Protein–RNA interactions for Protein: Q9NTJ3

SMC4, Structural maintenance of chromosomes protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 1,288 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMC4Q9NTJ3 CLN8-208ENST00000635751 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
SMC4Q9NTJ3 ST3GAL3-219ENST00000372374 2170 ntTSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
SMC4Q9NTJ3 TPCN2-208ENST00000637342 2856 ntTSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
SMC4Q9NTJ3 C2orf54-201ENST00000307486 2017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
SMC4Q9NTJ3 APTR-204ENST00000440088 2029 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
SMC4Q9NTJ3 FGF16-201ENST00000439435 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
SMC4Q9NTJ3 RTKN-201ENST00000233330 2220 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
SMC4Q9NTJ3 MAPK9-203ENST00000393360 4326 ntTSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
SMC4Q9NTJ3 RFC2-202ENST00000352131 1576 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
SMC4Q9NTJ3 DGKZ-203ENST00000421244 2862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
SMC4Q9NTJ3 USP21-203ENST00000368002 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
SMC4Q9NTJ3 TAF4-201ENST00000252996 4628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
SMC4Q9NTJ3 IL17RC-203ENST00000403601 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
SMC4Q9NTJ3 ETV7-205ENST00000538992 1434 ntTSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
SMC4Q9NTJ3 PRR16-201ENST00000379551 1826 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
SMC4Q9NTJ3 PTPMT1-202ENST00000326674 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
SMC4Q9NTJ3 H3F3A-204ENST00000366816 799 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.31■■□□□ 1.64
SMC4Q9NTJ3 POM121L13P-201ENST00000422362 380 ntBASIC25.31■■□□□ 1.64
SMC4Q9NTJ3 GCC2-AS1-202ENST00000440975 574 ntTSL 4 BASIC25.31■■□□□ 1.64
SMC4Q9NTJ3 EPHA5-AS1-202ENST00000509473 1177 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
SMC4Q9NTJ3 AL121906.2-201ENST00000621597 723 ntBASIC25.31■■□□□ 1.64
SMC4Q9NTJ3 MRGPRF-201ENST00000309099 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
SMC4Q9NTJ3 AC104581.1-201ENST00000324348 2852 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
SMC4Q9NTJ3 UBE2F-205ENST00000414443 2100 ntTSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
SMC4Q9NTJ3 CBR1-205ENST00000530908 1924 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
SMC4Q9NTJ3 CASP6-201ENST00000265164 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
SMC4Q9NTJ3 WFIKKN1-201ENST00000319070 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
SMC4Q9NTJ3 WNT7B-202ENST00000409496 2285 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
SMC4Q9NTJ3 RASGRP2-211ENST00000394432 2304 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
SMC4Q9NTJ3 DUT-201ENST00000331200 2147 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
SMC4Q9NTJ3 METRNL-203ENST00000571814 1900 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
SMC4Q9NTJ3 ZNF771-202ENST00000434417 1454 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
SMC4Q9NTJ3 SMTN-204ENST00000404574 1735 ntTSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
SMC4Q9NTJ3 FBXL12-205ENST00000586651 1736 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
SMC4Q9NTJ3 GNB1-201ENST00000378609 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
SMC4Q9NTJ3 HAGLROS-201ENST00000426615 1121 ntTSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
SMC4Q9NTJ3 TSPAN14-209ENST00000481124 808 ntTSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
SMC4Q9NTJ3 AP001458.2-201ENST00000528405 577 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC25.3■■□□□ 1.64
SMC4Q9NTJ3 MMAB-206ENST00000540016 945 ntTSL 3 BASIC25.3■■□□□ 1.64
SMC4Q9NTJ3 AC073912.1-201ENST00000546264 587 ntTSL 3 BASIC25.3■■□□□ 1.64
SMC4Q9NTJ3 CIRBP-213ENST00000587323 1092 ntTSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
SMC4Q9NTJ3 TBX6-201ENST00000279386 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
SMC4Q9NTJ3 TBX6-205ENST00000627355 1796 ntTSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
SMC4Q9NTJ3 GORASP1-220ENST00000479927 1345 ntTSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
SMC4Q9NTJ3 PRR7-202ENST00000502922 1345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
SMC4Q9NTJ3 RPUSD2-202ENST00000559271 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
SMC4Q9NTJ3 SOCS2-207ENST00000549206 2072 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.3■■□□□ 1.64
SMC4Q9NTJ3 GALNT16-204ENST00000553669 1629 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
SMC4Q9NTJ3 GNB1-209ENST00000610897 3145 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
