Protein–RNA interactions for Protein: Q9BQ16

SPOCK3, Testican-3, humanhuman

Predictions only

Length 436 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPOCK3Q9BQ16 TPTEP1-205ENST00000558085 1738 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
SPOCK3Q9BQ16 ST3GAL4-201ENST00000227495 1790 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
SPOCK3Q9BQ16 CENPA-201ENST00000233505 1299 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
SPOCK3Q9BQ16 GGCT-202ENST00000275428 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
SPOCK3Q9BQ16 AGTRAP-201ENST00000314340 1107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
SPOCK3Q9BQ16 FAM86C1-203ENST00000426628 952 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
SPOCK3Q9BQ16 SLC25A1P2-201ENST00000430693 912 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
SPOCK3Q9BQ16 NCF1B-202ENST00000432102 930 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
SPOCK3Q9BQ16 LRRC75A-AS1-205ENST00000475953 1201 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
SPOCK3Q9BQ16 COX11P1-201ENST00000489116 835 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
SPOCK3Q9BQ16 YBX1P2-201ENST00000489612 999 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
SPOCK3Q9BQ16 NPM2-204ENST00000518119 1190 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
SPOCK3Q9BQ16 MED9-202ENST00000580462 565 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
SPOCK3Q9BQ16 PDCD2L-203ENST00000587065 492 ntTSL 3 BASIC17.11■□□□□ 0.33
SPOCK3Q9BQ16 RAB11B-AS1-201ENST00000593581 1013 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
SPOCK3Q9BQ16 RPARP-AS1-206ENST00000596366 631 ntTSL 3 BASIC17.11■□□□□ 0.33
SPOCK3Q9BQ16 FP565260.3-205ENST00000620481 816 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
SPOCK3Q9BQ16 AC010653.2-201ENST00000623505 997 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
SPOCK3Q9BQ16 ASRGL1-211ENST00000628829 1161 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
SPOCK3Q9BQ16 PFDN6-206ENST00000463584 1915 ntTSL 3 BASIC17.11■□□□□ 0.33
SPOCK3Q9BQ16 GPBAR1-202ENST00000519574 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
SPOCK3Q9BQ16 GPRC5C-204ENST00000392629 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
SPOCK3Q9BQ16 C14orf180-201ENST00000331952 1455 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
SPOCK3Q9BQ16 ARL13B-205ENST00000471138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
SPOCK3Q9BQ16 ASAP2-201ENST00000281419 5712 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
SPOCK3Q9BQ16 SNX7-201ENST00000306121 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
SPOCK3Q9BQ16 MATK-215ENST00000619596 1740 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
SPOCK3Q9BQ16 REEP5-202ENST00000379638 3326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
SPOCK3Q9BQ16 C3orf33-201ENST00000340171 1884 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
SPOCK3Q9BQ16 ATG4D-201ENST00000309469 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
SPOCK3Q9BQ16 SCGB3A1-201ENST00000292641 521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
SPOCK3Q9BQ16 COX7A1-201ENST00000292907 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
SPOCK3Q9BQ16 TMIGD2-201ENST00000301272 1262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
SPOCK3Q9BQ16 RXFP4-201ENST00000368318 1240 ntAPPRIS P1 BASIC17.1■□□□□ 0.33
SPOCK3Q9BQ16 ZNF32-201ENST00000374433 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
SPOCK3Q9BQ16 ELOB-202ENST00000409477 997 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
SPOCK3Q9BQ16 AL596442.1-201ENST00000429305 429 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
SPOCK3Q9BQ16 TUBB8P6-201ENST00000436895 1288 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
SPOCK3Q9BQ16 KLHL21-204ENST00000467612 1056 ntTSL 3 BASIC17.1■□□□□ 0.33
SPOCK3Q9BQ16 KRT18P16-201ENST00000510337 1294 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
SPOCK3Q9BQ16 AL121956.5-201ENST00000625261 221 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
SPOCK3Q9BQ16 AL031432.5-201ENST00000641059 760 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
SPOCK3Q9BQ16 DDAH2-211ENST00000375787 1330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
SPOCK3Q9BQ16 HSD11B1L-221ENST00000583928 1319 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
SPOCK3Q9BQ16 IRX4-206ENST00000513692 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
SPOCK3Q9BQ16 IRX5-202ENST00000394636 2401 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC17.1■□□□□ 0.33
SPOCK3Q9BQ16 BACE1-209ENST00000513780 1465 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
SPOCK3Q9BQ16 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
SPOCK3Q9BQ16 CHRM4-201ENST00000433765 1511 ntAPPRIS P1 BASIC17.1■□□□□ 0.33
