Protein–RNA interactions for Protein: Q9NP61

ARFGAP3, ADP-ribosylation factor GTPase-activating protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 516 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARFGAP3Q9NP61 MMP28-204ENST00000615136 2033 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
ARFGAP3Q9NP61 HSD11B1L-201ENST00000301382 1457 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
ARFGAP3Q9NP61 USP25-204ENST00000400183 5341 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
ARFGAP3Q9NP61 CBR1-201ENST00000290349 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
ARFGAP3Q9NP61 UBE2D3-201ENST00000321805 1087 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
ARFGAP3Q9NP61 CTNNAL1-202ENST00000374593 761 ntTSL 3 BASIC21.02■□□□□ 0.96
ARFGAP3Q9NP61 TMEM109-202ENST00000536171 1959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
ARFGAP3Q9NP61 KRT86-202ENST00000423955 2217 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
ARFGAP3Q9NP61 MAN1B1-AS1-201ENST00000596585 1872 ntBASIC21.02■□□□□ 0.96
ARFGAP3Q9NP61 ACVR1B-203ENST00000426655 1782 ntTSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
ARFGAP3Q9NP61 GABBR1-204ENST00000377016 4299 ntTSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
ARFGAP3Q9NP61 TSPAN4-206ENST00000397408 1430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
ARFGAP3Q9NP61 BTBD9-205ENST00000419706 2034 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
ARFGAP3Q9NP61 ZNF623-203ENST00000526926 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
ARFGAP3Q9NP61 USP48-204ENST00000400301 4309 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.95
ARFGAP3Q9NP61 BCKDK-202ENST00000287507 1907 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.95
ARFGAP3Q9NP61 SLC35F3-201ENST00000366617 2762 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.95
ARFGAP3Q9NP61 CADPS2-208ENST00000615869 6066 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
ARFGAP3Q9NP61 PTPA-206ENST00000358994 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
ARFGAP3Q9NP61 ZBTB10-205ENST00000610895 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
ARFGAP3Q9NP61 RNF167-205ENST00000571816 1728 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
ARFGAP3Q9NP61 FOXI1-201ENST00000306268 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
ARFGAP3Q9NP61 SLC41A3-201ENST00000315891 1797 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
ARFGAP3Q9NP61 H1FX-AS1-204ENST00000511998 917 ntTSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
ARFGAP3Q9NP61 AC007773.1-201ENST00000592680 972 ntTSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
ARFGAP3Q9NP61 SLC34A3-202ENST00000538474 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
ARFGAP3Q9NP61 ANXA8L1-201ENST00000584982 2174 ntTSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
ARFGAP3Q9NP61 ZNF346-201ENST00000358149 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
ARFGAP3Q9NP61 KCNC4-204ENST00000438661 2953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
ARFGAP3Q9NP61 MSRB1-201ENST00000361871 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
ARFGAP3Q9NP61 SH3BP1-201ENST00000357436 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
ARFGAP3Q9NP61 TREX2-202ENST00000334497 1982 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
ARFGAP3Q9NP61 SLC11A2-208ENST00000546743 1740 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
ARFGAP3Q9NP61 POLD3-203ENST00000527458 2122 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
ARFGAP3Q9NP61 CCNJL-203ENST00000393977 3320 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
ARFGAP3Q9NP61 KMT5A-201ENST00000330479 3069 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
ARFGAP3Q9NP61 HERPUD2-202ENST00000396081 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
ARFGAP3Q9NP61 MYEOV-201ENST00000308946 2287 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
ARFGAP3Q9NP61 RNF32-208ENST00000432459 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
ARFGAP3Q9NP61 HNF4A-205ENST00000443598 1603 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
ARFGAP3Q9NP61 NOP14-204ENST00000502735 2723 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
ARFGAP3Q9NP61 ACHE-205ENST00000419336 1906 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
ARFGAP3Q9NP61 TAF6-211ENST00000453269 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
ARFGAP3Q9NP61 IQSEC1-201ENST00000273221 5279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
ARFGAP3Q9NP61 PKN1-201ENST00000242783 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
ARFGAP3Q9NP61 DTX3-208ENST00000551632 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21■□□□□ 0.95
ARFGAP3Q9NP61 ILDR2-203ENST00000469934 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
ARFGAP3Q9NP61 STX7-201ENST00000367937 1090 ntTSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
