Protein–RNA interactions for Protein: Q9BWT1

CDCA7, Cell division cycle-associated protein 7, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 371 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDCA7Q9BWT1 CLEC4GP1-201ENST00000596555 870 ntBASIC25.8■■□□□ 1.72
CDCA7Q9BWT1 CYB561-205ENST00000542042 1302 ntTSL 2 BASIC25.8■■□□□ 1.72
CDCA7Q9BWT1 AL024507.2-201ENST00000606070 2574 ntBASIC25.8■■□□□ 1.72
CDCA7Q9BWT1 HOXB6-201ENST00000225648 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
CDCA7Q9BWT1 DALRD3-202ENST00000341949 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
CDCA7Q9BWT1 NRM-203ENST00000376421 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
CDCA7Q9BWT1 ETV7-203ENST00000373737 1488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
CDCA7Q9BWT1 PYCR1-204ENST00000403172 1811 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
CDCA7Q9BWT1 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
CDCA7Q9BWT1 ODC1-202ENST00000405333 1943 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
CDCA7Q9BWT1 AL136038.3-201ENST00000561909 1096 ntBASIC25.79■■□□□ 1.72
CDCA7Q9BWT1 GPX4-210ENST00000611653 793 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
CDCA7Q9BWT1 SUSD3-205ENST00000617293 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.79■■□□□ 1.72
CDCA7Q9BWT1 VPS72-207ENST00000640458 689 ntTSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
CDCA7Q9BWT1 COL8A2-203ENST00000481785 2036 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
CDCA7Q9BWT1 OSCAR-208ENST00000611261 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
CDCA7Q9BWT1 RFXANK-205ENST00000456252 1325 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
CDCA7Q9BWT1 PAQR6-202ENST00000335852 2117 ntTSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
CDCA7Q9BWT1 UBE2B-201ENST00000265339 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
CDCA7Q9BWT1 FICD-201ENST00000361549 1816 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
CDCA7Q9BWT1 THOC3-212ENST00000628318 1442 ntTSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
CDCA7Q9BWT1 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
CDCA7Q9BWT1 BCAP29-202ENST00000379117 1946 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
CDCA7Q9BWT1 CPNE9-203ENST00000383832 2068 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
CDCA7Q9BWT1 TMEM230-206ENST00000379283 1660 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.78■■□□□ 1.72
CDCA7Q9BWT1 CHST8-202ENST00000434302 2225 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
CDCA7Q9BWT1 PSEN1-203ENST00000394157 1249 ntTSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
CDCA7Q9BWT1 LINC01024-205ENST00000521563 939 ntTSL 3 BASIC25.78■■□□□ 1.72
CDCA7Q9BWT1 UBA52-210ENST00000598780 668 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.78■■□□□ 1.72
CDCA7Q9BWT1 JUNB-201ENST00000302754 1820 ntAPPRIS P1 BASIC25.78■■□□□ 1.72
CDCA7Q9BWT1 DNASE1L2-201ENST00000320700 1326 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
CDCA7Q9BWT1 GSTZ1-204ENST00000393734 1424 ntTSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
CDCA7Q9BWT1 NAPA-210ENST00000595227 1460 ntTSL 3 BASIC25.78■■□□□ 1.72
CDCA7Q9BWT1 PPP3CC-202ENST00000289963 2135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
CDCA7Q9BWT1 SCRN2-201ENST00000290216 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
CDCA7Q9BWT1 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
CDCA7Q9BWT1 PPP1R7-207ENST00000407025 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
CDCA7Q9BWT1 WT1-212ENST00000640146 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
CDCA7Q9BWT1 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
CDCA7Q9BWT1 IKZF1-209ENST00000438033 1748 ntTSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
CDCA7Q9BWT1 EPHX3-201ENST00000221730 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
CDCA7Q9BWT1 KLHDC4-203ENST00000347925 1821 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
CDCA7Q9BWT1 AZU1-201ENST00000233997 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
CDCA7Q9BWT1 BOLA2B-201ENST00000305321 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
CDCA7Q9BWT1 ISCU-201ENST00000311893 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
CDCA7Q9BWT1 BOLA2-201ENST00000330978 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
CDCA7Q9BWT1 AL445685.1-201ENST00000425802 762 ntTSL 3 BASIC25.77■■□□□ 1.72
CDCA7Q9BWT1 PTK2-216ENST00000519881 863 ntTSL 3 BASIC25.77■■□□□ 1.72
CDCA7Q9BWT1 CHRNB1-207ENST00000575379 1095 ntTSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
