Protein–RNA interactions for Protein: Q9NPA1

KCNMB3, Calcium-activated potassium channel subunit beta-3, humanhuman

Predictions only

Length 279 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KCNMB3Q9NPA1 HSPB2-C11orf52-202ENST00000534100 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
KCNMB3Q9NPA1 KCNK4-207ENST00000539216 1723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
KCNMB3Q9NPA1 ISLR2-202ENST00000419208 2306 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
KCNMB3Q9NPA1 WIPF2-202ENST00000394103 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
KCNMB3Q9NPA1 NPNT-214ENST00000514622 2362 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
KCNMB3Q9NPA1 HNRNPLL-203ENST00000378915 2523 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
KCNMB3Q9NPA1 RAC1-202ENST00000356142 907 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
KCNMB3Q9NPA1 MCRIP1-201ENST00000455127 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
KCNMB3Q9NPA1 KRT18P16-201ENST00000510337 1294 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
KCNMB3Q9NPA1 AC091564.5-201ENST00000526456 820 ntTSL 4 BASIC22.19■■□□□ 1.14
KCNMB3Q9NPA1 AL353593.2-202ENST00000602947 550 ntTSL 4 BASIC22.19■■□□□ 1.14
KCNMB3Q9NPA1 FBXO28-202ENST00000424254 1334 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
KCNMB3Q9NPA1 CD8B-203ENST00000390655 1417 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
KCNMB3Q9NPA1 MEF2B-204ENST00000424583 1405 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
KCNMB3Q9NPA1 SAAL1-202ENST00000524803 1582 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
KCNMB3Q9NPA1 LHX3-202ENST00000371748 2365 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
KCNMB3Q9NPA1 SIMC1-203ENST00000429602 2694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
KCNMB3Q9NPA1 PHOX2B-201ENST00000226382 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
KCNMB3Q9NPA1 SYT5-202ENST00000537500 2612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
KCNMB3Q9NPA1 EPS8L1-201ENST00000201647 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
KCNMB3Q9NPA1 RTN4RL2-201ENST00000335099 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
KCNMB3Q9NPA1 AC125437.2-201ENST00000625180 2167 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
KCNMB3Q9NPA1 HDAC2-201ENST00000368632 2084 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
KCNMB3Q9NPA1 POLR1D-203ENST00000399697 2036 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
KCNMB3Q9NPA1 ST3GAL4-209ENST00000526727 1967 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
KCNMB3Q9NPA1 RAB34-204ENST00000395245 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
KCNMB3Q9NPA1 CFP-201ENST00000247153 1713 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
KCNMB3Q9NPA1 FAM131C-201ENST00000375662 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
KCNMB3Q9NPA1 CYHR1-202ENST00000403000 1477 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
KCNMB3Q9NPA1 CD151-213ENST00000528011 1369 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
KCNMB3Q9NPA1 HP1BP3-202ENST00000375000 928 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
KCNMB3Q9NPA1 UBE2F-203ENST00000409633 837 ntTSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
KCNMB3Q9NPA1 KRT16P5-201ENST00000455284 522 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
KCNMB3Q9NPA1 SFXN1-203ENST00000502393 637 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
KCNMB3Q9NPA1 PTTG1-205ENST00000520452 895 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
KCNMB3Q9NPA1 AC091564.2-201ENST00000527191 399 ntTSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
KCNMB3Q9NPA1 RHOD-202ENST00000532559 538 ntTSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
KCNMB3Q9NPA1 METTL23-208ENST00000588822 1049 ntTSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
KCNMB3Q9NPA1 AC011446.2-202ENST00000592882 756 ntTSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
KCNMB3Q9NPA1 KCTD13-207ENST00000568000 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
KCNMB3Q9NPA1 FBXO27-201ENST00000292853 2330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
KCNMB3Q9NPA1 ACOT2-204ENST00000613168 1553 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
KCNMB3Q9NPA1 CENPH-206ENST00000515001 1305 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
KCNMB3Q9NPA1 FAM98C-201ENST00000252530 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
KCNMB3Q9NPA1 KANK4-202ENST00000354381 2103 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
KCNMB3Q9NPA1 SEC61A2-206ENST00000379051 707 ntTSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
KCNMB3Q9NPA1 METTL5-206ENST00000409965 880 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
KCNMB3Q9NPA1 NCF1B-202ENST00000432102 930 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
KCNMB3Q9NPA1 ARMC4P1-202ENST00000576034 643 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
