Protein–RNA interactions for Protein: Q9UK58

CCNL1, Cyclin-L1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 526 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCNL1Q9UK58 CYB561-205ENST00000542042 1302 ntTSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
CCNL1Q9UK58 DGCR6L-201ENST00000248879 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
CCNL1Q9UK58 HLA-DRB1-201ENST00000360004 1229 ntAPPRIS P1 BASIC25.21■■□□□ 1.63
CCNL1Q9UK58 ZCCHC24-201ENST00000372333 906 ntTSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
CCNL1Q9UK58 AC004080.5-201ENST00000498652 368 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
CCNL1Q9UK58 REEP1-207ENST00000535845 1196 ntTSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
CCNL1Q9UK58 MIF4GD-205ENST00000578305 569 ntTSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
CCNL1Q9UK58 KCNIP4-206ENST00000447367 1641 ntTSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
CCNL1Q9UK58 CENPU-201ENST00000281453 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
CCNL1Q9UK58 ABLIM2-204ENST00000407564 2291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
CCNL1Q9UK58 UPF3A-201ENST00000351487 2235 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
CCNL1Q9UK58 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
CCNL1Q9UK58 CRACR2B-207ENST00000528542 1792 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
CCNL1Q9UK58 CPNE9-203ENST00000383832 2068 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
CCNL1Q9UK58 UNC119-201ENST00000301032 1653 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
CCNL1Q9UK58 DPP3P2-201ENST00000416030 1696 ntBASIC25.2■■□□□ 1.63
CCNL1Q9UK58 GUCA2B-201ENST00000372581 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
CCNL1Q9UK58 IMP3-202ENST00000403490 1237 ntAPPRIS P1 BASIC25.2■■□□□ 1.62
CCNL1Q9UK58 APBB3-216ENST00000511201 1014 ntTSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
CCNL1Q9UK58 AL353719.1-201ENST00000566847 864 ntBASIC25.2■■□□□ 1.62
CCNL1Q9UK58 AC140113.3-201ENST00000605663 199 ntBASIC25.2■■□□□ 1.62
CCNL1Q9UK58 NDUFV2-AS1-203ENST00000608008 779 ntBASIC25.2■■□□□ 1.62
CCNL1Q9UK58 AC009477.2-201ENST00000635976 171 ntAPPRIS P1 BASIC25.2■■□□□ 1.62
CCNL1Q9UK58 FICD-201ENST00000361549 1816 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
CCNL1Q9UK58 MYBL1-204ENST00000522677 5192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
CCNL1Q9UK58 MAGI2-217ENST00000629359 6704 ntTSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
CCNL1Q9UK58 TMEM230-207ENST00000379286 1735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
CCNL1Q9UK58 DBX1-201ENST00000524983 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
CCNL1Q9UK58 FAM228A-201ENST00000295150 1774 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
CCNL1Q9UK58 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
CCNL1Q9UK58 BOLA2B-201ENST00000305321 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
CCNL1Q9UK58 BOLA2-201ENST00000330978 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
CCNL1Q9UK58 TRPT1-203ENST00000394547 865 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
CCNL1Q9UK58 TMEM243-203ENST00000433078 1273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
CCNL1Q9UK58 RNF144A-AS1-204ENST00000437589 618 ntTSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
CCNL1Q9UK58 AC106771.1-201ENST00000502209 372 ntTSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
CCNL1Q9UK58 TMEM218-206ENST00000527766 812 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.19■■□□□ 1.62
CCNL1Q9UK58 AL512604.3-201ENST00000569583 964 ntBASIC25.19■■□□□ 1.62
CCNL1Q9UK58 AC069148.1-201ENST00000608741 768 ntBASIC25.19■■□□□ 1.62
CCNL1Q9UK58 TXNDC12-205ENST00000610127 806 ntTSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
CCNL1Q9UK58 MMP17-201ENST00000360564 2411 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
CCNL1Q9UK58 HMBS-214ENST00000542729 1469 ntTSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
CCNL1Q9UK58 BCAP29-202ENST00000379117 1946 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
CCNL1Q9UK58 TBL1Y-202ENST00000355162 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
CCNL1Q9UK58 ACTR3B-203ENST00000397282 1692 ntTSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
CCNL1Q9UK58 TTC9-201ENST00000256367 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
CCNL1Q9UK58 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC25.18■■□□□ 1.62
CCNL1Q9UK58 AKIRIN1-201ENST00000372984 1330 ntTSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
CCNL1Q9UK58 CAMK2B-207ENST00000358707 1895 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
