Protein–RNA interactions for Protein: Q9UKV0

HDAC9, Histone deacetylase 9, humanhuman

Predictions only

Length 1,011 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HDAC9Q9UKV0 CRTC2-203ENST00000368633 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
HDAC9Q9UKV0 WT1-212ENST00000640146 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
HDAC9Q9UKV0 PRKAR1B-211ENST00000537384 2533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
HDAC9Q9UKV0 AC010616.1-201ENST00000597630 2078 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
HDAC9Q9UKV0 UBTF-213ENST00000533177 3011 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
HDAC9Q9UKV0 TRAK2-202ENST00000430254 1436 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
HDAC9Q9UKV0 WRNIP1-204ENST00000380773 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
HDAC9Q9UKV0 IKZF1-209ENST00000438033 1748 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
HDAC9Q9UKV0 DUSP15-209ENST00000486996 1651 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
HDAC9Q9UKV0 SARDH-203ENST00000371868 2266 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
HDAC9Q9UKV0 TMEM204-202ENST00000566264 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
HDAC9Q9UKV0 DAPK3-201ENST00000301264 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
HDAC9Q9UKV0 PSMD9-208ENST00000542602 516 ntTSL 3 BASIC23.67■■□□□ 1.38
HDAC9Q9UKV0 AC006011.2-201ENST00000621313 1158 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
HDAC9Q9UKV0 FICD-201ENST00000361549 1816 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
HDAC9Q9UKV0 SCOC-207ENST00000506597 1838 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
HDAC9Q9UKV0 RNF224-201ENST00000445101 1798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.67■■□□□ 1.38
HDAC9Q9UKV0 FBXO25-202ENST00000350302 2229 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
HDAC9Q9UKV0 EPHX4-201ENST00000370383 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
HDAC9Q9UKV0 P2RY11-201ENST00000321826 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
HDAC9Q9UKV0 DCTD-201ENST00000357067 1931 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
HDAC9Q9UKV0 ALG1-201ENST00000262374 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
HDAC9Q9UKV0 HOXD12-202ENST00000406506 1318 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.66■■□□□ 1.38
HDAC9Q9UKV0 TBX6-201ENST00000279386 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
HDAC9Q9UKV0 TBX6-205ENST00000627355 1796 ntTSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
HDAC9Q9UKV0 AP001922.1-201ENST00000499390 1504 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
HDAC9Q9UKV0 PTPRJ-208ENST00000615445 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
HDAC9Q9UKV0 RXFP4-201ENST00000368318 1240 ntAPPRIS P1 BASIC23.66■■□□□ 1.38
HDAC9Q9UKV0 ST8SIA1-202ENST00000381424 1036 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
HDAC9Q9UKV0 TPM4P1-201ENST00000436100 807 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
HDAC9Q9UKV0 AC007161.3-201ENST00000469183 637 ntTSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
HDAC9Q9UKV0 RAB2A-211ENST00000531289 1058 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
HDAC9Q9UKV0 LTBR-211ENST00000543190 785 ntTSL 3 BASIC23.66■■□□□ 1.38
HDAC9Q9UKV0 WWOX-216ENST00000569818 525 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
HDAC9Q9UKV0 AP000692.2-201ENST00000608391 879 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
HDAC9Q9UKV0 AC130371.2-201ENST00000619443 611 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
HDAC9Q9UKV0 PSPH-202ENST00000395471 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
HDAC9Q9UKV0 CDIPT-201ENST00000219789 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
HDAC9Q9UKV0 NEURL4-202ENST00000399464 5200 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
HDAC9Q9UKV0 EDA-208ENST00000524573 1381 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
HDAC9Q9UKV0 RASGRP2-210ENST00000394430 2174 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
HDAC9Q9UKV0 ARFIP2-204ENST00000445086 1300 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
HDAC9Q9UKV0 VGLL3-201ENST00000383698 2475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
HDAC9Q9UKV0 CLN3-205ENST00000359984 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
HDAC9Q9UKV0 AC006128.1-201ENST00000624704 1661 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
HDAC9Q9UKV0 PMVK-201ENST00000368467 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
HDAC9Q9UKV0 SNCB-202ENST00000393693 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
HDAC9Q9UKV0 BX664615.1-201ENST00000443558 458 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
HDAC9Q9UKV0 OOEP-AS1-201ENST00000445350 463 ntTSL 3 BASIC23.65■■□□□ 1.38