CDCA7Q9BWT1 AL691432.3-201ENST00000621860 400 ntBASIC25.77■■□□□ 1.72
CDCA7Q9BWT1 AL023973.1-201ENST00000624619 620 ntBASIC25.77■■□□□ 1.72
CDCA7Q9BWT1 MEF2A-207ENST00000558812 2186 ntTSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
CDCA7Q9BWT1 HAGHL-203ENST00000389703 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
CDCA7Q9BWT1 SMN1-209ENST00000514951 1308 ntTSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
CDCA7Q9BWT1 MANEAL-203ENST00000397631 2327 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
CDCA7Q9BWT1 MESP1-201ENST00000300057 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
CDCA7Q9BWT1 ACY1-206ENST00000476351 1409 ntTSL 3 BASIC25.77■■□□□ 1.72
CDCA7Q9BWT1 SPAG4-201ENST00000374273 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
CDCA7Q9BWT1 ACSF2-207ENST00000504392 1881 ntTSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
CDCA7Q9BWT1 ZNF584-201ENST00000306910 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
CDCA7Q9BWT1 CFL1-201ENST00000308162 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
CDCA7Q9BWT1 AL132780.2-201ENST00000557615 1021 ntTSL 3 BASIC25.76■■□□□ 1.71
CDCA7Q9BWT1 GCHFR-202ENST00000558467 785 ntTSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
CDCA7Q9BWT1 APBB1-210ENST00000530885 1626 ntTSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
CDCA7Q9BWT1 OGG1-205ENST00000344629 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
CDCA7Q9BWT1 CLN8-208ENST00000635751 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
CDCA7Q9BWT1 MGAT1-204ENST00000427865 1919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
CDCA7Q9BWT1 ERF-202ENST00000440177 2032 ntTSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
CDCA7Q9BWT1 ARL2BP-201ENST00000219204 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
CDCA7Q9BWT1 CLN6-201ENST00000249806 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
CDCA7Q9BWT1 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
CDCA7Q9BWT1 CRHR1-201ENST00000293493 2621 ntTSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
CDCA7Q9BWT1 MPST-202ENST00000397225 2116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
CDCA7Q9BWT1 PTGER3-204ENST00000356595 1943 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
CDCA7Q9BWT1 PTGER3-207ENST00000370931 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
CDCA7Q9BWT1 BIRC2-206ENST00000530675 1927 ntTSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
CDCA7Q9BWT1 SLC2A8-215ENST00000610552 1763 ntTSL 3 BASIC25.75■■□□□ 1.71
CDCA7Q9BWT1 TMEM230-207ENST00000379286 1735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
CDCA7Q9BWT1 PTGER3-202ENST00000351052 1404 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
CDCA7Q9BWT1 ELP5-204ENST00000396628 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
CDCA7Q9BWT1 NMRK1-202ENST00000376808 1121 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
CDCA7Q9BWT1 TNNT3-206ENST00000381579 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
CDCA7Q9BWT1 AC104596.1-202ENST00000507486 759 ntTSL 3 BASIC25.75■■□□□ 1.71
CDCA7Q9BWT1 CD81-212ENST00000526072 1172 ntTSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
CDCA7Q9BWT1 CSRP1-214ENST00000531916 890 ntTSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
CDCA7Q9BWT1 CLN6-214ENST00000636314 442 ntTSL 3 BASIC25.75■■□□□ 1.71
CDCA7Q9BWT1 PKMYT1-204ENST00000440027 2061 ntTSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
CDCA7Q9BWT1 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC25.74■■□□□ 1.71
CDCA7Q9BWT1 AANAT-202ENST00000392492 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
CDCA7Q9BWT1 AP000523.1-201ENST00000398242 1049 ntBASIC25.74■■□□□ 1.71
CDCA7Q9BWT1 AC106771.1-201ENST00000502209 372 ntTSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
CDCA7Q9BWT1 CPEB1-AS1-201ENST00000560650 2138 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
CDCA7Q9BWT1 ETFA-216ENST00000560726 942 ntTSL 3 BASIC25.74■■□□□ 1.71
CDCA7Q9BWT1 CCDC106-206ENST00000591241 1153 ntTSL 3 BASIC25.74■■□□□ 1.71
CDCA7Q9BWT1 TBC1D9B-220ENST00000630103 303 ntTSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
CDCA7Q9BWT1 LSR-203ENST00000360798 1963 ntTSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
CDCA7Q9BWT1 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
CDCA7Q9BWT1 BZW1-202ENST00000409226 2455 ntTSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
CDCA7Q9BWT1 MMP17-201ENST00000360564 2411 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
CDCA7Q9BWT1 NRSN1-204ENST00000378491 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.6 ms