Protein–RNA interactions for Protein: Q9UIW0

VAX2, Ventral anterior homeobox 2, humanhuman

Predictions only

Length 290 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VAX2Q9UIW0 SEPT5-210ENST00000455784 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
VAX2Q9UIW0 SMPD3-203ENST00000563226 2093 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
VAX2Q9UIW0 MRPL37-202ENST00000360840 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
VAX2Q9UIW0 C10orf95-201ENST00000625129 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
VAX2Q9UIW0 FAM83E-201ENST00000263266 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
VAX2Q9UIW0 ODC1-202ENST00000405333 1943 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
VAX2Q9UIW0 PLEKHB2-204ENST00000409158 2277 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
VAX2Q9UIW0 GLT8D1-213ENST00000491606 1577 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
VAX2Q9UIW0 TM9SF1-203ENST00000524835 1938 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
VAX2Q9UIW0 FAM217A-208ENST00000639338 1929 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
VAX2Q9UIW0 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
VAX2Q9UIW0 ARID3A-201ENST00000263620 5941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
VAX2Q9UIW0 ITGB7-209ENST00000550743 2138 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
VAX2Q9UIW0 MAPKAP1-205ENST00000373503 3045 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
VAX2Q9UIW0 KRT8P36-201ENST00000489121 1440 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
VAX2Q9UIW0 ZNF419-207ENST00000442920 1857 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
VAX2Q9UIW0 ADGRG2-208ENST00000379873 4698 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
VAX2Q9UIW0 ZNF710-201ENST00000268154 4617 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
VAX2Q9UIW0 EARS2-206ENST00000563232 1709 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
VAX2Q9UIW0 ZNF821-211ENST00000564134 1748 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
VAX2Q9UIW0 PRMT2-204ENST00000397628 954 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
VAX2Q9UIW0 WDR86-AS1-204ENST00000489632 751 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
VAX2Q9UIW0 AC053503.5-201ENST00000601508 636 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
VAX2Q9UIW0 Z98883.1-202ENST00000635107 1289 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
VAX2Q9UIW0 FOXD4L1-201ENST00000306507 2491 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
VAX2Q9UIW0 HNRNPD-201ENST00000313899 3033 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
VAX2Q9UIW0 SUGCT-202ENST00000401647 1369 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
VAX2Q9UIW0 PDP1-208ENST00000520728 2554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
VAX2Q9UIW0 SEC22C-207ENST00000423701 1458 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
VAX2Q9UIW0 CCDC120-204ENST00000597275 2752 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
VAX2Q9UIW0 DEF8-211ENST00000563795 1767 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
VAX2Q9UIW0 KIF21B-203ENST00000422435 5519 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
VAX2Q9UIW0 C3orf33-201ENST00000340171 1884 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
VAX2Q9UIW0 IL10RB-201ENST00000290200 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
VAX2Q9UIW0 L2HGDH-203ENST00000421284 1958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
VAX2Q9UIW0 TEPSIN-201ENST00000300714 2287 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
VAX2Q9UIW0 THAP12-201ENST00000260045 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
VAX2Q9UIW0 DOK7-201ENST00000340083 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
VAX2Q9UIW0 DOK7-203ENST00000507039 2551 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
VAX2Q9UIW0 NOC4L-201ENST00000330579 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
VAX2Q9UIW0 TBX18-202ENST00000369663 6245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
VAX2Q9UIW0 CA11-201ENST00000084798 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
VAX2Q9UIW0 KDM1A-202ENST00000400181 3059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
VAX2Q9UIW0 ARPIN-202ENST00000460685 2145 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
VAX2Q9UIW0 KLF3-201ENST00000261438 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
VAX2Q9UIW0 ZYG11A-203ENST00000612017 3682 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
VAX2Q9UIW0 CCNJ-202ENST00000403870 2830 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
VAX2Q9UIW0 B3GNT9-201ENST00000449549 2917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
VAX2Q9UIW0 HBM-201ENST00000356815 506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
