Protein–RNA interactions for Protein: Q9P2K6

KLHL42, Kelch-like protein 42, humanhuman

Predictions only

Length 505 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KLHL42Q9P2K6 CCSAP-203ENST00000366687 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
KLHL42Q9P2K6 MAG-203ENST00000537831 2341 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
KLHL42Q9P2K6 WNT10A-201ENST00000258411 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
KLHL42Q9P2K6 NRXN2-205ENST00000409571 6381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
KLHL42Q9P2K6 TMSB4X-203ENST00000380636 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
KLHL42Q9P2K6 NBL1-209ENST00000548815 1953 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC19.28■□□□□ 0.68
KLHL42Q9P2K6 RUNX3-202ENST00000338888 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
KLHL42Q9P2K6 TMEM189-201ENST00000371650 2222 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
KLHL42Q9P2K6 PQLC2-202ENST00000375155 1805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
KLHL42Q9P2K6 PSMD6-201ENST00000295901 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
KLHL42Q9P2K6 HAUS4-204ENST00000490506 1447 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
KLHL42Q9P2K6 NFS1-214ENST00000541387 1436 ntTSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
KLHL42Q9P2K6 CCAR2-214ENST00000613179 1421 ntTSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
KLHL42Q9P2K6 NME1-207ENST00000480143 964 ntTSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
KLHL42Q9P2K6 KRT18P6-201ENST00000555540 1265 ntBASIC19.28■□□□□ 0.68
KLHL42Q9P2K6 C14orf28-204ENST00000557112 1097 ntTSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
KLHL42Q9P2K6 MAZ-215ENST00000569978 567 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
KLHL42Q9P2K6 AC008403.3-201ENST00000598924 454 ntBASIC19.28■□□□□ 0.68
KLHL42Q9P2K6 GTF2IRD2B-206ENST00000614064 573 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
KLHL42Q9P2K6 ESR2-212ENST00000556275 2695 ntTSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
KLHL42Q9P2K6 FMR1-201ENST00000218200 4333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
KLHL42Q9P2K6 ART5-203ENST00000397068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
KLHL42Q9P2K6 AP006587.1-201ENST00000534129 1502 ntBASIC19.28■□□□□ 0.68
KLHL42Q9P2K6 NEU4-205ENST00000407683 2273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
KLHL42Q9P2K6 VEGFB-201ENST00000309422 1380 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
KLHL42Q9P2K6 HDAC1-201ENST00000373548 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
KLHL42Q9P2K6 AKAP8L-201ENST00000397410 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
KLHL42Q9P2K6 PLEKHH3-201ENST00000293349 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
KLHL42Q9P2K6 RABEPK-204ENST00000394125 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
KLHL42Q9P2K6 HEMK1-206ENST00000455834 1499 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
KLHL42Q9P2K6 NDUFV3-202ENST00000354250 1575 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
KLHL42Q9P2K6 ANXA8-208ENST00000611843 2174 ntTSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
KLHL42Q9P2K6 ETFA-202ENST00000433983 1346 ntTSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
KLHL42Q9P2K6 MSANTD1-203ENST00000507492 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
KLHL42Q9P2K6 MPV17L2-204ENST00000599612 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
KLHL42Q9P2K6 DBN1-210ENST00000512501 1878 ntTSL 3 BASIC19.27■□□□□ 0.68
KLHL42Q9P2K6 C11orf49-201ENST00000278460 1645 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
KLHL42Q9P2K6 C10orf91-201ENST00000321248 1257 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
KLHL42Q9P2K6 DUSP23-201ENST00000368107 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
KLHL42Q9P2K6 AC022509.3-202ENST00000545819 566 ntTSL 3 BASIC19.27■□□□□ 0.68
KLHL42Q9P2K6 AC127496.6-201ENST00000576215 338 ntTSL 3 BASIC19.27■□□□□ 0.68
KLHL42Q9P2K6 MAGIX-206ENST00000615626 1057 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
KLHL42Q9P2K6 AC005225.2-202ENST00000617980 408 ntTSL 4 BASIC19.27■□□□□ 0.68
KLHL42Q9P2K6 LHX6-201ENST00000340587 3457 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
KLHL42Q9P2K6 IRX5-202ENST00000394636 2401 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC19.27■□□□□ 0.68
KLHL42Q9P2K6 PDZRN4-202ENST00000402685 3347 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
KLHL42Q9P2K6 GALNT10-202ENST00000377661 3778 ntTSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
KLHL42Q9P2K6 ST3GAL4-217ENST00000534083 1919 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.67
KLHL42Q9P2K6 MRPL2-202ENST00000388752 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
