Protein–RNA interactions for Protein: Q9BW85

CCDC94, Coiled-coil domain-containing protein 94, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 323 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC94Q9BW85 SSH3-202ENST00000308298 2046 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
CCDC94Q9BW85 RASA4B-201ENST00000306682 2589 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CCDC94Q9BW85 AC007613.1-201ENST00000572811 2597 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
CCDC94Q9BW85 FDXR-217ENST00000582944 1766 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
CCDC94Q9BW85 SEMA6D-205ENST00000389425 2318 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CCDC94Q9BW85 P4HB-201ENST00000331483 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CCDC94Q9BW85 KCNK6-201ENST00000263372 5722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CCDC94Q9BW85 NXN-202ENST00000537628 1340 ntTSL 3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
CCDC94Q9BW85 SPNS1-204ENST00000352260 1948 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CCDC94Q9BW85 MIB2-231ENST00000518681 3116 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CCDC94Q9BW85 TREX2-202ENST00000334497 1982 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CCDC94Q9BW85 DTD1-201ENST00000377452 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CCDC94Q9BW85 ARHGAP8-204ENST00000389774 1725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
CCDC94Q9BW85 GPAA1-201ENST00000355091 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CCDC94Q9BW85 RFT1-202ENST00000394738 1800 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
CCDC94Q9BW85 TMEM44-203ENST00000381975 2197 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CCDC94Q9BW85 NHLH2-201ENST00000320238 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CCDC94Q9BW85 LINC00304-201ENST00000321214 2243 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
CCDC94Q9BW85 CHKB-201ENST00000406938 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CCDC94Q9BW85 GDF15-201ENST00000252809 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CCDC94Q9BW85 MCHR1-202ENST00000381433 1219 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CCDC94Q9BW85 OTUB1-203ENST00000428192 1296 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
CCDC94Q9BW85 DCTPP1-205ENST00000568973 878 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
CCDC94Q9BW85 TXNL4A-203ENST00000585474 1185 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CCDC94Q9BW85 AL356652.1-201ENST00000615962 565 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
CCDC94Q9BW85 BANP-223ENST00000538234 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CCDC94Q9BW85 GRM5-202ENST00000305447 4571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CCDC94Q9BW85 USP39-204ENST00000409766 2033 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
CCDC94Q9BW85 MARC2-201ENST00000359316 1335 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CCDC94Q9BW85 GRB10-205ENST00000401949 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CCDC94Q9BW85 APLP2-204ENST00000345598 1862 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CCDC94Q9BW85 FAM198A-202ENST00000430121 3121 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
CCDC94Q9BW85 PRMT2-210ENST00000458387 1874 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CCDC94Q9BW85 PGPEP1L-202ENST00000535714 1483 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
CCDC94Q9BW85 SLC25A10-201ENST00000331531 1946 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CCDC94Q9BW85 NUTM2F-202ENST00000341207 2516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
CCDC94Q9BW85 NUTM2G-202ENST00000372322 2516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
CCDC94Q9BW85 EGFL7-203ENST00000371699 2125 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
CCDC94Q9BW85 SYN2-206ENST00000621198 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CCDC94Q9BW85 LRRC14-201ENST00000292524 5328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CCDC94Q9BW85 MEA1-201ENST00000244711 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CCDC94Q9BW85 GUK1-209ENST00000366730 937 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
CCDC94Q9BW85 CTDP1-208ENST00000613122 5866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CCDC94Q9BW85 RENBP-201ENST00000369997 1322 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
CCDC94Q9BW85 AC083805.3-201ENST00000619560 1315 ntTSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
CCDC94Q9BW85 CWH43-201ENST00000226432 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CCDC94Q9BW85 ST8SIA1-204ENST00000404299 1920 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CCDC94Q9BW85 AC091729.3-201ENST00000423008 1401 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
CCDC94Q9BW85 PI4KB-213ENST00000529142 2603 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
