Protein–RNA interactions for Protein: Q9BZY9

TRIM31, E3 ubiquitin-protein ligase TRIM31, humanhuman

Predictions only

Length 425 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM31Q9BZY9 ZNF211-204ENST00000347302 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
TRIM31Q9BZY9 MORC4-201ENST00000255495 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
TRIM31Q9BZY9 RUVBL2-211ENST00000601968 1641 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
TRIM31Q9BZY9 MB21D1-202ENST00000370318 1917 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
TRIM31Q9BZY9 EVL-202ENST00000402714 2353 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
TRIM31Q9BZY9 PPP2R5A-201ENST00000261461 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
TRIM31Q9BZY9 SNN-201ENST00000329565 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
TRIM31Q9BZY9 RGS9BP-201ENST00000334176 2894 ntAPPRIS P1 BASIC20.48■□□□□ 0.87
TRIM31Q9BZY9 HLX-201ENST00000366903 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
TRIM31Q9BZY9 ZBTB7B-201ENST00000292176 2129 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
TRIM31Q9BZY9 AKNA-205ENST00000374079 2138 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
TRIM31Q9BZY9 ANKRD13D-216ENST00000514166 2138 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
TRIM31Q9BZY9 LDHD-202ENST00000450168 1966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
TRIM31Q9BZY9 LIMS2-204ENST00000409286 1678 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
TRIM31Q9BZY9 GMPPA-201ENST00000313597 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
TRIM31Q9BZY9 EDEM1-201ENST00000256497 6146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
TRIM31Q9BZY9 FAM213B-201ENST00000378424 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
TRIM31Q9BZY9 TMTC1-203ENST00000539277 2758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
TRIM31Q9BZY9 ZNF623-203ENST00000526926 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
TRIM31Q9BZY9 LARGE2-206ENST00000529052 2459 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
TRIM31Q9BZY9 TRAM1L1-201ENST00000310754 2023 ntAPPRIS P1 BASIC20.48■□□□□ 0.87
TRIM31Q9BZY9 SHF-201ENST00000290894 2500 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
TRIM31Q9BZY9 DCAF8-211ENST00000475733 1426 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
TRIM31Q9BZY9 PLEKHG5-212ENST00000537245 4794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
TRIM31Q9BZY9 CLPSL2-201ENST00000360454 488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
TRIM31Q9BZY9 AC105001.1-201ENST00000506149 821 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
TRIM31Q9BZY9 RAB43-208ENST00000615093 783 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
TRIM31Q9BZY9 PLAGL1-207ENST00000417959 1645 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
TRIM31Q9BZY9 DUT-201ENST00000331200 2147 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
TRIM31Q9BZY9 SLC5A10-205ENST00000417251 1984 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
TRIM31Q9BZY9 HERPUD2-201ENST00000311350 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
TRIM31Q9BZY9 PCDHAC2-201ENST00000289269 5963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
TRIM31Q9BZY9 SSC4D-201ENST00000275560 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
TRIM31Q9BZY9 CERKL-201ENST00000339098 1677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
TRIM31Q9BZY9 APTR-204ENST00000440088 2029 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
TRIM31Q9BZY9 CITED2-201ENST00000367651 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
TRIM31Q9BZY9 RASSF1-202ENST00000357043 1864 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
TRIM31Q9BZY9 MFHAS1-201ENST00000276282 6414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
TRIM31Q9BZY9 BIRC2-206ENST00000530675 1927 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
TRIM31Q9BZY9 FOXN3-209ENST00000555353 1595 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
TRIM31Q9BZY9 KRT8P17-201ENST00000453110 1448 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
TRIM31Q9BZY9 PFKFB3-204ENST00000379785 2181 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
TRIM31Q9BZY9 UCN-201ENST00000296099 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
TRIM31Q9BZY9 AC009086.2-201ENST00000449759 610 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.47■□□□□ 0.87
TRIM31Q9BZY9 CASP6-205ENST00000505486 538 ntTSL 4 BASIC20.47■□□□□ 0.87
TRIM31Q9BZY9 AL583722.4-201ENST00000555524 716 ntTSL 3 BASIC20.47■□□□□ 0.87
TRIM31Q9BZY9 MMP25-AS1-204ENST00000572574 794 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
TRIM31Q9BZY9 KRT18P61-201ENST00000585825 1298 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
