Protein–RNA interactions for Protein: Q9BRY0

SLC39A3, Zinc transporter ZIP3, humanhuman

Predictions only

Length 314 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC39A3Q9BRY0 C19orf24-201ENST00000409293 983 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
SLC39A3Q9BRY0 CDV3P1-201ENST00000471403 739 ntBASIC18.91■□□□□ 0.62
SLC39A3Q9BRY0 SEC11A-208ENST00000559729 1256 ntTSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
SLC39A3Q9BRY0 AC007993.2-201ENST00000592842 521 ntTSL 4 BASIC18.91■□□□□ 0.62
SLC39A3Q9BRY0 KLHL21-206ENST00000610898 1945 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
SLC39A3Q9BRY0 PTBP1P-201ENST00000554374 1601 ntBASIC18.91■□□□□ 0.62
SLC39A3Q9BRY0 STK11-201ENST00000326873 2611 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
SLC39A3Q9BRY0 ZDHHC18-202ENST00000374142 5020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
SLC39A3Q9BRY0 PTAR1-205ENST00000472967 1689 ntTSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
SLC39A3Q9BRY0 LRRC42-203ENST00000371370 2037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
SLC39A3Q9BRY0 DENND2A-201ENST00000275884 3735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
SLC39A3Q9BRY0 WIPF2-202ENST00000394103 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
SLC39A3Q9BRY0 MTFP1-201ENST00000266263 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
SLC39A3Q9BRY0 RNH1-203ENST00000397604 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
SLC39A3Q9BRY0 SLC1A6-210ENST00000600144 1735 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
SLC39A3Q9BRY0 SLC25A43-201ENST00000217909 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
SLC39A3Q9BRY0 EXTL3-213ENST00000523149 1779 ntTSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
SLC39A3Q9BRY0 AC087633.2-202ENST00000565166 1439 ntBASIC18.91■□□□□ 0.62
SLC39A3Q9BRY0 PTPA-223ENST00000452489 2526 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
SLC39A3Q9BRY0 SLC34A3-202ENST00000538474 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
SLC39A3Q9BRY0 BIRC2-206ENST00000530675 1927 ntTSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
SLC39A3Q9BRY0 PROB1-201ENST00000434752 5122 ntAPPRIS P1 BASIC18.9■□□□□ 0.62
SLC39A3Q9BRY0 CAMKV-205ENST00000467248 1688 ntTSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
SLC39A3Q9BRY0 RAMP2-201ENST00000253796 780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
SLC39A3Q9BRY0 AC062017.1-203ENST00000413029 455 ntTSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
SLC39A3Q9BRY0 AC099681.3-201ENST00000421500 939 ntTSL 4 BASIC18.9■□□□□ 0.62
SLC39A3Q9BRY0 ATP6V0B-205ENST00000472174 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
SLC39A3Q9BRY0 TMEM41B-205ENST00000533723 723 ntTSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
SLC39A3Q9BRY0 HAS1-203ENST00000594621 760 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
SLC39A3Q9BRY0 RNASEH2B-206ENST00000611510 1257 ntTSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
SLC39A3Q9BRY0 BID-205ENST00000399774 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
SLC39A3Q9BRY0 MAPK9-201ENST00000343111 4369 ntTSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
SLC39A3Q9BRY0 LUC7L2-210ENST00000619796 2783 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
SLC39A3Q9BRY0 XKR6-203ENST00000416569 3382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
SLC39A3Q9BRY0 DNLZ-202ENST00000371739 2934 ntTSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
SLC39A3Q9BRY0 GPR137-201ENST00000313074 1485 ntTSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
SLC39A3Q9BRY0 GPR137-203ENST00000411458 1495 ntTSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
SLC39A3Q9BRY0 PNLIPRP2-204ENST00000591655 1456 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
SLC39A3Q9BRY0 GAS2L1-210ENST00000621062 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
SLC39A3Q9BRY0 CHPF-201ENST00000243776 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
SLC39A3Q9BRY0 CHST2-201ENST00000309575 4582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
SLC39A3Q9BRY0 SLC25A39-212ENST00000590194 1542 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
SLC39A3Q9BRY0 CNIH3-201ENST00000272133 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.62
SLC39A3Q9BRY0 RBM14-RBM4-201ENST00000412278 1566 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.62
SLC39A3Q9BRY0 ZBTB7B-201ENST00000292176 2129 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.62
SLC39A3Q9BRY0 PSMB11-201ENST00000408907 2110 ntAPPRIS P1 BASIC18.89■□□□□ 0.62
SLC39A3Q9BRY0 SH2B3-201ENST00000341259 5406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.62
SLC39A3Q9BRY0 PGP-201ENST00000333503 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.62
SLC39A3Q9BRY0 ZNF668-202ENST00000394983 2717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.62
