3-203ENST00000580621 1939 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
PCDHA12Q9UN75 DMPK-203ENST00000354227 1982 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
PCDHA12Q9UN75 PRORSD1P-201ENST00000295112 541 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
PCDHA12Q9UN75 AC068831.2-201ENST00000448987 367 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
PCDHA12Q9UN75 CLN6-206ENST00000565471 1075 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
PCDHA12Q9UN75 PRORSD1P-203ENST00000579162 626 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
PCDHA12Q9UN75 Six3os1_6.1-201ENST00000620790 196 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
PCDHA12Q9UN75 LHX3-202ENST00000371748 2365 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
PCDHA12Q9UN75 MAST2-201ENST00000361297 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
PCDHA12Q9UN75 SSBP2-218ENST00000514493 1790 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
PCDHA12Q9UN75 C19orf25-206ENST00000588849 1472 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
PCDHA12Q9UN75 UAP1-201ENST00000271469 2377 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
PCDHA12Q9UN75 ALDOA-221ENST00000566897 2448 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
PCDHA12Q9UN75 RBM14-RBM4-201ENST00000412278 1566 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
PCDHA12Q9UN75 KLC1-219ENST00000555836 2467 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
PCDHA12Q9UN75 LACTB-202ENST00000413507 2978 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
PCDHA12Q9UN75 MSLN-205ENST00000563941 2109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
PCDHA12Q9UN75 DPH1-201ENST00000263083 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
PCDHA12Q9UN75 COX7A2L-201ENST00000234301 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
PCDHA12Q9UN75 LINC00894-209ENST00000458274 547 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
PCDHA12Q9UN75 HOXB-AS3-204ENST00000466037 522 ntTSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
PCDHA12Q9UN75 AC035140.1-201ENST00000507957 493 ntTSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
PCDHA12Q9UN75 LY6E-205ENST00000519611 635 ntTSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
PCDHA12Q9UN75 BAALC-AS1-206ENST00000521383 736 ntTSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
PCDHA12Q9UN75 LY6E-212ENST00000522024 868 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
PCDHA12Q9UN75 AC016065.1-203ENST00000523225 1017 ntTSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
PCDHA12Q9UN75 SBK1-201ENST00000341901 4992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
PCDHA12Q9UN75 MRPL4-202ENST00000307422 1320 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
PCDHA12Q9UN75 ETFA-202ENST00000433983 1346 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
PCDHA12Q9UN75 DHRS4-204ENST00000543741 1340 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
PCDHA12Q9UN75 PATZ1-201ENST00000215919 2516 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
PCDHA12Q9UN75 RABEPK-204ENST00000394125 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
PCDHA12Q9UN75 SLC25A22-228ENST00000628067 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
PCDHA12Q9UN75 KANK4-202ENST00000354381 2103 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
PCDHA12Q9UN75 SHB-201ENST00000377707 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
PCDHA12Q9UN75 P2RY6-210ENST00000542092 1674 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.15
PCDHA12Q9UN75 PDZRN3-202ENST00000308537 1136 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
PCDHA12Q9UN75 VMO1-201ENST00000328739 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
PCDHA12Q9UN75 PRSS57-201ENST00000329267 1025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
PCDHA12Q9UN75 ISG20-202ENST00000379224 540 ntTSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
PCDHA12Q9UN75 ZNF436-AS1-202ENST00000437367 606 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
PCDHA12Q9UN75 RNF135-204ENST00000443677 1261 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
PCDHA12Q9UN75 MAGI2-AS3-211ENST00000451809 707 ntTSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
PCDHA12Q9UN75 C1QBPP2-201ENST00000528754 825 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
PCDHA12Q9UN75 B3GAT3-205ENST00000534026 1120 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
PCDHA12Q9UN75 PRSS57-202ENST00000613411 1090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
PCDHA12Q9UN75 TMEM191A-211ENST00000637163 1067 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
PCDHA12Q9UN75 KRT18-202ENST00000388837 1420 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
PCDHA12Q9UN75 PGAP1-204ENST00000409475 2443 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
PCDHA12Q9UN75 AGER-207ENST00000375076 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
PCDHA12Q9UN75 SLC25A15-201ENST00000338625 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
PCDHA12Q9UN75 ATP6V0B-213ENST00000532642 1685 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
PCDHA12Q9UN75 FAM57B-204ENST00000564806 1710 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
PCDHA12Q9UN75 PBX1-222ENST00000627490 1769 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
PCDHA12Q9UN75 KLHDC4-201ENST00000270583 1886 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
PCDHA12Q9UN75 PFKFB3-217ENST00000626882 1965 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
PCDHA12Q9UN75 APTR-204ENST00000440088 2029 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
PCDHA12Q9UN75 FBXO27-201ENST00000292853 2330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
PCDHA12Q9UN75 EYA2-202ENST00000327619 2702 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
PCDHA12Q9UN75 PITPNB-205ENST00000455418 2963 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
PCDHA12Q9UN75 CAPN10-202ENST00000270364 1267 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
PCDHA12Q9UN75 FMR1-202ENST00000334557 1295 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
PCDHA12Q9UN75 F8A2-201ENST00000369505 1116 ntAPPRIS P1 BASIC22.19■■□□□ 1.14
PCDHA12Q9UN75 HOTAIRM1-203ENST00000429611 722 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
PCDHA12Q9UN75 F2R-202ENST00000505600 442 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
PCDHA12Q9UN75 CDH18-AS1-201ENST00000513573 424 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
PCDHA12Q9UN75 LINC01301-204ENST00000530725 577 ntTSL 4 BASIC22.19■■□□□ 1.14
PCDHA12Q9UN75 OPA3-203ENST00000544371 1146 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
PCDHA12Q9UN75 FBXO17-202ENST00000595329 1299 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
PCDHA12Q9UN75 TRIM73-202ENST00000430211 1321 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
PCDHA12Q9UN75 MTX1-201ENST00000316721 1441 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
PCDHA12Q9UN75 CCAR2-214ENST00000613179 1421 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
PCDHA12Q9UN75 KRT87P-201ENST00000529785 1700 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
PCDHA12Q9UN75 RAB34-204ENST00000395245 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
PCDHA12Q9UN75 TH-206ENST00000381178 1910 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
PCDHA12Q9UN75 WIPF2-202ENST00000394103 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
PCDHA12Q9UN75 SSH1-209ENST00000551165 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
PCDHA12Q9UN75 NARS2-201ENST00000281038 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
PCDHA12Q9UN75 ACTR5-201ENST00000243903 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
PCDHA12Q9UN75 MARK3-206ENST00000440884 2643 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
PCDHA12Q9UN75 MARK2-204ENST00000402010 4728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
PCDHA12Q9UN75 AFG3L1P-217ENST00000557444 2447 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.1 ms