Protein–RNA interactions for Protein: Q9C0F1

CEP44, Centrosomal protein of 44 kDa, humanhuman

Predictions only

Length 390 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CEP44Q9C0F1 HAS3-201ENST00000219322 1163 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
CEP44Q9C0F1 RPP25L-201ENST00000297613 1092 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
CEP44Q9C0F1 AKR1A1-201ENST00000351829 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
CEP44Q9C0F1 VKORC1-204ENST00000394971 664 ntTSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
CEP44Q9C0F1 RPS2P55-201ENST00000397318 883 ntBASIC20.01■□□□□ 0.79
CEP44Q9C0F1 YBX1P10-201ENST00000444752 975 ntBASIC20.01■□□□□ 0.79
CEP44Q9C0F1 AL590666.2-201ENST00000448869 758 ntTSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
CEP44Q9C0F1 MCRIP1-201ENST00000455127 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
CEP44Q9C0F1 RPL29-204ENST00000479017 670 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.01■□□□□ 0.79
CEP44Q9C0F1 AC107956.1-201ENST00000494359 873 ntBASIC20.01■□□□□ 0.79
CEP44Q9C0F1 NDUFA13-203ENST00000503283 825 ntTSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
CEP44Q9C0F1 UBE2K-204ENST00000503368 891 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
CEP44Q9C0F1 ARF3-208ENST00000541959 807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
CEP44Q9C0F1 C17orf97-203ENST00000571106 736 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
CEP44Q9C0F1 SUMO2-203ENST00000578238 490 ntTSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
CEP44Q9C0F1 AC233702.5-201ENST00000584107 538 ntBASIC20.01■□□□□ 0.79
CEP44Q9C0F1 AC091551.1-201ENST00000590722 1228 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
CEP44Q9C0F1 AP001412.1-201ENST00000608405 714 ntBASIC20.01■□□□□ 0.79
CEP44Q9C0F1 KRTAP5-11-203ENST00000617152 558 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
CEP44Q9C0F1 LINC00482-201ENST00000332012 2023 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
CEP44Q9C0F1 HYLS1-203ENST00000526028 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
CEP44Q9C0F1 GPR50-AS1-201ENST00000454196 1620 ntTSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
CEP44Q9C0F1 GPR20-201ENST00000377741 1515 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.01■□□□□ 0.79
CEP44Q9C0F1 SMARCD2-203ENST00000448276 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
CEP44Q9C0F1 MEF2B-204ENST00000424583 1405 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
CEP44Q9C0F1 FSTL3-201ENST00000166139 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
CEP44Q9C0F1 UBE2H-201ENST00000355621 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
CEP44Q9C0F1 TMEM8A-201ENST00000250930 2346 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
CEP44Q9C0F1 TRIP6-201ENST00000200457 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
CEP44Q9C0F1 HEMK1-206ENST00000455834 1499 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
CEP44Q9C0F1 LETM2-208ENST00000524874 1459 ntTSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
CEP44Q9C0F1 LPAR2-203ENST00000586703 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
CEP44Q9C0F1 SLC1A5-203ENST00000542575 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
CEP44Q9C0F1 METTL27-201ENST00000297873 941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
CEP44Q9C0F1 SIVA1-201ENST00000329967 802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
CEP44Q9C0F1 MRGPRG-201ENST00000332314 870 ntAPPRIS P1 BASIC20■□□□□ 0.79
CEP44Q9C0F1 BSX-201ENST00000343035 830 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
CEP44Q9C0F1 S100A14-203ENST00000368701 1080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
CEP44Q9C0F1 PDCD2-202ENST00000392090 936 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
CEP44Q9C0F1 AL353807.1-201ENST00000427475 662 ntBASIC20■□□□□ 0.79
CEP44Q9C0F1 WDR86-AS1-203ENST00000480632 704 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
CEP44Q9C0F1 CNOT8-224ENST00000523698 862 ntTSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
CEP44Q9C0F1 FLT3LG-211ENST00000600429 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
CEP44Q9C0F1 Z99916.2-201ENST00000604037 246 ntBASIC20■□□□□ 0.79
CEP44Q9C0F1 FCMR-210ENST00000628511 1055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
CEP44Q9C0F1 PCMT1-205ENST00000464889 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
CEP44Q9C0F1 KRT83-201ENST00000293670 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
CEP44Q9C0F1 MOK-225ENST00000522867 1883 ntTSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
CEP44Q9C0F1 SLC4A4-201ENST00000264485 5852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
CEP44Q9C0F1 NEU4-202ENST00000391969 2526 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
