Protein–RNA interactions for Protein: Q9NXN4

GDAP2, Ganglioside-induced differentiation-associated protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 497 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GDAP2Q9NXN4 TRIM3-202ENST00000359518 3042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
GDAP2Q9NXN4 TPST2-202ENST00000398110 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
GDAP2Q9NXN4 ZDHHC8P1-201ENST00000255890 2382 ntTSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
GDAP2Q9NXN4 JDP2-201ENST00000267569 1700 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
GDAP2Q9NXN4 COMT-202ENST00000361682 2437 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
GDAP2Q9NXN4 CLK3-202ENST00000395066 2621 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
GDAP2Q9NXN4 CEBPA-201ENST00000498907 2631 ntAPPRIS P1 BASIC21■□□□□ 0.95
GDAP2Q9NXN4 SMC5-AS1-201ENST00000594708 1818 ntTSL 2 BASIC21■□□□□ 0.95
GDAP2Q9NXN4 GUCY1A3-210ENST00000513574 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
GDAP2Q9NXN4 AL596275.1-201ENST00000423464 877 ntBASIC21■□□□□ 0.95
GDAP2Q9NXN4 DYNLT3-203ENST00000432389 719 ntTSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
GDAP2Q9NXN4 ABCC5-211ENST00000446941 883 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
GDAP2Q9NXN4 AC108693.2-201ENST00000492981 303 ntTSL 3 BASIC21■□□□□ 0.95
GDAP2Q9NXN4 LINC00636-201ENST00000494231 1264 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
GDAP2Q9NXN4 AC092718.1-201ENST00000501068 1088 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
GDAP2Q9NXN4 CXCL2-202ENST00000508487 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
GDAP2Q9NXN4 PAIP2-208ENST00000511706 468 ntTSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
GDAP2Q9NXN4 LINC01123-202ENST00000419296 2436 ntTSL 2 BASIC21■□□□□ 0.95
GDAP2Q9NXN4 WIPF1-203ENST00000392546 2180 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
GDAP2Q9NXN4 PPP5C-202ENST00000391919 1929 ntTSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
GDAP2Q9NXN4 LGR4-201ENST00000379214 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
GDAP2Q9NXN4 ABHD5-205ENST00000458276 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
GDAP2Q9NXN4 MRPS2-201ENST00000241600 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
GDAP2Q9NXN4 SAE1-203ENST00000413379 2313 ntTSL 2 BASIC20.99■□□□□ 0.95
GDAP2Q9NXN4 CPT2-203ENST00000635862 2319 ntTSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
GDAP2Q9NXN4 CXCR3-201ENST00000373691 1861 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
GDAP2Q9NXN4 CIZ1-204ENST00000372938 2984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
GDAP2Q9NXN4 WWOX-202ENST00000402655 1594 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
GDAP2Q9NXN4 RPUSD2-202ENST00000559271 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.99■□□□□ 0.95
GDAP2Q9NXN4 FAM189B-201ENST00000350210 2379 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
GDAP2Q9NXN4 SRSF4-201ENST00000373795 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
GDAP2Q9NXN4 AL390879.2-201ENST00000424306 2222 ntTSL 2 BASIC20.99■□□□□ 0.95
GDAP2Q9NXN4 LINC01743-201ENST00000366308 964 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
GDAP2Q9NXN4 CCDC107-202ENST00000378406 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.99■□□□□ 0.95
GDAP2Q9NXN4 FDX2-207ENST00000494368 584 ntTSL 4 BASIC20.99■□□□□ 0.95
GDAP2Q9NXN4 TESC-AS1-201ENST00000547006 1053 ntTSL 2 BASIC20.99■□□□□ 0.95
GDAP2Q9NXN4 COPS7A-222ENST00000626119 1768 ntTSL 3 BASIC20.99■□□□□ 0.95
GDAP2Q9NXN4 SLC39A5-209ENST00000454355 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
GDAP2Q9NXN4 TMEM109-202ENST00000536171 1959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.99■□□□□ 0.95
GDAP2Q9NXN4 ESR2-204ENST00000353772 2454 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
GDAP2Q9NXN4 P2RX3-204ENST00000616487 1346 ntTSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
GDAP2Q9NXN4 LRRC42-203ENST00000371370 2037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.99■□□□□ 0.95
GDAP2Q9NXN4 PSMD8-201ENST00000215071 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
GDAP2Q9NXN4 GTF2IRD2B-210ENST00000629105 1910 ntTSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
GDAP2Q9NXN4 AOC1-202ENST00000416793 2453 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
GDAP2Q9NXN4 ZNF48-201ENST00000320159 3234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
GDAP2Q9NXN4 WDR74-201ENST00000278856 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
GDAP2Q9NXN4 RHOG-202ENST00000396978 1066 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.98■□□□□ 0.95
GDAP2Q9NXN4 COQ10B-203ENST00000409398 879 ntTSL 3 BASIC20.98■□□□□ 0.95
