Protein–RNA interactions for Protein: Q9C0C6

CIPC, CLOCK-interacting pacemaker, humanhuman

Predictions only

Length 399 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CIPCQ9C0C6 FDX2-207ENST00000494368 584 ntTSL 4 BASIC20.18■□□□□ 0.82
CIPCQ9C0C6 FOSL1-204ENST00000532401 1132 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
CIPCQ9C0C6 EFTUD1P1-201ENST00000558187 596 ntTSL 4 BASIC20.18■□□□□ 0.82
CIPCQ9C0C6 LINC02256-201ENST00000561999 366 ntTSL 3 BASIC20.18■□□□□ 0.82
CIPCQ9C0C6 AC010336.4-201ENST00000595655 438 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
CIPCQ9C0C6 NTAN1-211ENST00000622833 1049 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
CIPCQ9C0C6 NTAN1-212ENST00000624579 1115 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
CIPCQ9C0C6 FP475955.1-201ENST00000624937 553 ntTSL 4 BASIC20.18■□□□□ 0.82
CIPCQ9C0C6 MTFP1-206ENST00000629597 482 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
CIPCQ9C0C6 C17orf67-201ENST00000397861 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
CIPCQ9C0C6 PLEKHB1-204ENST00000398494 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
CIPCQ9C0C6 AOC1-202ENST00000416793 2453 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
CIPCQ9C0C6 TMEM91-203ENST00000392002 1389 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
CIPCQ9C0C6 RIPPLY3-201ENST00000329553 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
CIPCQ9C0C6 FBXL17-205ENST00000542267 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
CIPCQ9C0C6 LETM2-208ENST00000524874 1459 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
CIPCQ9C0C6 MAP3K21-203ENST00000366624 5809 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
CIPCQ9C0C6 GPR20-201ENST00000377741 1515 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.17■□□□□ 0.82
CIPCQ9C0C6 ARSE-205ENST00000540563 1990 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
CIPCQ9C0C6 GCSH-201ENST00000315467 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
CIPCQ9C0C6 PCSK6-217ENST00000618548 4269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
CIPCQ9C0C6 MAML1-201ENST00000292599 5723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
CIPCQ9C0C6 FAM129C-212ENST00000601861 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
CIPCQ9C0C6 TMEM129-201ENST00000303277 2678 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
CIPCQ9C0C6 RASSF7-204ENST00000431809 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
CIPCQ9C0C6 KRT78-201ENST00000304620 1778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
CIPCQ9C0C6 TSPY15P-201ENST00000457163 923 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
CIPCQ9C0C6 AL355075.4-201ENST00000554988 638 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
CIPCQ9C0C6 GRAP-204ENST00000573099 846 ntTSL 3 BASIC20.17■□□□□ 0.82
CIPCQ9C0C6 IRF3-222ENST00000599144 1117 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
CIPCQ9C0C6 AC073195.1-201ENST00000607241 877 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
CIPCQ9C0C6 PDZRN4-202ENST00000402685 3347 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
CIPCQ9C0C6 COL13A1-202ENST00000357811 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
CIPCQ9C0C6 SNUPN-205ENST00000564644 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
CIPCQ9C0C6 LSM4-203ENST00000593829 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
CIPCQ9C0C6 PHOSPHO1-202ENST00000413580 2173 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
CIPCQ9C0C6 CYP1B1-207ENST00000614273 2174 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
CIPCQ9C0C6 AC116351.2-201ENST00000606540 1585 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
CIPCQ9C0C6 DYNLT3-201ENST00000378578 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
CIPCQ9C0C6 LGALS9C-212ENST00000583322 1602 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
CIPCQ9C0C6 ACOT2-205ENST00000622407 1604 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
CIPCQ9C0C6 SPPL2B-212ENST00000618220 2459 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
CIPCQ9C0C6 FSTL3-201ENST00000166139 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
CIPCQ9C0C6 SRP68-201ENST00000307877 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
CIPCQ9C0C6 NYAP1-202ENST00000454988 2777 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
CIPCQ9C0C6 OR10H2-201ENST00000305899 1041 ntAPPRIS P1 BASIC20.16■□□□□ 0.82
CIPCQ9C0C6 LCE2B-201ENST00000368780 612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
CIPCQ9C0C6 COL11A2-204ENST00000395194 1194 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
CIPCQ9C0C6 RUFY3-203ENST00000417478 2143 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