SLC39A3Q9BRY0 RAB7A-201ENST00000265062 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
SLC39A3Q9BRY0 LIMS2-204ENST00000409286 1678 ntTSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
SLC39A3Q9BRY0 AC233280.1-201ENST00000423600 1684 ntTSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
SLC39A3Q9BRY0 ZBTB10-205ENST00000610895 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
SLC39A3Q9BRY0 MTA1-201ENST00000331320 2876 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
SLC39A3Q9BRY0 EDN3-204ENST00000371028 2397 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
SLC39A3Q9BRY0 CBX1-202ENST00000393408 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
SLC39A3Q9BRY0 TAF9-201ENST00000217893 1283 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
SLC39A3Q9BRY0 IZUMO4-203ENST00000395307 944 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
SLC39A3Q9BRY0 METTL26-203ENST00000397664 604 ntTSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
SLC39A3Q9BRY0 INTS11-205ENST00000429572 1104 ntTSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
SLC39A3Q9BRY0 NAT16-202ENST00000443096 1286 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
SLC39A3Q9BRY0 COL19A1-203ENST00000478620 589 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
SLC39A3Q9BRY0 C11orf24-209ENST00000533310 980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
SLC39A3Q9BRY0 SLC7A5P1-201ENST00000568957 537 ntBASIC18.89■□□□□ 0.61
SLC39A3Q9BRY0 AL136982.7-201ENST00000609363 465 ntTSL 4 BASIC18.89■□□□□ 0.61
SLC39A3Q9BRY0 SLC35A2-211ENST00000634461 533 ntTSL 4 BASIC18.89■□□□□ 0.61
SLC39A3Q9BRY0 NADK-201ENST00000341426 3235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
SLC39A3Q9BRY0 GRB10-205ENST00000401949 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
SLC39A3Q9BRY0 EEF1DP3-201ENST00000428783 1309 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
SLC39A3Q9BRY0 HSD11B1L-204ENST00000411793 1362 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
SLC39A3Q9BRY0 ENTPD6-202ENST00000360031 2766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
SLC39A3Q9BRY0 WDR25-201ENST00000335290 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
SLC39A3Q9BRY0 CASP16P-202ENST00000575497 2161 ntTSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
SLC39A3Q9BRY0 NECTIN1-201ENST00000264025 5840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
SLC39A3Q9BRY0 NTSR2-201ENST00000306928 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
SLC39A3Q9BRY0 CD247-201ENST00000362089 1609 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
SLC39A3Q9BRY0 PML-204ENST00000359928 1726 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
SLC39A3Q9BRY0 AKR7A3-201ENST00000361640 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
SLC39A3Q9BRY0 IFFO1-212ENST00000619571 2724 ntTSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
SLC39A3Q9BRY0 RASSF1-202ENST00000357043 1864 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
SLC39A3Q9BRY0 GRK6-201ENST00000355472 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
SLC39A3Q9BRY0 PFKFB3-217ENST00000626882 1965 ntTSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
SLC39A3Q9BRY0 CMTM7-201ENST00000334983 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
SLC39A3Q9BRY0 AC020922.1-201ENST00000591954 3058 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
SLC39A3Q9BRY0 CDK18-217ENST00000506784 2143 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
SLC39A3Q9BRY0 ASB6-202ENST00000277459 2180 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
SLC39A3Q9BRY0 LRWD1-201ENST00000292616 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
SLC39A3Q9BRY0 AP2S1-207ENST00000599990 829 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
SLC39A3Q9BRY0 KLHL17-201ENST00000338591 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
SLC39A3Q9BRY0 RCAN3-205ENST00000436717 2574 ntTSL 3 BASIC18.88■□□□□ 0.61
SLC39A3Q9BRY0 NKX2-1-203ENST00000518149 2583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
SLC39A3Q9BRY0 IGFBP1-203ENST00000468955 1369 ntTSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
SLC39A3Q9BRY0 PAQR6-205ENST00000368270 1765 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
SLC39A3Q9BRY0 ISOC1-201ENST00000173527 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
SLC39A3Q9BRY0 FBXO31-201ENST00000311635 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
SLC39A3Q9BRY0 CSPG5-202ENST00000383738 4161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
SLC39A3Q9BRY0 ANKRD13D-216ENST00000514166 2138 ntTSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
SLC39A3Q9BRY0 HCCS-201ENST00000321143 2277 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
SLC39A3Q9BRY0 HLX-201ENST00000366903 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
SLC39A3Q9BRY0 BTD-202ENST00000383778 2261 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.9 ms