Protein–RNA interactions for Protein: Q9BTC8

MTA3, Metastasis-associated protein MTA3, humanhuman

Predictions only

Length 594 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MTA3Q9BTC8 SLC11A2-208ENST00000546743 1740 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
MTA3Q9BTC8 LEFTY2-202ENST00000420304 2085 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
MTA3Q9BTC8 FITM1-201ENST00000267426 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
MTA3Q9BTC8 KRT18P29-201ENST00000397031 1267 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
MTA3Q9BTC8 AC239809.2-201ENST00000415381 517 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
MTA3Q9BTC8 METTL21A-204ENST00000425132 869 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
MTA3Q9BTC8 RNF121-214ENST00000533380 870 ntTSL 3 BASIC23.02■■□□□ 1.28
MTA3Q9BTC8 FBXO17-202ENST00000595329 1299 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
MTA3Q9BTC8 AC110285.5-201ENST00000611501 352 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
MTA3Q9BTC8 PUF60-202ENST00000349157 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
MTA3Q9BTC8 B4GALT2-201ENST00000309519 2004 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
MTA3Q9BTC8 PDLIM2-205ENST00000397761 1491 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
MTA3Q9BTC8 AC092835.1-201ENST00000425953 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
MTA3Q9BTC8 HSPB2-C11orf52-202ENST00000534100 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
MTA3Q9BTC8 SIMC1-203ENST00000429602 2694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
MTA3Q9BTC8 AC107959.1-202ENST00000502083 1945 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
MTA3Q9BTC8 CBR1-205ENST00000530908 1924 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
MTA3Q9BTC8 SLC52A2-209ENST00000530047 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
MTA3Q9BTC8 PCDHB11-202ENST00000624887 1973 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
MTA3Q9BTC8 FAM53A-202ENST00000461064 2159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
MTA3Q9BTC8 UAP1-201ENST00000271469 2377 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
MTA3Q9BTC8 ASMTL-206ENST00000534940 2048 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
MTA3Q9BTC8 KRT18-202ENST00000388837 1420 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
MTA3Q9BTC8 SLC35B1-201ENST00000240333 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
MTA3Q9BTC8 NEURL4-202ENST00000399464 5200 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
MTA3Q9BTC8 KRT18-207ENST00000550600 1696 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
MTA3Q9BTC8 PUSL1-201ENST00000379031 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
MTA3Q9BTC8 AC007405.3-201ENST00000429172 561 ntTSL 3 BASIC23.01■■□□□ 1.27
MTA3Q9BTC8 SPINK2-202ENST00000504762 659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
MTA3Q9BTC8 LINC01301-204ENST00000530725 577 ntTSL 4 BASIC23.01■■□□□ 1.27
MTA3Q9BTC8 CORO1B-210ENST00000627576 960 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
MTA3Q9BTC8 REST-211ENST00000640168 1268 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
MTA3Q9BTC8 AL023875.1-201ENST00000640777 796 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
MTA3Q9BTC8 SSH1-209ENST00000551165 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
MTA3Q9BTC8 PPM1L-204ENST00000497343 1589 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
MTA3Q9BTC8 AC006001.3-204ENST00000638711 2103 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
MTA3Q9BTC8 EBF4-202ENST00000380648 2910 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
MTA3Q9BTC8 PRORSD1P-201ENST00000295112 541 ntBASIC23■■□□□ 1.27
MTA3Q9BTC8 CMTM7-202ENST00000349718 1214 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
MTA3Q9BTC8 TUBB8P6-201ENST00000436895 1288 ntBASIC23■■□□□ 1.27
MTA3Q9BTC8 MCRIP1-201ENST00000455127 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
MTA3Q9BTC8 KRT16P5-201ENST00000455284 522 ntBASIC23■■□□□ 1.27
MTA3Q9BTC8 NDUFS6-202ENST00000469176 550 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
MTA3Q9BTC8 AC073111.3-201ENST00000478789 635 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23■■□□□ 1.27
MTA3Q9BTC8 CDH18-AS1-201ENST00000513573 424 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
MTA3Q9BTC8 PRORSD1P-203ENST00000579162 626 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
MTA3Q9BTC8 AC004264.1-201ENST00000608354 794 ntBASIC23■■□□□ 1.27
MTA3Q9BTC8 AC013268.1-201ENST00000639717 1208 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
MTA3Q9BTC8 WWOX-202ENST00000402655 1594 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