CIPCQ9C0C6 ECEL1P3-201ENST00000427961 737 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
CIPCQ9C0C6 BX322234.1-201ENST00000444188 980 ntTSL 3 BASIC20.16■□□□□ 0.82
CIPCQ9C0C6 AF131216.3-201ENST00000525867 1099 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
CIPCQ9C0C6 RNASEK-202ENST00000548577 810 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
CIPCQ9C0C6 AP003071.4-201ENST00000562276 1284 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
CIPCQ9C0C6 SMAGP-206ENST00000604188 433 ntTSL 3 BASIC20.16■□□□□ 0.82
CIPCQ9C0C6 SBK1-201ENST00000341901 4992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
CIPCQ9C0C6 NUDT11-201ENST00000375992 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
CIPCQ9C0C6 RABEPK-204ENST00000394125 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
CIPCQ9C0C6 AC018553.1-201ENST00000616682 1458 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
CIPCQ9C0C6 C17orf58-201ENST00000334461 1535 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
CIPCQ9C0C6 EPDR1-201ENST00000199448 2599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
CIPCQ9C0C6 CRACR2B-207ENST00000528542 1792 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
CIPCQ9C0C6 CLN3-205ENST00000359984 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
CIPCQ9C0C6 DNAJC7-203ENST00000457167 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
CIPCQ9C0C6 SDHAF3-202ENST00000432641 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
CIPCQ9C0C6 SLC46A3-202ENST00000380814 2121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
CIPCQ9C0C6 SLC22A17-202ENST00000354772 2238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
CIPCQ9C0C6 TUBGCP3-204ENST00000464139 2461 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
CIPCQ9C0C6 KCNMA1-293ENST00000640969 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
CIPCQ9C0C6 EFS-202ENST00000351354 2704 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
CIPCQ9C0C6 GAMT-201ENST00000252288 1121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
CIPCQ9C0C6 HYAL3-203ENST00000415204 959 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
CIPCQ9C0C6 AC211429.1-201ENST00000415277 523 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
CIPCQ9C0C6 CCK-203ENST00000434608 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
CIPCQ9C0C6 LINC01786-202ENST00000453732 389 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
CIPCQ9C0C6 MFSD4A-206ENST00000489709 1136 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
CIPCQ9C0C6 AC021087.1-201ENST00000512642 522 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
CIPCQ9C0C6 AC117500.4-201ENST00000542797 617 ntTSL 3 BASIC20.15■□□□□ 0.82
CIPCQ9C0C6 P2RX3-204ENST00000616487 1346 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
CIPCQ9C0C6 WDR37-206ENST00000620998 1303 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
CIPCQ9C0C6 DPF1-209ENST00000456296 1562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
CIPCQ9C0C6 STK25-204ENST00000405585 1643 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
CIPCQ9C0C6 CTNND2-201ENST00000304623 5481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
CIPCQ9C0C6 GABARAPL3-202ENST00000624044 1851 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
CIPCQ9C0C6 LINC01521-201ENST00000504184 1943 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
CIPCQ9C0C6 GABRA2-214ENST00000515082 2366 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
CIPCQ9C0C6 AOC3-207ENST00000617500 2392 ntTSL 4 BASIC20.15■□□□□ 0.82
CIPCQ9C0C6 C19orf35-201ENST00000342063 2574 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
CIPCQ9C0C6 ZNF688-201ENST00000223459 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
CIPCQ9C0C6 SLC16A3-201ENST00000392339 2074 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
CIPCQ9C0C6 SLC16A3-202ENST00000392341 2086 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
CIPCQ9C0C6 CHRNA3-202ENST00000348639 2030 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
CIPCQ9C0C6 NSDHL-201ENST00000370274 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
CIPCQ9C0C6 NAP1L4-212ENST00000526115 1941 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
CIPCQ9C0C6 FGFR1-238ENST00000532791 5590 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
CIPCQ9C0C6 PHGDH-210ENST00000641115 1638 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
CIPCQ9C0C6 C19orf25-206ENST00000588849 1472 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
CIPCQ9C0C6 HSD11B1L-204ENST00000411793 1362 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
CIPCQ9C0C6 AATK-AS1-203ENST00000637878 1306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
CIPCQ9C0C6 RAP1B-203ENST00000378985 1017 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.1 ms