KLHL42Q9P2K6 CDCA4-201ENST00000336219 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
KLHL42Q9P2K6 MAGED2-203ENST00000375053 2066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
KLHL42Q9P2K6 FAM129C-208ENST00000599164 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
KLHL42Q9P2K6 GPR139-202ENST00000570682 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
KLHL42Q9P2K6 FAM3A-215ENST00000447601 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
KLHL42Q9P2K6 ZDHHC14-203ENST00000359775 7380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
KLHL42Q9P2K6 ZBED3-201ENST00000255198 6172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
KLHL42Q9P2K6 ZDHHC12-202ENST00000372667 1187 ntTSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
KLHL42Q9P2K6 AC073316.3-201ENST00000437354 982 ntTSL 3 BASIC19.26■□□□□ 0.67
KLHL42Q9P2K6 GLT1D1-204ENST00000442111 2995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
KLHL42Q9P2K6 AC026366.1-201ENST00000488803 879 ntBASIC19.26■□□□□ 0.67
KLHL42Q9P2K6 AP003097.1-201ENST00000530657 1135 ntBASIC19.26■□□□□ 0.67
KLHL42Q9P2K6 PNN-205ENST00000556530 601 ntTSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
KLHL42Q9P2K6 ACADVL-203ENST00000356839 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
KLHL42Q9P2K6 SARDH-201ENST00000298628 1484 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
KLHL42Q9P2K6 MAP2K2-202ENST00000394867 1471 ntTSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
KLHL42Q9P2K6 PDLIM2-205ENST00000397761 1491 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
KLHL42Q9P2K6 SLC25A15-201ENST00000338625 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
KLHL42Q9P2K6 TSPAN3-210ENST00000561277 1592 ntTSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
KLHL42Q9P2K6 TBC1D10A-204ENST00000403477 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
KLHL42Q9P2K6 WIPF2-202ENST00000394103 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
KLHL42Q9P2K6 CNTNAP3B-202ENST00000341990 2666 ntTSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
KLHL42Q9P2K6 MARCH9-201ENST00000266643 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
KLHL42Q9P2K6 HOXC4-201ENST00000303406 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
KLHL42Q9P2K6 ZBTB7B-201ENST00000292176 2129 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
KLHL42Q9P2K6 AL158211.5-201ENST00000623583 2518 ntBASIC19.25■□□□□ 0.67
KLHL42Q9P2K6 SSBP3-216ENST00000610401 3168 ntTSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
KLHL42Q9P2K6 FLT1-204ENST00000541932 2969 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
KLHL42Q9P2K6 FAM19A4-201ENST00000295569 2292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
KLHL42Q9P2K6 RPS6KA2-201ENST00000265678 5824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
KLHL42Q9P2K6 GOLGA6L3-201ENST00000507199 1679 ntBASIC19.25■□□□□ 0.67
KLHL42Q9P2K6 BCS1L-201ENST00000359273 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
KLHL42Q9P2K6 HIGD1A-201ENST00000321331 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
KLHL42Q9P2K6 IPO13-201ENST00000372339 1201 ntTSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
KLHL42Q9P2K6 CD99-203ENST00000381184 918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
KLHL42Q9P2K6 FKBP2-202ENST00000394540 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
KLHL42Q9P2K6 MAGI2-AS3-202ENST00000422093 762 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
KLHL42Q9P2K6 ZNF529-AS1-202ENST00000475219 1033 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
KLHL42Q9P2K6 LEF1-AS1-203ENST00000507799 459 ntTSL 3 BASIC19.25■□□□□ 0.67
KLHL42Q9P2K6 RNA5SP413-201ENST00000516373 109 ntBASIC19.25■□□□□ 0.67
KLHL42Q9P2K6 SPI1-204ENST00000533968 1290 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
KLHL42Q9P2K6 ZNF580-203ENST00000545125 1025 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.25■□□□□ 0.67
KLHL42Q9P2K6 ZNF264-205ENST00000599653 705 ntTSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
KLHL42Q9P2K6 SLC35A3-218ENST00000639994 1114 ntTSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
KLHL42Q9P2K6 NKX3-2-201ENST00000382438 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
KLHL42Q9P2K6 S1PR5-201ENST00000333430 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
KLHL42Q9P2K6 AC008105.1-201ENST00000587534 2003 ntTSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
KLHL42Q9P2K6 DUT-202ENST00000455976 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
KLHL42Q9P2K6 NTMT1-210ENST00000613644 1501 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.25■□□□□ 0.67
KLHL42Q9P2K6 CCNO-201ENST00000282572 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
KLHL42Q9P2K6 STIM2-211ENST00000639195 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.7 ms