Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBF2

COPG2, Coatomer subunit gamma-2, humanhuman

Predictions only

Length 871 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COPG2Q9UBF2 MRPL40-201ENST00000333130 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
COPG2Q9UBF2 TOR2A-201ENST00000336067 1370 ntTSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
COPG2Q9UBF2 NAGPA-AS1-202ENST00000632058 2265 ntTSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
COPG2Q9UBF2 LYSMD4-202ENST00000344791 2885 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
COPG2Q9UBF2 RETREG2-203ENST00000430297 4618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
COPG2Q9UBF2 EPS8L2-230ENST00000610855 1633 ntTSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
COPG2Q9UBF2 UCHL5-204ENST00000367451 1346 ntTSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
COPG2Q9UBF2 RASSF1-202ENST00000357043 1864 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
COPG2Q9UBF2 TREX2-206ENST00000370232 1864 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
COPG2Q9UBF2 NTSR2-201ENST00000306928 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
COPG2Q9UBF2 SEPT6-202ENST00000354228 1576 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
COPG2Q9UBF2 DUT-201ENST00000331200 2147 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
COPG2Q9UBF2 PRSS3-202ENST00000361005 966 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
COPG2Q9UBF2 GPC5-201ENST00000377067 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
COPG2Q9UBF2 MAP2K4P1-201ENST00000438453 1195 ntBASIC19.59■□□□□ 0.73
COPG2Q9UBF2 ZNF696-204ENST00000520333 605 ntTSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
COPG2Q9UBF2 AC080023.1-201ENST00000526906 803 ntTSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
COPG2Q9UBF2 AC012313.6-201ENST00000599889 790 ntTSL 3 BASIC19.59■□□□□ 0.73
COPG2Q9UBF2 MAZ-216ENST00000616501 991 ntTSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
COPG2Q9UBF2 AL161421.1-201ENST00000619666 1101 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
COPG2Q9UBF2 OR10C1-204ENST00000622521 1039 ntBASIC19.59■□□□□ 0.73
COPG2Q9UBF2 AC093762.2-201ENST00000641700 291 ntAPPRIS P1 BASIC19.59■□□□□ 0.73
COPG2Q9UBF2 FOXL2-201ENST00000330315 2917 ntAPPRIS P1 BASIC19.59■□□□□ 0.73
COPG2Q9UBF2 CDHR5-201ENST00000349570 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
COPG2Q9UBF2 TBC1D10A-204ENST00000403477 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
COPG2Q9UBF2 MARK1-205ENST00000611084 5321 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
COPG2Q9UBF2 KRT16P6-202ENST00000425692 1426 ntBASIC19.59■□□□□ 0.73
COPG2Q9UBF2 MED26-207ENST00000611692 1444 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
COPG2Q9UBF2 CD55-203ENST00000367063 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
COPG2Q9UBF2 SLC27A3-214ENST00000624995 2413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
COPG2Q9UBF2 ARHGEF18-202ENST00000359920 5733 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.73
COPG2Q9UBF2 FLT1-207ENST00000615840 6453 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
COPG2Q9UBF2 APAF1-210ENST00000551964 5444 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
COPG2Q9UBF2 PRMT2-206ENST00000397638 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
COPG2Q9UBF2 FENDRR-203ENST00000595886 3095 ntTSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.73
COPG2Q9UBF2 PLPBP-201ENST00000328195 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
COPG2Q9UBF2 KCNA3-201ENST00000369769 2569 ntAPPRIS P1 BASIC19.58■□□□□ 0.73
COPG2Q9UBF2 DUSP18-205ENST00000404885 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
COPG2Q9UBF2 CD58-203ENST00000457047 1328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
COPG2Q9UBF2 FAM160A2-201ENST00000265978 3481 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
COPG2Q9UBF2 RPLP0-201ENST00000228306 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
COPG2Q9UBF2 HMX1-202ENST00000506970 651 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
COPG2Q9UBF2 ARHGAP8-204ENST00000389774 1725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.72
COPG2Q9UBF2 FUZ-212ENST00000528094 1479 ntTSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.72
COPG2Q9UBF2 DIO3-201ENST00000510508 2102 ntAPPRIS P1 BASIC19.58■□□□□ 0.72
COPG2Q9UBF2 WT1-205ENST00000452863 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
COPG2Q9UBF2 PCDHA4-201ENST00000378125 2328 ntTSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.72
COPG2Q9UBF2 LIPG-203ENST00000577628 2323 ntTSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.72
