Protein–RNA interactions for Protein: Q9NRH2

SNRK, SNF-related serine/threonine-protein kinase, humanhuman

Predictions only

Length 765 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNRKQ9NRH2 ZNF561-AS1-201ENST00000585797 1593 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
SNRKQ9NRH2 BRSK2-212ENST00000531197 3163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
SNRKQ9NRH2 PHGDH-210ENST00000641115 1638 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
SNRKQ9NRH2 SHCBP1L-201ENST00000367547 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
SNRKQ9NRH2 TMEM91-203ENST00000392002 1389 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
SNRKQ9NRH2 Z83844.2-201ENST00000456099 1945 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
SNRKQ9NRH2 ME2-218ENST00000640965 2476 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
SNRKQ9NRH2 C17orf58-201ENST00000334461 1535 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
SNRKQ9NRH2 TREX2-204ENST00000370212 861 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
SNRKQ9NRH2 TREX2-205ENST00000370231 1255 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
SNRKQ9NRH2 TREX2-207ENST00000393862 907 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
SNRKQ9NRH2 TSPAN4-209ENST00000409543 1031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
SNRKQ9NRH2 ANKRD54-204ENST00000411961 946 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
SNRKQ9NRH2 AL590666.2-201ENST00000448869 758 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
SNRKQ9NRH2 TGIF1-219ENST00000551541 990 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
SNRKQ9NRH2 AC090877.2-202ENST00000560363 574 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
SNRKQ9NRH2 ELAC1-203ENST00000588577 694 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
SNRKQ9NRH2 KRTAP5-11-203ENST00000617152 558 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
SNRKQ9NRH2 KRTAP5-AS1-201ENST00000424148 2265 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
SNRKQ9NRH2 SMIM10L2B-201ENST00000433425 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
SNRKQ9NRH2 SOX8-201ENST00000293894 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
SNRKQ9NRH2 MOK-225ENST00000522867 1883 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
SNRKQ9NRH2 TXNRD2-202ENST00000400518 2025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
SNRKQ9NRH2 CBWD3-201ENST00000360171 2165 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
SNRKQ9NRH2 DOK2-201ENST00000276420 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
SNRKQ9NRH2 TOR1A-201ENST00000351698 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
SNRKQ9NRH2 MORF4L2-AS1-201ENST00000435306 2086 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
SNRKQ9NRH2 CXCL16-201ENST00000293778 2222 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
SNRKQ9NRH2 TFP1-202ENST00000475455 1573 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
SNRKQ9NRH2 CD8B-203ENST00000390655 1417 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
SNRKQ9NRH2 ZIM2-206ENST00000599935 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
SNRKQ9NRH2 AKR1A1-201ENST00000351829 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
SNRKQ9NRH2 PFN3-201ENST00000358571 530 ntAPPRIS P1 BASIC24.05■■□□□ 1.44
SNRKQ9NRH2 GPSM1-203ENST00000392944 1111 ntTSL 3 BASIC24.05■■□□□ 1.44
SNRKQ9NRH2 METTL5-206ENST00000409965 880 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
SNRKQ9NRH2 AC035140.1-201ENST00000507957 493 ntTSL 3 BASIC24.05■■□□□ 1.44
SNRKQ9NRH2 DHRS4-206ENST00000558581 1143 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
SNRKQ9NRH2 ISG20-210ENST00000560741 800 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
SNRKQ9NRH2 AC007786.1-201ENST00000587859 709 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
SNRKQ9NRH2 CABP2-204ENST00000636477 941 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
SNRKQ9NRH2 RABEPK-204ENST00000394125 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
SNRKQ9NRH2 MARK3-206ENST00000440884 2643 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
SNRKQ9NRH2 NFKBIE-204ENST00000619360 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
SNRKQ9NRH2 SH3RF3-201ENST00000309415 5803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
SNRKQ9NRH2 EPS8L1-201ENST00000201647 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
SNRKQ9NRH2 PARP2-202ENST00000429687 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
SNRKQ9NRH2 ROPN1-209ENST00000495093 1376 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
SNRKQ9NRH2 UBXN11-201ENST00000314675 2254 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
SNRKQ9NRH2 ENTPD8-201ENST00000344119 2111 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
