Protein–RNA interactions for Protein: Q9NZI2

KCNIP1, Kv channel-interacting protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 227 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KCNIP1Q9NZI2 CPEB1-214ENST00000617522 2220 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
KCNIP1Q9NZI2 AGPAT5-201ENST00000285518 3685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
KCNIP1Q9NZI2 ACOT2-205ENST00000622407 1604 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
KCNIP1Q9NZI2 CLIP3-206ENST00000593074 2080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
KCNIP1Q9NZI2 FAM124A-202ENST00000322475 4761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
KCNIP1Q9NZI2 FAM216A-201ENST00000377673 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
KCNIP1Q9NZI2 C3orf18-203ENST00000426034 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
KCNIP1Q9NZI2 PSMG4-209ENST00000473000 4603 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
KCNIP1Q9NZI2 DMAP1-202ENST00000361745 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
KCNIP1Q9NZI2 CYB561-213ENST00000581573 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
KCNIP1Q9NZI2 ZNF286A-204ENST00000464847 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
KCNIP1Q9NZI2 STIM2-211ENST00000639195 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
KCNIP1Q9NZI2 ZNF512B-201ENST00000369888 5919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
KCNIP1Q9NZI2 HEG1-201ENST00000311127 9156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
KCNIP1Q9NZI2 FN3K-201ENST00000300784 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
KCNIP1Q9NZI2 RFXANK-201ENST00000303088 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
KCNIP1Q9NZI2 AC010980.2-201ENST00000587099 1412 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
KCNIP1Q9NZI2 SPNS1-201ENST00000311008 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
KCNIP1Q9NZI2 ORAI3-204ENST00000566237 1393 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
KCNIP1Q9NZI2 TPST2-201ENST00000338754 5697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
KCNIP1Q9NZI2 AKR7A3-201ENST00000361640 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
KCNIP1Q9NZI2 IQCJ-SCHIP1-204ENST00000485419 2445 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
KCNIP1Q9NZI2 TMC6-201ENST00000306591 1681 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
KCNIP1Q9NZI2 WFIKKN1-201ENST00000319070 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
KCNIP1Q9NZI2 NEDD8-201ENST00000250495 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
KCNIP1Q9NZI2 GGTLC1-201ENST00000278765 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
KCNIP1Q9NZI2 VSX1-201ENST00000376707 943 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
KCNIP1Q9NZI2 STAG3L3-201ENST00000423834 1262 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
KCNIP1Q9NZI2 VSX1-206ENST00000444511 1197 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
KCNIP1Q9NZI2 CAPNS1-205ENST00000588780 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
KCNIP1Q9NZI2 SCO1-203ENST00000577427 1601 ntTSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
KCNIP1Q9NZI2 SREBF2-201ENST00000361204 5240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
KCNIP1Q9NZI2 UBE2QL1-201ENST00000399816 4317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
KCNIP1Q9NZI2 TSPAN17-202ENST00000310032 2550 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
KCNIP1Q9NZI2 RRNAD1-202ENST00000368218 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
KCNIP1Q9NZI2 HTR7P1-202ENST00000624664 4411 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
KCNIP1Q9NZI2 ZNF331-214ENST00000511154 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
KCNIP1Q9NZI2 SAXO1-202ENST00000380534 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
KCNIP1Q9NZI2 PTGER2-201ENST00000245457 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
KCNIP1Q9NZI2 TNFRSF25-203ENST00000351959 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
KCNIP1Q9NZI2 RNASET2-203ENST00000366855 1417 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
KCNIP1Q9NZI2 FAM212B-203ENST00000444059 1423 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
KCNIP1Q9NZI2 ETS1-208ENST00000535549 4594 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
KCNIP1Q9NZI2 NKX2-1-202ENST00000498187 2338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
KCNIP1Q9NZI2 GLB1-201ENST00000307363 2616 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
KCNIP1Q9NZI2 EZH2-201ENST00000320356 2639 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
KCNIP1Q9NZI2 PAQR4-203ENST00000572687 2251 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
KCNIP1Q9NZI2 LONRF3-202ENST00000371628 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
KCNIP1Q9NZI2 AL158211.5-201ENST00000623583 2518 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
