Protein–RNA interactions for Protein: Q9HCU9

BRMS1, Breast cancer metastasis-suppressor 1, humanhuman

Predictions only

Length 246 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BRMS1Q9HCU9 TH-206ENST00000381178 1910 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
BRMS1Q9HCU9 FUZ-201ENST00000313777 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
BRMS1Q9HCU9 KCNK4-201ENST00000394525 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
BRMS1Q9HCU9 SPOCK3-215ENST00000510741 1963 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
BRMS1Q9HCU9 RAB34-204ENST00000395245 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
BRMS1Q9HCU9 PHLDA3-202ENST00000367311 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
BRMS1Q9HCU9 EPOR-208ENST00000592375 2086 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
BRMS1Q9HCU9 OGG1-204ENST00000339511 1815 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
BRMS1Q9HCU9 CFC1-201ENST00000259216 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
BRMS1Q9HCU9 CFC1B-201ENST00000281882 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
BRMS1Q9HCU9 TNIK-208ENST00000465393 750 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
BRMS1Q9HCU9 MAX-217ENST00000557277 728 ntTSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
BRMS1Q9HCU9 EML2-AS1-202ENST00000591087 838 ntTSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
BRMS1Q9HCU9 AP2M1-203ENST00000411763 1577 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
BRMS1Q9HCU9 AC116351.2-201ENST00000606540 1585 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
BRMS1Q9HCU9 KCNC2-204ENST00000540018 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
BRMS1Q9HCU9 SH2B1-202ENST00000337120 6043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
BRMS1Q9HCU9 DPH1-201ENST00000263083 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
BRMS1Q9HCU9 PPFIA1-201ENST00000253925 5234 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
BRMS1Q9HCU9 AC018553.1-201ENST00000616682 1458 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
BRMS1Q9HCU9 PDLIM2-221ENST00000622702 1490 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
BRMS1Q9HCU9 KLC1-219ENST00000555836 2467 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
BRMS1Q9HCU9 RIMKLB-202ENST00000357529 5830 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
BRMS1Q9HCU9 PARP2-202ENST00000429687 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
BRMS1Q9HCU9 RBM14-RBM4-201ENST00000412278 1566 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
BRMS1Q9HCU9 DALRD3-201ENST00000313778 1968 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
BRMS1Q9HCU9 ACOT2-205ENST00000622407 1604 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
BRMS1Q9HCU9 MRAP-201ENST00000303645 935 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
BRMS1Q9HCU9 MDK-204ENST00000395569 686 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
BRMS1Q9HCU9 AC114730.1-201ENST00000400768 472 ntTSL 4 BASIC22.73■■□□□ 1.23
BRMS1Q9HCU9 RPS2P52-201ENST00000469610 820 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
BRMS1Q9HCU9 AL929601.1-201ENST00000551565 573 ntTSL 4 BASIC22.73■■□□□ 1.23
BRMS1Q9HCU9 AC009065.4-203ENST00000562838 535 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
BRMS1Q9HCU9 AC009093.4-201ENST00000567984 561 ntTSL 4 BASIC22.73■■□□□ 1.23
BRMS1Q9HCU9 AC113189.1-201ENST00000570444 327 ntTSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
BRMS1Q9HCU9 AC068987.5-201ENST00000642069 987 ntAPPRIS P1 BASIC22.73■■□□□ 1.23
BRMS1Q9HCU9 RUVBL2-206ENST00000595090 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
BRMS1Q9HCU9 KCNN2-207ENST00000610748 2091 ntTSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
BRMS1Q9HCU9 KATNAL2-208ENST00000592005 1348 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
BRMS1Q9HCU9 LTBP4-201ENST00000204005 5032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
BRMS1Q9HCU9 CDO1-201ENST00000250535 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
BRMS1Q9HCU9 C17orf58-201ENST00000334461 1535 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
BRMS1Q9HCU9 ISCA1-203ENST00000375991 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
BRMS1Q9HCU9 HOXB2-201ENST00000330070 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
BRMS1Q9HCU9 TPCN2-209ENST00000637504 2736 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
BRMS1Q9HCU9 KANSL1-202ENST00000432791 5343 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
BRMS1Q9HCU9 C10orf76-201ENST00000311122 724 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
BRMS1Q9HCU9 TTC9B-201ENST00000311308 843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
BRMS1Q9HCU9 NPY-202ENST00000405982 565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
