Protein–RNA interactions for Protein: Q9BTD1

SHANK2-AS3, Putative uncharacterized protein SHANK2-AS3, humanhuman

Predictions only

Length 123 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SHANK2-AS3Q9BTD1 MREG-201ENST00000263268 1314 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
SHANK2-AS3Q9BTD1 RBFOX1-215ENST00000553186 2196 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SHANK2-AS3Q9BTD1 HIBADH-201ENST00000265395 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SHANK2-AS3Q9BTD1 ILDR2-203ENST00000469934 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
SHANK2-AS3Q9BTD1 PPM1B-201ENST00000282412 2606 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SHANK2-AS3Q9BTD1 ACAT1-201ENST00000265838 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SHANK2-AS3Q9BTD1 STK16-201ENST00000396738 1673 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
SHANK2-AS3Q9BTD1 SAMD11-211ENST00000616125 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
SHANK2-AS3Q9BTD1 EGFR-204ENST00000420316 1570 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SHANK2-AS3Q9BTD1 PSMB11-201ENST00000408907 2110 ntAPPRIS P1 BASIC15.16■□□□□ 0.02
SHANK2-AS3Q9BTD1 FOXP4-205ENST00000409208 3341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
SHANK2-AS3Q9BTD1 SPEG-203ENST00000396688 1457 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
SHANK2-AS3Q9BTD1 SIRT3-202ENST00000524564 1395 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
SHANK2-AS3Q9BTD1 SPI1-201ENST00000227163 1168 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
SHANK2-AS3Q9BTD1 UBE2C-203ENST00000352551 665 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
SHANK2-AS3Q9BTD1 UNC50-201ENST00000357765 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SHANK2-AS3Q9BTD1 MGST3-205ENST00000367889 1015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SHANK2-AS3Q9BTD1 C2orf69P4-201ENST00000565394 541 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
SHANK2-AS3Q9BTD1 AC092143.4-201ENST00000570217 559 ntTSL 4 BASIC15.16■□□□□ 0.02
SHANK2-AS3Q9BTD1 ACYP2-207ENST00000606082 713 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
SHANK2-AS3Q9BTD1 SLC36A1-209ENST00000521925 1621 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SHANK2-AS3Q9BTD1 AOC3-204ENST00000591562 2522 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
SHANK2-AS3Q9BTD1 PRSS36-202ENST00000418068 2446 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
SHANK2-AS3Q9BTD1 PPARG-202ENST00000309576 1870 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
SHANK2-AS3Q9BTD1 RNASET2-203ENST00000366855 1417 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
SHANK2-AS3Q9BTD1 SLMAP-201ENST00000295951 5433 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
SHANK2-AS3Q9BTD1 GAS2L1-208ENST00000616432 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SHANK2-AS3Q9BTD1 BLACE-201ENST00000378120 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SHANK2-AS3Q9BTD1 WDR37-203ENST00000381329 1307 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SHANK2-AS3Q9BTD1 MAFG-201ENST00000357736 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SHANK2-AS3Q9BTD1 ST3GAL4-205ENST00000449406 1669 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
SHANK2-AS3Q9BTD1 NUDT4-202ENST00000415493 4839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
SHANK2-AS3Q9BTD1 DMWD-201ENST00000270223 3305 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
SHANK2-AS3Q9BTD1 HLX-201ENST00000366903 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
SHANK2-AS3Q9BTD1 THAP7-AS1-203ENST00000452284 2298 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
SHANK2-AS3Q9BTD1 DPF1-209ENST00000456296 1562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
SHANK2-AS3Q9BTD1 RPUSD2-202ENST00000559271 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
SHANK2-AS3Q9BTD1 PAFAH1B2-202ENST00000419197 2517 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
SHANK2-AS3Q9BTD1 TLE3-226ENST00000627388 5742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
SHANK2-AS3Q9BTD1 RNH1-206ENST00000438658 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
SHANK2-AS3Q9BTD1 PKD2-201ENST00000237596 5056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
SHANK2-AS3Q9BTD1 C11orf49-201ENST00000278460 1645 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
SHANK2-AS3Q9BTD1 PRKCSH-209ENST00000589838 1898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
SHANK2-AS3Q9BTD1 MBD3-201ENST00000156825 5518 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
SHANK2-AS3Q9BTD1 AL355472.2-201ENST00000422958 438 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
SHANK2-AS3Q9BTD1 PYCR3-203ENST00000433751 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
SHANK2-AS3Q9BTD1 KRT18P5-201ENST00000436075 1291 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
SHANK2-AS3Q9BTD1 HIGD1A-204ENST00000452906 585 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
SHANK2-AS3Q9BTD1 AC079305.3-201ENST00000455416 218 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
