Protein–RNA interactions for Protein: Q9NTQ9

GJB4, Gap junction beta-4 protein, humanhuman

Predictions only

Length 266 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GJB4Q9NTQ9 MAFG-AS1-201ENST00000582106 1895 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
GJB4Q9NTQ9 CCSAP-201ENST00000284617 5121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
GJB4Q9NTQ9 CCDC71-201ENST00000321895 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
GJB4Q9NTQ9 RIIAD1-201ENST00000326413 1772 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
GJB4Q9NTQ9 TNFSF11-203ENST00000398795 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
GJB4Q9NTQ9 LONRF3-202ENST00000371628 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
GJB4Q9NTQ9 HOXA6-201ENST00000222728 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
GJB4Q9NTQ9 IPO13-201ENST00000372339 1201 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
GJB4Q9NTQ9 CALM3-202ENST00000391918 702 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
GJB4Q9NTQ9 EGFEM1P-209ENST00000502332 728 ntTSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
GJB4Q9NTQ9 THAP6-213ENST00000514480 1161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
GJB4Q9NTQ9 UNC93B5-201ENST00000530315 699 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
GJB4Q9NTQ9 AC009065.4-203ENST00000562838 535 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
GJB4Q9NTQ9 MMP25-204ENST00000612971 1017 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
GJB4Q9NTQ9 AC120498.8-201ENST00000614275 531 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
GJB4Q9NTQ9 TMEM53-205ENST00000372244 1472 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
GJB4Q9NTQ9 CAMKMT-201ENST00000378494 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
GJB4Q9NTQ9 R3HCC1-210ENST00000625275 1489 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
GJB4Q9NTQ9 DOK7-206ENST00000515886 2263 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
GJB4Q9NTQ9 CARD9-201ENST00000371732 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
GJB4Q9NTQ9 QTRT1-201ENST00000250237 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
GJB4Q9NTQ9 RBM42-204ENST00000589559 1328 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
GJB4Q9NTQ9 BCAT2-208ENST00000598162 1329 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
GJB4Q9NTQ9 AC093484.2-201ENST00000580996 2166 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
GJB4Q9NTQ9 THTPA-202ENST00000404535 1779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
GJB4Q9NTQ9 WWOX-202ENST00000402655 1594 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
GJB4Q9NTQ9 FOXC1-201ENST00000380874 3926 ntAPPRIS P1 BASIC22.76■■□□□ 1.23
GJB4Q9NTQ9 PQLC2-202ENST00000375155 1805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
GJB4Q9NTQ9 KCTD18-201ENST00000359878 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
GJB4Q9NTQ9 ZMAT3-203ENST00000432729 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
GJB4Q9NTQ9 MARK2-208ENST00000508192 2924 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
GJB4Q9NTQ9 NFS1-214ENST00000541387 1436 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
GJB4Q9NTQ9 CABLES1-201ENST00000256925 5002 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
GJB4Q9NTQ9 AKNA-205ENST00000374079 2138 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
GJB4Q9NTQ9 NRL-206ENST00000561028 2103 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
GJB4Q9NTQ9 EZH2-201ENST00000320356 2639 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
GJB4Q9NTQ9 THAP7-201ENST00000215742 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
GJB4Q9NTQ9 SYNE2-201ENST00000341472 1132 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
GJB4Q9NTQ9 DYNLRB1-203ENST00000374846 1044 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
GJB4Q9NTQ9 MRPS26-201ENST00000380325 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
GJB4Q9NTQ9 GTF2A2-203ENST00000396061 758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
GJB4Q9NTQ9 AC114730.1-201ENST00000400768 472 ntTSL 4 BASIC22.75■■□□□ 1.23
GJB4Q9NTQ9 TNIK-208ENST00000465393 750 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
GJB4Q9NTQ9 KRT18P6-201ENST00000555540 1265 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
GJB4Q9NTQ9 PSMC3IP-208ENST00000590760 664 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
GJB4Q9NTQ9 GPR35-201ENST00000319838 2249 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
GJB4Q9NTQ9 ANTXR1-203ENST00000409829 2221 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
GJB4Q9NTQ9 CASP6-201ENST00000265164 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
GJB4Q9NTQ9 RPUSD2-202ENST00000559271 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
GJB4Q9NTQ9 GPR31-201ENST00000366834 2059 ntAPPRIS P1 BASIC22.75■■□□□ 1.23
