Protein–RNA interactions for Protein: Q9GZU7

CTDSP1, Carboxy-terminal domain RNA polymerase II polypeptide A small phosphatase 1, humanhuman

Predictions only

Length 261 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTDSP1Q9GZU7 VCPKMT-202ENST00000395860 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
CTDSP1Q9GZU7 PRR5-201ENST00000006251 1767 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
CTDSP1Q9GZU7 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
CTDSP1Q9GZU7 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
CTDSP1Q9GZU7 ATP6V0E2-204ENST00000464662 513 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
CTDSP1Q9GZU7 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
CTDSP1Q9GZU7 GUCY1A2-201ENST00000282249 3047 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
CTDSP1Q9GZU7 NR2F1-AS1-210ENST00000606739 1431 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
CTDSP1Q9GZU7 CTSB-202ENST00000353047 3875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
CTDSP1Q9GZU7 ADGRG2-202ENST00000354791 4494 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
CTDSP1Q9GZU7 B3GNT9-201ENST00000449549 2917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
CTDSP1Q9GZU7 GTSE1-AS1-202ENST00000623117 1518 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
CTDSP1Q9GZU7 TINAGL1-211ENST00000537531 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
CTDSP1Q9GZU7 WIZP1-201ENST00000531444 2299 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
CTDSP1Q9GZU7 GNE-201ENST00000377902 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
CTDSP1Q9GZU7 KANSL1L-201ENST00000281772 4754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
CTDSP1Q9GZU7 CYP2A6-201ENST00000301141 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
CTDSP1Q9GZU7 SMIM4-203ENST00000477703 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
CTDSP1Q9GZU7 TYMP-202ENST00000395678 1614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
CTDSP1Q9GZU7 LRPPRC-202ENST00000409659 1610 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
CTDSP1Q9GZU7 BACE1-201ENST00000313005 6326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
CTDSP1Q9GZU7 PIEZO1-201ENST00000301015 8072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
CTDSP1Q9GZU7 RIMS4-201ENST00000372851 5203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
CTDSP1Q9GZU7 RAB43-201ENST00000315150 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
CTDSP1Q9GZU7 MAP7-209ENST00000618822 4497 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
CTDSP1Q9GZU7 ASIC3-202ENST00000349064 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
CTDSP1Q9GZU7 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
CTDSP1Q9GZU7 SENP5-202ENST00000419026 973 ntTSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
CTDSP1Q9GZU7 ZNF436-AS1-206ENST00000518821 461 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
CTDSP1Q9GZU7 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
CTDSP1Q9GZU7 MIR2861-201ENST00000636310 90 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
CTDSP1Q9GZU7 ORC5-201ENST00000297431 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
CTDSP1Q9GZU7 NOMO2-202ENST00000381474 3911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
CTDSP1Q9GZU7 TAOK2-202ENST00000308893 5169 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
CTDSP1Q9GZU7 CAMKV-205ENST00000467248 1688 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
CTDSP1Q9GZU7 CD177-203ENST00000618265 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
CTDSP1Q9GZU7 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
CTDSP1Q9GZU7 ADAM15-207ENST00000368413 1901 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.02
CTDSP1Q9GZU7 ATP2C1-218ENST00000510168 5067 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.02
CTDSP1Q9GZU7 CDH24-201ENST00000267383 2873 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
CTDSP1Q9GZU7 IGFLR1-201ENST00000246532 1645 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
CTDSP1Q9GZU7 HNRNPAB-201ENST00000355836 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
CTDSP1Q9GZU7 NIPAL4-202ENST00000435489 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.02
CTDSP1Q9GZU7 MAPK11-201ENST00000330651 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