TRIM31Q9BZY9 SLC35A3-213ENST00000638988 1286 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
TRIM31Q9BZY9 MYCNOS-205ENST00000641950 531 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
TRIM31Q9BZY9 OGG1-204ENST00000339511 1815 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
TRIM31Q9BZY9 QKI-203ENST00000361752 9463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
TRIM31Q9BZY9 TM9SF1-206ENST00000528669 2425 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
TRIM31Q9BZY9 BTD-202ENST00000383778 2261 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
TRIM31Q9BZY9 RGS3-232ENST00000620489 1503 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
TRIM31Q9BZY9 TMEM155-201ENST00000337677 2313 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
TRIM31Q9BZY9 AK3-202ENST00000381809 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
TRIM31Q9BZY9 SEPT6-202ENST00000354228 1576 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
TRIM31Q9BZY9 ARHGAP22-210ENST00000477708 1951 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
TRIM31Q9BZY9 RNF146-203ENST00000368314 2369 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
TRIM31Q9BZY9 EPS8L2-230ENST00000610855 1633 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
TRIM31Q9BZY9 GPRC5C-204ENST00000392629 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
TRIM31Q9BZY9 FAM72C-202ENST00000584486 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
TRIM31Q9BZY9 RHOU-201ENST00000366691 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
TRIM31Q9BZY9 GRK6-201ENST00000355472 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
TRIM31Q9BZY9 SNX4-201ENST00000251775 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
TRIM31Q9BZY9 COBL-202ENST00000395540 2332 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
TRIM31Q9BZY9 TPSAB1-201ENST00000338844 1175 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
TRIM31Q9BZY9 PARP1-202ENST00000366792 553 ntTSL 3 BASIC20.46■□□□□ 0.87
TRIM31Q9BZY9 AC062017.1-203ENST00000413029 455 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
TRIM31Q9BZY9 ZNRF2P2-202ENST00000442865 590 ntTSL 4 BASIC20.46■□□□□ 0.87
TRIM31Q9BZY9 NDUFB2-207ENST00000465506 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
TRIM31Q9BZY9 ARHGAP8-204ENST00000389774 1725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
TRIM31Q9BZY9 CELF6-202ENST00000395258 1741 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
TRIM31Q9BZY9 EVX2-201ENST00000308618 4203 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
TRIM31Q9BZY9 P2RX5-202ENST00000345901 2031 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
TRIM31Q9BZY9 KRT6C-201ENST00000252250 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
TRIM31Q9BZY9 KRT6B-201ENST00000252252 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
TRIM31Q9BZY9 LRRC20-205ENST00000395010 2959 ntTSL 3 BASIC20.46■□□□□ 0.87
TRIM31Q9BZY9 ANTXR1-202ENST00000409349 1384 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
TRIM31Q9BZY9 NADK-201ENST00000341426 3235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
TRIM31Q9BZY9 CARD9-201ENST00000371732 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
TRIM31Q9BZY9 PSMB11-201ENST00000408907 2110 ntAPPRIS P1 BASIC20.45■□□□□ 0.86
TRIM31Q9BZY9 AZIN1-201ENST00000337198 4721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
TRIM31Q9BZY9 CMTM3-201ENST00000361909 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
TRIM31Q9BZY9 SLC34A3-202ENST00000538474 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
TRIM31Q9BZY9 FGF17-202ENST00000518533 1706 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
TRIM31Q9BZY9 MEN1-201ENST00000312049 2761 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
TRIM31Q9BZY9 HS3ST3A1-201ENST00000284110 2527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
TRIM31Q9BZY9 P2RX2-204ENST00000351222 1140 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
TRIM31Q9BZY9 PRSS3-202ENST00000361005 966 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
TRIM31Q9BZY9 LYRM9-201ENST00000379102 501 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
TRIM31Q9BZY9 DHRS4-202ENST00000397074 785 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
TRIM31Q9BZY9 KRT19P1-201ENST00000405746 1186 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
TRIM31Q9BZY9 BRD2-214ENST00000496118 735 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
TRIM31Q9BZY9 LYRM9-206ENST00000508862 807 ntTSL 3 BASIC20.45■□□□□ 0.86
TRIM31Q9BZY9 RASGEF1B-208ENST00000510780 539 ntTSL 3 BASIC20.45■□□□□ 0.86
TRIM31Q9BZY9 RASGEF1B-209ENST00000512343 498 ntTSL 3 BASIC20.45■□□□□ 0.86
TRIM31Q9BZY9 GALNS-213ENST00000569433 723 ntTSL 3 BASIC20.45■□□□□ 0.86
TRIM31Q9BZY9 AL831711.1-201ENST00000636824 569 ntTSL 4 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.3 ms