Protein–RNA interactions for Protein: Q9HCJ6

VAT1L, Synaptic vesicle membrane protein VAT-1 homolog-like, humanhuman

Predictions only

Length 419 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VAT1LQ9HCJ6 SMAGP-206ENST00000604188 433 ntTSL 3 BASIC22.87■■□□□ 1.25
VAT1LQ9HCJ6 FCMR-210ENST00000628511 1055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
VAT1LQ9HCJ6 HGH1-201ENST00000347708 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
VAT1LQ9HCJ6 ST7-OT4-201ENST00000397750 1576 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
VAT1LQ9HCJ6 HDHD5-201ENST00000155674 1735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
VAT1LQ9HCJ6 FDXR-201ENST00000293195 1875 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
VAT1LQ9HCJ6 SSH3-202ENST00000308298 2046 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
VAT1LQ9HCJ6 PRKG2-207ENST00000628926 2623 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
VAT1LQ9HCJ6 NYAP1-202ENST00000454988 2777 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
VAT1LQ9HCJ6 ROPN1-209ENST00000495093 1376 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
VAT1LQ9HCJ6 THOC6-209ENST00000575576 1360 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
VAT1LQ9HCJ6 KCNMB4-201ENST00000258111 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
VAT1LQ9HCJ6 HDGFL2-208ENST00000616600 2281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
VAT1LQ9HCJ6 FBXO25-203ENST00000352684 2360 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
VAT1LQ9HCJ6 DOK2-201ENST00000276420 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
VAT1LQ9HCJ6 PRSS33-204ENST00000576886 1755 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
VAT1LQ9HCJ6 GPR50-AS1-201ENST00000454196 1620 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
VAT1LQ9HCJ6 KREMEN2-201ENST00000303746 2326 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
VAT1LQ9HCJ6 TAF7-201ENST00000313368 2334 ntAPPRIS P1 BASIC22.86■■□□□ 1.25
VAT1LQ9HCJ6 USP39-204ENST00000409766 2033 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
VAT1LQ9HCJ6 SSNA1-201ENST00000322310 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
VAT1LQ9HCJ6 NKAIN4-201ENST00000370307 793 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
VAT1LQ9HCJ6 MCRIP1-201ENST00000455127 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
VAT1LQ9HCJ6 CAPN5-206ENST00000531028 534 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
VAT1LQ9HCJ6 ISG20-210ENST00000560741 800 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
VAT1LQ9HCJ6 UBE2K-201ENST00000261427 5245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
VAT1LQ9HCJ6 CLN8-208ENST00000635751 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
VAT1LQ9HCJ6 KIAA0895L-206ENST00000563902 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
VAT1LQ9HCJ6 CLN5-201ENST00000377453 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
VAT1LQ9HCJ6 RNF224-201ENST00000445101 1798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.86■■□□□ 1.25
VAT1LQ9HCJ6 LINC01123-202ENST00000419296 2436 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
VAT1LQ9HCJ6 RPS6KL1-216ENST00000557413 2425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
VAT1LQ9HCJ6 TRIP13-201ENST00000166345 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
VAT1LQ9HCJ6 ZNF688-201ENST00000223459 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
VAT1LQ9HCJ6 ETFA-202ENST00000433983 1346 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
VAT1LQ9HCJ6 CSPG5-201ENST00000264723 4080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
VAT1LQ9HCJ6 LPAR2-203ENST00000586703 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
VAT1LQ9HCJ6 MAP3K15-201ENST00000338883 4012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
VAT1LQ9HCJ6 ZSCAN1-201ENST00000282326 2054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
VAT1LQ9HCJ6 SUMF2-208ENST00000434526 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
VAT1LQ9HCJ6 PDCD2-202ENST00000392090 936 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
VAT1LQ9HCJ6 RPS2P55-201ENST00000397318 883 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
VAT1LQ9HCJ6 METTL5-206ENST00000409965 880 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
VAT1LQ9HCJ6 KRT16P5-201ENST00000455284 522 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
VAT1LQ9HCJ6 AC107956.1-201ENST00000494359 873 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
VAT1LQ9HCJ6 AL354712.1-201ENST00000563570 477 ntTSL 3 BASIC22.85■■□□□ 1.25
VAT1LQ9HCJ6 AC004264.1-201ENST00000608354 794 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
VAT1LQ9HCJ6 HSPA8-202ENST00000453788 2004 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
VAT1LQ9HCJ6 LGALS9C-212ENST00000583322 1602 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