SHANK2-AS3Q9BTD1 HTT-AS-201ENST00000503893 515 ntTSL 4 BASIC15.15■□□□□ 0.02
SHANK2-AS3Q9BTD1 LINC01976-201ENST00000565120 434 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
SHANK2-AS3Q9BTD1 AC011767.1-201ENST00000617410 1153 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
SHANK2-AS3Q9BTD1 SOCS2-206ENST00000549122 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
SHANK2-AS3Q9BTD1 FDFT1-226ENST00000623368 2368 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
SHANK2-AS3Q9BTD1 SLC25A41-201ENST00000321510 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
SHANK2-AS3Q9BTD1 TJP1-208ENST00000495972 2890 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
SHANK2-AS3Q9BTD1 P3H4-201ENST00000355468 2791 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
SHANK2-AS3Q9BTD1 PVRIG-201ENST00000317271 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
SHANK2-AS3Q9BTD1 MMP23B-202ENST00000378675 1309 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
SHANK2-AS3Q9BTD1 ZFP69-202ENST00000372706 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
SHANK2-AS3Q9BTD1 BABAM1-208ENST00000598188 1470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
SHANK2-AS3Q9BTD1 FAM206A-201ENST00000322940 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
SHANK2-AS3Q9BTD1 NFATC2IP-201ENST00000320805 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
SHANK2-AS3Q9BTD1 DCBLD2-201ENST00000326840 6122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
SHANK2-AS3Q9BTD1 KCNC3-203ENST00000477616 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
SHANK2-AS3Q9BTD1 SERPINF2-201ENST00000324015 2284 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
SHANK2-AS3Q9BTD1 NPAS1-207ENST00000602189 1643 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
SHANK2-AS3Q9BTD1 NAGPA-AS1-202ENST00000632058 2265 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
SHANK2-AS3Q9BTD1 FAM160A2-201ENST00000265978 3481 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
SHANK2-AS3Q9BTD1 CCDC71-201ENST00000321895 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
SHANK2-AS3Q9BTD1 PTOV1-AS1-201ENST00000596521 2155 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
SHANK2-AS3Q9BTD1 ANKDD1B-204ENST00000601380 2569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
SHANK2-AS3Q9BTD1 FAM83E-201ENST00000263266 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
SHANK2-AS3Q9BTD1 TMEM53-202ENST00000372237 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
SHANK2-AS3Q9BTD1 ENTPD6-201ENST00000354989 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
SHANK2-AS3Q9BTD1 DLGAP4-206ENST00000475894 3110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
SHANK2-AS3Q9BTD1 LYNX1-204ENST00000614491 4708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
SHANK2-AS3Q9BTD1 NECAB1-201ENST00000417640 5289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
SHANK2-AS3Q9BTD1 CFD-201ENST00000327726 1201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
SHANK2-AS3Q9BTD1 ZNF644-203ENST00000361321 1253 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
SHANK2-AS3Q9BTD1 FAM207A-202ENST00000397826 880 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
SHANK2-AS3Q9BTD1 HES2-205ENST00000487437 968 ntTSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
SHANK2-AS3Q9BTD1 NDUFS3-207ENST00000529276 558 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
SHANK2-AS3Q9BTD1 RPLP2-207ENST00000530797 637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
SHANK2-AS3Q9BTD1 SEPT4-215ENST00000580809 952 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
SHANK2-AS3Q9BTD1 ARFRP1-202ENST00000607873 1061 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
SHANK2-AS3Q9BTD1 MEN1-206ENST00000377321 2614 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
SHANK2-AS3Q9BTD1 ARMC6-220ENST00000546344 1814 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
SHANK2-AS3Q9BTD1 DBNDD2-203ENST00000372710 1417 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
SHANK2-AS3Q9BTD1 AC120498.9-201ENST00000339021 3867 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
SHANK2-AS3Q9BTD1 SKOR2-202ENST00000425639 3899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
SHANK2-AS3Q9BTD1 NHLH2-201ENST00000320238 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
SHANK2-AS3Q9BTD1 CDKN1C-203ENST00000430149 1570 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
SHANK2-AS3Q9BTD1 LPCAT3-201ENST00000261407 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
SHANK2-AS3Q9BTD1 ZNF771-202ENST00000434417 1454 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
SHANK2-AS3Q9BTD1 MEN1-208ENST00000394374 3155 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
SHANK2-AS3Q9BTD1 STRBP-201ENST00000348403 3337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
SHANK2-AS3Q9BTD1 AC093627.4-201ENST00000484550 5008 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
SHANK2-AS3Q9BTD1 SLC52A2-209ENST00000530047 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
SHANK2-AS3Q9BTD1 AC004408.2-201ENST00000623613 2777 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.8 ms