Protein–RNA interactions for Protein: Q9H4P4

RNF41, E3 ubiquitin-protein ligase NRDP1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 317 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNF41Q9H4P4 ALKBH6-213ENST00000486389 1525 ntTSL 3 BASIC23.28■■□□□ 1.32
RNF41Q9H4P4 KLF2-201ENST00000248071 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
RNF41Q9H4P4 LRRC42-203ENST00000371370 2037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
RNF41Q9H4P4 ODC1-201ENST00000234111 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
RNF41Q9H4P4 TOR1A-201ENST00000351698 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
RNF41Q9H4P4 EPDR1-201ENST00000199448 2599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
RNF41Q9H4P4 POU5F1-201ENST00000259915 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
RNF41Q9H4P4 CCAR2-214ENST00000613179 1421 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
RNF41Q9H4P4 MRPL15-201ENST00000260102 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
RNF41Q9H4P4 MTHFD1L-201ENST00000367307 1049 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
RNF41Q9H4P4 CCDC74B-203ENST00000409128 789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
RNF41Q9H4P4 UBE2SP1-201ENST00000450587 669 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
RNF41Q9H4P4 PTTG1-205ENST00000520452 895 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.28■■□□□ 1.32
RNF41Q9H4P4 NDUFS3-212ENST00000534208 583 ntTSL 4 BASIC23.28■■□□□ 1.32
RNF41Q9H4P4 AC004771.5-201ENST00000575985 542 ntTSL 4 BASIC23.28■■□□□ 1.32
RNF41Q9H4P4 AC011446.2-202ENST00000592882 756 ntTSL 3 BASIC23.28■■□□□ 1.32
RNF41Q9H4P4 AC013268.1-201ENST00000639717 1208 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
RNF41Q9H4P4 INTS11-209ENST00000450926 1839 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
RNF41Q9H4P4 KMT5B-201ENST00000304363 5837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
RNF41Q9H4P4 LONP1-203ENST00000585374 2882 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
RNF41Q9H4P4 STK16-201ENST00000396738 1673 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
RNF41Q9H4P4 ACY1-215ENST00000636358 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
RNF41Q9H4P4 KLHDC4-201ENST00000270583 1886 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
RNF41Q9H4P4 RAB5A-201ENST00000273047 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
RNF41Q9H4P4 CD8B-203ENST00000390655 1417 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
RNF41Q9H4P4 PCSK6-217ENST00000618548 4269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
RNF41Q9H4P4 ACOT8-201ENST00000217455 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
RNF41Q9H4P4 PSMG1-202ENST00000380900 907 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
RNF41Q9H4P4 SMG1P1-207ENST00000446662 852 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
RNF41Q9H4P4 FP475955.1-201ENST00000624937 553 ntTSL 4 BASIC23.27■■□□□ 1.32
RNF41Q9H4P4 GOLGA6L3-201ENST00000507199 1679 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
RNF41Q9H4P4 P2RY6-210ENST00000542092 1674 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
RNF41Q9H4P4 YIPF2-201ENST00000253031 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
RNF41Q9H4P4 SAXO1-202ENST00000380534 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
RNF41Q9H4P4 RNH1-203ENST00000397604 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
RNF41Q9H4P4 KRT87P-201ENST00000529785 1700 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
RNF41Q9H4P4 RPUSD1-202ENST00000561734 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
RNF41Q9H4P4 PSMD8-201ENST00000215071 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
RNF41Q9H4P4 RBM14-RBM4-201ENST00000412278 1566 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
RNF41Q9H4P4 RPUSD2-202ENST00000559271 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
RNF41Q9H4P4 ODF3L2-202ENST00000382696 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.31
RNF41Q9H4P4 MRFAP1-201ENST00000320912 2049 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
RNF41Q9H4P4 MAPT-203ENST00000340799 5724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
RNF41Q9H4P4 ACAP3-201ENST00000353662 2280 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
RNF41Q9H4P4 Z83844.2-201ENST00000456099 1945 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
RNF41Q9H4P4 KXD1-202ENST00000539106 1496 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.26■■□□□ 1.31
RNF41Q9H4P4 HIC1-207ENST00000619757 6711 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
RNF41Q9H4P4 RORA-204ENST00000449337 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
RNF41Q9H4P4 PEX7-202ENST00000367756 680 ntTSL 3 BASIC23.26■■□□□ 1.31
