Protein–RNA interactions for Protein: Q9HAU5

UPF2, Regulator of nonsense transcripts 2, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,272 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UPF2Q9HAU5 FAM212B-203ENST00000444059 1423 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
UPF2Q9HAU5 MED26-207ENST00000611692 1444 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
UPF2Q9HAU5 GOLPH3-201ENST00000265070 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
UPF2Q9HAU5 SENP6-201ENST00000327284 2700 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
UPF2Q9HAU5 TMEM155-201ENST00000337677 2313 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
UPF2Q9HAU5 PTH2R-204ENST00000617735 2472 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
UPF2Q9HAU5 TMEM129-202ENST00000382936 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
UPF2Q9HAU5 RNH1-203ENST00000397604 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
UPF2Q9HAU5 SLC25A39-212ENST00000590194 1542 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
UPF2Q9HAU5 HEBP2-204ENST00000607197 10014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
UPF2Q9HAU5 GLI4-201ENST00000340042 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
UPF2Q9HAU5 EEF1A2-201ENST00000217182 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
UPF2Q9HAU5 SLC16A5-206ENST00000580123 2019 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
UPF2Q9HAU5 MUTYH-203ENST00000372098 1839 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
UPF2Q9HAU5 MUTYH-204ENST00000372104 1823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
UPF2Q9HAU5 MUTYH-205ENST00000372110 1809 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
UPF2Q9HAU5 CAPZB-205ENST00000433834 1462 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
UPF2Q9HAU5 MAZ-214ENST00000568544 1464 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
UPF2Q9HAU5 ESPN-216ENST00000636330 4731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
UPF2Q9HAU5 EI24-201ENST00000278903 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
UPF2Q9HAU5 MAP1LC3A-202ENST00000374837 961 ntTSL 3 BASIC24.15■■□□□ 1.46
UPF2Q9HAU5 TSPY4-201ENST00000383008 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
UPF2Q9HAU5 RNH1-202ENST00000356187 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
UPF2Q9HAU5 KRT8P17-201ENST00000453110 1448 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
UPF2Q9HAU5 NECAB3-202ENST00000375238 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
UPF2Q9HAU5 PYCR1-216ENST00000619204 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
UPF2Q9HAU5 GTF2IRD2B-210ENST00000629105 1910 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
UPF2Q9HAU5 IRF7-203ENST00000397566 2051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
UPF2Q9HAU5 AP001271.2-201ENST00000624018 1556 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
UPF2Q9HAU5 SPIRE2-201ENST00000378247 3235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
UPF2Q9HAU5 WDR88-201ENST00000355868 1718 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
UPF2Q9HAU5 MIB2-203ENST00000378712 2890 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
UPF2Q9HAU5 TMSB4X-203ENST00000380636 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
UPF2Q9HAU5 TSEN15-203ENST00000423085 1743 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
UPF2Q9HAU5 ENTPD8-204ENST00000472938 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
UPF2Q9HAU5 ZDHHC3-205ENST00000424952 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
UPF2Q9HAU5 FKRP-202ENST00000391909 2801 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
UPF2Q9HAU5 P2RY6-210ENST00000542092 1674 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
UPF2Q9HAU5 ARMC6-220ENST00000546344 1814 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.46
UPF2Q9HAU5 TEAD2-202ENST00000377214 2440 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.46
UPF2Q9HAU5 AHCYL2-201ENST00000325006 5056 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
UPF2Q9HAU5 ADRM1-201ENST00000253003 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
UPF2Q9HAU5 EPS8L2-230ENST00000610855 1633 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.46
UPF2Q9HAU5 MAN2A1-201ENST00000261483 4667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
UPF2Q9HAU5 AC069544.2-201ENST00000640019 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
UPF2Q9HAU5 AK1-201ENST00000223836 736 ntTSL 3 BASIC24.14■■□□□ 1.45
UPF2Q9HAU5 GALK1-201ENST00000225614 1445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
UPF2Q9HAU5 SIM2-201ENST00000290399 4442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
UPF2Q9HAU5 RAP1B-202ENST00000341355 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.14■■□□□ 1.45
