Protein–RNA interactions for Protein: Q9UMY4

SNX12, Sorting nexin-12, humanhuman

Predictions only

Length 172 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNX12Q9UMY4 KRT24-201ENST00000264651 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
SNX12Q9UMY4 RCAN3-205ENST00000436717 2574 ntTSL 3 BASIC20.75■□□□□ 0.91
SNX12Q9UMY4 PDP1-208ENST00000520728 2554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
SNX12Q9UMY4 NUDT10-202ENST00000376006 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
SNX12Q9UMY4 ZNF771-202ENST00000434417 1454 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.75■□□□□ 0.91
SNX12Q9UMY4 PHGDH-210ENST00000641115 1638 ntBASIC20.75■□□□□ 0.91
SNX12Q9UMY4 GDF10-201ENST00000580279 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
SNX12Q9UMY4 KDF1-201ENST00000320567 1793 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.74■□□□□ 0.91
SNX12Q9UMY4 FAM213A-206ENST00000615554 2213 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.74■□□□□ 0.91
SNX12Q9UMY4 KLHL35-201ENST00000376292 1500 ntTSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
SNX12Q9UMY4 ANKRD40-201ENST00000285243 4184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
SNX12Q9UMY4 FGF2-201ENST00000264498 6775 ntTSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
SNX12Q9UMY4 SLC25A20-201ENST00000319017 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
SNX12Q9UMY4 TCTEX1D4-201ENST00000339355 763 ntAPPRIS P1 BASIC20.74■□□□□ 0.91
SNX12Q9UMY4 TGIF1-207ENST00000407501 1585 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.74■□□□□ 0.91
SNX12Q9UMY4 CCND3-204ENST00000414200 1724 ntTSL 2 BASIC20.74■□□□□ 0.91
SNX12Q9UMY4 YBX1P1-201ENST00000445822 960 ntBASIC20.74■□□□□ 0.91
SNX12Q9UMY4 RPUSD2-202ENST00000559271 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.74■□□□□ 0.91
SNX12Q9UMY4 SLC35A3-213ENST00000638988 1286 ntTSL 5 BASIC20.74■□□□□ 0.91
SNX12Q9UMY4 TMEM182-210ENST00000639249 1025 ntTSL 5 BASIC20.74■□□□□ 0.91
SNX12Q9UMY4 PIP5K1C-201ENST00000335312 5080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
SNX12Q9UMY4 CDK13-202ENST00000340829 5066 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
SNX12Q9UMY4 B4GALNT1-213ENST00000552350 1649 ntTSL 4 BASIC20.74■□□□□ 0.91
SNX12Q9UMY4 RGS9BP-201ENST00000334176 2894 ntAPPRIS P1 BASIC20.74■□□□□ 0.91
SNX12Q9UMY4 MARC2-202ENST00000366913 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
SNX12Q9UMY4 SCARF1-202ENST00000348987 2619 ntTSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
SNX12Q9UMY4 FGF16-201ENST00000439435 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
SNX12Q9UMY4 CDC123-201ENST00000281141 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
SNX12Q9UMY4 FIP1L1-202ENST00000337488 2198 ntTSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
SNX12Q9UMY4 FIP1L1-203ENST00000358575 2180 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC20.73■□□□□ 0.91
SNX12Q9UMY4 CRB2-202ENST00000373631 5550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
SNX12Q9UMY4 SLC23A3-201ENST00000295738 2037 ntTSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
SNX12Q9UMY4 LRCH3-207ENST00000441090 2034 ntTSL 2 BASIC20.73■□□□□ 0.91
SNX12Q9UMY4 MRPL2-202ENST00000388752 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
SNX12Q9UMY4 REEP2-201ENST00000254901 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
SNX12Q9UMY4 RPS6KA1-203ENST00000374166 3131 ntTSL 5 BASIC20.73■□□□□ 0.91
SNX12Q9UMY4 EMC7-201ENST00000256545 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
SNX12Q9UMY4 TMEM218-201ENST00000279968 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
SNX12Q9UMY4 MIR31HG-201ENST00000304425 745 ntTSL 2 BASIC20.73■□□□□ 0.91
SNX12Q9UMY4 PTRH1-201ENST00000335223 759 ntTSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
SNX12Q9UMY4 JTB-203ENST00000368589 1216 ntTSL 2 BASIC20.73■□□□□ 0.91
SNX12Q9UMY4 RBP4-201ENST00000371464 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
SNX12Q9UMY4 MRPL14-201ENST00000372014 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
SNX12Q9UMY4 ASPDH-202ENST00000389208 1040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.73■□□□□ 0.91
SNX12Q9UMY4 UBE2Q2-208ENST00000569423 2969 ntTSL 2 BASIC20.73■□□□□ 0.91
SNX12Q9UMY4 LRRC37A17P-202ENST00000570478 572 ntTSL 4 BASIC20.73■□□□□ 0.91
SNX12Q9UMY4 AC016405.3-201ENST00000607710 860 ntBASIC20.73■□□□□ 0.91
SNX12Q9UMY4 WDR45-207ENST00000376372 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
SNX12Q9UMY4 AL161938.1-201ENST00000569833 2180 ntBASIC20.73■□□□□ 0.91
SNX12Q9UMY4 FLCN-203ENST00000389169 1692 ntTSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