KCNMB3Q9NPA1 ELAC1-203ENST00000588577 694 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
KCNMB3Q9NPA1 AL024498.1-202ENST00000606652 480 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
KCNMB3Q9NPA1 FAM197Y4-202ENST00000622692 608 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
KCNMB3Q9NPA1 MAP7D1-201ENST00000316156 3456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
KCNMB3Q9NPA1 MICU2-201ENST00000382374 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
KCNMB3Q9NPA1 RAB5C-202ENST00000393860 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
KCNMB3Q9NPA1 FAM110A-204ENST00000381941 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
KCNMB3Q9NPA1 PATZ1-201ENST00000215919 2516 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
KCNMB3Q9NPA1 SNX3-201ENST00000230085 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
KCNMB3Q9NPA1 PAIP1-203ENST00000436644 1734 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
KCNMB3Q9NPA1 SHCBP1L-201ENST00000367547 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
KCNMB3Q9NPA1 ZNF561-AS1-201ENST00000585797 1593 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
KCNMB3Q9NPA1 NTMT1-209ENST00000611055 1562 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
KCNMB3Q9NPA1 BCS1L-201ENST00000359273 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
KCNMB3Q9NPA1 CYB561-204ENST00000448884 1496 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
KCNMB3Q9NPA1 B4GALT2-201ENST00000309519 2004 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
KCNMB3Q9NPA1 SOS2-201ENST00000216373 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
KCNMB3Q9NPA1 THOC6-209ENST00000575576 1360 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
KCNMB3Q9NPA1 TTBK1-202ENST00000304139 2449 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
KCNMB3Q9NPA1 MRM1-204ENST00000614766 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
KCNMB3Q9NPA1 TMEM191C-214ENST00000621561 1337 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
KCNMB3Q9NPA1 MRPL15-201ENST00000260102 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
KCNMB3Q9NPA1 AL360181.5-201ENST00000368554 1044 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
KCNMB3Q9NPA1 SMG1P1-207ENST00000446662 852 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
KCNMB3Q9NPA1 UBE2SP1-201ENST00000450587 669 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
KCNMB3Q9NPA1 CERNA3-201ENST00000521403 557 ntTSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
KCNMB3Q9NPA1 GLB1-201ENST00000307363 2616 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
KCNMB3Q9NPA1 DUT-201ENST00000331200 2147 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
KCNMB3Q9NPA1 PTPRJ-201ENST00000418331 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
KCNMB3Q9NPA1 PRR16-201ENST00000379551 1826 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
KCNMB3Q9NPA1 MSLN-205ENST00000563941 2109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
KCNMB3Q9NPA1 EFHD2-201ENST00000375980 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
KCNMB3Q9NPA1 AKR1A1-201ENST00000351829 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
KCNMB3Q9NPA1 POLR2J-202ENST00000393794 784 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
KCNMB3Q9NPA1 AC007040.1-201ENST00000416229 477 ntTSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
KCNMB3Q9NPA1 IAH1-215ENST00000497473 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
KCNMB3Q9NPA1 TK2-204ENST00000525974 1178 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
KCNMB3Q9NPA1 C17orf62-238ENST00000585064 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
KCNMB3Q9NPA1 SPIB-206ENST00000596074 847 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
KCNMB3Q9NPA1 GABRD-201ENST00000378585 1961 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
KCNMB3Q9NPA1 PLSCR3-212ENST00000576201 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
KCNMB3Q9NPA1 SLC25A22-228ENST00000628067 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
KCNMB3Q9NPA1 RUNX3-202ENST00000338888 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
KCNMB3Q9NPA1 GPR20-201ENST00000377741 1515 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
KCNMB3Q9NPA1 NDOR1-204ENST00000458322 1829 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
KCNMB3Q9NPA1 SMC5-AS1-201ENST00000594708 1818 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
KCNMB3Q9NPA1 PBX1-222ENST00000627490 1769 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
KCNMB3Q9NPA1 SMARCD2-203ENST00000448276 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
KCNMB3Q9NPA1 NSUN2-206ENST00000506139 2619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.14
KCNMB3Q9NPA1 KLC1-208ENST00000452929 2453 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
KCNMB3Q9NPA1 C6orf132-202ENST00000356542 894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.8 ms