Protein–RNA interactions for Protein: Q9UKL4

GJD2, Gap junction delta-2 protein, humanhuman

Predictions only

Length 321 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GJD2Q9UKL4 TDRKH-205ENST00000368827 2318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
GJD2Q9UKL4 SERPINH1-212ENST00000530284 1358 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
GJD2Q9UKL4 SLC25A51-202ENST00000377716 1691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
GJD2Q9UKL4 NAGPA-202ENST00000381955 2100 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
GJD2Q9UKL4 IER5L-201ENST00000372491 2711 ntAPPRIS P1 BASIC22.36■■□□□ 1.17
GJD2Q9UKL4 PKMYT1-204ENST00000440027 2061 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
GJD2Q9UKL4 ZGPAT-201ENST00000328969 1945 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
GJD2Q9UKL4 INPP1-202ENST00000392329 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
GJD2Q9UKL4 FBXW11-203ENST00000393802 2181 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
GJD2Q9UKL4 TREX2-206ENST00000370232 1864 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
GJD2Q9UKL4 TMEM230-207ENST00000379286 1735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
GJD2Q9UKL4 SLC1A6-203ENST00000544886 2420 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
GJD2Q9UKL4 SLC35A2-217ENST00000635589 1424 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
GJD2Q9UKL4 GGCT-202ENST00000275428 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
GJD2Q9UKL4 AC002467.1-201ENST00000457510 657 ntTSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
GJD2Q9UKL4 AL133352.1-203ENST00000557395 1234 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
GJD2Q9UKL4 AC087498.1-201ENST00000572493 945 ntAPPRIS P1 BASIC22.35■■□□□ 1.17
GJD2Q9UKL4 ZNF667-AS1-208ENST00000594783 475 ntTSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
GJD2Q9UKL4 AC141257.4-201ENST00000634557 245 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
GJD2Q9UKL4 AC136944.6-201ENST00000634818 245 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
GJD2Q9UKL4 ZNF326-202ENST00000361911 1538 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
GJD2Q9UKL4 EPOR-208ENST00000592375 2086 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
GJD2Q9UKL4 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
GJD2Q9UKL4 PTPN18-202ENST00000347849 2472 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
GJD2Q9UKL4 ESX1-201ENST00000372588 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
GJD2Q9UKL4 OGG1-205ENST00000344629 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
GJD2Q9UKL4 WASH6P-203ENST00000460206 1826 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
GJD2Q9UKL4 RITA1-201ENST00000548278 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
GJD2Q9UKL4 ANKRD2-202ENST00000307518 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
GJD2Q9UKL4 CBLN3-201ENST00000267406 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
GJD2Q9UKL4 AUP1-201ENST00000377526 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
GJD2Q9UKL4 DPP3P2-201ENST00000416030 1696 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
GJD2Q9UKL4 PFDN6-206ENST00000463584 1915 ntTSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
GJD2Q9UKL4 PIEZO1-202ENST00000327397 1246 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
GJD2Q9UKL4 FAM207BP-201ENST00000447172 505 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
GJD2Q9UKL4 LINC01293-201ENST00000453951 1266 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
GJD2Q9UKL4 RPL39L-203ENST00000455270 653 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
GJD2Q9UKL4 LINC01385-201ENST00000512310 780 ntTSL 4 BASIC22.34■■□□□ 1.17
GJD2Q9UKL4 AC098864.1-204ENST00000513752 805 ntTSL 4 BASIC22.34■■□□□ 1.17
GJD2Q9UKL4 DBP-204ENST00000599385 709 ntTSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
GJD2Q9UKL4 AC243829.1-201ENST00000615128 1059 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
GJD2Q9UKL4 SCRN2-201ENST00000290216 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
GJD2Q9UKL4 TBX6-201ENST00000279386 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
GJD2Q9UKL4 PPHLN1-213ENST00000549190 1777 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
GJD2Q9UKL4 VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 1753 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
GJD2Q9UKL4 TBX6-205ENST00000627355 1796 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
GJD2Q9UKL4 SH2D3A-201ENST00000245908 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
GJD2Q9UKL4 LIMS2-201ENST00000324938 2111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
GJD2Q9UKL4 CLN3-205ENST00000359984 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