SNX12Q9UMY4 CABP7-201ENST00000216144 3259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
SNX12Q9UMY4 CEP85L-205ENST00000419517 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
SNX12Q9UMY4 CFP-201ENST00000247153 1713 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.73■□□□□ 0.91
SNX12Q9UMY4 TNFRSF14-201ENST00000355716 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
SNX12Q9UMY4 TTLL10-203ENST00000379290 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
SNX12Q9UMY4 ICA1-206ENST00000402384 2458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.72■□□□□ 0.91
SNX12Q9UMY4 GAS2L1P2-201ENST00000436355 1356 ntBASIC20.72■□□□□ 0.91
SNX12Q9UMY4 SPHK2-213ENST00000601712 1394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.72■□□□□ 0.91
SNX12Q9UMY4 ITPKB-203ENST00000429204 6162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.72■□□□□ 0.91
SNX12Q9UMY4 RAPH1-211ENST00000457812 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.72■□□□□ 0.91
SNX12Q9UMY4 LZTS2-202ENST00000370223 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
SNX12Q9UMY4 FAM90A1-201ENST00000307435 2342 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.72■□□□□ 0.91
SNX12Q9UMY4 MFSD10-211ENST00000514800 1776 ntTSL 5 BASIC20.72■□□□□ 0.91
SNX12Q9UMY4 MOXD1-203ENST00000392401 2191 ntTSL 4 BASIC20.72■□□□□ 0.91
SNX12Q9UMY4 ABCG4-206ENST00000622721 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
SNX12Q9UMY4 C6orf223-202ENST00000439969 2757 ntTSL 2 BASIC20.72■□□□□ 0.91
SNX12Q9UMY4 DBNL-210ENST00000448521 1808 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
SNX12Q9UMY4 TMEM70-201ENST00000312184 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
SNX12Q9UMY4 LRRC14-201ENST00000292524 5328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
SNX12Q9UMY4 PSPC1-201ENST00000338910 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
SNX12Q9UMY4 P3H4-202ENST00000393928 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
SNX12Q9UMY4 AC026471.1-201ENST00000564629 3026 ntBASIC20.72■□□□□ 0.91
SNX12Q9UMY4 TPSG1-201ENST00000234798 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
SNX12Q9UMY4 KRT19P1-201ENST00000405746 1186 ntBASIC20.72■□□□□ 0.91
SNX12Q9UMY4 UQCRFS1P1-201ENST00000435169 820 ntBASIC20.72■□□□□ 0.91
SNX12Q9UMY4 TERF1P5-201ENST00000477545 1207 ntBASIC20.72■□□□□ 0.91
SNX12Q9UMY4 AC012414.4-201ENST00000560839 1074 ntTSL 5 BASIC20.72■□□□□ 0.91
SNX12Q9UMY4 AL162412.1-201ENST00000567129 965 ntBASIC20.72■□□□□ 0.91
SNX12Q9UMY4 PRSS22-203ENST00000571228 1037 ntTSL 2 BASIC20.72■□□□□ 0.91
SNX12Q9UMY4 ETHE1-205ENST00000600651 1052 ntTSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
SNX12Q9UMY4 AC060814.5-201ENST00000630916 1074 ntTSL 2 BASIC20.72■□□□□ 0.91
SNX12Q9UMY4 SYTL1-210ENST00000616558 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
SNX12Q9UMY4 FARSA-207ENST00000588025 2057 ntTSL 5 BASIC20.72■□□□□ 0.91
SNX12Q9UMY4 MYEOV-201ENST00000308946 2287 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
SNX12Q9UMY4 SH3BP1-201ENST00000357436 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
SNX12Q9UMY4 TBC1D9-201ENST00000442267 5306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
SNX12Q9UMY4 AGAP4-201ENST00000311652 2715 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
SNX12Q9UMY4 NR1H2-210ENST00000598168 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.72■□□□□ 0.91
SNX12Q9UMY4 FAM187A-202ENST00000412523 1748 ntTSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
SNX12Q9UMY4 ETV2-202ENST00000379026 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.72■□□□□ 0.91
SNX12Q9UMY4 ANKRD17-211ENST00000639793 3486 ntTSL 5 BASIC20.72■□□□□ 0.91
SNX12Q9UMY4 PPP1R3F-202ENST00000376188 2443 ntTSL 2 BASIC20.72■□□□□ 0.91
SNX12Q9UMY4 ADAMTS9-202ENST00000459780 2871 ntTSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
SNX12Q9UMY4 CWH43-201ENST00000226432 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
SNX12Q9UMY4 SYBU-232ENST00000533171 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.71■□□□□ 0.91
SNX12Q9UMY4 GRK6-201ENST00000355472 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
SNX12Q9UMY4 AC005082.1-201ENST00000413042 2259 ntBASIC20.71■□□□□ 0.91
SNX12Q9UMY4 HNF4A-205ENST00000443598 1603 ntTSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
SNX12Q9UMY4 GLS-202ENST00000338435 4475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
SNX12Q9UMY4 TTLL3-209ENST00000426895 2767 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.71■□□□□ 0.91
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 60 ms