Protein–RNA interactions for Protein: Q9HCM3

KIAA1549, UPF0606 protein KIAA1549, humanhuman

Predictions only

Length 1,950 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KIAA1549Q9HCM3 C16orf74-202ENST00000602583 1237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
KIAA1549Q9HCM3 AL353708.3-201ENST00000610272 989 ntBASIC17.65■□□□□ 0.42
KIAA1549Q9HCM3 TOR1A-201ENST00000351698 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
KIAA1549Q9HCM3 FENDRR-203ENST00000595886 3095 ntTSL 2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
KIAA1549Q9HCM3 KLHDC4-201ENST00000270583 1886 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
KIAA1549Q9HCM3 GLB1-201ENST00000307363 2616 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
KIAA1549Q9HCM3 CSF1-203ENST00000369801 1364 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
KIAA1549Q9HCM3 TAF15-215ENST00000605844 2191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
KIAA1549Q9HCM3 PPP5C-202ENST00000391919 1929 ntTSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
KIAA1549Q9HCM3 KRT8P9-201ENST00000558927 1449 ntBASIC17.65■□□□□ 0.42
KIAA1549Q9HCM3 CHST1-201ENST00000308064 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
KIAA1549Q9HCM3 UBXN11-201ENST00000314675 2254 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
KIAA1549Q9HCM3 CSPG5-203ENST00000456150 2089 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.42
KIAA1549Q9HCM3 HAS3-201ENST00000219322 1163 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
KIAA1549Q9HCM3 HLA-G-202ENST00000376815 851 ntBASIC17.64■□□□□ 0.41
KIAA1549Q9HCM3 HLA-G-203ENST00000376818 1127 ntBASIC17.64■□□□□ 0.41
KIAA1549Q9HCM3 BX322234.1-201ENST00000444188 980 ntTSL 3 BASIC17.64■□□□□ 0.41
KIAA1549Q9HCM3 AC015712.2-203ENST00000560461 688 ntTSL 3 BASIC17.64■□□□□ 0.41
KIAA1549Q9HCM3 RBM14-RBM4-201ENST00000412278 1566 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
KIAA1549Q9HCM3 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
KIAA1549Q9HCM3 KRT16P3-203ENST00000580621 1939 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
KIAA1549Q9HCM3 HMOX2-218ENST00000619913 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
KIAA1549Q9HCM3 GTF2IRD2B-210ENST00000629105 1910 ntTSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
KIAA1549Q9HCM3 TMEM250-205ENST00000561457 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
KIAA1549Q9HCM3 HAUS4-204ENST00000490506 1447 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
KIAA1549Q9HCM3 PRMT2-206ENST00000397638 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
KIAA1549Q9HCM3 GAMT-201ENST00000252288 1121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
KIAA1549Q9HCM3 WNT1-201ENST00000293549 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
KIAA1549Q9HCM3 VKORC1-202ENST00000319788 1077 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
KIAA1549Q9HCM3 VMO1-201ENST00000328739 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
KIAA1549Q9HCM3 HDAC11-203ENST00000402271 1018 ntTSL 3 BASIC17.64■□□□□ 0.41
KIAA1549Q9HCM3 DMRT2-206ENST00000412350 1244 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
KIAA1549Q9HCM3 EFTUD1P1-201ENST00000558187 596 ntTSL 4 BASIC17.64■□□□□ 0.41
KIAA1549Q9HCM3 AF186192.3-201ENST00000583427 947 ntBASIC17.64■□□□□ 0.41
KIAA1549Q9HCM3 GOLGA6L3-201ENST00000507199 1679 ntBASIC17.64■□□□□ 0.41
KIAA1549Q9HCM3 YIPF2-201ENST00000253031 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
KIAA1549Q9HCM3 C19orf25-206ENST00000588849 1472 ntTSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
KIAA1549Q9HCM3 ISLR2-202ENST00000419208 2306 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
KIAA1549Q9HCM3 PRMT8-202ENST00000382622 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
KIAA1549Q9HCM3 SAAL1-204ENST00000529318 1503 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
KIAA1549Q9HCM3 KLF2-201ENST00000248071 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
KIAA1549Q9HCM3 KRT16-201ENST00000301653 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
KIAA1549Q9HCM3 SMARCB1-204ENST00000407422 1643 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
KIAA1549Q9HCM3 FYN-204ENST00000368678 2573 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
KIAA1549Q9HCM3 INTS11-208ENST00000435064 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
KIAA1549Q9HCM3 MFSD10-201ENST00000329687 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
KIAA1549Q9HCM3 DTX2-212ENST00000446820 1770 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
KIAA1549Q9HCM3 SLC52A2-209ENST00000530047 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
KIAA1549Q9HCM3 DNTTIP1-201ENST00000372622 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