VAT1LQ9HCJ6 DNAAF3-207ENST00000527223 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
VAT1LQ9HCJ6 ZBTB7A-201ENST00000322357 5422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
VAT1LQ9HCJ6 NXNL2-202ENST00000375855 1457 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
VAT1LQ9HCJ6 BRSK2-215ENST00000544817 1842 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
VAT1LQ9HCJ6 SLC25A15-201ENST00000338625 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
VAT1LQ9HCJ6 MFSD10-201ENST00000329687 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
VAT1LQ9HCJ6 UNKL-205ENST00000397464 2180 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
VAT1LQ9HCJ6 CHRNB2-205ENST00000637900 2390 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
VAT1LQ9HCJ6 DYRK2-202ENST00000344096 8912 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
VAT1LQ9HCJ6 ALKBH6-213ENST00000486389 1525 ntTSL 3 BASIC22.84■■□□□ 1.25
VAT1LQ9HCJ6 MIR718-201ENST00000390190 70 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
VAT1LQ9HCJ6 C16orf90-202ENST00000437192 907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
VAT1LQ9HCJ6 ADAMTS19-AS1-201ENST00000502827 786 ntTSL 4 BASIC22.84■■□□□ 1.25
VAT1LQ9HCJ6 FP475955.1-201ENST00000624937 553 ntTSL 4 BASIC22.84■■□□□ 1.25
VAT1LQ9HCJ6 IRX4-208ENST00000622814 2398 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
VAT1LQ9HCJ6 LINC01547-202ENST00000397841 2303 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
VAT1LQ9HCJ6 HTR7P1-201ENST00000538670 1336 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
VAT1LQ9HCJ6 SLC17A7-201ENST00000221485 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
VAT1LQ9HCJ6 ARNTL2-204ENST00000395901 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
VAT1LQ9HCJ6 RNH1-203ENST00000397604 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
VAT1LQ9HCJ6 AGAP1-205ENST00000409538 6138 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
VAT1LQ9HCJ6 REM2-201ENST00000267396 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
VAT1LQ9HCJ6 NF2-201ENST00000334961 2020 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
VAT1LQ9HCJ6 ZNF773-204ENST00000598770 2019 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
VAT1LQ9HCJ6 WDR74-201ENST00000278856 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
VAT1LQ9HCJ6 YBEY-205ENST00000397694 534 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
VAT1LQ9HCJ6 NPY-202ENST00000405982 565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
VAT1LQ9HCJ6 NDUFA13-203ENST00000503283 825 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
VAT1LQ9HCJ6 AC140479.4-201ENST00000561715 463 ntTSL 4 BASIC22.83■■□□□ 1.25
VAT1LQ9HCJ6 LETM2-208ENST00000524874 1459 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
VAT1LQ9HCJ6 PAQR4-201ENST00000293978 2644 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
VAT1LQ9HCJ6 COCH-201ENST00000216361 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
VAT1LQ9HCJ6 AOC1-202ENST00000416793 2453 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
VAT1LQ9HCJ6 PLCL1-201ENST00000428675 5125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
VAT1LQ9HCJ6 ZNF510-203ENST00000375231 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
VAT1LQ9HCJ6 AC007249.2-201ENST00000553181 1737 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
VAT1LQ9HCJ6 MAP4K4-210ENST00000425019 4403 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
VAT1LQ9HCJ6 SORCS2-203ENST00000507866 6152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
VAT1LQ9HCJ6 PLEKHH3-201ENST00000293349 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
VAT1LQ9HCJ6 UBXN11-201ENST00000314675 2254 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
VAT1LQ9HCJ6 CPLX3-201ENST00000395018 2082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
VAT1LQ9HCJ6 SARDH-201ENST00000298628 1484 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
VAT1LQ9HCJ6 C19orf25-206ENST00000588849 1472 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
VAT1LQ9HCJ6 MRGPRG-201ENST00000332314 870 ntAPPRIS P1 BASIC22.82■■□□□ 1.24
VAT1LQ9HCJ6 CCDC107-202ENST00000378406 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
VAT1LQ9HCJ6 DNPH1-202ENST00000393987 796 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
VAT1LQ9HCJ6 C17orf97-203ENST00000571106 736 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
VAT1LQ9HCJ6 AC097641.1-201ENST00000580671 588 ntTSL 4 BASIC22.82■■□□□ 1.24
VAT1LQ9HCJ6 LINC01521-201ENST00000504184 1943 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
VAT1LQ9HCJ6 PNCK-201ENST00000340888 1508 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
VAT1LQ9HCJ6 MEF2B-204ENST00000424583 1405 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.8 ms