CTDSP1Q9GZU7 TMCC2-209ENST00000637895 1455 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CTDSP1Q9GZU7 SLC25A20-201ENST00000319017 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CTDSP1Q9GZU7 IGSF9-206ENST00000611023 2663 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CTDSP1Q9GZU7 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CTDSP1Q9GZU7 FAM102B-202ENST00000405454 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CTDSP1Q9GZU7 PTGER3-201ENST00000306666 2333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CTDSP1Q9GZU7 MYO1B-202ENST00000339514 5026 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CTDSP1Q9GZU7 NAPRT-202ENST00000426292 1654 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CTDSP1Q9GZU7 HSD17B12-201ENST00000278353 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CTDSP1Q9GZU7 PRDM8-203ENST00000504452 3706 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CTDSP1Q9GZU7 CLTA-204ENST00000433436 1235 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CTDSP1Q9GZU7 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CTDSP1Q9GZU7 CLTA-209ENST00000538225 1181 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CTDSP1Q9GZU7 CLTA-210ENST00000540080 989 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CTDSP1Q9GZU7 FBXL12-203ENST00000586073 582 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CTDSP1Q9GZU7 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CTDSP1Q9GZU7 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
CTDSP1Q9GZU7 SNAP23-201ENST00000249647 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CTDSP1Q9GZU7 CBWD6-201ENST00000377391 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CTDSP1Q9GZU7 AL121749.1-201ENST00000635993 1768 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CTDSP1Q9GZU7 SLC47A2-201ENST00000325411 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CTDSP1Q9GZU7 TMC6-202ENST00000322914 2786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CTDSP1Q9GZU7 SLC35A3-217ENST00000639807 2767 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CTDSP1Q9GZU7 KDM1A-201ENST00000356634 3033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CTDSP1Q9GZU7 LRRC3-201ENST00000291592 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CTDSP1Q9GZU7 CASTOR1-202ENST00000407689 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CTDSP1Q9GZU7 KRBOX1-AS1-201ENST00000447834 2134 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CTDSP1Q9GZU7 GFY-201ENST00000576655 1876 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CTDSP1Q9GZU7 TJP1-212ENST00000614355 6977 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CTDSP1Q9GZU7 AC139713.2-201ENST00000641328 2723 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
CTDSP1Q9GZU7 SERPINA4-202ENST00000555095 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CTDSP1Q9GZU7 ERLIN2-202ENST00000335171 1742 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CTDSP1Q9GZU7 DBNL-217ENST00000468694 2068 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CTDSP1Q9GZU7 SMPD3-203ENST00000563226 2093 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CTDSP1Q9GZU7 MSLN-207ENST00000566549 2418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CTDSP1Q9GZU7 SLC25A46-202ENST00000447245 1575 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CTDSP1Q9GZU7 FAM217A-208ENST00000639338 1929 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CTDSP1Q9GZU7 FAM76A-205ENST00000419687 1661 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CTDSP1Q9GZU7 BOD1L2-201ENST00000585477 3239 ntAPPRIS P1 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CTDSP1Q9GZU7 PRELID3A-209ENST00000592149 2001 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CTDSP1Q9GZU7 TCF25-225ENST00000614813 2047 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CTDSP1Q9GZU7 MCF2L-203ENST00000375604 6445 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CTDSP1Q9GZU7 TINAGL1-202ENST00000457433 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CTDSP1Q9GZU7 DUSP4-201ENST00000240100 5537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CTDSP1Q9GZU7 FAM46A-201ENST00000320172 5609 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CTDSP1Q9GZU7 ACTN3-203ENST00000513398 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CTDSP1Q9GZU7 GCH1-207ENST00000622544 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CTDSP1Q9GZU7 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CTDSP1Q9GZU7 NPW-201ENST00000329610 498 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CTDSP1Q9GZU7 C2orf82-201ENST00000331342 465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CTDSP1Q9GZU7 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CTDSP1Q9GZU7 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CTDSP1Q9GZU7 RNF166-203ENST00000541206 2419 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CTDSP1Q9GZU7 B3GALNT1-202ENST00000392779 3221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CTDSP1Q9GZU7 ZNF274-203ENST00000424679 2539 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CTDSP1Q9GZU7 JAKMIP1-202ENST00000409021 2975 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.7 ms