Protein–RNA interactions for Protein: Q9GZM3

POLR2J2, DNA-directed RNA polymerase II subunit RPB11-b1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 115 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLR2J2Q9GZM3 AC233280.1-201ENST00000423600 1684 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
POLR2J2Q9GZM3 GNB1-201ENST00000378609 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
POLR2J2Q9GZM3 RTN4-201ENST00000317610 2333 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
POLR2J2Q9GZM3 RGS3-232ENST00000620489 1503 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
POLR2J2Q9GZM3 ATRN-201ENST00000262919 8633 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
POLR2J2Q9GZM3 FAM160A2-201ENST00000265978 3481 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
POLR2J2Q9GZM3 AL035252.2-201ENST00000454676 3168 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
POLR2J2Q9GZM3 CDH23-212ENST00000616684 4814 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
POLR2J2Q9GZM3 ETV2-202ENST00000379026 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
POLR2J2Q9GZM3 TBX21-201ENST00000177694 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
POLR2J2Q9GZM3 CDK17-203ENST00000543119 2442 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
POLR2J2Q9GZM3 ZC3H12D-201ENST00000409806 5791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
POLR2J2Q9GZM3 FXR2-201ENST00000250113 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
POLR2J2Q9GZM3 ETHE1-201ENST00000292147 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
POLR2J2Q9GZM3 UBE2C-203ENST00000352551 665 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
POLR2J2Q9GZM3 IZUMO4-203ENST00000395307 944 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
POLR2J2Q9GZM3 HTT-AS-201ENST00000503893 515 ntTSL 4 BASIC18.18■□□□□ 0.5
POLR2J2Q9GZM3 HMX1-202ENST00000506970 651 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
POLR2J2Q9GZM3 AC005410.1-201ENST00000579522 462 ntTSL 3 BASIC18.18■□□□□ 0.5
POLR2J2Q9GZM3 AC016588.1-201ENST00000591533 542 ntTSL 4 BASIC18.18■□□□□ 0.5
POLR2J2Q9GZM3 ARFRP1-202ENST00000607873 1061 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
POLR2J2Q9GZM3 ARFRP1-208ENST00000612256 2974 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
POLR2J2Q9GZM3 UBXN2B-206ENST00000638450 591 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
POLR2J2Q9GZM3 NTRK1-201ENST00000358660 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
POLR2J2Q9GZM3 AC245041.2-204ENST00000610809 1962 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
POLR2J2Q9GZM3 ACADVL-203ENST00000356839 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
POLR2J2Q9GZM3 HAUS4-202ENST00000342454 1474 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
POLR2J2Q9GZM3 FAM3A-215ENST00000447601 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
POLR2J2Q9GZM3 IDUA-201ENST00000247933 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
POLR2J2Q9GZM3 OBSL1-203ENST00000373876 5503 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
POLR2J2Q9GZM3 TLE3-226ENST00000627388 5742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
POLR2J2Q9GZM3 KRT18-207ENST00000550600 1696 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
POLR2J2Q9GZM3 CLN3-205ENST00000359984 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
POLR2J2Q9GZM3 WT1-205ENST00000452863 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
POLR2J2Q9GZM3 FNBP1-203ENST00000443566 5227 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
POLR2J2Q9GZM3 KLHL21-206ENST00000610898 1945 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
POLR2J2Q9GZM3 CBLC-201ENST00000270279 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
POLR2J2Q9GZM3 NTSR2-201ENST00000306928 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
POLR2J2Q9GZM3 NDOR1-203ENST00000427047 2315 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
POLR2J2Q9GZM3 PFKFB3-217ENST00000626882 1965 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
POLR2J2Q9GZM3 SKOR2-202ENST00000425639 3899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
POLR2J2Q9GZM3 ST3GAL3-219ENST00000372374 2170 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
POLR2J2Q9GZM3 TCAIM-203ENST00000396078 2178 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
POLR2J2Q9GZM3 IQSEC2-218ENST00000640694 5958 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
POLR2J2Q9GZM3 MAPKAPK2-202ENST00000367103 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
POLR2J2Q9GZM3 MOB3C-202ENST00000319928 2822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
POLR2J2Q9GZM3 WRNIP1-202ENST00000380769 3239 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
POLR2J2Q9GZM3 ZNF644-203ENST00000361321 1253 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
POLR2J2Q9GZM3 TNFRSF18-203ENST00000379268 1179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
