Protein–RNA interactions for Protein: Q9H0E7

USP44, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 44, humanhuman

Predictions only

Length 712 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP44Q9H0E7 RPL23AP53-202ENST00000606507 370 ntTSL 3 BASIC24.7■■□□□ 1.54
USP44Q9H0E7 MTFP1-206ENST00000629597 482 ntTSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
USP44Q9H0E7 MICU2-201ENST00000382374 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
USP44Q9H0E7 SARDH-201ENST00000298628 1484 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
USP44Q9H0E7 LINC02361-201ENST00000538731 1484 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
USP44Q9H0E7 PSMD6-201ENST00000295901 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
USP44Q9H0E7 MRFAP1-201ENST00000320912 2049 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
USP44Q9H0E7 FAM3A-203ENST00000369641 1359 ntTSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
USP44Q9H0E7 ROPN1-209ENST00000495093 1376 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
USP44Q9H0E7 TTC12-202ENST00000393020 2541 ntTSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
USP44Q9H0E7 ACHE-204ENST00000412389 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
USP44Q9H0E7 HMOX2-218ENST00000619913 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
USP44Q9H0E7 CHST8-203ENST00000438847 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
USP44Q9H0E7 AC093827.2-201ENST00000512654 315 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
USP44Q9H0E7 ARF3-208ENST00000541959 807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
USP44Q9H0E7 AC027682.2-201ENST00000563083 336 ntTSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
USP44Q9H0E7 AC091551.1-201ENST00000590722 1228 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
USP44Q9H0E7 FCMR-210ENST00000628511 1055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
USP44Q9H0E7 CABP2-204ENST00000636477 941 ntTSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
USP44Q9H0E7 SMC5-AS1-201ENST00000594708 1818 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
USP44Q9H0E7 ANKLE2-201ENST00000357997 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
USP44Q9H0E7 RBM34-201ENST00000408888 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
USP44Q9H0E7 PRELID3B-201ENST00000355937 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
USP44Q9H0E7 EBF1-202ENST00000380654 2345 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
USP44Q9H0E7 KRT78-201ENST00000304620 1778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
USP44Q9H0E7 KLF2-201ENST00000248071 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
USP44Q9H0E7 KRTAP5-AS1-201ENST00000424148 2265 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
USP44Q9H0E7 CXCL16-201ENST00000293778 2222 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
USP44Q9H0E7 RPUSD2-202ENST00000559271 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
USP44Q9H0E7 GPR20-201ENST00000377741 1515 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.68■■□□□ 1.54
USP44Q9H0E7 BEAN1-202ENST00000536005 1988 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
USP44Q9H0E7 PFKFB3-217ENST00000626882 1965 ntTSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
USP44Q9H0E7 RAB29-203ENST00000414729 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
USP44Q9H0E7 RBCK1-213ENST00000475269 1200 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
USP44Q9H0E7 RARRES2P10-201ENST00000564312 460 ntBASIC24.68■■□□□ 1.54
USP44Q9H0E7 AP006294.2-201ENST00000641667 209 ntBASIC24.68■■□□□ 1.54
USP44Q9H0E7 NXNL2-202ENST00000375855 1457 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
USP44Q9H0E7 KRT16P3-203ENST00000580621 1939 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
USP44Q9H0E7 CCM2-202ENST00000381112 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
USP44Q9H0E7 GPT-205ENST00000528431 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
USP44Q9H0E7 BYSL-201ENST00000230340 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
USP44Q9H0E7 GCSH-201ENST00000315467 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
USP44Q9H0E7 FAM58A-204ENST00000576892 1306 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
USP44Q9H0E7 OGG1-217ENST00000449570 1948 ntTSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
USP44Q9H0E7 NAB2-202ENST00000342556 2318 ntTSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
USP44Q9H0E7 ZGPAT-203ENST00000357119 1896 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
USP44Q9H0E7 FGF16-201ENST00000439435 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
USP44Q9H0E7 C1QBP-201ENST00000225698 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
USP44Q9H0E7 PTPRCAP-201ENST00000326294 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