CEP44Q9C0F1 SOX21-201ENST00000376945 2778 ntAPPRIS P1 BASIC20■□□□□ 0.79
CEP44Q9C0F1 SHB-201ENST00000377707 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
CEP44Q9C0F1 NCLN-205ENST00000590671 2070 ntTSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
CEP44Q9C0F1 HDHD5-201ENST00000155674 1735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
CEP44Q9C0F1 NR2F2-201ENST00000394166 5275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
CEP44Q9C0F1 MTUS2-202ENST00000380808 1793 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
CEP44Q9C0F1 ATP5D-201ENST00000215375 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
CEP44Q9C0F1 NKAIN4-201ENST00000370307 793 ntTSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
CEP44Q9C0F1 DNPH1-202ENST00000393987 796 ntTSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
CEP44Q9C0F1 SMIM19-201ENST00000414154 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
CEP44Q9C0F1 MOK-228ENST00000523231 1114 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
CEP44Q9C0F1 TGIF1-219ENST00000551541 990 ntTSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
CEP44Q9C0F1 RPL23AP53-202ENST00000606507 370 ntTSL 3 BASIC19.99■□□□□ 0.79
CEP44Q9C0F1 PRMT5-204ENST00000397441 2418 ntTSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
CEP44Q9C0F1 SLC16A5-201ENST00000329783 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
CEP44Q9C0F1 MAEA-208ENST00000505839 1444 ntTSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
CEP44Q9C0F1 SLC25A15-201ENST00000338625 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
CEP44Q9C0F1 KXD1-202ENST00000539106 1496 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.99■□□□□ 0.79
CEP44Q9C0F1 UBE2F-201ENST00000272930 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
CEP44Q9C0F1 MTFR1L-203ENST00000374303 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
CEP44Q9C0F1 RBPJL-203ENST00000372743 1623 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
CEP44Q9C0F1 NDOR1-201ENST00000344894 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
CEP44Q9C0F1 SLC35B2-205ENST00000538577 1909 ntTSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
CEP44Q9C0F1 ART5-203ENST00000397068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
CEP44Q9C0F1 ZDHHC8P1-201ENST00000255890 2382 ntTSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
CEP44Q9C0F1 ITGBL1-206ENST00000618057 2368 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
CEP44Q9C0F1 SLC16A10-202ENST00000368851 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
CEP44Q9C0F1 TCEAL6-202ENST00000372774 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
CEP44Q9C0F1 MDFI-202ENST00000373050 809 ntTSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
CEP44Q9C0F1 MRPL2-207ENST00000487429 905 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
CEP44Q9C0F1 AC019257.1-201ENST00000517676 557 ntTSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
CEP44Q9C0F1 AC015712.2-203ENST00000560461 688 ntTSL 3 BASIC19.98■□□□□ 0.79
CEP44Q9C0F1 FAM212B-203ENST00000444059 1423 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
CEP44Q9C0F1 GCSH-201ENST00000315467 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
CEP44Q9C0F1 SMTN-204ENST00000404574 1735 ntTSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
CEP44Q9C0F1 PYCR3-207ENST00000495276 2332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
CEP44Q9C0F1 TRIB3-201ENST00000217233 2499 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
CEP44Q9C0F1 ME2-202ENST00000382927 2492 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
CEP44Q9C0F1 HTR7P1-201ENST00000538670 1336 ntBASIC19.98■□□□□ 0.79
CEP44Q9C0F1 TMEM161A-202ENST00000450333 1930 ntTSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
CEP44Q9C0F1 RELA-201ENST00000308639 2681 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
CEP44Q9C0F1 GALNT10-202ENST00000377661 3778 ntTSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
CEP44Q9C0F1 KIAA1456-201ENST00000400069 1982 ntTSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
CEP44Q9C0F1 ZNF852-201ENST00000436261 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
CEP44Q9C0F1 FMR1-204ENST00000370471 4125 ntTSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
CEP44Q9C0F1 ROPN1-209ENST00000495093 1376 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
CEP44Q9C0F1 OBSL1-204ENST00000404537 5841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
CEP44Q9C0F1 NSUN2-206ENST00000506139 2619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
CEP44Q9C0F1 BRSK2-201ENST00000308219 4089 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
CEP44Q9C0F1 LPAR1-201ENST00000358883 2687 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11.9 ms