Protein–RNA interactions for Protein: Q9UKV5

AMFR, E3 ubiquitin-protein ligase AMFR, humanhuman

Predictions only

Length 643 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AMFRQ9UKV5 NDOR1-203ENST00000427047 2315 ntTSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
AMFRQ9UKV5 CCM2-202ENST00000381112 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
AMFRQ9UKV5 DMRT2-204ENST00000382251 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
AMFRQ9UKV5 NAGPA-AS1-202ENST00000632058 2265 ntTSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
AMFRQ9UKV5 BRAF-201ENST00000288602 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
AMFRQ9UKV5 TMEM218-201ENST00000279968 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
AMFRQ9UKV5 IL15RA-201ENST00000379971 588 ntTSL 3 BASIC20.79■□□□□ 0.92
AMFRQ9UKV5 AC016769.1-201ENST00000409132 1010 ntBASIC20.79■□□□□ 0.92
AMFRQ9UKV5 GXYLT1P2-201ENST00000433312 1230 ntBASIC20.79■□□□□ 0.92
AMFRQ9UKV5 IDNK-204ENST00000454393 1210 ntTSL 3 BASIC20.79■□□□□ 0.92
AMFRQ9UKV5 LINC01956-201ENST00000557729 695 ntTSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
AMFRQ9UKV5 ZNF561-AS1-205ENST00000588765 579 ntTSL 4 BASIC20.79■□□□□ 0.92
AMFRQ9UKV5 MIR6821-201ENST00000617625 74 ntBASIC20.79■□□□□ 0.92
AMFRQ9UKV5 LINC01184-201ENST00000499346 1380 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
AMFRQ9UKV5 SPRED3-202ENST00000586301 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
AMFRQ9UKV5 RAB34-201ENST00000301043 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
AMFRQ9UKV5 ASPHD1-201ENST00000308748 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
AMFRQ9UKV5 MEN1-206ENST00000377321 2614 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
AMFRQ9UKV5 METRN-204ENST00000568223 3325 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
AMFRQ9UKV5 IDUA-201ENST00000247933 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
AMFRQ9UKV5 RBFOX1-215ENST00000553186 2196 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
AMFRQ9UKV5 ANKDD1B-204ENST00000601380 2569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
AMFRQ9UKV5 NOM1-201ENST00000275820 6077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
AMFRQ9UKV5 AC091729.3-201ENST00000423008 1401 ntTSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
AMFRQ9UKV5 CADPS-201ENST00000283269 4591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
AMFRQ9UKV5 OSR2-210ENST00000523368 1519 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
AMFRQ9UKV5 RTN4-201ENST00000317610 2333 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
AMFRQ9UKV5 FA2H-201ENST00000219368 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
AMFRQ9UKV5 PRKCSH-209ENST00000589838 1898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
AMFRQ9UKV5 ACAT1-201ENST00000265838 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
AMFRQ9UKV5 FGF16-201ENST00000439435 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
AMFRQ9UKV5 ACBD4-202ENST00000376955 1453 ntTSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
AMFRQ9UKV5 MAPK9-208ENST00000455781 4336 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
AMFRQ9UKV5 AL355472.2-201ENST00000422958 438 ntBASIC20.78■□□□□ 0.92
AMFRQ9UKV5 ZNF717-203ENST00000477374 1169 ntTSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
AMFRQ9UKV5 ZNF436-AS1-206ENST00000518821 461 ntTSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
AMFRQ9UKV5 AC005410.1-201ENST00000579522 462 ntTSL 3 BASIC20.78■□□□□ 0.92
AMFRQ9UKV5 AC069236.1-201ENST00000604339 616 ntBASIC20.78■□□□□ 0.92
AMFRQ9UKV5 AC087623.3-201ENST00000607047 1098 ntBASIC20.78■□□□□ 0.92
AMFRQ9UKV5 SLC35A2-212ENST00000634665 486 ntTSL 4 BASIC20.78■□□□□ 0.92
AMFRQ9UKV5 PAX1-201ENST00000398485 2838 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
AMFRQ9UKV5 MUTYH-203ENST00000372098 1839 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
AMFRQ9UKV5 MUTYH-204ENST00000372104 1823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
AMFRQ9UKV5 MUTYH-205ENST00000372110 1809 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
AMFRQ9UKV5 LAPTM4B-204ENST00000619747 2758 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
AMFRQ9UKV5 PRSS12-201ENST00000296498 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
AMFRQ9UKV5 KIF22-203ENST00000561482 2505 ntTSL 2 BASIC20.77■□□□□ 0.92
AMFRQ9UKV5 SLC27A3-214ENST00000624995 2413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
AMFRQ9UKV5 CHMP6-201ENST00000325167 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
AMFRQ9UKV5 STK16-201ENST00000396738 1673 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.77■□□□□ 0.92
