Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBB9

TFIP11, Tuftelin-interacting protein 11, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 837 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TFIP11Q9UBB9 FAM72A-203ENST00000367129 676 ntTSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
TFIP11Q9UBB9 FAM72A-205ENST00000468509 629 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
TFIP11Q9UBB9 AL589743.5-201ENST00000616611 1050 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
TFIP11Q9UBB9 AC000035.1-201ENST00000634116 343 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
TFIP11Q9UBB9 POU5F1-209ENST00000638788 369 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
TFIP11Q9UBB9 CDH22-201ENST00000372262 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
TFIP11Q9UBB9 CTBP2-202ENST00000334808 2130 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
TFIP11Q9UBB9 AKNA-205ENST00000374079 2138 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
TFIP11Q9UBB9 THTPA-202ENST00000404535 1779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
TFIP11Q9UBB9 DHRS3-204ENST00000616661 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
TFIP11Q9UBB9 SLC36A1-209ENST00000521925 1621 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
TFIP11Q9UBB9 PHGDH-210ENST00000641115 1638 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
TFIP11Q9UBB9 CD58-203ENST00000457047 1328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
TFIP11Q9UBB9 MOB2-201ENST00000329957 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
TFIP11Q9UBB9 CTNNAL1-202ENST00000374593 761 ntTSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
TFIP11Q9UBB9 PGPEP1L-201ENST00000378919 995 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
TFIP11Q9UBB9 CLDN3-201ENST00000395145 1274 ntAPPRIS P1 BASIC22.68■■□□□ 1.22
TFIP11Q9UBB9 ZNF263-205ENST00000574253 1139 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
TFIP11Q9UBB9 AC024267.6-201ENST00000580603 583 ntTSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
TFIP11Q9UBB9 TNXA-203ENST00000507684 2038 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
TFIP11Q9UBB9 GPR146-201ENST00000397095 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
TFIP11Q9UBB9 CLDN14-202ENST00000399135 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
TFIP11Q9UBB9 P2RY6-212ENST00000618468 2431 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
TFIP11Q9UBB9 LDHAL6A-202ENST00000396213 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
TFIP11Q9UBB9 CDK13-202ENST00000340829 5066 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
TFIP11Q9UBB9 NPAS1-207ENST00000602189 1643 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
TFIP11Q9UBB9 HOXC4-201ENST00000303406 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
TFIP11Q9UBB9 RNF38-202ENST00000350199 5104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
TFIP11Q9UBB9 SPSB1-201ENST00000328089 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
TFIP11Q9UBB9 ARHGAP27-201ENST00000290470 1376 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
TFIP11Q9UBB9 ATPIF1-202ENST00000465645 1855 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
TFIP11Q9UBB9 TMEM53-202ENST00000372237 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
TFIP11Q9UBB9 MZB1-201ENST00000302125 825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
TFIP11Q9UBB9 C19orf81-201ENST00000425202 765 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
TFIP11Q9UBB9 LINC01117-201ENST00000443670 699 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
TFIP11Q9UBB9 AC005181.1-201ENST00000604782 1256 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
TFIP11Q9UBB9 P2RY2-201ENST00000311131 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
TFIP11Q9UBB9 RAI14-201ENST00000265109 5092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
TFIP11Q9UBB9 ALDOA-212ENST00000564546 2104 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
TFIP11Q9UBB9 CDKN1C-203ENST00000430149 1570 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
TFIP11Q9UBB9 FA2H-201ENST00000219368 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
TFIP11Q9UBB9 LZTS3-201ENST00000329152 5257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
TFIP11Q9UBB9 TSSC4-207ENST00000451491 1423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
TFIP11Q9UBB9 FAM206A-201ENST00000322940 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
TFIP11Q9UBB9 AC233280.1-201ENST00000423600 1684 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
TFIP11Q9UBB9 NEURL3-202ENST00000435380 1675 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
TFIP11Q9UBB9 PCMT1-201ENST00000367378 1293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
TFIP11Q9UBB9 VSX1-201ENST00000376707 943 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
TFIP11Q9UBB9 AL512625.2-201ENST00000417533 625 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