RNF41Q9H4P4 LINC01786-202ENST00000453732 389 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
RNF41Q9H4P4 KRT16P5-201ENST00000455284 522 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
RNF41Q9H4P4 SFXN1-203ENST00000502393 637 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
RNF41Q9H4P4 AC091564.2-201ENST00000527191 399 ntTSL 3 BASIC23.26■■□□□ 1.31
RNF41Q9H4P4 OVCH1-AS1-203ENST00000551108 963 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
RNF41Q9H4P4 CABP2-204ENST00000636477 941 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
RNF41Q9H4P4 ZNF276-208ENST00000568064 2203 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
RNF41Q9H4P4 SPG7-202ENST00000341316 2288 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
RNF41Q9H4P4 MGARP-201ENST00000398955 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
RNF41Q9H4P4 ACOT2-204ENST00000613168 1553 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
RNF41Q9H4P4 LBX2-AS1-202ENST00000603175 2083 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
RNF41Q9H4P4 BRSK2-208ENST00000528841 3586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
RNF41Q9H4P4 RBPJL-203ENST00000372743 1623 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
RNF41Q9H4P4 CHST8-203ENST00000438847 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
RNF41Q9H4P4 THOC6-209ENST00000575576 1360 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
RNF41Q9H4P4 GPR20-201ENST00000377741 1515 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.25■■□□□ 1.31
RNF41Q9H4P4 EXOC3L2-202ENST00000413988 2964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
RNF41Q9H4P4 RAB29-203ENST00000414729 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
RNF41Q9H4P4 NCF1B-202ENST00000432102 930 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
RNF41Q9H4P4 NELFE-206ENST00000444811 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
RNF41Q9H4P4 MCRIP1-201ENST00000455127 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
RNF41Q9H4P4 CERNA3-201ENST00000521403 557 ntTSL 3 BASIC23.25■■□□□ 1.31
RNF41Q9H4P4 BACE1-203ENST00000428381 1333 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
RNF41Q9H4P4 GTF2IRD2B-210ENST00000629105 1910 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
RNF41Q9H4P4 RASL12-201ENST00000220062 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
RNF41Q9H4P4 DALRD3-205ENST00000440857 2014 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
RNF41Q9H4P4 PSMD6-201ENST00000295901 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
RNF41Q9H4P4 ANKRD13D-202ENST00000447274 2881 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
RNF41Q9H4P4 SAAL1-202ENST00000524803 1582 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
RNF41Q9H4P4 PFKFB3-217ENST00000626882 1965 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
RNF41Q9H4P4 SAV1-201ENST00000324679 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
RNF41Q9H4P4 LGALS7-201ENST00000378626 466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
RNF41Q9H4P4 AC007040.1-201ENST00000416229 477 ntTSL 3 BASIC23.24■■□□□ 1.31
RNF41Q9H4P4 STK24-AS1-201ENST00000434547 1278 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
RNF41Q9H4P4 TNFRSF18-204ENST00000486728 727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
RNF41Q9H4P4 IAH1-215ENST00000497473 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
RNF41Q9H4P4 DLEU7-203ENST00000504404 1122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
RNF41Q9H4P4 KRT18P16-201ENST00000510337 1294 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
RNF41Q9H4P4 AC091564.5-201ENST00000526456 820 ntTSL 4 BASIC23.24■■□□□ 1.31
RNF41Q9H4P4 RHOD-202ENST00000532559 538 ntTSL 3 BASIC23.24■■□□□ 1.31
RNF41Q9H4P4 GRAMD1B-209ENST00000533341 707 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
RNF41Q9H4P4 ARF3-208ENST00000541959 807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
RNF41Q9H4P4 C17orf97-203ENST00000571106 736 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
RNF41Q9H4P4 ARMC4P1-202ENST00000576034 643 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
RNF41Q9H4P4 SYNGR4-202ENST00000595322 533 ntTSL 3 BASIC23.24■■□□□ 1.31
RNF41Q9H4P4 JOSD2-202ENST00000595669 733 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
RNF41Q9H4P4 SPIB-206ENST00000596074 847 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
RNF41Q9H4P4 SMAGP-206ENST00000604188 433 ntTSL 3 BASIC23.24■■□□□ 1.31
RNF41Q9H4P4 POLR1D-203ENST00000399697 2036 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
RNF41Q9H4P4 C19orf66-201ENST00000253110 2117 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
RNF41Q9H4P4 GRK4-203ENST00000398052 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.2 ms