BRMS1Q9HCU9 SLC47A1P1-201ENST00000420951 500 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
BRMS1Q9HCU9 AC092849.2-201ENST00000492523 333 ntTSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
BRMS1Q9HCU9 PSME3-210ENST00000590720 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
BRMS1Q9HCU9 KRT83-201ENST00000293670 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
BRMS1Q9HCU9 GABRD-201ENST00000378585 1961 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
BRMS1Q9HCU9 CAV3-201ENST00000343849 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
BRMS1Q9HCU9 LRRC42-203ENST00000371370 2037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
BRMS1Q9HCU9 HSPA8-202ENST00000453788 2004 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
BRMS1Q9HCU9 LEFTY2-202ENST00000420304 2085 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
BRMS1Q9HCU9 TAPT1-201ENST00000405303 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
BRMS1Q9HCU9 PCSK6-214ENST00000611716 4409 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
BRMS1Q9HCU9 KDM5C-203ENST00000375383 5122 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
BRMS1Q9HCU9 ARNTL2-204ENST00000395901 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
BRMS1Q9HCU9 PLSCR3-212ENST00000576201 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
BRMS1Q9HCU9 THAP7-201ENST00000215742 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
BRMS1Q9HCU9 MEA1-201ENST00000244711 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
BRMS1Q9HCU9 CKLF-201ENST00000264001 669 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
BRMS1Q9HCU9 NDUFB1-201ENST00000329559 528 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
BRMS1Q9HCU9 STPG4-207ENST00000445927 891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
BRMS1Q9HCU9 SEC23A-AS1-201ENST00000557350 500 ntTSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
BRMS1Q9HCU9 HLX-201ENST00000366903 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
BRMS1Q9HCU9 MRGPRE-201ENST00000389832 1409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
BRMS1Q9HCU9 PSMD8-201ENST00000215071 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
BRMS1Q9HCU9 PGAM5-203ENST00000498926 2834 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
BRMS1Q9HCU9 FAM57B-204ENST00000564806 1710 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
BRMS1Q9HCU9 TXNRD2-202ENST00000400518 2025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
BRMS1Q9HCU9 AC068473.1-201ENST00000317008 1111 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
BRMS1Q9HCU9 SYNE2-201ENST00000341472 1132 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
BRMS1Q9HCU9 FAM160B1-201ENST00000369246 666 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
BRMS1Q9HCU9 EGFL7-202ENST00000371698 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
BRMS1Q9HCU9 RNA5SP413-201ENST00000516373 109 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
BRMS1Q9HCU9 PDXDC2P-202ENST00000527016 543 ntTSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.22
BRMS1Q9HCU9 COX4I1-202ENST00000561569 716 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
BRMS1Q9HCU9 CIRBP-213ENST00000587323 1092 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
BRMS1Q9HCU9 DCAKD-205ENST00000588499 990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
BRMS1Q9HCU9 AC008687.6-201ENST00000596318 630 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
BRMS1Q9HCU9 ANAPC11-223ENST00000612413 964 ntTSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.22
BRMS1Q9HCU9 AC120498.8-201ENST00000614275 531 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
BRMS1Q9HCU9 AL121906.2-201ENST00000621597 723 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
BRMS1Q9HCU9 PYURF-201ENST00000273968 1361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
BRMS1Q9HCU9 ADCY5-202ENST00000462833 7311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
BRMS1Q9HCU9 CDAN1-201ENST00000356231 4637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
BRMS1Q9HCU9 RNH1-203ENST00000397604 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
BRMS1Q9HCU9 EMC8-202ENST00000435200 1935 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
BRMS1Q9HCU9 METRNL-203ENST00000571814 1900 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
BRMS1Q9HCU9 ACVR1B-201ENST00000257963 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
BRMS1Q9HCU9 ENGASE-205ENST00000579016 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
BRMS1Q9HCU9 FAM46B-201ENST00000289166 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
BRMS1Q9HCU9 CHP2-201ENST00000300113 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
BRMS1Q9HCU9 MMP11-201ENST00000215743 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
BRMS1Q9HCU9 IRGQ-205ENST00000602269 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.1 ms