USP44Q9H0E7 DMRT2-206ENST00000412350 1244 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
USP44Q9H0E7 SNX5-213ENST00000486039 602 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
USP44Q9H0E7 SBF2-AS1-202ENST00000499953 854 ntTSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
USP44Q9H0E7 AC092718.1-201ENST00000501068 1088 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
USP44Q9H0E7 MOK-228ENST00000523231 1114 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
USP44Q9H0E7 TMEM9B-203ENST00000528117 949 ntTSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
USP44Q9H0E7 KRTAP5-11-203ENST00000617152 558 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
USP44Q9H0E7 AKT2-210ENST00000424901 5170 ntTSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
USP44Q9H0E7 TNFRSF1A-201ENST00000162749 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
USP44Q9H0E7 DPH1-201ENST00000263083 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
USP44Q9H0E7 GRB14-201ENST00000263915 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
USP44Q9H0E7 ADAD1-202ENST00000388724 1912 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
USP44Q9H0E7 LSM4-203ENST00000593829 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
USP44Q9H0E7 PML-204ENST00000359928 1726 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
USP44Q9H0E7 GLB1-201ENST00000307363 2616 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
USP44Q9H0E7 FAM131C-201ENST00000375662 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
USP44Q9H0E7 P2RY6-210ENST00000542092 1674 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
USP44Q9H0E7 VAV3-202ENST00000370056 4990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
USP44Q9H0E7 AC125437.2-201ENST00000625180 2167 ntBASIC24.66■■□□□ 1.54
USP44Q9H0E7 TSPY8-201ENST00000287721 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
USP44Q9H0E7 CXCL3-201ENST00000296026 1075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
USP44Q9H0E7 BSX-201ENST00000343035 830 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
USP44Q9H0E7 RPS2P55-201ENST00000397318 883 ntBASIC24.66■■□□□ 1.54
USP44Q9H0E7 ANKRD54-204ENST00000411961 946 ntTSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
USP44Q9H0E7 TSPY10-201ENST00000428845 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
USP44Q9H0E7 TSPY3-203ENST00000457222 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
USP44Q9H0E7 GLYCTK-205ENST00000473032 935 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
USP44Q9H0E7 AC107956.1-201ENST00000494359 873 ntBASIC24.66■■□□□ 1.54
USP44Q9H0E7 AC019257.1-201ENST00000517676 557 ntTSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
USP44Q9H0E7 REXO2-216ENST00000544196 452 ntTSL 3 BASIC24.66■■□□□ 1.54
USP44Q9H0E7 AL049780.2-201ENST00000556236 367 ntTSL 3 BASIC24.66■■□□□ 1.54
USP44Q9H0E7 AC004264.1-201ENST00000608354 794 ntBASIC24.66■■□□□ 1.54
USP44Q9H0E7 OLFM1-204ENST00000371793 2444 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.66■■□□□ 1.54
USP44Q9H0E7 RBM14-RBM4-201ENST00000412278 1566 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
USP44Q9H0E7 CFP-201ENST00000247153 1713 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
USP44Q9H0E7 EPS8L1-201ENST00000201647 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
USP44Q9H0E7 SSBP3-216ENST00000610401 3168 ntTSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
USP44Q9H0E7 DVL3-203ENST00000431765 2294 ntTSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
USP44Q9H0E7 TTBK1-202ENST00000304139 2449 ntTSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
USP44Q9H0E7 HSDL1-202ENST00000434463 1493 ntTSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
USP44Q9H0E7 GIPR-202ENST00000304207 1432 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
USP44Q9H0E7 LYPD1-201ENST00000345008 1033 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
USP44Q9H0E7 NKAIN4-201ENST00000370307 793 ntTSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
USP44Q9H0E7 TMEM44-203ENST00000381975 2197 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
USP44Q9H0E7 NCF1B-202ENST00000432102 930 ntTSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
USP44Q9H0E7 APTR-204ENST00000440088 2029 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
USP44Q9H0E7 LINC01786-202ENST00000453732 389 ntTSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
USP44Q9H0E7 ADAMTS19-AS1-201ENST00000502827 786 ntTSL 4 BASIC24.65■■□□□ 1.54
USP44Q9H0E7 NDUFA13-203ENST00000503283 825 ntTSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
USP44Q9H0E7 NFE2L1-204ENST00000536222 2172 ntTSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
USP44Q9H0E7 NOL3-204ENST00000564053 1592 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.7 ms