ARFGAP3Q9NP61 FAM46A-203ENST00000369756 5537 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
ARFGAP3Q9NP61 GPR3-201ENST00000374024 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
ARFGAP3Q9NP61 C19orf12-205ENST00000392278 895 ntTSL 2 BASIC21■□□□□ 0.95
ARFGAP3Q9NP61 CAMKMT-202ENST00000402247 665 ntTSL 2 BASIC21■□□□□ 0.95
ARFGAP3Q9NP61 PYCR3-203ENST00000433751 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21■□□□□ 0.95
ARFGAP3Q9NP61 DBI-210ENST00000542275 757 ntTSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
ARFGAP3Q9NP61 AC140479.5-201ENST00000568189 735 ntTSL 3 BASIC21■□□□□ 0.95
ARFGAP3Q9NP61 CIRBP-222ENST00000589235 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21■□□□□ 0.95
ARFGAP3Q9NP61 RPS15-210ENST00000592623 873 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
ARFGAP3Q9NP61 AC092437.1-201ENST00000624794 1048 ntBASIC21■□□□□ 0.95
ARFGAP3Q9NP61 AC093762.3-201ENST00000641918 318 ntAPPRIS P1 BASIC21■□□□□ 0.95
ARFGAP3Q9NP61 ZBTB48-202ENST00000377674 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
ARFGAP3Q9NP61 TTLL10-203ENST00000379290 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
ARFGAP3Q9NP61 KCNQ5-203ENST00000355635 6623 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
ARFGAP3Q9NP61 AIRN-201ENST00000601203 4374 ntBASIC21■□□□□ 0.95
ARFGAP3Q9NP61 GPR162-203ENST00000428545 1610 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
ARFGAP3Q9NP61 GPR50-AS1-201ENST00000454196 1620 ntTSL 2 BASIC21■□□□□ 0.95
ARFGAP3Q9NP61 PAQR6-205ENST00000368270 1765 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
ARFGAP3Q9NP61 ETV7-206ENST00000615781 1776 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
ARFGAP3Q9NP61 RALGPS1-208ENST00000424082 2362 ntTSL 2 BASIC21■□□□□ 0.95
ARFGAP3Q9NP61 AIRE-201ENST00000291582 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
ARFGAP3Q9NP61 TCAP-201ENST00000309889 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
ARFGAP3Q9NP61 SNX21-201ENST00000342644 1506 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
ARFGAP3Q9NP61 SDK1-202ENST00000404826 10397 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
ARFGAP3Q9NP61 COPS7A-204ENST00000534947 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
ARFGAP3Q9NP61 RDH13-203ENST00000415061 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
ARFGAP3Q9NP61 POMT2-201ENST00000261534 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
ARFGAP3Q9NP61 CA7-201ENST00000338437 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
ARFGAP3Q9NP61 PLEKHG5-201ENST00000340850 4715 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
ARFGAP3Q9NP61 PLEKHG5-211ENST00000535355 4725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.99■□□□□ 0.95
ARFGAP3Q9NP61 EXD3-208ENST00000479452 962 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
ARFGAP3Q9NP61 AC137761.2-201ENST00000561729 223 ntBASIC20.99■□□□□ 0.95
ARFGAP3Q9NP61 AC145350.3-201ENST00000569033 163 ntBASIC20.99■□□□□ 0.95
ARFGAP3Q9NP61 ZSCAN1-201ENST00000282326 2054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.99■□□□□ 0.95
ARFGAP3Q9NP61 CLEC10A-201ENST00000254868 1797 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
ARFGAP3Q9NP61 HLA-G-204ENST00000376828 1490 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.99■□□□□ 0.95
ARFGAP3Q9NP61 ATP2A2-201ENST00000308664 4453 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
ARFGAP3Q9NP61 HYLS1-203ENST00000526028 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
ARFGAP3Q9NP61 PKP3-201ENST00000331563 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
ARFGAP3Q9NP61 ASMTL-201ENST00000381317 2027 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
ARFGAP3Q9NP61 ASMTL-202ENST00000381333 2035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.99■□□□□ 0.95
ARFGAP3Q9NP61 MAFF-207ENST00000538999 2365 ntTSL 2 BASIC20.99■□□□□ 0.95
ARFGAP3Q9NP61 ACSF2-201ENST00000300441 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
ARFGAP3Q9NP61 TRMT6-202ENST00000453074 2239 ntTSL 2 BASIC20.98■□□□□ 0.95
ARFGAP3Q9NP61 NDRG2-242ENST00000555158 2216 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
ARFGAP3Q9NP61 TLK2-203ENST00000346027 3449 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
ARFGAP3Q9NP61 GPR31-201ENST00000366834 2059 ntAPPRIS P1 BASIC20.98■□□□□ 0.95
ARFGAP3Q9NP61 MAN1A1-201ENST00000368468 5014 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.98■□□□□ 0.95
ARFGAP3Q9NP61 SPNS1-204ENST00000352260 1948 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
ARFGAP3Q9NP61 GSTM3-202ENST00000361066 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
ARFGAP3Q9NP61 ZNF302-206ENST00000505242 2849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
ARFGAP3Q9NP61 MYO9A-214ENST00000566885 5111 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.4 ms