Protein–RNA interactions for Protein: Q9UKK3

PARP4, Poly [ADP-ribose] polymerase 4, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,724 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PARP4Q9UKK3 HIGD1A-204ENST00000452906 585 ntTSL 2 BASIC26.01■■□□□ 1.75
PARP4Q9UKK3 SERPINH1-212ENST00000530284 1358 ntTSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
PARP4Q9UKK3 C17orf62-221ENST00000581196 668 ntTSL 4 BASIC26.01■■□□□ 1.75
PARP4Q9UKK3 AC011298.2-201ENST00000617989 482 ntBASIC26.01■■□□□ 1.75
PARP4Q9UKK3 AC116562.4-202ENST00000641738 218 ntBASIC26.01■■□□□ 1.75
PARP4Q9UKK3 SPIRE2-202ENST00000393062 2172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
PARP4Q9UKK3 NPIPA8-201ENST00000525596 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
PARP4Q9UKK3 SRMS-201ENST00000217188 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
PARP4Q9UKK3 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
PARP4Q9UKK3 PTPA-216ENST00000432651 857 ntTSL 2 BASIC26■■□□□ 1.75
PARP4Q9UKK3 TMEM249-203ENST00000565365 975 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC26■■□□□ 1.75
PARP4Q9UKK3 DCTN5-208ENST00000568589 772 ntTSL 2 BASIC26■■□□□ 1.75
PARP4Q9UKK3 AC011498.2-201ENST00000588798 540 ntTSL 3 BASIC26■■□□□ 1.75
PARP4Q9UKK3 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
PARP4Q9UKK3 ALG1-201ENST00000262374 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
PARP4Q9UKK3 FADS6-204ENST00000614223 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
PARP4Q9UKK3 GORAB-201ENST00000367762 1699 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
PARP4Q9UKK3 BZW1-202ENST00000409226 2455 ntTSL 2 BASIC26■■□□□ 1.75
PARP4Q9UKK3 NOL3-204ENST00000564053 1592 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26■■□□□ 1.75
PARP4Q9UKK3 PTGER3-209ENST00000460330 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
PARP4Q9UKK3 PRSS50-202ENST00000315170 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
PARP4Q9UKK3 TRIM3-214ENST00000536344 2704 ntTSL 2 BASIC26■■□□□ 1.75
PARP4Q9UKK3 ERF-202ENST00000440177 2032 ntTSL 2 BASIC26■■□□□ 1.75
PARP4Q9UKK3 CCK-201ENST00000334681 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
PARP4Q9UKK3 KRTAP5-3-201ENST00000399685 899 ntAPPRIS P1 BASIC26■■□□□ 1.75
PARP4Q9UKK3 TUBB8P6-201ENST00000436895 1288 ntBASIC26■■□□□ 1.75
PARP4Q9UKK3 AF250324.1-201ENST00000506276 703 ntTSL 3 BASIC26■■□□□ 1.75
PARP4Q9UKK3 C17orf49-208ENST00000552402 760 ntTSL 2 BASIC26■■□□□ 1.75
PARP4Q9UKK3 IFI27L2-206ENST00000556727 556 ntTSL 3 BASIC26■■□□□ 1.75
PARP4Q9UKK3 CHRNB1-207ENST00000575379 1095 ntTSL 2 BASIC26■■□□□ 1.75
PARP4Q9UKK3 RAB11B-AS1-201ENST00000593581 1013 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
PARP4Q9UKK3 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
PARP4Q9UKK3 FBXO25-202ENST00000350302 2229 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
PARP4Q9UKK3 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
PARP4Q9UKK3 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
PARP4Q9UKK3 PLK5-205ENST00000642079 1969 ntBASIC25.99■■□□□ 1.75
PARP4Q9UKK3 TMEM204-202ENST00000566264 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
PARP4Q9UKK3 THOC3-212ENST00000628318 1442 ntTSL 5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
PARP4Q9UKK3 SCOC-207ENST00000506597 1838 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
PARP4Q9UKK3 KCNK17-202ENST00000453413 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
PARP4Q9UKK3 DGCR6L-201ENST00000248879 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
PARP4Q9UKK3 TLCD1-201ENST00000292090 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
PARP4Q9UKK3 MOK-234ENST00000524370 1165 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
PARP4Q9UKK3 AF186192.2-201ENST00000524514 423 ntTSL 3 BASIC25.99■■□□□ 1.75
PARP4Q9UKK3 AC008763.3-201ENST00000597959 777 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC25.99■■□□□ 1.75
PARP4Q9UKK3 TMEM25-203ENST00000354284 1456 ntTSL 2 BASIC25.98■■□□□ 1.75
PARP4Q9UKK3 HMBS-214ENST00000542729 1469 ntTSL 2 BASIC25.98■■□□□ 1.75
PARP4Q9UKK3 NAGK-229ENST00000613852 1801 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
PARP4Q9UKK3 CYP2D6-201ENST00000359033 1433 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
PARP4Q9UKK3 SLC35A2-217ENST00000635589 1424 ntTSL 2 BASIC25.98■■□□□ 1.75