AMFRQ9UKV5 CDHR5-201ENST00000349570 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
AMFRQ9UKV5 LYSMD4-202ENST00000344791 2885 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
AMFRQ9UKV5 PSMB11-201ENST00000408907 2110 ntAPPRIS P1 BASIC20.77■□□□□ 0.92
AMFRQ9UKV5 SDCBP-204ENST00000447182 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
AMFRQ9UKV5 BET1L-204ENST00000410108 637 ntTSL 3 BASIC20.77■□□□□ 0.92
AMFRQ9UKV5 AC008694.1-202ENST00000636953 945 ntBASIC20.77■□□□□ 0.92
AMFRQ9UKV5 NOP14-202ENST00000398071 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
AMFRQ9UKV5 MREG-201ENST00000263268 1314 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.77■□□□□ 0.91
AMFRQ9UKV5 CERKL-203ENST00000374969 1330 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.91
AMFRQ9UKV5 TMEM214-203ENST00000404032 2830 ntTSL 2 BASIC20.77■□□□□ 0.91
AMFRQ9UKV5 ST3GAL4-205ENST00000449406 1669 ntTSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.91
AMFRQ9UKV5 KSR1-205ENST00000509603 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.91
AMFRQ9UKV5 FAM83E-201ENST00000263266 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
AMFRQ9UKV5 ADORA2A-215ENST00000618076 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
AMFRQ9UKV5 ARMC6-220ENST00000546344 1814 ntTSL 2 BASIC20.76■□□□□ 0.91
AMFRQ9UKV5 AC245041.2-204ENST00000610809 1962 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
AMFRQ9UKV5 C11orf49-201ENST00000278460 1645 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
AMFRQ9UKV5 SLC36A1-209ENST00000521925 1621 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
AMFRQ9UKV5 CITED1-201ENST00000246139 1231 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
AMFRQ9UKV5 ETHE1-201ENST00000292147 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
AMFRQ9UKV5 RHOD-201ENST00000308831 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
AMFRQ9UKV5 UBE2C-203ENST00000352551 665 ntTSL 2 BASIC20.76■□□□□ 0.91
AMFRQ9UKV5 MGST3-205ENST00000367889 1015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
AMFRQ9UKV5 GPX1-202ENST00000419783 1146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
AMFRQ9UKV5 CYP2T1P-201ENST00000432607 1285 ntBASIC20.76■□□□□ 0.91
AMFRQ9UKV5 AC023632.3-201ENST00000521633 145 ntBASIC20.76■□□□□ 0.91
AMFRQ9UKV5 PET100-202ENST00000594797 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
AMFRQ9UKV5 ACYP2-207ENST00000606082 713 ntTSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
AMFRQ9UKV5 AC011767.1-201ENST00000617410 1153 ntBASIC20.76■□□□□ 0.91
AMFRQ9UKV5 EVL-202ENST00000402714 2353 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
AMFRQ9UKV5 C1orf198-201ENST00000366663 3858 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
AMFRQ9UKV5 ZKSCAN7-205ENST00000426540 2791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.76■□□□□ 0.91
AMFRQ9UKV5 RNASET2-203ENST00000366855 1417 ntTSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
AMFRQ9UKV5 ZBTB33-202ENST00000557385 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
AMFRQ9UKV5 LIPG-203ENST00000577628 2323 ntTSL 2 BASIC20.76■□□□□ 0.91
AMFRQ9UKV5 SOCS2-207ENST00000549206 2072 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.76■□□□□ 0.91
AMFRQ9UKV5 IKBKG-214ENST00000618670 2069 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
AMFRQ9UKV5 DPF1-209ENST00000456296 1562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
AMFRQ9UKV5 TMEM198-202ENST00000373883 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
AMFRQ9UKV5 RNH1-206ENST00000438658 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
AMFRQ9UKV5 PIK3R1-201ENST00000320694 2625 ntTSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
AMFRQ9UKV5 AKNA-205ENST00000374079 2138 ntTSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
AMFRQ9UKV5 PPARG-202ENST00000309576 1870 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.75■□□□□ 0.91
AMFRQ9UKV5 STMN4-202ENST00000350889 2288 ntTSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
AMFRQ9UKV5 SIRT3-202ENST00000524564 1395 ntTSL 2 BASIC20.75■□□□□ 0.91
AMFRQ9UKV5 P2RY6-212ENST00000618468 2431 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.75■□□□□ 0.91
AMFRQ9UKV5 THTPA-202ENST00000404535 1779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.75■□□□□ 0.91
AMFRQ9UKV5 IRF7-203ENST00000397566 2051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
AMFRQ9UKV5 KRT18P5-201ENST00000436075 1291 ntBASIC20.75■□□□□ 0.91
AMFRQ9UKV5 TMEM230-210ENST00000612323 1231 ntTSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21 ms