KIAA1549Q9HCM3 DHRS4-206ENST00000558581 1143 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
KIAA1549Q9HCM3 OGG1-204ENST00000339511 1815 ntTSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
KIAA1549Q9HCM3 PSKH2-201ENST00000276616 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
KIAA1549Q9HCM3 HTR7P1-201ENST00000538670 1336 ntBASIC17.63■□□□□ 0.41
KIAA1549Q9HCM3 COL13A1-202ENST00000357811 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
KIAA1549Q9HCM3 TMEM91-203ENST00000392002 1389 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
KIAA1549Q9HCM3 Z83844.2-201ENST00000456099 1945 ntTSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
KIAA1549Q9HCM3 DALRD3-205ENST00000440857 2014 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
KIAA1549Q9HCM3 DMRTA2-202ENST00000418121 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
KIAA1549Q9HCM3 GALNT16-204ENST00000553669 1629 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
KIAA1549Q9HCM3 AC073130.3-201ENST00000624389 2278 ntBASIC17.63■□□□□ 0.41
KIAA1549Q9HCM3 TRPV6-209ENST00000638686 2298 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
KIAA1549Q9HCM3 PGAP1-204ENST00000409475 2443 ntTSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
KIAA1549Q9HCM3 SNX3-201ENST00000230085 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
KIAA1549Q9HCM3 TTC12-202ENST00000393020 2541 ntTSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
KIAA1549Q9HCM3 FAM66B-202ENST00000606573 2630 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
KIAA1549Q9HCM3 OGG1-217ENST00000449570 1948 ntTSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
KIAA1549Q9HCM3 ASB16-201ENST00000293414 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
KIAA1549Q9HCM3 AKIP1-206ENST00000525005 1128 ntTSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
KIAA1549Q9HCM3 YPEL3-207ENST00000566134 761 ntTSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
KIAA1549Q9HCM3 C1QL1P1-201ENST00000568105 661 ntBASIC17.62■□□□□ 0.41
KIAA1549Q9HCM3 CD177P1-201ENST00000606252 935 ntBASIC17.62■□□□□ 0.41
KIAA1549Q9HCM3 REXO1L10P-201ENST00000615707 1290 ntBASIC17.62■□□□□ 0.41
KIAA1549Q9HCM3 REXO1L12P-201ENST00000622156 912 ntBASIC17.62■□□□□ 0.41
KIAA1549Q9HCM3 RPUSD1-202ENST00000561734 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
KIAA1549Q9HCM3 COMMD7-202ENST00000446419 1343 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
KIAA1549Q9HCM3 VEGFB-201ENST00000309422 1380 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
KIAA1549Q9HCM3 EBF1-202ENST00000380654 2345 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
KIAA1549Q9HCM3 WIPF2-202ENST00000394103 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
KIAA1549Q9HCM3 MAEA-208ENST00000505839 1444 ntTSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
KIAA1549Q9HCM3 AL135905.2-201ENST00000584934 1404 ntBASIC17.62■□□□□ 0.41
KIAA1549Q9HCM3 MAP7D2-203ENST00000443379 2476 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
KIAA1549Q9HCM3 PSMD8-201ENST00000215071 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
KIAA1549Q9HCM3 RNH1-203ENST00000397604 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
KIAA1549Q9HCM3 B4GALT2-201ENST00000309519 2004 ntTSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
KIAA1549Q9HCM3 KIAA0895L-206ENST00000563902 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
KIAA1549Q9HCM3 UBR2-203ENST00000372903 2423 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
KIAA1549Q9HCM3 HPF1-201ENST00000393381 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
KIAA1549Q9HCM3 FDX2-207ENST00000494368 584 ntTSL 4 BASIC17.62■□□□□ 0.41
KIAA1549Q9HCM3 AC093752.1-201ENST00000511950 605 ntTSL 4 BASIC17.62■□□□□ 0.41
KIAA1549Q9HCM3 AC134349.1-201ENST00000543969 385 ntTSL 3 BASIC17.62■□□□□ 0.41
KIAA1549Q9HCM3 C20orf27-201ENST00000217195 1302 ntTSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
KIAA1549Q9HCM3 SRI-203ENST00000419179 1307 ntTSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
KIAA1549Q9HCM3 CCAR2-214ENST00000613179 1421 ntTSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
KIAA1549Q9HCM3 AC116351.2-201ENST00000606540 1585 ntBASIC17.62■□□□□ 0.41
KIAA1549Q9HCM3 CD37-204ENST00000535669 1674 ntTSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
KIAA1549Q9HCM3 MRM1-204ENST00000614766 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
KIAA1549Q9HCM3 POLR1D-203ENST00000399697 2036 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
KIAA1549Q9HCM3 NPNT-214ENST00000514622 2362 ntTSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
KIAA1549Q9HCM3 EPDR1-201ENST00000199448 2599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
KIAA1549Q9HCM3 NOS3-204ENST00000467517 2377 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.7 ms