Protein–RNA interactions for Protein: Q9GZT6

CCDC90B, Coiled-coil domain-containing protein 90B, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 254 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC90BQ9GZT6 FDXR-204ENST00000442102 1967 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
CCDC90BQ9GZT6 ODC1-202ENST00000405333 1943 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
CCDC90BQ9GZT6 LENG9-203ENST00000611161 1916 ntAPPRIS P1 BASIC18.1■□□□□ 0.49
CCDC90BQ9GZT6 CACNA2D2-201ENST00000266039 5476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
CCDC90BQ9GZT6 OGFOD2-201ENST00000228922 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
CCDC90BQ9GZT6 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
CCDC90BQ9GZT6 PLEKHM2-201ENST00000375793 4004 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
CCDC90BQ9GZT6 SETD9-211ENST00000628593 1306 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
CCDC90BQ9GZT6 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
CCDC90BQ9GZT6 SLC26A1-203ENST00000398520 1111 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
CCDC90BQ9GZT6 KCTD20-202ENST00000373731 5619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
CCDC90BQ9GZT6 NLGN2-201ENST00000302926 4642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
CCDC90BQ9GZT6 ZNF419-201ENST00000221735 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
CCDC90BQ9GZT6 STARD3-201ENST00000336308 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
CCDC90BQ9GZT6 FAM129C-208ENST00000599164 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
CCDC90BQ9GZT6 SLC35B1-201ENST00000240333 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
CCDC90BQ9GZT6 MAP3K6-201ENST00000357582 4136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
CCDC90BQ9GZT6 TRIM9-201ENST00000298355 5284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
CCDC90BQ9GZT6 FAM135A-205ENST00000418814 6415 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
CCDC90BQ9GZT6 SH3BP1-201ENST00000357436 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
CCDC90BQ9GZT6 RALGPS1-204ENST00000373436 1667 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
CCDC90BQ9GZT6 ST3GAL3-239ENST00000545417 1667 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
CCDC90BQ9GZT6 ANKS3-201ENST00000304283 2662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
CCDC90BQ9GZT6 MCF2L-203ENST00000375604 6445 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
CCDC90BQ9GZT6 ADAM23-201ENST00000264377 6330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
CCDC90BQ9GZT6 MTDH-203ENST00000519934 2184 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
CCDC90BQ9GZT6 INS-202ENST00000381330 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
CCDC90BQ9GZT6 ARPC4-208ENST00000498623 942 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
CCDC90BQ9GZT6 TPT1-AS1-211ENST00000520622 604 ntTSL 4 BASIC18.09■□□□□ 0.49
CCDC90BQ9GZT6 DUX4L19-201ENST00000557448 1267 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
CCDC90BQ9GZT6 EEF1DP3-203ENST00000566025 782 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
CCDC90BQ9GZT6 GJD3-201ENST00000578689 885 ntAPPRIS P1 BASIC18.09■□□□□ 0.49
CCDC90BQ9GZT6 AC011298.3-201ENST00000615796 283 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
CCDC90BQ9GZT6 APOC3-205ENST00000630701 541 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
CCDC90BQ9GZT6 SLCO4A1-201ENST00000217159 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
CCDC90BQ9GZT6 CBR1-205ENST00000530908 1924 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
CCDC90BQ9GZT6 NEURL1B-201ENST00000369800 6424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
CCDC90BQ9GZT6 MOK-225ENST00000522867 1883 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
CCDC90BQ9GZT6 FAM57B-204ENST00000564806 1710 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
CCDC90BQ9GZT6 CMIP-209ENST00000566513 2288 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
CCDC90BQ9GZT6 ACSF2-201ENST00000300441 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
CCDC90BQ9GZT6 NOXO1-202ENST00000356120 1539 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
CCDC90BQ9GZT6 TCAP-201ENST00000309889 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
CCDC90BQ9GZT6 CTBP2-202ENST00000334808 2130 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
CCDC90BQ9GZT6 ALDOA-212ENST00000564546 2104 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
CCDC90BQ9GZT6 CDC42EP3-201ENST00000295324 5700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
CCDC90BQ9GZT6 MYO1B-204ENST00000392318 5082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
CCDC90BQ9GZT6 PIGQ-206ENST00000422307 2052 ntTSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.49
CCDC90BQ9GZT6 HMCES-203ENST00000417226 1490 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