PARP4Q9UKK3 AUP1-201ENST00000377526 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
PARP4Q9UKK3 C22orf39-206ENST00000611555 1977 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
PARP4Q9UKK3 MINOS1-NBL1-204ENST00000602662 1623 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.98■■□□□ 1.75
PARP4Q9UKK3 C1orf50-201ENST00000372525 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
PARP4Q9UKK3 TRPT1-203ENST00000394547 865 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
PARP4Q9UKK3 SLC25A1P2-201ENST00000430693 912 ntBASIC25.98■■□□□ 1.75
PARP4Q9UKK3 CDIPT-204ENST00000563415 1047 ntTSL 3 BASIC25.98■■□□□ 1.75
PARP4Q9UKK3 ART5-203ENST00000397068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
PARP4Q9UKK3 PPHLN1-213ENST00000549190 1777 ntTSL 5 BASIC25.98■■□□□ 1.75
PARP4Q9UKK3 ZIC4-209ENST00000473123 1481 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.98■■□□□ 1.75
PARP4Q9UKK3 AC091153.3-201ENST00000497885 472 ntTSL 2 BASIC25.97■■□□□ 1.75
PARP4Q9UKK3 VPS72-207ENST00000640458 689 ntTSL 5 BASIC25.97■■□□□ 1.75
PARP4Q9UKK3 SAE1-201ENST00000270225 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
PARP4Q9UKK3 STK25-204ENST00000405585 1643 ntTSL 2 BASIC25.97■■□□□ 1.75
PARP4Q9UKK3 FAM129C-211ENST00000600871 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.97■■□□□ 1.75
PARP4Q9UKK3 PTPN18-202ENST00000347849 2472 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
PARP4Q9UKK3 NDUFAF6-203ENST00000396124 1798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.97■■□□□ 1.75
PARP4Q9UKK3 S100A16-203ENST00000368705 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
PARP4Q9UKK3 MRPL43-205ENST00000370234 798 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
PARP4Q9UKK3 AIF1L-203ENST00000372298 849 ntTSL 3 BASIC25.97■■□□□ 1.75
PARP4Q9UKK3 AC004951.3-201ENST00000418645 1148 ntBASIC25.97■■□□□ 1.75
PARP4Q9UKK3 AC037459.1-202ENST00000430850 531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC25.97■■□□□ 1.75
PARP4Q9UKK3 FAHD2CP-202ENST00000443258 893 ntTSL 3 BASIC25.97■■□□□ 1.75
PARP4Q9UKK3 LHX9-206ENST00000561173 2144 ntTSL 5 BASIC25.97■■□□□ 1.75
PARP4Q9UKK3 ABHD17A-204ENST00000590661 1079 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
PARP4Q9UKK3 ANKRD2-202ENST00000307518 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
PARP4Q9UKK3 JPT1-206ENST00000476258 2289 ntTSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
PARP4Q9UKK3 CALM2-201ENST00000272298 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
PARP4Q9UKK3 GPRIN2-201ENST00000374314 1696 ntAPPRIS P1 BASIC25.96■■□□□ 1.75
PARP4Q9UKK3 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
PARP4Q9UKK3 PDLIM7-205ENST00000393551 1226 ntTSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
PARP4Q9UKK3 KCTD7-202ENST00000443322 1160 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
PARP4Q9UKK3 TMEM135-209ENST00000532959 1149 ntTSL 2 BASIC25.96■■□□□ 1.75
PARP4Q9UKK3 mascRNA-menRNA.2-201ENST00000616984 58 ntBASIC25.96■■□□□ 1.75
PARP4Q9UKK3 AC130371.2-201ENST00000619443 611 ntBASIC25.96■■□□□ 1.75
PARP4Q9UKK3 ASNS-206ENST00000437628 1638 ntTSL 2 BASIC25.96■■□□□ 1.75
PARP4Q9UKK3 WWOX-202ENST00000402655 1594 ntTSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
PARP4Q9UKK3 PRMT1-201ENST00000391851 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
PARP4Q9UKK3 KRT83-201ENST00000293670 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.75
PARP4Q9UKK3 PCED1A-202ENST00000360652 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.75
PARP4Q9UKK3 KHDRBS2-201ENST00000281156 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.75
PARP4Q9UKK3 GGT1-205ENST00000403838 1033 ntTSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
PARP4Q9UKK3 DAP-202ENST00000432074 1048 ntTSL 2 BASIC25.95■■□□□ 1.74
PARP4Q9UKK3 OSCAR-208ENST00000611261 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25.95■■□□□ 1.74
PARP4Q9UKK3 AC092338.2-201ENST00000568827 1415 ntBASIC25.94■■□□□ 1.74
PARP4Q9UKK3 CT47A1-201ENST00000433030 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
PARP4Q9UKK3 DUX4-205ENST00000570263 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
PARP4Q9UKK3 AC012313.10-201ENST00000623509 926 ntBASIC25.94■■□□□ 1.74
PARP4Q9UKK3 FARP2-223ENST00000627550 2122 ntTSL 2 BASIC25.94■■□□□ 1.74
PARP4Q9UKK3 HLA-A-209ENST00000638375 975 ntBASIC25.94■■□□□ 1.74
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.1 ms