Protein–RNA interactions for Protein: Q9P031

CCDC59, Thyroid transcription factor 1-associated protein 26, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 241 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC59Q9P031 ESPN-216ENST00000636330 4731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
CCDC59Q9P031 MSLN-207ENST00000566549 2418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.38
CCDC59Q9P031 RELL2-207ENST00000521367 1780 ntTSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
CCDC59Q9P031 PTTG1IP-201ENST00000330938 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
CCDC59Q9P031 AC132008.2-203ENST00000418868 1552 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
CCDC59Q9P031 APTR-204ENST00000440088 2029 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
CCDC59Q9P031 UBE2O-201ENST00000319380 5436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
CCDC59Q9P031 THAP12-201ENST00000260045 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
CCDC59Q9P031 RNH1-203ENST00000397604 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
CCDC59Q9P031 PTK6-201ENST00000217185 2401 ntTSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
CCDC59Q9P031 MT1M-201ENST00000379818 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
CCDC59Q9P031 HES6-206ENST00000409574 738 ntTSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
CCDC59Q9P031 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC17.45■□□□□ 0.38
CCDC59Q9P031 TPT1-AS1-211ENST00000520622 604 ntTSL 4 BASIC17.45■□□□□ 0.38
CCDC59Q9P031 AL355102.2-201ENST00000553811 600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
CCDC59Q9P031 LINC02136-201ENST00000567469 530 ntTSL 4 BASIC17.45■□□□□ 0.38
CCDC59Q9P031 AC007448.3-201ENST00000585193 689 ntTSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
CCDC59Q9P031 MAP3K6-207ENST00000493901 4309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
CCDC59Q9P031 RBCK1-203ENST00000382181 2208 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
CCDC59Q9P031 WBP2-219ENST00000626827 1867 ntTSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
CCDC59Q9P031 HOXC9-203ENST00000508190 1505 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.45■□□□□ 0.38
CCDC59Q9P031 SLC35E1-208ENST00000595753 5099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
CCDC59Q9P031 CCDC91-220ENST00000545336 2738 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
CCDC59Q9P031 TSGA10IP-203ENST00000532620 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
CCDC59Q9P031 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
CCDC59Q9P031 CCDC27-201ENST00000294600 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
CCDC59Q9P031 NOMO3-202ENST00000399336 4356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
CCDC59Q9P031 KIF13B-206ENST00000524189 8745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
CCDC59Q9P031 SIRT3-204ENST00000525319 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
CCDC59Q9P031 KDM1A-202ENST00000400181 3059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
CCDC59Q9P031 RAVER1-207ENST00000615032 1952 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
CCDC59Q9P031 SGSM2-201ENST00000268989 4863 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
CCDC59Q9P031 TBXAS1-204ENST00000416849 2505 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
CCDC59Q9P031 PDLIM4-201ENST00000253754 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
CCDC59Q9P031 LHX8-202ENST00000356261 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
CCDC59Q9P031 HSF4-215ENST00000521374 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
CCDC59Q9P031 CARD19-201ENST00000375464 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
CCDC59Q9P031 TSPY9P-201ENST00000440215 945 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
CCDC59Q9P031 TSPY11P-201ENST00000442607 1045 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
CCDC59Q9P031 AC245052.3-201ENST00000450182 901 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
CCDC59Q9P031 ARHGDIA-217ENST00000584461 886 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
CCDC59Q9P031 FP565260.3-201ENST00000612610 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
CCDC59Q9P031 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
CCDC59Q9P031 PCBP3-205ENST00000400310 2168 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
CCDC59Q9P031 P2RY6-210ENST00000542092 1674 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
CCDC59Q9P031 LRP1-204ENST00000553277 1693 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
CCDC59Q9P031 HCN1-201ENST00000303230 9885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
CCDC59Q9P031 PHF20L1-214ENST00000485595 1810 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
CCDC59Q9P031 ZNF668-208ENST00000538906 2865 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