KCNIP1Q9NZI2 IRGQ-205ENST00000602269 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
KCNIP1Q9NZI2 BRI3BP-201ENST00000341446 6648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
KCNIP1Q9NZI2 NXN-202ENST00000537628 1340 ntTSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
KCNIP1Q9NZI2 ADAP1-216ENST00000539900 2178 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
KCNIP1Q9NZI2 AC125437.2-201ENST00000625180 2167 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
KCNIP1Q9NZI2 AP001271.2-201ENST00000624018 1556 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
KCNIP1Q9NZI2 ETHE1-201ENST00000292147 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
KCNIP1Q9NZI2 CFD-201ENST00000327726 1201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
KCNIP1Q9NZI2 MOB2-201ENST00000329957 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
KCNIP1Q9NZI2 UBE2C-203ENST00000352551 665 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
KCNIP1Q9NZI2 AL512625.2-201ENST00000417533 625 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
KCNIP1Q9NZI2 APTR-203ENST00000430801 583 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
KCNIP1Q9NZI2 C2orf69P4-201ENST00000565394 541 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
KCNIP1Q9NZI2 AC016588.1-201ENST00000591533 542 ntTSL 4 BASIC16.53■□□□□ 0.24
KCNIP1Q9NZI2 AL032819.3-201ENST00000640283 925 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
KCNIP1Q9NZI2 POLE2-202ENST00000539565 1792 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
KCNIP1Q9NZI2 SPEG-203ENST00000396688 1457 ntTSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
KCNIP1Q9NZI2 ZSWIM8-223ENST00000605216 6004 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
KCNIP1Q9NZI2 DVL3-203ENST00000431765 2294 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
KCNIP1Q9NZI2 DVL1-204ENST00000610709 2268 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
KCNIP1Q9NZI2 RUNX1-207ENST00000437180 5967 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
KCNIP1Q9NZI2 L1CAM-205ENST00000370060 5113 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
KCNIP1Q9NZI2 UBE3A-201ENST00000232165 5051 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
KCNIP1Q9NZI2 PEX6-201ENST00000244546 2696 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
KCNIP1Q9NZI2 IL6R-202ENST00000368485 5914 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
KCNIP1Q9NZI2 AC006001.3-204ENST00000638711 2103 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
KCNIP1Q9NZI2 EOMES-202ENST00000449599 2829 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
KCNIP1Q9NZI2 PUF60-202ENST00000349157 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
KCNIP1Q9NZI2 PRR16-201ENST00000379551 1826 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
KCNIP1Q9NZI2 RBM14-RBM4-201ENST00000412278 1566 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
KCNIP1Q9NZI2 PLCH2-203ENST00000378486 4837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
KCNIP1Q9NZI2 PLCH2-204ENST00000419816 4837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
KCNIP1Q9NZI2 NAPSA-201ENST00000253719 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
KCNIP1Q9NZI2 KIAA1456-201ENST00000400069 1982 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
KCNIP1Q9NZI2 C19orf73-201ENST00000408991 744 ntAPPRIS P1 BASIC16.52■□□□□ 0.24
KCNIP1Q9NZI2 LSM12P1-201ENST00000411836 588 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
KCNIP1Q9NZI2 SUZ12P1-202ENST00000578070 929 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
KCNIP1Q9NZI2 PDCD5-204ENST00000586035 601 ntTSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
KCNIP1Q9NZI2 AC005181.1-201ENST00000604782 1256 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
KCNIP1Q9NZI2 MAZ-216ENST00000616501 991 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
KCNIP1Q9NZI2 TSSK6-201ENST00000585580 1467 ntAPPRIS P1 BASIC16.52■□□□□ 0.23
KCNIP1Q9NZI2 AKAP8L-201ENST00000397410 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
KCNIP1Q9NZI2 PCDHA5-202ENST00000529859 5218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
KCNIP1Q9NZI2 CAPN12-201ENST00000328867 2762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
KCNIP1Q9NZI2 WEE1-202ENST00000450114 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
KCNIP1Q9NZI2 ADCY6-206ENST00000550422 5877 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.23
KCNIP1Q9NZI2 TREX2-206ENST00000370232 1864 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
KCNIP1Q9NZI2 MGLL-204ENST00000434178 4941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
KCNIP1Q9NZI2 ZNF12-201ENST00000342651 2921 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.23
KCNIP1Q9NZI2 SYNC-201ENST00000373484 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.23
KCNIP1Q9NZI2 CLN8-208ENST00000635751 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 57.9 ms