CCDC94Q9BW85 NUP160-203ENST00000526870 1537 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CCDC94Q9BW85 GSEC-202ENST00000629441 1572 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
CCDC94Q9BW85 INPP4A-201ENST00000074304 6752 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.15
CCDC94Q9BW85 SAMD3-202ENST00000368134 2377 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.15
CCDC94Q9BW85 SLC35E4-202ENST00000406566 2081 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CCDC94Q9BW85 CDC42EP5-201ENST00000301200 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CCDC94Q9BW85 TTC9B-201ENST00000311308 843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CCDC94Q9BW85 RPS14-201ENST00000312037 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CCDC94Q9BW85 CHPF-202ENST00000373891 1079 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
CCDC94Q9BW85 GATS-209ENST00000454084 1030 ntTSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
CCDC94Q9BW85 AC027451.1-201ENST00000530667 553 ntTSL 4 BASIC22.2■■□□□ 1.14
CCDC94Q9BW85 AC073896.1-201ENST00000549318 937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
CCDC94Q9BW85 AF274858.3-202ENST00000569906 755 ntTSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
CCDC94Q9BW85 ATRAID-208ENST00000611786 1256 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CCDC94Q9BW85 PTCD3-220ENST00000627371 210 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
CCDC94Q9BW85 CTSH-201ENST00000220166 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CCDC94Q9BW85 KCNC2-204ENST00000540018 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
CCDC94Q9BW85 MTSS1L-204ENST00000616026 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
CCDC94Q9BW85 HOOK1-201ENST00000371208 5857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CCDC94Q9BW85 SNAP47-202ENST00000366759 2362 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CCDC94Q9BW85 CEP78-201ENST00000277082 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
CCDC94Q9BW85 ADORA2A-201ENST00000337539 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CCDC94Q9BW85 YTHDC2-207ENST00000515883 2629 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CCDC94Q9BW85 AC027702.1-201ENST00000563810 1770 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
CCDC94Q9BW85 KCNC4-203ENST00000413138 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
CCDC94Q9BW85 LAYN-202ENST00000375615 1836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CCDC94Q9BW85 ZNF511-201ENST00000359035 2004 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
CCDC94Q9BW85 FAM160A2-201ENST00000265978 3481 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CCDC94Q9BW85 FAM214B-203ENST00000378561 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CCDC94Q9BW85 CCDC3-201ENST00000378825 2731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CCDC94Q9BW85 POU3F2-201ENST00000328345 4879 ntAPPRIS P1 BASIC22.19■■□□□ 1.14
CCDC94Q9BW85 KAT2A-201ENST00000225916 3109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CCDC94Q9BW85 HAPLN4-201ENST00000291481 3449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CCDC94Q9BW85 SOX11-201ENST00000322002 8719 ntAPPRIS P1 BASIC22.19■■□□□ 1.14
CCDC94Q9BW85 PRTN3-201ENST00000234347 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CCDC94Q9BW85 ABHD17AP1-201ENST00000358206 933 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
CCDC94Q9BW85 CNIH4-203ENST00000366858 702 ntTSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
CCDC94Q9BW85 ANKRD39-201ENST00000393537 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CCDC94Q9BW85 LINC02531-201ENST00000404689 593 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
CCDC94Q9BW85 NAA60-204ENST00000421765 1045 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
CCDC94Q9BW85 TSPY20P-201ENST00000450910 630 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
CCDC94Q9BW85 PLEKHB1-216ENST00000543085 632 ntTSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
CCDC94Q9BW85 MIR4651-201ENST00000582622 73 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
CCDC94Q9BW85 TSSC4-203ENST00000380996 1544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CCDC94Q9BW85 GMPPA-205ENST00000373917 1630 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
CCDC94Q9BW85 PKMYT1-213ENST00000574385 1892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
CCDC94Q9BW85 CDC42SE2-206ENST00000503291 2025 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CCDC94Q9BW85 PHKG1-205ENST00000452681 2226 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
CCDC94Q9BW85 COL9A3-201ENST00000343916 2485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CCDC94Q9BW85 RNF38-204ENST00000357058 5254 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
CCDC94Q9BW85 ADAMTS19-205ENST00000638972 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.6 ms