CCNL1Q9UK58 VRK2-207ENST00000440705 1676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
CCNL1Q9UK58 CT47A1-201ENST00000433030 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
CCNL1Q9UK58 AC008771.1-201ENST00000508000 1151 ntTSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
CCNL1Q9UK58 CD81-212ENST00000526072 1172 ntTSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
CCNL1Q9UK58 TMEM135-209ENST00000532959 1149 ntTSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
CCNL1Q9UK58 UBA52-210ENST00000598780 668 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.18■■□□□ 1.62
CCNL1Q9UK58 COL8A2-203ENST00000481785 2036 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
CCNL1Q9UK58 PTGER3-202ENST00000351052 1404 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
CCNL1Q9UK58 CRADD-202ENST00000542893 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
CCNL1Q9UK58 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
CCNL1Q9UK58 AL161756.1-202ENST00000359491 1717 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
CCNL1Q9UK58 MRPL54-201ENST00000330133 626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
CCNL1Q9UK58 NMRK1-202ENST00000376808 1121 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
CCNL1Q9UK58 AANAT-202ENST00000392492 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
CCNL1Q9UK58 DAP-202ENST00000432074 1048 ntTSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
CCNL1Q9UK58 KRT18P38-201ENST00000449496 1282 ntBASIC25.17■■□□□ 1.62
CCNL1Q9UK58 MRPL2-208ENST00000489623 570 ntTSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
CCNL1Q9UK58 Z85996.1-201ENST00000494644 937 ntBASIC25.17■■□□□ 1.62
CCNL1Q9UK58 GCHFR-202ENST00000558467 785 ntTSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
CCNL1Q9UK58 BIRC5-207ENST00000590449 568 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
CCNL1Q9UK58 CCDC106-206ENST00000591241 1153 ntTSL 3 BASIC25.17■■□□□ 1.62
CCNL1Q9UK58 SUSD3-205ENST00000617293 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.17■■□□□ 1.62
CCNL1Q9UK58 CLN3-205ENST00000359984 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
CCNL1Q9UK58 LGALS9C-209ENST00000581545 1378 ntTSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
CCNL1Q9UK58 BZW1-202ENST00000409226 2455 ntTSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
CCNL1Q9UK58 DYRK1B-204ENST00000593685 2724 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
CCNL1Q9UK58 INPP1-202ENST00000392329 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
CCNL1Q9UK58 PDLIM7-205ENST00000393551 1226 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
CCNL1Q9UK58 AL445685.1-201ENST00000425802 762 ntTSL 3 BASIC25.16■■□□□ 1.62
CCNL1Q9UK58 PRSS44-201ENST00000515154 1146 ntBASIC25.16■■□□□ 1.62
CCNL1Q9UK58 PTK2-216ENST00000519881 863 ntTSL 3 BASIC25.16■■□□□ 1.62
CCNL1Q9UK58 GRP-204ENST00000529320 824 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
CCNL1Q9UK58 KXD1-203ENST00000540691 1592 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.16■■□□□ 1.62
CCNL1Q9UK58 SYT7-208ENST00000542670 1887 ntTSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
CCNL1Q9UK58 NDUFB10-202ENST00000543683 830 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
CCNL1Q9UK58 DHRS2-210ENST00000611765 1287 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
CCNL1Q9UK58 AC008622.2-201ENST00000617006 1229 ntBASIC25.16■■□□□ 1.62
CCNL1Q9UK58 THOC3-212ENST00000628318 1442 ntTSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
CCNL1Q9UK58 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
CCNL1Q9UK58 JUNB-201ENST00000302754 1820 ntAPPRIS P1 BASIC25.16■■□□□ 1.62
CCNL1Q9UK58 WASH6P-203ENST00000460206 1826 ntTSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
CCNL1Q9UK58 CALHM3-201ENST00000369783 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
CCNL1Q9UK58 UBE2B-201ENST00000265339 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
CCNL1Q9UK58 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
CCNL1Q9UK58 AL137002.2-201ENST00000639766 2238 ntTSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
CCNL1Q9UK58 ESX1-201ENST00000372588 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
CCNL1Q9UK58 GJA8-201ENST00000369235 1302 ntAPPRIS P1 BASIC25.15■■□□□ 1.62
CCNL1Q9UK58 MPST-202ENST00000397225 2116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
CCNL1Q9UK58 LSR-203ENST00000360798 1963 ntTSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
CCNL1Q9UK58 PSMD6-201ENST00000295901 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
CCNL1Q9UK58 RBFA-202ENST00000306735 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 79 ms