GJB4Q9NTQ9 MAPK9-203ENST00000393360 4326 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
GJB4Q9NTQ9 SLC35B1-201ENST00000240333 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
GJB4Q9NTQ9 TMPRSS6-207ENST00000442782 1695 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
GJB4Q9NTQ9 TBC1D10A-204ENST00000403477 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
GJB4Q9NTQ9 TMEM151B-202ENST00000451188 4895 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
GJB4Q9NTQ9 TACO1-201ENST00000258975 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
GJB4Q9NTQ9 ZNF346-201ENST00000358149 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
GJB4Q9NTQ9 GNG4-203ENST00000391854 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
GJB4Q9NTQ9 FOXN3-214ENST00000557258 2692 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
GJB4Q9NTQ9 UHRF2-202ENST00000381373 802 ntTSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
GJB4Q9NTQ9 SLC47A1P1-201ENST00000420951 500 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
GJB4Q9NTQ9 UNC93B4-201ENST00000505679 747 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
GJB4Q9NTQ9 PLEKHB1-216ENST00000543085 632 ntTSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
GJB4Q9NTQ9 NAT14-204ENST00000591590 1011 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
GJB4Q9NTQ9 AC008687.6-201ENST00000596318 630 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
GJB4Q9NTQ9 AC087482.1-204ENST00000636067 2431 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
GJB4Q9NTQ9 DMRT2-201ENST00000259622 2459 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
GJB4Q9NTQ9 GALNT16-204ENST00000553669 1629 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
GJB4Q9NTQ9 KLHL21-206ENST00000610898 1945 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
GJB4Q9NTQ9 TOM1L1-202ENST00000445275 2228 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
GJB4Q9NTQ9 BACE2-202ENST00000330333 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
GJB4Q9NTQ9 ACD-201ENST00000219251 2052 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
GJB4Q9NTQ9 FAM102B-201ENST00000370035 5600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
GJB4Q9NTQ9 TMEM151A-201ENST00000327259 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
GJB4Q9NTQ9 NSMF-201ENST00000265663 2981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
GJB4Q9NTQ9 RAVER2-201ENST00000294428 4398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
GJB4Q9NTQ9 LRP8-204ENST00000371454 3322 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
GJB4Q9NTQ9 CDH5-204ENST00000563425 1932 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
GJB4Q9NTQ9 FOXK2-201ENST00000335255 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
GJB4Q9NTQ9 ZNF580-201ENST00000325333 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
GJB4Q9NTQ9 H3F3A-204ENST00000366816 799 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
GJB4Q9NTQ9 GAS7-202ENST00000396115 929 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
GJB4Q9NTQ9 C2orf82-203ENST00000409533 561 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC22.73■■□□□ 1.23
GJB4Q9NTQ9 LCN6-203ENST00000476567 1015 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
GJB4Q9NTQ9 EPHA5-AS1-202ENST00000509473 1177 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
GJB4Q9NTQ9 ZNF580-203ENST00000545125 1025 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
GJB4Q9NTQ9 AC233263.1-201ENST00000578059 224 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
GJB4Q9NTQ9 ANKS6-201ENST00000353234 7164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
GJB4Q9NTQ9 PSKH2-201ENST00000276616 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
GJB4Q9NTQ9 TMEM91-203ENST00000392002 1389 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
GJB4Q9NTQ9 AC148477.3-202ENST00000376617 1766 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
GJB4Q9NTQ9 HOMEZ-201ENST00000357460 4971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
GJB4Q9NTQ9 ZNF821-221ENST00000611294 1833 ntTSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
GJB4Q9NTQ9 PHF2-201ENST00000359246 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
GJB4Q9NTQ9 PTGER3-203ENST00000354608 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
GJB4Q9NTQ9 DMRT2-205ENST00000382255 2367 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
GJB4Q9NTQ9 ZNF281-202ENST00000367352 2933 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
GJB4Q9NTQ9 TSPAN3-210ENST00000561277 1592 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
GJB4Q9NTQ9 SCO1-203ENST00000577427 1601 ntTSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
GJB4Q9NTQ9 CAMKV-205ENST00000467248 1688 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.7 ms