GDAP2Q9NXN4 SAPCD2P4-201ENST00000424595 1171 ntBASIC20.98■□□□□ 0.95
GDAP2Q9NXN4 SLC6A6-208ENST00000621751 1252 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
GDAP2Q9NXN4 AC113410.3-201ENST00000623366 203 ntBASIC20.98■□□□□ 0.95
GDAP2Q9NXN4 BEST4-201ENST00000372207 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
GDAP2Q9NXN4 MAP2K2-202ENST00000394867 1471 ntTSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
GDAP2Q9NXN4 P2RY6-210ENST00000542092 1674 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.98■□□□□ 0.95
GDAP2Q9NXN4 PRKG2-207ENST00000628926 2623 ntTSL 2 BASIC20.98■□□□□ 0.95
GDAP2Q9NXN4 TOR1A-201ENST00000351698 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
GDAP2Q9NXN4 DKK3-203ENST00000525493 1326 ntTSL 2 BASIC20.98■□□□□ 0.95
GDAP2Q9NXN4 WBP2-213ENST00000590221 1745 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC20.98■□□□□ 0.95
GDAP2Q9NXN4 LINC01547-202ENST00000397841 2303 ntTSL 2 BASIC20.98■□□□□ 0.95
GDAP2Q9NXN4 GNB1-209ENST00000610897 3145 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
GDAP2Q9NXN4 SLC1A6-202ENST00000430939 1794 ntTSL 2 BASIC20.97■□□□□ 0.95
GDAP2Q9NXN4 TAF15-215ENST00000605844 2191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
GDAP2Q9NXN4 MTMR14-201ENST00000296003 2494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
GDAP2Q9NXN4 PRMT5-201ENST00000216350 2271 ntTSL 2 BASIC20.97■□□□□ 0.95
GDAP2Q9NXN4 LIME1-201ENST00000309546 1178 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
GDAP2Q9NXN4 POMC-202ENST00000380794 1295 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.97■□□□□ 0.95
GDAP2Q9NXN4 BABAM1-202ENST00000447614 930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
GDAP2Q9NXN4 MIR4497-201ENST00000583208 89 ntBASIC20.97■□□□□ 0.95
GDAP2Q9NXN4 RPS15-203ENST00000586096 570 ntTSL 2 BASIC20.97■□□□□ 0.95
GDAP2Q9NXN4 COCH-201ENST00000216361 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
GDAP2Q9NXN4 KIAA0895-204ENST00000415803 2865 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
GDAP2Q9NXN4 DTX2-212ENST00000446820 1770 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
GDAP2Q9NXN4 SAXO1-202ENST00000380534 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
GDAP2Q9NXN4 MORF4L2-AS1-201ENST00000435306 2086 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
GDAP2Q9NXN4 MOB3C-202ENST00000319928 2822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.96■□□□□ 0.95
GDAP2Q9NXN4 GIPR-202ENST00000304207 1432 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
GDAP2Q9NXN4 ONECUT3-201ENST00000382349 8318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
GDAP2Q9NXN4 FAM131C-201ENST00000375662 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
GDAP2Q9NXN4 ADAD1-202ENST00000388724 1912 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
GDAP2Q9NXN4 MAP7D2-203ENST00000443379 2476 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.96■□□□□ 0.95
GDAP2Q9NXN4 PDLIM5-205ENST00000380180 2020 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
GDAP2Q9NXN4 RBM45-207ENST00000616198 1788 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
GDAP2Q9NXN4 SSNA1-201ENST00000322310 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
GDAP2Q9NXN4 UBALD1-209ENST00000591897 1275 ntTSL 2 BASIC20.96■□□□□ 0.95
GDAP2Q9NXN4 AC073195.1-201ENST00000607241 877 ntBASIC20.96■□□□□ 0.95
GDAP2Q9NXN4 PODNL1-203ENST00000538371 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.96■□□□□ 0.95
GDAP2Q9NXN4 ADGRA3-204ENST00000502482 2870 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
GDAP2Q9NXN4 ICAM5-201ENST00000221980 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
GDAP2Q9NXN4 SENP5-204ENST00000445299 2491 ntTSL 2 BASIC20.96■□□□□ 0.95
GDAP2Q9NXN4 AUP1-201ENST00000377526 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
GDAP2Q9NXN4 PMPCB-202ENST00000428154 1714 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
GDAP2Q9NXN4 DLEU7-201ENST00000400393 2092 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
GDAP2Q9NXN4 PIGQ-206ENST00000422307 2052 ntTSL 3 BASIC20.95■□□□□ 0.94
GDAP2Q9NXN4 ENTPD8-201ENST00000344119 2111 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
GDAP2Q9NXN4 RDX-202ENST00000405097 2761 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
GDAP2Q9NXN4 RBM14-RBM4-201ENST00000412278 1566 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.95■□□□□ 0.94
GDAP2Q9NXN4 FAM3C-201ENST00000359943 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
GDAP2Q9NXN4 BIK-201ENST00000216115 953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
GDAP2Q9NXN4 MDK-205ENST00000405308 1166 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.95■□□□□ 0.94
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.6 ms