CCDC90BQ9GZT6 AP5B1-201ENST00000532090 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
CCDC90BQ9GZT6 ACD-202ENST00000393919 1974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
CCDC90BQ9GZT6 ADAD1-202ENST00000388724 1912 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
CCDC90BQ9GZT6 DUT-202ENST00000455976 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
CCDC90BQ9GZT6 SDR39U1-208ENST00000554698 1364 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
CCDC90BQ9GZT6 CRMP1-202ENST00000397890 2911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
CCDC90BQ9GZT6 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.49
CCDC90BQ9GZT6 LINC01356-201ENST00000401018 1819 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
CCDC90BQ9GZT6 LINC00461-203ENST00000504246 2300 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
CCDC90BQ9GZT6 EIF4EBP1-201ENST00000338825 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
CCDC90BQ9GZT6 SNX3-202ENST00000349379 890 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
CCDC90BQ9GZT6 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
CCDC90BQ9GZT6 RARRES2P11-201ENST00000635158 484 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
CCDC90BQ9GZT6 TUBBP5-204ENST00000635438 565 ntTSL 4 BASIC18.08■□□□□ 0.48
CCDC90BQ9GZT6 ACVR1B-203ENST00000426655 1782 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
CCDC90BQ9GZT6 EIF2B1-204ENST00000537073 1768 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
CCDC90BQ9GZT6 RNF167-205ENST00000571816 1728 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
CCDC90BQ9GZT6 CHMP6-201ENST00000325167 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
CCDC90BQ9GZT6 NOL4L-211ENST00000621426 6577 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
CCDC90BQ9GZT6 EEF1A2-201ENST00000217182 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
CCDC90BQ9GZT6 TRMT2A-203ENST00000404751 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
CCDC90BQ9GZT6 AC132008.2-203ENST00000418868 1552 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
CCDC90BQ9GZT6 PTP4A1-201ENST00000370651 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
CCDC90BQ9GZT6 PFKFB3-202ENST00000360521 1964 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
CCDC90BQ9GZT6 HOXC9-203ENST00000508190 1505 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.48
CCDC90BQ9GZT6 UBALD1-206ENST00000590965 1462 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
CCDC90BQ9GZT6 COL4A3BP-201ENST00000261415 2262 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CCDC90BQ9GZT6 CDHR1-201ENST00000332904 2694 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CCDC90BQ9GZT6 CLASRP-201ENST00000221455 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CCDC90BQ9GZT6 SLC34A3-202ENST00000538474 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
CCDC90BQ9GZT6 AC116050.2-201ENST00000612102 1779 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
CCDC90BQ9GZT6 CTDSP2-204ENST00000548823 1368 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CCDC90BQ9GZT6 LINC01168-201ENST00000461291 5254 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
CCDC90BQ9GZT6 SPSB4-201ENST00000310546 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CCDC90BQ9GZT6 MAGI1-213ENST00000483466 4791 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CCDC90BQ9GZT6 SHISA5-220ENST00000619810 2385 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
CCDC90BQ9GZT6 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
CCDC90BQ9GZT6 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CCDC90BQ9GZT6 AC245052.3-201ENST00000450182 901 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
CCDC90BQ9GZT6 LAG3-201ENST00000203629 1974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CCDC90BQ9GZT6 CCT5-214ENST00000515676 1997 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
CCDC90BQ9GZT6 GUCY1A2-201ENST00000282249 3047 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CCDC90BQ9GZT6 NAA35-201ENST00000361671 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CCDC90BQ9GZT6 RAB5C-202ENST00000393860 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CCDC90BQ9GZT6 TMEM79-203ENST00000405535 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CCDC90BQ9GZT6 B3GALNT2-201ENST00000313984 1874 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CCDC90BQ9GZT6 ADAMTS9-202ENST00000459780 2871 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CCDC90BQ9GZT6 B4GALT4-202ENST00000393765 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CCDC90BQ9GZT6 CPEB2-207ENST00000507071 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CCDC90BQ9GZT6 TDRP-201ENST00000324079 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CCDC90BQ9GZT6 BAIAP2-204ENST00000428708 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.2 ms