SPOCK3Q9BQ16 MDFI-203ENST00000373051 1622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
SPOCK3Q9BQ16 DPH1-203ENST00000570477 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
SPOCK3Q9BQ16 RNF224-201ENST00000445101 1798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.1■□□□□ 0.33
SPOCK3Q9BQ16 KMT5A-202ENST00000402868 3140 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
SPOCK3Q9BQ16 CD7-207ENST00000584284 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
SPOCK3Q9BQ16 MFSD10-201ENST00000329687 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
SPOCK3Q9BQ16 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
SPOCK3Q9BQ16 ARID4B-203ENST00000366603 5946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
SPOCK3Q9BQ16 CD7-201ENST00000312648 1281 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
SPOCK3Q9BQ16 HIST1H2APS4-201ENST00000362070 348 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
SPOCK3Q9BQ16 TRPT1-202ENST00000394546 1058 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
SPOCK3Q9BQ16 SCO2-202ENST00000395693 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
SPOCK3Q9BQ16 KRTAP5-3-201ENST00000399685 899 ntAPPRIS P1 BASIC17.09■□□□□ 0.33
SPOCK3Q9BQ16 COPS8-203ENST00000409334 794 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
SPOCK3Q9BQ16 TRPT1-210ENST00000541278 941 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
SPOCK3Q9BQ16 IFI27L2-206ENST00000556727 556 ntTSL 3 BASIC17.09■□□□□ 0.33
SPOCK3Q9BQ16 H1FNT-201ENST00000335017 1300 ntAPPRIS P1 BASIC17.09■□□□□ 0.33
SPOCK3Q9BQ16 HOXD12-202ENST00000406506 1318 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.09■□□□□ 0.33
SPOCK3Q9BQ16 MLF2-202ENST00000435120 1379 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
SPOCK3Q9BQ16 ART5-203ENST00000397068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
SPOCK3Q9BQ16 RAB34-201ENST00000301043 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
SPOCK3Q9BQ16 STK25-204ENST00000405585 1643 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
SPOCK3Q9BQ16 PTPRJ-201ENST00000418331 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
SPOCK3Q9BQ16 LHX8-202ENST00000356261 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
SPOCK3Q9BQ16 MAGIX-207ENST00000615915 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
SPOCK3Q9BQ16 C10orf91-202ENST00000392630 1846 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
SPOCK3Q9BQ16 SPNS1-207ENST00000565975 1979 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
SPOCK3Q9BQ16 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
SPOCK3Q9BQ16 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
SPOCK3Q9BQ16 GALNT14-202ENST00000349752 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
SPOCK3Q9BQ16 C1orf198-201ENST00000366663 3858 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
SPOCK3Q9BQ16 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.33
SPOCK3Q9BQ16 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
SPOCK3Q9BQ16 ZSCAN18-217ENST00000601144 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
SPOCK3Q9BQ16 DOK1-203ENST00000409429 1955 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
SPOCK3Q9BQ16 CPNE9-205ENST00000613455 1742 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
SPOCK3Q9BQ16 TEX45-201ENST00000361664 1679 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
SPOCK3Q9BQ16 SAAL1-202ENST00000524803 1582 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
SPOCK3Q9BQ16 HOXD11-201ENST00000249504 1533 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.08■□□□□ 0.32
SPOCK3Q9BQ16 HEMK1-206ENST00000455834 1499 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
SPOCK3Q9BQ16 OGFOD2-222ENST00000545317 1481 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
SPOCK3Q9BQ16 RAVER2-201ENST00000294428 4398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
SPOCK3Q9BQ16 FO681492.1-203ENST00000622861 1362 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
SPOCK3Q9BQ16 SWI5-201ENST00000320188 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
SPOCK3Q9BQ16 SGO1-208ENST00000437051 1187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
SPOCK3Q9BQ16 FDX2-206ENST00000492239 773 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
SPOCK3Q9BQ16 LCN10-205ENST00000497771 723 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
SPOCK3Q9BQ16 AC091153.3-201ENST00000497885 472 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
SPOCK3Q9BQ16 LINC01385-201ENST00000512310 780 ntTSL 4 BASIC17.08■□□□□ 0.32
SPOCK3Q9BQ16 ALKAL1-202ENST00000523939 536 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
SPOCK3Q9BQ16 AL512604.3-201ENST00000569583 964 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
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