Protein–RNA interactions for Protein: Q9P0W2

HMG20B, SWI/SNF-related matrix-associated actin-dependent regulator of chromatin subfamily E member 1-related, humanhuman

Predictions only

Length 317 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HMG20BQ9P0W2 MGARP-201ENST00000398955 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
HMG20BQ9P0W2 STAU2-229ENST00000524300 3065 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
HMG20BQ9P0W2 SHKBP1-225ENST00000600733 2284 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
HMG20BQ9P0W2 KMT5B-204ENST00000402185 1881 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
HMG20BQ9P0W2 EXOC3L2-202ENST00000413988 2964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
HMG20BQ9P0W2 RNF224-201ENST00000445101 1798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.06■■□□□ 1.44
HMG20BQ9P0W2 TRMU-202ENST00000381019 1381 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
HMG20BQ9P0W2 SENP5-204ENST00000445299 2491 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
HMG20BQ9P0W2 GLT8D1-206ENST00000478968 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
HMG20BQ9P0W2 LIME1-201ENST00000309546 1178 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
HMG20BQ9P0W2 MCRIP1-201ENST00000455127 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
HMG20BQ9P0W2 CXCL2-202ENST00000508487 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
HMG20BQ9P0W2 CAPN5-206ENST00000531028 534 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
HMG20BQ9P0W2 AC015712.2-203ENST00000560461 688 ntTSL 3 BASIC24.06■■□□□ 1.44
HMG20BQ9P0W2 IMPA2-208ENST00000589238 923 ntTSL 3 BASIC24.06■■□□□ 1.44
HMG20BQ9P0W2 SYNGR4-202ENST00000595322 533 ntTSL 3 BASIC24.06■■□□□ 1.44
HMG20BQ9P0W2 AL135905.2-201ENST00000584934 1404 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
HMG20BQ9P0W2 PHOX2B-201ENST00000226382 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
HMG20BQ9P0W2 HTR7P1-201ENST00000538670 1336 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
HMG20BQ9P0W2 ACHE-204ENST00000412389 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
HMG20BQ9P0W2 IRF7-205ENST00000397574 1968 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
HMG20BQ9P0W2 ZNF852-201ENST00000436261 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
HMG20BQ9P0W2 COQ10A-201ENST00000308197 1652 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
HMG20BQ9P0W2 SUMF2-201ENST00000275607 1894 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
HMG20BQ9P0W2 AC110769.1-201ENST00000420161 815 ntTSL 3 BASIC24.05■■□□□ 1.44
HMG20BQ9P0W2 TSPY7P-201ENST00000431358 1114 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
HMG20BQ9P0W2 TSPY1-202ENST00000451548 1160 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
HMG20BQ9P0W2 AC007161.3-201ENST00000469183 637 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
HMG20BQ9P0W2 TNNT1-208ENST00000587465 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
HMG20BQ9P0W2 RPL23AP53-202ENST00000606507 370 ntTSL 3 BASIC24.05■■□□□ 1.44
HMG20BQ9P0W2 AC004706.3-201ENST00000634558 1009 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
HMG20BQ9P0W2 RTBDN-207ENST00000589272 2076 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
HMG20BQ9P0W2 CRACR2B-207ENST00000528542 1792 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
HMG20BQ9P0W2 PHGDH-210ENST00000641115 1638 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
HMG20BQ9P0W2 COMMD7-202ENST00000446419 1343 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
HMG20BQ9P0W2 C17orf58-201ENST00000334461 1535 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
HMG20BQ9P0W2 RGS3-232ENST00000620489 1503 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
HMG20BQ9P0W2 RGMA-208ENST00000556658 1889 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
HMG20BQ9P0W2 TMEM230-207ENST00000379286 1735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
HMG20BQ9P0W2 P4HB-201ENST00000331483 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
HMG20BQ9P0W2 KCTD13-207ENST00000568000 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
HMG20BQ9P0W2 PNKP-214ENST00000600573 1602 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
HMG20BQ9P0W2 EGLN2-202ENST00000406058 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
HMG20BQ9P0W2 SPOCK3-204ENST00000502330 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
HMG20BQ9P0W2 LINC01743-201ENST00000366308 964 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
HMG20BQ9P0W2 TMSB4X-201ENST00000380633 495 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.04■■□□□ 1.44
HMG20BQ9P0W2 SBF2-AS1-202ENST00000499953 854 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
HMG20BQ9P0W2 AC005943.1-201ENST00000585937 1002 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.04■■□□□ 1.44
HMG20BQ9P0W2 MTFP1-206ENST00000629597 482 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