MTA3Q9BTC8 ESPN-202ENST00000416731 1338 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
MTA3Q9BTC8 DBN1-210ENST00000512501 1878 ntTSL 3 BASIC23■■□□□ 1.27
MTA3Q9BTC8 RBFOX1-215ENST00000553186 2196 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
MTA3Q9BTC8 NEU4-201ENST00000325935 2288 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
MTA3Q9BTC8 RUVBL2-206ENST00000595090 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
MTA3Q9BTC8 SRP68-201ENST00000307877 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
MTA3Q9BTC8 EPS8L1-203ENST00000540810 2360 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
MTA3Q9BTC8 CARD9-201ENST00000371732 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
MTA3Q9BTC8 PQLC2-202ENST00000375155 1805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
MTA3Q9BTC8 SGCE-207ENST00000447873 1597 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
MTA3Q9BTC8 COX7A2L-201ENST00000234301 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
MTA3Q9BTC8 MTFP1-202ENST00000355143 891 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
MTA3Q9BTC8 MAGI2-AS3-211ENST00000451809 707 ntTSL 3 BASIC22.99■■□□□ 1.27
MTA3Q9BTC8 IAH1-215ENST00000497473 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
MTA3Q9BTC8 RPPH1-201ENST00000516869 333 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
MTA3Q9BTC8 AC022509.3-202ENST00000545819 566 ntTSL 3 BASIC22.99■■□□□ 1.27
MTA3Q9BTC8 ELAC1-203ENST00000588577 694 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
MTA3Q9BTC8 BX649632.1-201ENST00000610187 819 ntTSL 3 BASIC22.99■■□□□ 1.27
MTA3Q9BTC8 RAB5C-202ENST00000393860 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
MTA3Q9BTC8 Z83844.2-201ENST00000456099 1945 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
MTA3Q9BTC8 CD8B-203ENST00000390655 1417 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
MTA3Q9BTC8 KRT8P8-201ENST00000434750 1448 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
MTA3Q9BTC8 HOXC13-AS-201ENST00000512916 1408 ntTSL 3 BASIC22.99■■□□□ 1.27
MTA3Q9BTC8 CRTC1-204ENST00000601916 1834 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
MTA3Q9BTC8 DEDD2-204ENST00000595337 1894 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.98■■□□□ 1.27
MTA3Q9BTC8 MICU2-201ENST00000382374 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
MTA3Q9BTC8 MBD1-216ENST00000587605 1945 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
MTA3Q9BTC8 PVRIG-201ENST00000317271 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
MTA3Q9BTC8 NOL3-204ENST00000564053 1592 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
MTA3Q9BTC8 FBXW7-202ENST00000281708 4976 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
MTA3Q9BTC8 EPS8L1-201ENST00000201647 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
MTA3Q9BTC8 BOLA1-203ENST00000369153 1096 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.98■■□□□ 1.27
MTA3Q9BTC8 KRASP1-201ENST00000407852 552 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
MTA3Q9BTC8 A3GALT2-201ENST00000442999 1023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
MTA3Q9BTC8 NELFE-206ENST00000444811 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
MTA3Q9BTC8 SMAGP-206ENST00000604188 433 ntTSL 3 BASIC22.98■■□□□ 1.27
MTA3Q9BTC8 TARDBP-228ENST00000629725 1031 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
MTA3Q9BTC8 RNASET2-214ENST00000620173 1391 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
MTA3Q9BTC8 WIPF2-202ENST00000394103 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
MTA3Q9BTC8 CYHR1-202ENST00000403000 1477 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
MTA3Q9BTC8 RNF135-205ENST00000535306 2098 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
MTA3Q9BTC8 TATDN2-201ENST00000287652 5342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
MTA3Q9BTC8 FAM187A-202ENST00000412523 1748 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
MTA3Q9BTC8 FFAR3-201ENST00000327809 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
MTA3Q9BTC8 SOX8-201ENST00000293894 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
MTA3Q9BTC8 DBNL-210ENST00000448521 1808 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
MTA3Q9BTC8 ZNF821-221ENST00000611294 1833 ntTSL 3 BASIC22.97■■□□□ 1.27
MTA3Q9BTC8 E4F1-204ENST00000564139 2493 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
MTA3Q9BTC8 SERTAD4-AS1-201ENST00000437764 726 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
MTA3Q9BTC8 ENGASE-205ENST00000579016 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
MTA3Q9BTC8 MAGED2-203ENST00000375053 2066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.6 ms