POLR2J2Q9GZM3 RASGRP2-209ENST00000394429 453 ntTSL 3 BASIC18.17■□□□□ 0.5
POLR2J2Q9GZM3 AC084032.1-201ENST00000552324 578 ntTSL 4 BASIC18.17■□□□□ 0.5
POLR2J2Q9GZM3 C2orf69P4-201ENST00000565394 541 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
POLR2J2Q9GZM3 LOXL1-AS1-208ENST00000565756 885 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
POLR2J2Q9GZM3 PARD6A-203ENST00000602551 1171 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
POLR2J2Q9GZM3 KCNMA1-224ENST00000618048 1269 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
POLR2J2Q9GZM3 SLC35A2-211ENST00000634461 533 ntTSL 4 BASIC18.17■□□□□ 0.5
POLR2J2Q9GZM3 NEURL3-202ENST00000435380 1675 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
POLR2J2Q9GZM3 CAMKV-205ENST00000467248 1688 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
POLR2J2Q9GZM3 AC138430.1-201ENST00000586064 5409 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
POLR2J2Q9GZM3 LIN54-209ENST00000510557 2257 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
POLR2J2Q9GZM3 KCNH2-202ENST00000330883 3267 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
POLR2J2Q9GZM3 OSTM1-201ENST00000193322 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
POLR2J2Q9GZM3 LDHAL6A-202ENST00000396213 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
POLR2J2Q9GZM3 CSPG5-202ENST00000383738 4161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
POLR2J2Q9GZM3 PCDHB14-202ENST00000624896 2367 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
POLR2J2Q9GZM3 GRTP1-203ENST00000375431 1384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
POLR2J2Q9GZM3 PTBP1-220ENST00000627714 2201 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
POLR2J2Q9GZM3 PRPF39-201ENST00000355765 2868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
POLR2J2Q9GZM3 B4GALT2-201ENST00000309519 2004 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
POLR2J2Q9GZM3 NEU4-201ENST00000325935 2288 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
POLR2J2Q9GZM3 B4GALNT1-213ENST00000552350 1649 ntTSL 4 BASIC18.16■□□□□ 0.5
POLR2J2Q9GZM3 GAS2L1-208ENST00000616432 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
POLR2J2Q9GZM3 AC010980.2-201ENST00000587099 1412 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
POLR2J2Q9GZM3 ZSWIM5-201ENST00000359600 5819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
POLR2J2Q9GZM3 MED25-201ENST00000312865 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
POLR2J2Q9GZM3 RILPL2-201ENST00000280571 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
POLR2J2Q9GZM3 FUZ-201ENST00000313777 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
POLR2J2Q9GZM3 CNTNAP3B-203ENST00000377561 5379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
POLR2J2Q9GZM3 NRM-203ENST00000376421 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
POLR2J2Q9GZM3 EARS2-206ENST00000563232 1709 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
POLR2J2Q9GZM3 PCDHGB3-202ENST00000618934 2445 ntAPPRIS P1 BASIC18.16■□□□□ 0.5
POLR2J2Q9GZM3 AP2S1-201ENST00000263270 935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
POLR2J2Q9GZM3 CFD-201ENST00000327726 1201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
POLR2J2Q9GZM3 CLDN3-201ENST00000395145 1274 ntAPPRIS P1 BASIC18.16■□□□□ 0.5
POLR2J2Q9GZM3 AC026271.2-201ENST00000428091 497 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
POLR2J2Q9GZM3 TRIM35-203ENST00000521253 1215 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
POLR2J2Q9GZM3 SEC11A-208ENST00000559729 1256 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
POLR2J2Q9GZM3 CIRBP-211ENST00000586773 942 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
POLR2J2Q9GZM3 HOXC4-201ENST00000303406 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
POLR2J2Q9GZM3 ACAT1-201ENST00000265838 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
POLR2J2Q9GZM3 AC005332.7-201ENST00000614046 2005 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
POLR2J2Q9GZM3 TLK2-202ENST00000343388 3227 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
POLR2J2Q9GZM3 NXN-202ENST00000537628 1340 ntTSL 3 BASIC18.16■□□□□ 0.5
POLR2J2Q9GZM3 BRSK2-215ENST00000544817 1842 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
POLR2J2Q9GZM3 ACD-201ENST00000219251 2052 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
POLR2J2Q9GZM3 PRKAG2-203ENST00000418337 2318 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
POLR2J2Q9GZM3 SLC35B1-201ENST00000240333 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
POLR2J2Q9GZM3 DUT-201ENST00000331200 2147 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
POLR2J2Q9GZM3 SLC34A3-201ENST00000361134 2124 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
POLR2J2Q9GZM3 TAL1-202ENST00000371884 4642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.8 ms