Protein–RNA interactions for Protein: Q9BTV4

TMEM43, Transmembrane protein 43, humanhuman

Predictions only

Length 400 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM43Q9BTV4 NAA20-202ENST00000334982 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
TMEM43Q9BTV4 ALKBH6-212ENST00000485128 959 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
TMEM43Q9BTV4 AC083906.2-201ENST00000511578 360 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
TMEM43Q9BTV4 ULK4P1-204ENST00000565949 721 ntTSL 4 BASIC17.98■□□□□ 0.47
TMEM43Q9BTV4 BHLHA15-202ENST00000609256 796 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
TMEM43Q9BTV4 AL772284.2-201ENST00000620151 1147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
TMEM43Q9BTV4 OGFR-204ENST00000621591 1194 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
TMEM43Q9BTV4 MAPK14-210ENST00000622903 1003 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
TMEM43Q9BTV4 BABAM1-208ENST00000598188 1470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
TMEM43Q9BTV4 NTSR2-201ENST00000306928 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
TMEM43Q9BTV4 TMSB15B-201ENST00000419165 1666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
TMEM43Q9BTV4 ZKSCAN7-205ENST00000426540 2791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
TMEM43Q9BTV4 GLS-201ENST00000320717 4834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
TMEM43Q9BTV4 ARHGAP9-202ENST00000393797 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
TMEM43Q9BTV4 MOB3C-202ENST00000319928 2822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
TMEM43Q9BTV4 BRSK2-215ENST00000544817 1842 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
TMEM43Q9BTV4 SOCS2-210ENST00000551556 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
TMEM43Q9BTV4 KCNH2-202ENST00000330883 3267 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
TMEM43Q9BTV4 B3GNT2-201ENST00000301998 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
TMEM43Q9BTV4 ZSCAN1-201ENST00000282326 2054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
TMEM43Q9BTV4 C5orf17-202ENST00000512559 1984 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
TMEM43Q9BTV4 DEDD2-204ENST00000595337 1894 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC17.97■□□□□ 0.47
TMEM43Q9BTV4 FUZ-201ENST00000313777 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
TMEM43Q9BTV4 P2RY6-210ENST00000542092 1674 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
TMEM43Q9BTV4 PTPA-223ENST00000452489 2526 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
TMEM43Q9BTV4 GOLGA4-208ENST00000444882 1451 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
TMEM43Q9BTV4 ARHGAP11A-208ENST00000567348 2422 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
TMEM43Q9BTV4 CTDSP2-204ENST00000548823 1368 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
TMEM43Q9BTV4 SPATA25-201ENST00000372519 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
TMEM43Q9BTV4 RNF5-203ENST00000375094 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
TMEM43Q9BTV4 MIPEPP3-201ENST00000412105 444 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
TMEM43Q9BTV4 TMEM41B-205ENST00000533723 723 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
TMEM43Q9BTV4 CAMTA1-216ENST00000557126 486 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
TMEM43Q9BTV4 RPH3A-203ENST00000543106 2581 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
TMEM43Q9BTV4 SCO1-203ENST00000577427 1601 ntTSL 3 BASIC17.97■□□□□ 0.47
TMEM43Q9BTV4 PIGQ-206ENST00000422307 2052 ntTSL 3 BASIC17.97■□□□□ 0.47
TMEM43Q9BTV4 NES-201ENST00000368223 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
TMEM43Q9BTV4 UNC119-202ENST00000335765 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
TMEM43Q9BTV4 SEPT2-203ENST00000391971 3315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
TMEM43Q9BTV4 LARGE2-206ENST00000529052 2459 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
TMEM43Q9BTV4 SLC22A17-211ENST00000637426 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
TMEM43Q9BTV4 HDAC4-201ENST00000345617 8976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
TMEM43Q9BTV4 HDAC4-215ENST00000543185 8990 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
TMEM43Q9BTV4 KRT9-201ENST00000246662 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
TMEM43Q9BTV4 CDC42EP1-201ENST00000249014 2181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
TMEM43Q9BTV4 KCNK4-207ENST00000539216 1723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
TMEM43Q9BTV4 FAM214B-203ENST00000378561 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
TMEM43Q9BTV4 DNAJA4-210ENST00000489435 947 ntTSL 3 BASIC17.96■□□□□ 0.47
TMEM43Q9BTV4 PPP1R14BP3-201ENST00000509033 445 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
TMEM43Q9BTV4 MCRIP1-203ENST00000538396 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
