Protein–RNA interactions for Protein: Q9NXS3

KLHL28, Kelch-like protein 28, humanhuman

Predictions only

Length 571 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KLHL28Q9NXS3 SPNS1-201ENST00000311008 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
KLHL28Q9NXS3 AC090340.1-201ENST00000620778 4980 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
KLHL28Q9NXS3 STIM2-211ENST00000639195 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
KLHL28Q9NXS3 DEDD2-204ENST00000595337 1894 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC18.39■□□□□ 0.53
KLHL28Q9NXS3 MED26-207ENST00000611692 1444 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
KLHL28Q9NXS3 ADAD1-202ENST00000388724 1912 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
KLHL28Q9NXS3 WFIKKN1-201ENST00000319070 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
KLHL28Q9NXS3 FAM216A-201ENST00000377673 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
KLHL28Q9NXS3 ACOT2-205ENST00000622407 1604 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
KLHL28Q9NXS3 ADAP1-216ENST00000539900 2178 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
KLHL28Q9NXS3 ARHGAP22-204ENST00000417247 2340 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
KLHL28Q9NXS3 UBE2B-201ENST00000265339 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
KLHL28Q9NXS3 UNC50-201ENST00000357765 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
KLHL28Q9NXS3 HSD17B10-202ENST00000375298 823 ntTSL 3 BASIC18.38■□□□□ 0.53
KLHL28Q9NXS3 HES2-205ENST00000487437 968 ntTSL 3 BASIC18.38■□□□□ 0.53
KLHL28Q9NXS3 WWTR1-AS1-203ENST00000495094 975 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
KLHL28Q9NXS3 AC099522.1-201ENST00000505955 881 ntTSL 3 BASIC18.38■□□□□ 0.53
KLHL28Q9NXS3 AL589743.5-201ENST00000616611 1050 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
KLHL28Q9NXS3 OR10C1-204ENST00000622521 1039 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
KLHL28Q9NXS3 AC133041.1-202ENST00000642053 222 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
KLHL28Q9NXS3 RBM15B-201ENST00000563281 6641 ntAPPRIS P1 BASIC18.38■□□□□ 0.53
KLHL28Q9NXS3 EP300-201ENST00000263253 9587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
KLHL28Q9NXS3 WDR25-201ENST00000335290 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
KLHL28Q9NXS3 CPEB1-214ENST00000617522 2220 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
KLHL28Q9NXS3 PAQR4-203ENST00000572687 2251 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
KLHL28Q9NXS3 DVL1-204ENST00000610709 2268 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
KLHL28Q9NXS3 MKRN4P-201ENST00000444706 1521 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
KLHL28Q9NXS3 AC120498.9-201ENST00000339021 3867 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
KLHL28Q9NXS3 NKX2-1-202ENST00000498187 2338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
KLHL28Q9NXS3 AC009237.14-201ENST00000609975 1594 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
KLHL28Q9NXS3 PCID2-203ENST00000375457 2372 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
KLHL28Q9NXS3 EPS8L1-203ENST00000540810 2360 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
KLHL28Q9NXS3 AL158211.5-201ENST00000623583 2518 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
KLHL28Q9NXS3 POLE2-202ENST00000539565 1792 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
KLHL28Q9NXS3 SYNC-201ENST00000373484 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
KLHL28Q9NXS3 WEE1-202ENST00000450114 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
KLHL28Q9NXS3 DVL3-203ENST00000431765 2294 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
KLHL28Q9NXS3 PTGER2-201ENST00000245457 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
KLHL28Q9NXS3 OIP5-201ENST00000220514 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
KLHL28Q9NXS3 GPX1-202ENST00000419783 1146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
KLHL28Q9NXS3 CD99P1-203ENST00000431582 602 ntTSL 4 BASIC18.37■□□□□ 0.53
KLHL28Q9NXS3 LINC01956-201ENST00000557729 695 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
KLHL28Q9NXS3 MAGIX-202ENST00000595224 1238 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
KLHL28Q9NXS3 ALDH3A2-224ENST00000626500 995 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
KLHL28Q9NXS3 UNKL-204ENST00000389221 5116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
KLHL28Q9NXS3 EZH2-201ENST00000320356 2639 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
KLHL28Q9NXS3 MREG-201ENST00000263268 1314 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
KLHL28Q9NXS3 MMP23B-202ENST00000378675 1309 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
KLHL28Q9NXS3 GRTP1-203ENST00000375431 1384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
