Protein–RNA interactions for Protein: Q9NS93

TM7SF3, Transmembrane 7 superfamily member 3, humanhuman

Predictions only

Length 570 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TM7SF3Q9NS93 CBLC-201ENST00000270279 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
TM7SF3Q9NS93 DNTTIP1-201ENST00000372622 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
TM7SF3Q9NS93 RAMP1-204ENST00000409726 734 ntTSL 3 BASIC19.59■□□□□ 0.73
TM7SF3Q9NS93 USP46-AS1-201ENST00000503051 1048 ntTSL 3 BASIC19.59■□□□□ 0.73
TM7SF3Q9NS93 NCAM1-AS1-201ENST00000526229 1081 ntTSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
TM7SF3Q9NS93 TPM1-226ENST00000560959 925 ntTSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
TM7SF3Q9NS93 NAPSB-206ENST00000562112 1266 ntBASIC19.59■□□□□ 0.73
TM7SF3Q9NS93 AP005263.1-201ENST00000579126 914 ntTSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
TM7SF3Q9NS93 ACTR8-202ENST00000482349 2091 ntTSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
TM7SF3Q9NS93 NCLN-205ENST00000590671 2070 ntTSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
TM7SF3Q9NS93 KCNS3-201ENST00000304101 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
TM7SF3Q9NS93 ST6GALNAC6-215ENST00000542456 2018 ntTSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
TM7SF3Q9NS93 RASSF7-204ENST00000431809 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
TM7SF3Q9NS93 AL391422.3-201ENST00000603791 2761 ntBASIC19.59■□□□□ 0.73
TM7SF3Q9NS93 SLC22A17-202ENST00000354772 2238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
TM7SF3Q9NS93 KRT18-202ENST00000388837 1420 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
TM7SF3Q9NS93 FLCN-203ENST00000389169 1692 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
TM7SF3Q9NS93 PPARG-202ENST00000309576 1870 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.73
TM7SF3Q9NS93 PHF2-201ENST00000359246 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
TM7SF3Q9NS93 DUSP5-201ENST00000369583 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
TM7SF3Q9NS93 WT1-212ENST00000640146 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
TM7SF3Q9NS93 MGARP-201ENST00000398955 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
TM7SF3Q9NS93 CHRNA3-202ENST00000348639 2030 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
TM7SF3Q9NS93 SNAP23-202ENST00000349777 2480 ntTSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.73
TM7SF3Q9NS93 DNAL4-201ENST00000216068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
TM7SF3Q9NS93 B4GALT1-202ENST00000535206 1535 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
TM7SF3Q9NS93 CLDND2-201ENST00000291715 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
TM7SF3Q9NS93 RTL8A-201ENST00000370775 1244 ntAPPRIS P1 BASIC19.58■□□□□ 0.72
TM7SF3Q9NS93 FBXO32-202ENST00000443022 1227 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
TM7SF3Q9NS93 MCRIP1-201ENST00000455127 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
TM7SF3Q9NS93 SLC52A2-205ENST00000526752 710 ntTSL 3 BASIC19.58■□□□□ 0.72
TM7SF3Q9NS93 SMAD7-207ENST00000589634 1278 ntAPPRIS ALT1 TSL 4 BASIC19.58■□□□□ 0.72
TM7SF3Q9NS93 FP475955.1-201ENST00000624937 553 ntTSL 4 BASIC19.58■□□□□ 0.72
TM7SF3Q9NS93 SLC1A5-203ENST00000542575 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
TM7SF3Q9NS93 NMRAL1-213ENST00000574733 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.72
TM7SF3Q9NS93 C19orf35-201ENST00000342063 2574 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.72
TM7SF3Q9NS93 RALGPS1-204ENST00000373436 1667 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
TM7SF3Q9NS93 CIZ1-204ENST00000372938 2984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
TM7SF3Q9NS93 B4GALNT1-213ENST00000552350 1649 ntTSL 4 BASIC19.58■□□□□ 0.72
TM7SF3Q9NS93 NTN5-201ENST00000270235 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
TM7SF3Q9NS93 TINAGL1-211ENST00000537531 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.72
TM7SF3Q9NS93 LY6K-201ENST00000292430 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
TM7SF3Q9NS93 GUCY1A3-210ENST00000513574 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
TM7SF3Q9NS93 TANGO2-217ENST00000456048 2439 ntTSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
TM7SF3Q9NS93 GLT8D1-213ENST00000491606 1577 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
TM7SF3Q9NS93 KRT18P22-201ENST00000402024 1347 ntBASIC19.57■□□□□ 0.72
TM7SF3Q9NS93 SPAG16-209ENST00000447990 1330 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
TM7SF3Q9NS93 LRR1-201ENST00000298288 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
TM7SF3Q9NS93 RAD23A-203ENST00000586534 1746 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