TMEM43Q9BTV4 AC018521.5-202ENST00000577279 374 ntTSL 3 BASIC17.96■□□□□ 0.47
TMEM43Q9BTV4 AC018521.5-201ENST00000582787 496 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
TMEM43Q9BTV4 AC092118.2-201ENST00000613495 667 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
TMEM43Q9BTV4 TMEM8A-201ENST00000250930 2346 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
TMEM43Q9BTV4 TOR2A-203ENST00000373284 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
TMEM43Q9BTV4 UBE2F-205ENST00000414443 2100 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
TMEM43Q9BTV4 RAB11B-201ENST00000328024 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
TMEM43Q9BTV4 TREX1-205ENST00000625293 1783 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
TMEM43Q9BTV4 KLHL31-202ENST00000407079 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
TMEM43Q9BTV4 GRM5-202ENST00000305447 4571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.46
TMEM43Q9BTV4 OGG1-204ENST00000339511 1815 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
TMEM43Q9BTV4 FAM110A-204ENST00000381941 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
TMEM43Q9BTV4 TMEM155-201ENST00000337677 2313 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
TMEM43Q9BTV4 RNH1-203ENST00000397604 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
TMEM43Q9BTV4 PFKFB3-217ENST00000626882 1965 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
TMEM43Q9BTV4 EHBP1-209ENST00000431489 5076 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
TMEM43Q9BTV4 WDR45-207ENST00000376372 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
TMEM43Q9BTV4 MFSD1-219ENST00000622669 2361 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
TMEM43Q9BTV4 HTRA3-201ENST00000307358 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
TMEM43Q9BTV4 ARHGAP28-203ENST00000383472 2295 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
TMEM43Q9BTV4 FGFR3-210ENST00000613647 4438 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
TMEM43Q9BTV4 MYC-201ENST00000259523 2042 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
TMEM43Q9BTV4 WIPF1-205ENST00000409415 1772 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
TMEM43Q9BTV4 NUDT22-201ENST00000279206 1094 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
TMEM43Q9BTV4 AC073210.2-201ENST00000430369 194 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
TMEM43Q9BTV4 NCF1B-203ENST00000435988 1254 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
TMEM43Q9BTV4 NUDT22-204ENST00000441250 986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
TMEM43Q9BTV4 NME6-213ENST00000451657 871 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
TMEM43Q9BTV4 SCO2-203ENST00000535425 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
TMEM43Q9BTV4 RPH3AL-203ENST00000536489 1235 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
TMEM43Q9BTV4 EWSR1-208ENST00000414183 2189 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
TMEM43Q9BTV4 SAMD14-203ENST00000503131 1938 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
TMEM43Q9BTV4 KCNK17-201ENST00000373231 1658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
TMEM43Q9BTV4 NDOR1-203ENST00000427047 2315 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
TMEM43Q9BTV4 ZNF213-202ENST00000416391 2996 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
TMEM43Q9BTV4 PPP1R36-201ENST00000298705 1405 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
TMEM43Q9BTV4 PUF60-202ENST00000349157 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
TMEM43Q9BTV4 GLB1-201ENST00000307363 2616 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
TMEM43Q9BTV4 CDKN1C-203ENST00000430149 1570 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
TMEM43Q9BTV4 AC004408.2-201ENST00000623613 2777 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
TMEM43Q9BTV4 EEF1D-225ENST00000529272 1311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
TMEM43Q9BTV4 KDELR3-201ENST00000216014 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
TMEM43Q9BTV4 SDCBP-204ENST00000447182 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
TMEM43Q9BTV4 AL158211.5-201ENST00000623583 2518 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
TMEM43Q9BTV4 SLC27A1-204ENST00000598424 2681 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
TMEM43Q9BTV4 ADGRG2-210ENST00000379878 4803 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
TMEM43Q9BTV4 EPN2-212ENST00000575595 1491 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
TMEM43Q9BTV4 B4GALT2-201ENST00000309519 2004 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
TMEM43Q9BTV4 LRRC42-203ENST00000371370 2037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
TMEM43Q9BTV4 ROR1-201ENST00000371079 5832 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.3 ms