CCDC59Q9P031 SNX19-209ENST00000530356 1562 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
CCDC59Q9P031 KRBOX1-AS1-201ENST00000447834 2134 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
CCDC59Q9P031 MAP6-201ENST00000304771 3334 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
CCDC59Q9P031 MRPL23-AS1-201ENST00000419080 1876 ntTSL 3 BASIC17.44■□□□□ 0.38
CCDC59Q9P031 AGPAT3-201ENST00000291572 5546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
CCDC59Q9P031 C11orf49-201ENST00000278460 1645 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
CCDC59Q9P031 FAM167A-207ENST00000534308 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
CCDC59Q9P031 CORO1A-216ENST00000570045 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
CCDC59Q9P031 AL031598.1-201ENST00000561511 1773 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
CCDC59Q9P031 NUP50-AS1-201ENST00000426282 2076 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
CCDC59Q9P031 SGSM2-202ENST00000426855 4734 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
CCDC59Q9P031 ZNF200-202ENST00000396870 2373 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
CCDC59Q9P031 ZBTB16-201ENST00000335953 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
CCDC59Q9P031 QPCTL-202ENST00000366382 1814 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
CCDC59Q9P031 AC019163.1-201ENST00000512634 610 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
CCDC59Q9P031 LY6H-205ENST00000615409 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
CCDC59Q9P031 GSEC-201ENST00000626810 2289 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
CCDC59Q9P031 RELL2-205ENST00000518856 1419 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
CCDC59Q9P031 DMRTA1-201ENST00000325870 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
CCDC59Q9P031 HMGXB3-206ENST00000613459 5567 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
CCDC59Q9P031 KDELR1-203ENST00000597017 1594 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
CCDC59Q9P031 ANKRD11-217ENST00000613312 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
CCDC59Q9P031 SLC25A48-201ENST00000274513 1880 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
CCDC59Q9P031 ZNF710-201ENST00000268154 4617 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
CCDC59Q9P031 CCT7-215ENST00000539919 2031 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
CCDC59Q9P031 SYNPO-201ENST00000307662 5374 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
CCDC59Q9P031 DACT2-201ENST00000366795 2942 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
CCDC59Q9P031 WTAP-201ENST00000337387 1622 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
CCDC59Q9P031 EEF1A1-203ENST00000331523 1923 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
CCDC59Q9P031 GGT6-202ENST00000381550 2145 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
CCDC59Q9P031 ANKRD13D-216ENST00000514166 2138 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
CCDC59Q9P031 AHCYL2-201ENST00000325006 5056 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
CCDC59Q9P031 PCSK7-201ENST00000320934 4649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
CCDC59Q9P031 TRAPPC12-201ENST00000324266 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
CCDC59Q9P031 APLP2-210ENST00000528499 2530 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
CCDC59Q9P031 PIGV-201ENST00000078527 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
CCDC59Q9P031 HBM-201ENST00000356815 506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
CCDC59Q9P031 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC17.42■□□□□ 0.38
CCDC59Q9P031 ERRFI1-204ENST00000474874 479 ntTSL 3 BASIC17.42■□□□□ 0.38
CCDC59Q9P031 PPP1R14A-204ENST00000591291 433 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
CCDC59Q9P031 AL138724.1-201ENST00000606771 1088 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
CCDC59Q9P031 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
CCDC59Q9P031 GTF2IRD2B-210ENST00000629105 1910 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
CCDC59Q9P031 LRRN4CL-201ENST00000317449 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
CCDC59Q9P031 TMPRSS9-205ENST00000613480 2568 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
CCDC59Q9P031 FAM131A-202ENST00000340957 2421 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
CCDC59Q9P031 MSANTD1-201ENST00000438480 2922 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
CCDC59Q9P031 RNF139-201ENST00000303545 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
CCDC59Q9P031 RASL11B-201ENST00000248706 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
CCDC59Q9P031 TCF7-204ENST00000395029 3330 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
CCDC59Q9P031 EIF4G3-214ENST00000634879 5325 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.4 ms