GJD2Q9UKL4 FAM72A-202ENST00000367128 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
GJD2Q9UKL4 FAM72D-201ENST00000400889 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
GJD2Q9UKL4 SH3GLB2-203ENST00000372564 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
GJD2Q9UKL4 DALRD3-202ENST00000341949 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
GJD2Q9UKL4 UNC93B1-201ENST00000227471 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
GJD2Q9UKL4 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
GJD2Q9UKL4 NEUROG1-201ENST00000314744 1668 ntAPPRIS P1 BASIC22.33■■□□□ 1.17
GJD2Q9UKL4 NEIL1-206ENST00000564784 2019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
GJD2Q9UKL4 UNKL-202ENST00000301712 1431 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
GJD2Q9UKL4 KRT16P6-202ENST00000425692 1426 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
GJD2Q9UKL4 PCED1CP-201ENST00000419887 785 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
GJD2Q9UKL4 AC004080.2-201ENST00000523331 556 ntTSL 4 BASIC22.33■■□□□ 1.17
GJD2Q9UKL4 TMEM249-203ENST00000565365 975 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.17
GJD2Q9UKL4 AC006504.5-207ENST00000586220 487 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
GJD2Q9UKL4 AL121956.5-201ENST00000625261 221 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
GJD2Q9UKL4 MLF2-202ENST00000435120 1379 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
GJD2Q9UKL4 CCDC38-201ENST00000344280 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
GJD2Q9UKL4 DPYS-201ENST00000351513 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
GJD2Q9UKL4 SCRT2-201ENST00000246104 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
GJD2Q9UKL4 CRACR2B-207ENST00000528542 1792 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
GJD2Q9UKL4 UBE2B-201ENST00000265339 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
GJD2Q9UKL4 CYP2D6-201ENST00000359033 1433 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
GJD2Q9UKL4 ALKBH6-213ENST00000486389 1525 ntTSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
GJD2Q9UKL4 EEF1A2-202ENST00000298049 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
GJD2Q9UKL4 SAE1-201ENST00000270225 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
GJD2Q9UKL4 POC1B-209ENST00000549035 2038 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
GJD2Q9UKL4 MED30-201ENST00000297347 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
GJD2Q9UKL4 BET1L-202ENST00000332865 533 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
GJD2Q9UKL4 AIF1L-203ENST00000372298 849 ntTSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
GJD2Q9UKL4 LINC00421-201ENST00000413833 1054 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
GJD2Q9UKL4 RNF144A-AS1-204ENST00000437589 618 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
GJD2Q9UKL4 RAP1B-228ENST00000542145 1060 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
GJD2Q9UKL4 LCE1C-202ENST00000607093 644 ntAPPRIS P2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
GJD2Q9UKL4 mascRNA-menRNA.2-201ENST00000616984 58 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
GJD2Q9UKL4 C1QTNF8-202ENST00000621771 897 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
GJD2Q9UKL4 KLHDC4-204ENST00000353170 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
GJD2Q9UKL4 LYSMD2-201ENST00000267838 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
GJD2Q9UKL4 FAM129C-211ENST00000600871 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
GJD2Q9UKL4 P2RY11-201ENST00000321826 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
GJD2Q9UKL4 ADORA2A-AS1-203ENST00000427813 2027 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
GJD2Q9UKL4 IRX4-201ENST00000231357 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
GJD2Q9UKL4 SLCO3A1-202ENST00000424469 2705 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
GJD2Q9UKL4 PRKACA-201ENST00000308677 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
GJD2Q9UKL4 C19orf12-201ENST00000323670 2464 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
GJD2Q9UKL4 FBXO31-207ENST00000618298 1871 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
GJD2Q9UKL4 KXD1-203ENST00000540691 1592 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
GJD2Q9UKL4 IFNLR1-202ENST00000327575 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
GJD2Q9UKL4 ETV7-203ENST00000373737 1488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
GJD2Q9UKL4 CCK-201ENST00000334681 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
GJD2Q9UKL4 SPATA22-202ENST00000355380 1216 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
GJD2Q9UKL4 TRPT1-202ENST00000394546 1058 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.2 ms