HMG20BQ9P0W2 HYLS1-203ENST00000526028 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
HMG20BQ9P0W2 LGR4-202ENST00000389858 5163 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
HMG20BQ9P0W2 KRT83-201ENST00000293670 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
HMG20BQ9P0W2 Z83844.2-201ENST00000456099 1945 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
HMG20BQ9P0W2 ACBD4-203ENST00000398322 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
HMG20BQ9P0W2 GPR35-202ENST00000403859 2032 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
HMG20BQ9P0W2 LPAR2-203ENST00000586703 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
HMG20BQ9P0W2 GALNT16-204ENST00000553669 1629 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
HMG20BQ9P0W2 CCNO-201ENST00000282572 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
HMG20BQ9P0W2 MAP7D2-203ENST00000443379 2476 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
HMG20BQ9P0W2 C19orf25-206ENST00000588849 1472 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
HMG20BQ9P0W2 C19orf66-209ENST00000591813 1481 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
HMG20BQ9P0W2 CTAG2-201ENST00000247306 993 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
HMG20BQ9P0W2 CMTM8-201ENST00000307526 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
HMG20BQ9P0W2 AL390728.5-201ENST00000428687 706 ntTSL 3 BASIC24.03■■□□□ 1.44
HMG20BQ9P0W2 AF186192.3-201ENST00000583427 947 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
HMG20BQ9P0W2 MRPL4-204ENST00000588502 827 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
HMG20BQ9P0W2 SMAGP-206ENST00000604188 433 ntTSL 3 BASIC24.03■■□□□ 1.44
HMG20BQ9P0W2 DDRGK1-201ENST00000354488 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
HMG20BQ9P0W2 PRSS33-204ENST00000576886 1755 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
HMG20BQ9P0W2 LINC00482-201ENST00000332012 2023 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
HMG20BQ9P0W2 ERMP1-202ENST00000339450 5376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
HMG20BQ9P0W2 SAV1-201ENST00000324679 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
HMG20BQ9P0W2 SMYD2-201ENST00000366957 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
HMG20BQ9P0W2 GTF3C5-203ENST00000372099 1999 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
HMG20BQ9P0W2 TP53RK-201ENST00000372102 2012 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
HMG20BQ9P0W2 AC016065.1-203ENST00000523225 1017 ntTSL 3 BASIC24.02■■□□□ 1.44
HMG20BQ9P0W2 EFTUD1P1-201ENST00000558187 596 ntTSL 4 BASIC24.02■■□□□ 1.44
HMG20BQ9P0W2 GNB5-211ENST00000560116 918 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
HMG20BQ9P0W2 PRKACA-209ENST00000590853 1101 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
HMG20BQ9P0W2 AC004264.1-201ENST00000608354 794 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
HMG20BQ9P0W2 DCAKD-208ENST00000614054 2054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
HMG20BQ9P0W2 ADM-207ENST00000530439 1839 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
HMG20BQ9P0W2 CNR1-203ENST00000369501 6031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
HMG20BQ9P0W2 PQLC2-201ENST00000375153 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
HMG20BQ9P0W2 CHST1-201ENST00000308064 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
HMG20BQ9P0W2 UBXN6-201ENST00000301281 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
HMG20BQ9P0W2 E4F1-204ENST00000564139 2493 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
HMG20BQ9P0W2 C7orf43-201ENST00000316937 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
HMG20BQ9P0W2 FAM66B-202ENST00000606573 2630 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
HMG20BQ9P0W2 ILKAP-201ENST00000254654 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
HMG20BQ9P0W2 KRT78-201ENST00000304620 1778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
HMG20BQ9P0W2 PBX1-222ENST00000627490 1769 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
HMG20BQ9P0W2 C19orf66-201ENST00000253110 2117 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
HMG20BQ9P0W2 AP006587.1-201ENST00000534129 1502 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
HMG20BQ9P0W2 SYT7-208ENST00000542670 1887 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
HMG20BQ9P0W2 TMEM98-206ENST00000579849 4434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
HMG20BQ9P0W2 ZNF276-208ENST00000568064 2203 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
HMG20BQ9P0W2 TSTD1-202ENST00000368023 574 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
HMG20BQ9P0W2 SAPCD2P4-201ENST00000424595 1171 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
HMG20BQ9P0W2 RNH1-203ENST00000397604 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17 ms