TM7SF3Q9NS93 YAP1-202ENST00000345877 5284 ntTSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
TM7SF3Q9NS93 KLHDC1-201ENST00000359332 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
TM7SF3Q9NS93 MKRN1-208ENST00000474576 1661 ntTSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
TM7SF3Q9NS93 KRT18P57-201ENST00000443599 1254 ntBASIC19.57■□□□□ 0.72
TM7SF3Q9NS93 DUT-205ENST00000558813 769 ntTSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
TM7SF3Q9NS93 CR392000.1-201ENST00000624770 1228 ntBASIC19.57■□□□□ 0.72
TM7SF3Q9NS93 CCNYL1-202ENST00000339882 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
TM7SF3Q9NS93 KEAP1-202ENST00000393623 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
TM7SF3Q9NS93 CEBPA-201ENST00000498907 2631 ntAPPRIS P1 BASIC19.57■□□□□ 0.72
TM7SF3Q9NS93 RAB1B-201ENST00000311481 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
TM7SF3Q9NS93 JADE2-204ENST00000402835 2797 ntTSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
TM7SF3Q9NS93 WISP2-201ENST00000190983 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
TM7SF3Q9NS93 NDRG2-215ENST00000553503 2162 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
TM7SF3Q9NS93 AP2M1-203ENST00000411763 1577 ntTSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
TM7SF3Q9NS93 TUBGCP3-204ENST00000464139 2461 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
TM7SF3Q9NS93 MCEMP1-201ENST00000333598 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
TM7SF3Q9NS93 CLK3-202ENST00000395066 2621 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
TM7SF3Q9NS93 OLA1-204ENST00000409546 2071 ntTSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
TM7SF3Q9NS93 NKX6-1-202ENST00000515820 2194 ntTSL 3 BASIC19.56■□□□□ 0.72
TM7SF3Q9NS93 PABPC4-204ENST00000372862 2470 ntTSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
TM7SF3Q9NS93 RUFY3-203ENST00000417478 2143 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
TM7SF3Q9NS93 AL390955.1-201ENST00000428694 934 ntBASIC19.56■□□□□ 0.72
TM7SF3Q9NS93 AL137013.1-201ENST00000432946 1228 ntBASIC19.56■□□□□ 0.72
TM7SF3Q9NS93 KSR1P1-201ENST00000446298 240 ntBASIC19.56■□□□□ 0.72
TM7SF3Q9NS93 NME3-204ENST00000563498 920 ntTSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
TM7SF3Q9NS93 KRT78-201ENST00000304620 1778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
TM7SF3Q9NS93 FOXK2-201ENST00000335255 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
TM7SF3Q9NS93 IL17RC-202ENST00000383812 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
TM7SF3Q9NS93 LINC01505-207ENST00000637185 1540 ntTSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
TM7SF3Q9NS93 ACBD4-201ENST00000321854 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
TM7SF3Q9NS93 XBP1-203ENST00000403532 1824 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC19.55■□□□□ 0.72
TM7SF3Q9NS93 DNAAF4-201ENST00000321149 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
TM7SF3Q9NS93 CPNE7-202ENST00000319518 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
TM7SF3Q9NS93 CYP2D8P-201ENST00000433633 1490 ntBASIC19.55■□□□□ 0.72
TM7SF3Q9NS93 ETV7-206ENST00000615781 1776 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
TM7SF3Q9NS93 KREMEN2-202ENST00000319500 1882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
TM7SF3Q9NS93 VMO1-201ENST00000328739 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
TM7SF3Q9NS93 ING1-202ENST00000338450 1189 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
TM7SF3Q9NS93 TDRD10-202ENST00000368482 2331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
TM7SF3Q9NS93 KMT5B-204ENST00000402185 1881 ntTSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
TM7SF3Q9NS93 VSIG2-202ENST00000403470 1191 ntTSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
TM7SF3Q9NS93 AL133410.2-201ENST00000425499 696 ntTSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
TM7SF3Q9NS93 AC134772.1-201ENST00000438872 885 ntTSL 3 BASIC19.55■□□□□ 0.72
TM7SF3Q9NS93 RNF146-204ENST00000476956 884 ntTSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
TM7SF3Q9NS93 AC116562.2-201ENST00000507042 360 ntBASIC19.55■□□□□ 0.72
TM7SF3Q9NS93 PACSIN3-211ENST00000539589 2009 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
TM7SF3Q9NS93 CDKN3-209ENST00000556102 938 ntTSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
TM7SF3Q9NS93 FITM1-202ENST00000559294 800 ntBASIC19.55■□□□□ 0.72
TM7SF3Q9NS93 ADGRA3-204ENST00000502482 2870 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
TM7SF3Q9NS93 LINC01006-201ENST00000333319 2292 ntBASIC19.55■□□□□ 0.72
TM7SF3Q9NS93 ST3GAL3-239ENST00000545417 1667 ntTSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.3 ms