SNRKQ9NRH2 GPR50-AS1-201ENST00000454196 1620 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
SNRKQ9NRH2 LGALS9C-212ENST00000583322 1602 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
SNRKQ9NRH2 HAS3-201ENST00000219322 1163 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
SNRKQ9NRH2 WDR74-201ENST00000278856 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
SNRKQ9NRH2 CCDC107-202ENST00000378406 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
SNRKQ9NRH2 DNPH1-202ENST00000393987 796 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
SNRKQ9NRH2 MRPL2-207ENST00000487429 905 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
SNRKQ9NRH2 AL354712.1-201ENST00000563570 477 ntTSL 3 BASIC24.04■■□□□ 1.44
SNRKQ9NRH2 SMAGP-206ENST00000604188 433 ntTSL 3 BASIC24.04■■□□□ 1.44
SNRKQ9NRH2 FCMR-210ENST00000628511 1055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
SNRKQ9NRH2 INTS11-209ENST00000450926 1839 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
SNRKQ9NRH2 SSBP3-216ENST00000610401 3168 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
SNRKQ9NRH2 NPAS1-201ENST00000439365 1341 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
SNRKQ9NRH2 SAV1-201ENST00000324679 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
SNRKQ9NRH2 ONECUT3-201ENST00000382349 8318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
SNRKQ9NRH2 THOC6-209ENST00000575576 1360 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
SNRKQ9NRH2 RASL12-201ENST00000220062 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
SNRKQ9NRH2 MAP3K14-AS1-203ENST00000585780 2475 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
SNRKQ9NRH2 EBF1-202ENST00000380654 2345 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
SNRKQ9NRH2 FAM98C-201ENST00000252530 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
SNRKQ9NRH2 RPS2P55-201ENST00000397318 883 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
SNRKQ9NRH2 AC107956.1-201ENST00000494359 873 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
SNRKQ9NRH2 ADAMTS19-AS1-201ENST00000502827 786 ntTSL 4 BASIC24.03■■□□□ 1.44
SNRKQ9NRH2 AC140479.4-201ENST00000561715 463 ntTSL 4 BASIC24.03■■□□□ 1.44
SNRKQ9NRH2 AC027682.2-201ENST00000563083 336 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
SNRKQ9NRH2 ALKBH6-213ENST00000486389 1525 ntTSL 3 BASIC24.03■■□□□ 1.44
SNRKQ9NRH2 SAAL1-204ENST00000529318 1503 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
SNRKQ9NRH2 TRMU-202ENST00000381019 1381 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
SNRKQ9NRH2 ODF3L2-202ENST00000382696 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
SNRKQ9NRH2 TTC12-202ENST00000393020 2541 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
SNRKQ9NRH2 ZSCAN1-201ENST00000282326 2054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
SNRKQ9NRH2 CPLX3-201ENST00000395018 2082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
SNRKQ9NRH2 GALNT16-204ENST00000553669 1629 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
SNRKQ9NRH2 KCNMA1-252ENST00000639120 2308 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
SNRKQ9NRH2 LETM2-208ENST00000524874 1459 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
SNRKQ9NRH2 MTURN-201ENST00000324453 5937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
SNRKQ9NRH2 BEAN1-202ENST00000536005 1988 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
SNRKQ9NRH2 PDCD2-202ENST00000392090 936 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
SNRKQ9NRH2 AC110769.1-201ENST00000420161 815 ntTSL 3 BASIC24.02■■□□□ 1.44
SNRKQ9NRH2 SNORA78-201ENST00000459373 127 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
SNRKQ9NRH2 RBCK1-213ENST00000475269 1200 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
SNRKQ9NRH2 AC097641.1-201ENST00000580671 588 ntTSL 4 BASIC24.02■■□□□ 1.44
SNRKQ9NRH2 C17orf62-238ENST00000585064 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
SNRKQ9NRH2 FAM98C-205ENST00000588262 826 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
SNRKQ9NRH2 TMEM8A-201ENST00000250930 2346 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
SNRKQ9NRH2 DLEU7-201ENST00000400393 2092 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
SNRKQ9NRH2 NRXN2-205ENST00000409571 6381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
SNRKQ9NRH2 KCNH2-201ENST00000262186 4286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
SNRKQ9NRH2 SYT7-208ENST00000542670 1887 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
SNRKQ9NRH2 ALDOA-221ENST00000566897 2448 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
SNRKQ9NRH2 ING1-201ENST00000333219 5119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.9 ms