VAX2Q9UIW0 HES6-206ENST00000409574 738 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
VAX2Q9UIW0 SLC47A1P1-202ENST00000449666 945 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
VAX2Q9UIW0 APOC3-205ENST00000630701 541 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
VAX2Q9UIW0 NEURL3-202ENST00000435380 1675 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
VAX2Q9UIW0 TUBA3FP-202ENST00000422086 1974 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
VAX2Q9UIW0 ZNF394-201ENST00000337673 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
VAX2Q9UIW0 PDLIM3-201ENST00000284767 2589 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
VAX2Q9UIW0 PJA1-202ENST00000374571 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
VAX2Q9UIW0 MAP6-201ENST00000304771 3334 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
VAX2Q9UIW0 UBE2D2-202ENST00000398733 2702 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
VAX2Q9UIW0 USP49-202ENST00000373010 2446 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
VAX2Q9UIW0 HNF1A-202ENST00000400024 2337 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
VAX2Q9UIW0 NFATC4-220ENST00000555393 2235 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
VAX2Q9UIW0 ZNF446-203ENST00000594369 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
VAX2Q9UIW0 MARK4-210ENST00000620044 2105 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
VAX2Q9UIW0 LSM4-203ENST00000593829 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
VAX2Q9UIW0 ATP6V1D-201ENST00000216442 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
VAX2Q9UIW0 CHKB-201ENST00000406938 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
VAX2Q9UIW0 PPP1R18-201ENST00000274853 4599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
VAX2Q9UIW0 SLC25A41-201ENST00000321510 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
VAX2Q9UIW0 PPP1R18-205ENST00000615527 4597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
VAX2Q9UIW0 DLK1-202ENST00000341267 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
VAX2Q9UIW0 LLGL2-203ENST00000392550 3509 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
VAX2Q9UIW0 SLC25A20-201ENST00000319017 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
VAX2Q9UIW0 AC116050.2-201ENST00000612102 1779 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
VAX2Q9UIW0 NPTX2-201ENST00000265634 2700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
VAX2Q9UIW0 PGRMC2-208ENST00000613358 3783 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
VAX2Q9UIW0 BRI3BP-201ENST00000341446 6648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
VAX2Q9UIW0 NEURL3-204ENST00000451794 1461 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
VAX2Q9UIW0 FPGS-202ENST00000373228 1383 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
VAX2Q9UIW0 PIK3R2-201ENST00000222254 4033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
VAX2Q9UIW0 SPNS3-201ENST00000355530 2133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
VAX2Q9UIW0 AK3-203ENST00000447596 705 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
VAX2Q9UIW0 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
VAX2Q9UIW0 AEBP2-201ENST00000266508 3620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
VAX2Q9UIW0 XKR8-201ENST00000373884 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
VAX2Q9UIW0 PHKA2-201ENST00000379942 5559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
VAX2Q9UIW0 ATRIP-201ENST00000320211 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
VAX2Q9UIW0 FICD-201ENST00000361549 1816 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
VAX2Q9UIW0 SEMA3C-201ENST00000265361 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
VAX2Q9UIW0 ELAC2-202ENST00000395962 2924 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
VAX2Q9UIW0 H2AFX-202ENST00000530167 1614 ntAPPRIS P1 BASIC15.42■□□□□ 0.06
VAX2Q9UIW0 ADGRG2-209ENST00000379876 4779 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
VAX2Q9UIW0 NOXO1-202ENST00000356120 1539 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
VAX2Q9UIW0 ATF5-201ENST00000423777 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
VAX2Q9UIW0 LANCL3-201ENST00000378619 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
VAX2Q9UIW0 IVNS1ABP-202ENST00000367498 4199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
VAX2Q9UIW0 NAPRT-203ENST00000435154 1877 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
VAX2Q9UIW0 SYT7-208ENST00000542670 1887 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
VAX2Q9UIW0 HTR7P1-202ENST00000624664 4411 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
VAX2Q9UIW0 PRDM14-201ENST00000276594 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.1 ms