COPG2Q9UBF2 HS3ST3A1-201ENST00000284110 2527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
COPG2Q9UBF2 KIF22-203ENST00000561482 2505 ntTSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.72
COPG2Q9UBF2 CPXM2-204ENST00000615851 2512 ntTSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.72
COPG2Q9UBF2 BRAF-201ENST00000288602 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
COPG2Q9UBF2 KRT19-201ENST00000361566 1390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
COPG2Q9UBF2 MAPK9-208ENST00000455781 4336 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
COPG2Q9UBF2 ANXA8L1-201ENST00000584982 2174 ntTSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
COPG2Q9UBF2 ALKBH7-201ENST00000245812 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
COPG2Q9UBF2 RGS3-232ENST00000620489 1503 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
COPG2Q9UBF2 ZDHHC18-202ENST00000374142 5020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
COPG2Q9UBF2 LIMS2-204ENST00000409286 1678 ntTSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
COPG2Q9UBF2 P2RY6-210ENST00000542092 1674 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
COPG2Q9UBF2 HIST1H2AM-201ENST00000359611 393 ntAPPRIS P1 BASIC19.57■□□□□ 0.72
COPG2Q9UBF2 PIGP-203ENST00000399098 972 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
COPG2Q9UBF2 AL512625.2-201ENST00000417533 625 ntBASIC19.57■□□□□ 0.72
COPG2Q9UBF2 AC069236.1-201ENST00000604339 616 ntBASIC19.57■□□□□ 0.72
COPG2Q9UBF2 AL031963.3-201ENST00000606441 850 ntBASIC19.57■□□□□ 0.72
COPG2Q9UBF2 SRRM3-204ENST00000611745 3612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
COPG2Q9UBF2 CADPS-201ENST00000283269 4591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
COPG2Q9UBF2 LYSMD4-210ENST00000545021 2431 ntTSL 4 BASIC19.57■□□□□ 0.72
COPG2Q9UBF2 OGG1-204ENST00000339511 1815 ntTSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
COPG2Q9UBF2 GPRC5C-204ENST00000392629 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
COPG2Q9UBF2 PCDHB14-202ENST00000624896 2367 ntTSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
COPG2Q9UBF2 AL032819.2-201ENST00000624543 2162 ntBASIC19.57■□□□□ 0.72
COPG2Q9UBF2 ILDR2-203ENST00000469934 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
COPG2Q9UBF2 KCNH2-202ENST00000330883 3267 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
COPG2Q9UBF2 AP001271.2-201ENST00000624018 1556 ntBASIC19.57■□□□□ 0.72
COPG2Q9UBF2 GRTP1-203ENST00000375431 1384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
COPG2Q9UBF2 ORAI2-204ENST00000473939 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
COPG2Q9UBF2 IKBKG-214ENST00000618670 2069 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
COPG2Q9UBF2 LEMD2-201ENST00000293760 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
COPG2Q9UBF2 SEPT2-203ENST00000391971 3315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
COPG2Q9UBF2 CDC123-201ENST00000281141 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
COPG2Q9UBF2 NEURL3-202ENST00000435380 1675 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
COPG2Q9UBF2 KRT18-207ENST00000550600 1696 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
COPG2Q9UBF2 AHRR-204ENST00000506456 2350 ntTSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
COPG2Q9UBF2 SCARF2-203ENST00000623402 3248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
COPG2Q9UBF2 CA11-201ENST00000084798 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
COPG2Q9UBF2 CDK6-202ENST00000424848 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
COPG2Q9UBF2 LEF1-203ENST00000438313 1488 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
COPG2Q9UBF2 RIMBP3-201ENST00000619918 6105 ntAPPRIS P1 BASIC19.56■□□□□ 0.72
COPG2Q9UBF2 BLACE-201ENST00000378120 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
COPG2Q9UBF2 OIP5-201ENST00000220514 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
COPG2Q9UBF2 EIF3B-202ENST00000397011 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
COPG2Q9UBF2 PSMB11-201ENST00000408907 2110 ntAPPRIS P1 BASIC19.56■□□□□ 0.72
COPG2Q9UBF2 FTCDNL1-202ENST00000420128 1021 ntTSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
COPG2Q9UBF2 AC084032.1-201ENST00000552324 578 ntTSL 4 BASIC19.56■□□□□ 0.72
COPG2Q9UBF2 AC106738.2-202ENST00000558156 533 ntTSL 4 BASIC19.56■□□□□ 0.72
COPG2Q9UBF2 LOXL1-AS1-208ENST00000565756 885 ntTSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
COPG2Q9UBF2 AC133552.2-202ENST00000575694 574 ntBASIC19.56■□□□□ 0.72
COPG2Q9UBF2 PTGIR-205ENST00000597185 775 ntTSL 3 BASIC19.56■□□□□ 0.72
COPG2Q9UBF2 AC005181.1-201ENST00000604782 1256 ntBASIC19.56■□□□□ 0.72
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18 ms