TFIP11Q9UBB9 AC023632.3-201ENST00000521633 145 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
TFIP11Q9UBB9 ANAPC11-208ENST00000572851 686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
TFIP11Q9UBB9 ZNF346-209ENST00000512315 1575 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
TFIP11Q9UBB9 IKBKG-207ENST00000611071 2103 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
TFIP11Q9UBB9 CRACR2B-207ENST00000528542 1792 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
TFIP11Q9UBB9 ZDHHC3-205ENST00000424952 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
TFIP11Q9UBB9 ZDHHC16-202ENST00000352634 1718 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
TFIP11Q9UBB9 LIMS2-204ENST00000409286 1678 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
TFIP11Q9UBB9 KIF22-203ENST00000561482 2505 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
TFIP11Q9UBB9 SAMD11-211ENST00000616125 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
TFIP11Q9UBB9 ALKBH7-201ENST00000245812 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
TFIP11Q9UBB9 DIP2A-203ENST00000435722 2760 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
TFIP11Q9UBB9 SLC34A3-202ENST00000538474 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
TFIP11Q9UBB9 GPC5-201ENST00000377067 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
TFIP11Q9UBB9 VSX1-206ENST00000444511 1197 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
TFIP11Q9UBB9 MFSD14C-203ENST00000602917 786 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
TFIP11Q9UBB9 MDK-213ENST00000617138 635 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
TFIP11Q9UBB9 PTCD3-220ENST00000627371 210 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
TFIP11Q9UBB9 AL032819.3-201ENST00000640283 925 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
TFIP11Q9UBB9 MCC-208ENST00000514701 2855 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
TFIP11Q9UBB9 LHX8-202ENST00000356261 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
TFIP11Q9UBB9 SSBP2-218ENST00000514493 1790 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
TFIP11Q9UBB9 MIF-AS1-201ENST00000406213 1476 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
TFIP11Q9UBB9 CYB561-204ENST00000448884 1496 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
TFIP11Q9UBB9 ARHGAP22-210ENST00000477708 1951 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
TFIP11Q9UBB9 FAM212B-203ENST00000444059 1423 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
TFIP11Q9UBB9 PFKFB3-204ENST00000379785 2181 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
TFIP11Q9UBB9 LAMP1-201ENST00000332556 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
TFIP11Q9UBB9 SLC22A17-211ENST00000637426 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
TFIP11Q9UBB9 NXN-202ENST00000537628 1340 ntTSL 3 BASIC22.64■■□□□ 1.22
TFIP11Q9UBB9 NAGPA-AS1-202ENST00000632058 2265 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.22
TFIP11Q9UBB9 FOXD4-201ENST00000382500 1974 ntAPPRIS P1 BASIC22.64■■□□□ 1.21
TFIP11Q9UBB9 NEDD8-201ENST00000250495 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
TFIP11Q9UBB9 LYRM1-205ENST00000562740 931 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
TFIP11Q9UBB9 CIRBP-211ENST00000586773 942 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
TFIP11Q9UBB9 IKBKGP1-201ENST00000612193 1073 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
TFIP11Q9UBB9 ENTPD8-204ENST00000472938 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
TFIP11Q9UBB9 TBXA2R-202ENST00000411851 1494 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
TFIP11Q9UBB9 DUT-202ENST00000455976 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
TFIP11Q9UBB9 USP48-201ENST00000308271 4595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
TFIP11Q9UBB9 ISLR2-202ENST00000419208 2306 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
TFIP11Q9UBB9 RASSF1-202ENST00000357043 1864 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
TFIP11Q9UBB9 FAM170B-201ENST00000311787 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
TFIP11Q9UBB9 PQLC2-202ENST00000375155 1805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
TFIP11Q9UBB9 PTBP1-220ENST00000627714 2201 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
TFIP11Q9UBB9 SPIRE2-201ENST00000378247 3235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
TFIP11Q9UBB9 SNAP47-202ENST00000366759 2362 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
TFIP11Q9UBB9 TOR2A-203ENST00000373284 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
TFIP11Q9UBB9 CFP-201ENST00000247153 1713 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
TFIP11Q9UBB9 TMSB4X-203ENST00000380636 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
TFIP11Q9UBB9 AC069544.2-201ENST00000640019 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.1 ms