SMC4Q9NTJ3 UBC-201ENST00000339647 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
SMC4Q9NTJ3 CCT5-205ENST00000506600 1939 ntTSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
SMC4Q9NTJ3 BX005266.2-202ENST00000446626 2245 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
SMC4Q9NTJ3 CPEB1-214ENST00000617522 2220 ntTSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
SMC4Q9NTJ3 DHRS7-201ENST00000216500 2322 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
SMC4Q9NTJ3 ISLR2-202ENST00000419208 2306 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
SMC4Q9NTJ3 TMEM218-213ENST00000531909 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
SMC4Q9NTJ3 MRPL12-201ENST00000333676 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
SMC4Q9NTJ3 C6orf48-205ENST00000375640 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
SMC4Q9NTJ3 ESRRAP1-201ENST00000400596 1257 ntBASIC25.29■■□□□ 1.64
SMC4Q9NTJ3 THEM4-205ENST00000489410 643 ntTSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
SMC4Q9NTJ3 DEDD2-205ENST00000596251 1183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
SMC4Q9NTJ3 NCBP2-AS2-201ENST00000602845 918 ntAPPRIS P1 BASIC25.29■■□□□ 1.64
SMC4Q9NTJ3 EFHD2-201ENST00000375980 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
SMC4Q9NTJ3 DEDD2-204ENST00000595337 1894 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC25.29■■□□□ 1.64
SMC4Q9NTJ3 MBD1-216ENST00000587605 1945 ntTSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
SMC4Q9NTJ3 PWWP2AP1-201ENST00000429776 2273 ntBASIC25.29■■□□□ 1.64
SMC4Q9NTJ3 CACNA2D1-203ENST00000423588 1429 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
SMC4Q9NTJ3 CLIP3-206ENST00000593074 2080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
SMC4Q9NTJ3 IL17RE-206ENST00000454190 2757 ntTSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
SMC4Q9NTJ3 PDLIM2-207ENST00000409417 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
SMC4Q9NTJ3 CCM2-202ENST00000381112 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
SMC4Q9NTJ3 WDR74-202ENST00000311713 1153 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
SMC4Q9NTJ3 PNN-205ENST00000556530 601 ntTSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
SMC4Q9NTJ3 MAX-217ENST00000557277 728 ntTSL 3 BASIC25.28■■□□□ 1.64
SMC4Q9NTJ3 MAZ-215ENST00000569978 567 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
SMC4Q9NTJ3 AC233263.1-201ENST00000578059 224 ntBASIC25.28■■□□□ 1.64
SMC4Q9NTJ3 FAM32A-205ENST00000589852 1168 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
SMC4Q9NTJ3 NRP2-206ENST00000417189 2386 ntTSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
SMC4Q9NTJ3 P2RY6-210ENST00000542092 1674 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
SMC4Q9NTJ3 KCNK4-207ENST00000539216 1723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
SMC4Q9NTJ3 ANKRD13D-216ENST00000514166 2138 ntTSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
SMC4Q9NTJ3 TREX1-205ENST00000625293 1783 ntBASIC25.28■■□□□ 1.64
SMC4Q9NTJ3 ZNF282-204ENST00000610704 3722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
SMC4Q9NTJ3 GNAI1-201ENST00000351004 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
SMC4Q9NTJ3 CFP-201ENST00000247153 1713 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
SMC4Q9NTJ3 LSR-214ENST00000621372 2274 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
SMC4Q9NTJ3 GUK1-201ENST00000312726 1084 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
SMC4Q9NTJ3 CEACAM3-201ENST00000344550 1022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
SMC4Q9NTJ3 LINC01881-205ENST00000456398 1235 ntTSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
SMC4Q9NTJ3 RAVER2-201ENST00000294428 4398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
SMC4Q9NTJ3 TBL1Y-201ENST00000346432 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
SMC4Q9NTJ3 ACADVL-203ENST00000356839 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
SMC4Q9NTJ3 EML2-220ENST00000589876 2364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
SMC4Q9NTJ3 LPAR2-202ENST00000542587 2546 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
SMC4Q9NTJ3 ANXA2-201ENST00000332680 1444 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
SMC4Q9NTJ3 NFIL3-201ENST00000297689 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
SMC4Q9NTJ3 AC006001.3-204ENST00000638711 2103 ntTSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
SMC4Q9NTJ3 CSPG5-201ENST00000264723 4080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
SMC4Q9NTJ3 AC092835.1-201ENST00000425953 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
SMC4Q9NTJ3 MAP4K4-210ENST00000425019 4403 ntTSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.2 ms