HDAC9Q9UKV0 DCTN3-209ENST00000477738 713 ntTSL 3 BASIC23.65■■□□□ 1.38
HDAC9Q9UKV0 MEGF6-202ENST00000356575 5455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
HDAC9Q9UKV0 PHGDH-210ENST00000641115 1638 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
HDAC9Q9UKV0 IGDCC4-201ENST00000352385 6508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
HDAC9Q9UKV0 UBE2B-201ENST00000265339 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
HDAC9Q9UKV0 PABPC1L2A-201ENST00000373519 2237 ntAPPRIS P1 BASIC23.64■■□□□ 1.38
HDAC9Q9UKV0 KCNK15-201ENST00000372861 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
HDAC9Q9UKV0 FAM131C-201ENST00000375662 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
HDAC9Q9UKV0 CDH5-202ENST00000539168 1672 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.38
HDAC9Q9UKV0 CHCHD6-201ENST00000290913 1006 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
HDAC9Q9UKV0 TPPP3-202ENST00000393957 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
HDAC9Q9UKV0 TNFSF13-208ENST00000483039 959 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
HDAC9Q9UKV0 AP002807.1-202ENST00000526897 791 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
HDAC9Q9UKV0 FFAR4-203ENST00000604414 1142 ntTSL 3 BASIC23.64■■□□□ 1.37
HDAC9Q9UKV0 AC011298.2-201ENST00000617989 482 ntBASIC23.64■■□□□ 1.37
HDAC9Q9UKV0 HIRA-201ENST00000263208 4053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
HDAC9Q9UKV0 NDRG2-242ENST00000555158 2216 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
HDAC9Q9UKV0 SYT7-208ENST00000542670 1887 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
HDAC9Q9UKV0 SCRN2-201ENST00000290216 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
HDAC9Q9UKV0 ABCG4-204ENST00000615496 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
HDAC9Q9UKV0 AC004890.2-202ENST00000463462 1494 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
HDAC9Q9UKV0 NDUFA10-214ENST00000620965 1489 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
HDAC9Q9UKV0 MAP2K5-203ENST00000354498 1783 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
HDAC9Q9UKV0 OSR1-201ENST00000272223 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
HDAC9Q9UKV0 CENPA-201ENST00000233505 1299 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
HDAC9Q9UKV0 IZUMO2-201ENST00000293405 728 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
HDAC9Q9UKV0 KRT17P2-202ENST00000326333 1174 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
HDAC9Q9UKV0 CKS1B-203ENST00000368439 912 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
HDAC9Q9UKV0 HS2ST1-202ENST00000370551 1585 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
HDAC9Q9UKV0 PRICKLE4-202ENST00000394260 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
HDAC9Q9UKV0 PRICKLE4-203ENST00000394263 1155 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
HDAC9Q9UKV0 AK4P3-201ENST00000418260 669 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
HDAC9Q9UKV0 BX890604.1-205ENST00000425492 856 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
HDAC9Q9UKV0 AL513320.1-201ENST00000435049 622 ntTSL 3 BASIC23.63■■□□□ 1.37
HDAC9Q9UKV0 FDX2-206ENST00000492239 773 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
HDAC9Q9UKV0 ABHD14B-208ENST00000525795 980 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.63■■□□□ 1.37
HDAC9Q9UKV0 CDIPT-204ENST00000563415 1047 ntTSL 3 BASIC23.63■■□□□ 1.37
HDAC9Q9UKV0 LINC01238-205ENST00000567549 1107 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
HDAC9Q9UKV0 CENPX-206ENST00000580435 710 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
HDAC9Q9UKV0 CYB561D2-210ENST00000607121 1004 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
HDAC9Q9UKV0 TRABD2A-201ENST00000335459 1844 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
HDAC9Q9UKV0 AC092720.2-201ENST00000602388 1665 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
HDAC9Q9UKV0 BSCL2-207ENST00000407022 1516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
HDAC9Q9UKV0 PNMA2-204ENST00000522362 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
HDAC9Q9UKV0 STEAP2-204ENST00000394626 2456 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
HDAC9Q9UKV0 MINOS1-NBL1-204ENST00000602662 1623 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
HDAC9Q9UKV0 RAD23A-203ENST00000586534 1746 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
HDAC9Q9UKV0 RCC2P6-201ENST00000526625 1557 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
HDAC9Q9UKV0 GPM6B-204ENST00000398361 1033 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
HDAC9Q9UKV0 AC004951.3-201ENST00000418645 1148 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
HDAC9Q9UKV0 ICAM1-202ENST00000423829 1296 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51.5 ms