Protein–RNA interactions for Protein: Q99856

ARID3A, AT-rich interactive domain-containing protein 3A, humanhuman

Predictions only

Length 593 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARID3AQ99856 KANSL1-202ENST00000432791 5343 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.15
ARID3AQ99856 CYB5R2-212ENST00000533558 1658 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
ARID3AQ99856 HOXA11-AS-204ENST00000522674 1549 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
ARID3AQ99856 MTHFD1L-211ENST00000611279 3475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
ARID3AQ99856 SORBS3-221ENST00000523965 2028 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
ARID3AQ99856 LRP3-201ENST00000253193 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
ARID3AQ99856 DUSP28-201ENST00000343217 1555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
ARID3AQ99856 BAG4-202ENST00000432471 1943 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
ARID3AQ99856 ALG1-202ENST00000544428 1419 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
ARID3AQ99856 MXD3-202ENST00000427908 2269 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
ARID3AQ99856 SSTR3-202ENST00000617123 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
ARID3AQ99856 CCDC74B-205ENST00000409943 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
ARID3AQ99856 AC245052.3-201ENST00000450182 901 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
ARID3AQ99856 NMRAL1-212ENST00000574425 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
ARID3AQ99856 ZNF419-201ENST00000221735 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
ARID3AQ99856 LINC00315-201ENST00000441947 2323 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
ARID3AQ99856 TSC22D3-205ENST00000372390 1812 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
ARID3AQ99856 GPT-205ENST00000528431 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
ARID3AQ99856 COL18A1-202ENST00000355480 5924 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
ARID3AQ99856 GCH1-207ENST00000622544 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
ARID3AQ99856 LINC00304-201ENST00000321214 2243 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
ARID3AQ99856 CIDEB-202ENST00000336557 2409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
ARID3AQ99856 CABIN1-202ENST00000337989 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
ARID3AQ99856 GNAI1-201ENST00000351004 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
ARID3AQ99856 C7orf49-213ENST00000617987 1727 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
ARID3AQ99856 CHTOP-201ENST00000368686 2250 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
ARID3AQ99856 GUCY1A2-201ENST00000282249 3047 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
ARID3AQ99856 ORAI2-204ENST00000473939 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
ARID3AQ99856 MAFF-206ENST00000538320 2458 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.25■■□□□ 1.15
ARID3AQ99856 RGMA-210ENST00000557301 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
ARID3AQ99856 AC007192.1-201ENST00000593731 5142 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
ARID3AQ99856 RAB28-203ENST00000338176 1787 ntTSL 3 BASIC22.25■■□□□ 1.15
ARID3AQ99856 PGM5-202ENST00000396396 3338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
ARID3AQ99856 GPAA1-202ENST00000361036 1840 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
ARID3AQ99856 WASH6P-203ENST00000460206 1826 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
ARID3AQ99856 CXADR-201ENST00000284878 6254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
ARID3AQ99856 ABCC6P2-202ENST00000542005 706 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
ARID3AQ99856 ABCC6-204ENST00000575728 714 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
ARID3AQ99856 NOMO1-208ENST00000620755 3921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
ARID3AQ99856 RSAD1-201ENST00000258955 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
ARID3AQ99856 POM121C-208ENST00000615331 5835 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
ARID3AQ99856 DTX2-212ENST00000446820 1770 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
ARID3AQ99856 LINC00605-201ENST00000514902 1558 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
ARID3AQ99856 SPNS1-201ENST00000311008 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
ARID3AQ99856 ME3-202ENST00000393324 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
ARID3AQ99856 FOXO3-202ENST00000406360 7341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
ARID3AQ99856 TMEM206-201ENST00000261455 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
ARID3AQ99856 SNAI3-AS1-202ENST00000563475 2081 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
ARID3AQ99856 C19orf67-203ENST00000548523 1427 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
ARID3AQ99856 ZBTB42-202ENST00000555360 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
ARID3AQ99856 NR2F1-201ENST00000327111 3732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
ARID3AQ99856 TULP1-201ENST00000229771 2162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
ARID3AQ99856 C19orf24-201ENST00000409293 983 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
ARID3AQ99856 MVB12A-212ENST00000543795 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
ARID3AQ99856 TMEM230-210ENST00000612323 1231 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
ARID3AQ99856 FOXP1-214ENST00000493089 2703 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
ARID3AQ99856 THAP7-AS1-203ENST00000452284 2298 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
ARID3AQ99856 WNK2-201ENST00000297954 7138 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
ARID3AQ99856 CERS4-209ENST00000559450 1637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
ARID3AQ99856 PKMYT1-213ENST00000574385 1892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
ARID3AQ99856 FBXL22-202ENST00000534939 2443 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
ARID3AQ99856 EEPD1-201ENST00000242108 4765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
ARID3AQ99856 ZNF746-202ENST00000458143 3797 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
ARID3AQ99856 AP3S1-201ENST00000316788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
ARID3AQ99856 FBXO33-201ENST00000298097 3853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
ARID3AQ99856 DTX3-201ENST00000337737 2029 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
ARID3AQ99856 FDXR-219ENST00000583917 1762 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
ARID3AQ99856 NOXO1-202ENST00000356120 1539 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
ARID3AQ99856 LAD1-202ENST00000391967 2906 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
ARID3AQ99856 IVD-206ENST00000487418 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
ARID3AQ99856 UBE2I-203ENST00000397514 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
ARID3AQ99856 LINC02199-202ENST00000510067 1008 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
ARID3AQ99856 ZNF561-AS1-205ENST00000588765 579 ntTSL 4 BASIC22.23■■□□□ 1.15
ARID3AQ99856 AC010536.3-201ENST00000620306 533 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
ARID3AQ99856 INAVA-202ENST00000413687 2197 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
ARID3AQ99856 SAMD11-211ENST00000616125 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
ARID3AQ99856 CDH24-201ENST00000267383 2873 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
ARID3AQ99856 GAS8-202ENST00000536122 1687 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
ARID3AQ99856 MAP6-201ENST00000304771 3334 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
ARID3AQ99856 PKIB-206ENST00000392490 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
ARID3AQ99856 MCCC1-201ENST00000265594 2545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
ARID3AQ99856 OGG1-203ENST00000302036 2220 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
ARID3AQ99856 MEN1-209ENST00000394376 3034 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
ARID3AQ99856 DHRS4-202ENST00000397074 785 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
ARID3AQ99856 KRT18P11-201ENST00000435214 1283 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
ARID3AQ99856 NAT16-202ENST00000443096 1286 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
ARID3AQ99856 SUZ12P1-202ENST00000578070 929 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
ARID3AQ99856 KLK9-202ENST00000594211 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
ARID3AQ99856 NUF2-208ENST00000524800 1845 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
ARID3AQ99856 SPOCK2-209ENST00000536168 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
ARID3AQ99856 TOLLIP-201ENST00000263646 2283 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
ARID3AQ99856 BMP8B-201ENST00000372827 4822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
ARID3AQ99856 PCSK7-201ENST00000320934 4649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
ARID3AQ99856 UBE2F-201ENST00000272930 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
ARID3AQ99856 PACSIN3-211ENST00000539589 2009 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
ARID3AQ99856 EIF3C-211ENST00000566866 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
ARID3AQ99856 FASTK-217ENST00000540185 1609 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
ARID3AQ99856 AMFR-201ENST00000290649 3600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
ARID3AQ99856 FARP1-242ENST00000627049 5103 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
ARID3AQ99856 MLNR-201ENST00000218721 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.6 ms