UPF2Q9HAU5 HYI-206ENST00000372434 1025 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
UPF2Q9HAU5 N4BP3-201ENST00000274605 6080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
UPF2Q9HAU5 NEURL3-202ENST00000435380 1675 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
UPF2Q9HAU5 IKBIP-203ENST00000393042 1368 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
UPF2Q9HAU5 DBNL-217ENST00000468694 2068 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
UPF2Q9HAU5 EXTL3-201ENST00000220562 6483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
UPF2Q9HAU5 BLACE-201ENST00000378120 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
UPF2Q9HAU5 ANKRD6-202ENST00000369408 5258 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
UPF2Q9HAU5 NCAN-201ENST00000252575 6387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
UPF2Q9HAU5 OPRD1-201ENST00000234961 9345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
UPF2Q9HAU5 MLLT1-201ENST00000252674 4507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
UPF2Q9HAU5 P2RX2-204ENST00000351222 1140 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
UPF2Q9HAU5 TMEM54-202ENST00000373463 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
UPF2Q9HAU5 ZNF292-204ENST00000392985 1096 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
UPF2Q9HAU5 FAIM-203ENST00000393034 927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
UPF2Q9HAU5 AC004882.1-201ENST00000416352 590 ntTSL 3 BASIC24.13■■□□□ 1.45
UPF2Q9HAU5 CASP6-205ENST00000505486 538 ntTSL 4 BASIC24.13■■□□□ 1.45
UPF2Q9HAU5 C19orf84-201ENST00000570516 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
UPF2Q9HAU5 AP2S1-207ENST00000599990 829 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
UPF2Q9HAU5 RALB-208ENST00000631312 311 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
UPF2Q9HAU5 ZNF213-202ENST00000416391 2996 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
UPF2Q9HAU5 RPH3A-203ENST00000543106 2581 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
UPF2Q9HAU5 ANTXR1-202ENST00000409349 1384 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
UPF2Q9HAU5 IGFBP1-203ENST00000468955 1369 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
UPF2Q9HAU5 CDH24-205ENST00000554034 2759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
UPF2Q9HAU5 SPATA20-226ENST00000619622 2769 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
UPF2Q9HAU5 EDN3-204ENST00000371028 2397 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
UPF2Q9HAU5 SYNM-202ENST00000336292 7394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
UPF2Q9HAU5 SOWAHC-201ENST00000356454 4657 ntAPPRIS P1 BASIC24.13■■□□□ 1.45
UPF2Q9HAU5 ZIC1-201ENST00000282928 5241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
UPF2Q9HAU5 CA11-201ENST00000084798 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
UPF2Q9HAU5 CASD1-201ENST00000297273 3942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
UPF2Q9HAU5 KRT8-217ENST00000619952 2437 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
UPF2Q9HAU5 FBXO41-204ENST00000520530 3293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
UPF2Q9HAU5 ASMTL-201ENST00000381317 2027 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
UPF2Q9HAU5 ASMTL-202ENST00000381333 2035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
UPF2Q9HAU5 POFUT2-201ENST00000331343 4825 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
UPF2Q9HAU5 CCDC28B-201ENST00000373602 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
UPF2Q9HAU5 AKNA-205ENST00000374079 2138 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
UPF2Q9HAU5 AC123595.1-201ENST00000440769 1046 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
UPF2Q9HAU5 AC105001.1-201ENST00000506149 821 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
UPF2Q9HAU5 ZNF436-AS1-206ENST00000518821 461 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
UPF2Q9HAU5 AP001972.3-201ENST00000530792 495 ntTSL 3 BASIC24.12■■□□□ 1.45
UPF2Q9HAU5 GABARAPL2-205ENST00000568455 646 ntTSL 3 BASIC24.12■■□□□ 1.45
UPF2Q9HAU5 AC244517.4-202ENST00000624089 484 ntTSL 3 BASIC24.12■■□□□ 1.45
UPF2Q9HAU5 LTBP3-217ENST00000530785 2461 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
UPF2Q9HAU5 CNIH2-201ENST00000311445 1356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
UPF2Q9HAU5 CYP21A1P-202ENST00000354927 1481 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
UPF2Q9HAU5 GLDN-201ENST00000335449 4971 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
UPF2Q9HAU5 GJB6-204ENST00000400066 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
UPF2Q9HAU5 CARD9-201ENST00000371732 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34 ms