KLHL28Q9NXS3 EOMES-202ENST00000449599 2829 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
KLHL28Q9NXS3 ANKRD2-202ENST00000307518 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
KLHL28Q9NXS3 ENTPD2-201ENST00000312665 1500 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
KLHL28Q9NXS3 SCO1-203ENST00000577427 1601 ntTSL 3 BASIC18.37■□□□□ 0.53
KLHL28Q9NXS3 TMC6-201ENST00000306591 1681 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
KLHL28Q9NXS3 SAXO1-202ENST00000380534 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
KLHL28Q9NXS3 FBXL19-207ENST00000565690 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
KLHL28Q9NXS3 STK10-201ENST00000176763 6060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
KLHL28Q9NXS3 AZIN1-201ENST00000337198 4721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
KLHL28Q9NXS3 TLNRD1-201ENST00000267984 4845 ntAPPRIS P1 BASIC18.36■□□□□ 0.53
KLHL28Q9NXS3 MRC2-201ENST00000303375 5988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
KLHL28Q9NXS3 STARD10-201ENST00000334805 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
KLHL28Q9NXS3 AKR7A3-201ENST00000361640 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
KLHL28Q9NXS3 CHPF-202ENST00000373891 1079 ntTSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
KLHL28Q9NXS3 UBE2E3-201ENST00000392415 1347 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.36■□□□□ 0.53
KLHL28Q9NXS3 IL15RA-208ENST00000397251 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
KLHL28Q9NXS3 CT47A12-201ENST00000419982 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
KLHL28Q9NXS3 ZCCHC9-204ENST00000438268 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
KLHL28Q9NXS3 HAGHL-213ENST00000564545 663 ntTSL 3 BASIC18.36■□□□□ 0.53
KLHL28Q9NXS3 IRGQ-205ENST00000602269 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
KLHL28Q9NXS3 IL15RA-221ENST00000620865 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
KLHL28Q9NXS3 IL15RA-222ENST00000622442 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
KLHL28Q9NXS3 AC006001.3-204ENST00000638711 2103 ntTSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
KLHL28Q9NXS3 GLB1-201ENST00000307363 2616 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
KLHL28Q9NXS3 GPR35-201ENST00000319838 2249 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
KLHL28Q9NXS3 AKAP8L-201ENST00000397410 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
KLHL28Q9NXS3 ARHGEF28-203ENST00000426542 6118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
KLHL28Q9NXS3 ANKIB1-201ENST00000265742 6081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
KLHL28Q9NXS3 PRR16-201ENST00000379551 1826 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
KLHL28Q9NXS3 CLN8-208ENST00000635751 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
KLHL28Q9NXS3 ETV7-206ENST00000615781 1776 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
KLHL28Q9NXS3 ADRA1A-203ENST00000380572 1697 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
KLHL28Q9NXS3 TFRC-202ENST00000392396 5032 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
KLHL28Q9NXS3 DMAP1-202ENST00000361745 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
KLHL28Q9NXS3 HAUS4-202ENST00000342454 1474 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
KLHL28Q9NXS3 ZNF12-201ENST00000342651 2921 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
KLHL28Q9NXS3 GPRC5C-204ENST00000392629 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
KLHL28Q9NXS3 AC091729.3-201ENST00000423008 1401 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
KLHL28Q9NXS3 IL17RE-206ENST00000454190 2757 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
KLHL28Q9NXS3 KLHDC9-201ENST00000368011 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
KLHL28Q9NXS3 DNTTIP1-201ENST00000372622 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
KLHL28Q9NXS3 STAG3L3-201ENST00000423834 1262 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
KLHL28Q9NXS3 AC093787.1-201ENST00000450396 207 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
KLHL28Q9NXS3 SMIM20-201ENST00000506197 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
KLHL28Q9NXS3 TRIM35-203ENST00000521253 1215 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
KLHL28Q9NXS3 CIRBP-211ENST00000586773 942 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
KLHL28Q9NXS3 ACYP2-207ENST00000606082 713 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
KLHL28Q9NXS3 TMEM191A-211ENST00000637163 1067 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
KLHL28Q9NXS3 KIAA1456-201ENST00000400069 1982 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
KLHL28Q9NXS3 PUF60-202ENST00000349157 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
KLHL28Q9NXS3 AP001271.2-201ENST00000624018 1556 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.3 ms