Protein–RNA interactions for Protein: Q99707

MTR, Methionine synthase, humanhuman

Predictions only

Length 1,265 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MTRQ99707 BACE2-201ENST00000328735 2824 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
MTRQ99707 FGF2-202ENST00000608478 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
MTRQ99707 AC107959.1-202ENST00000502083 1945 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
MTRQ99707 STIM2-211ENST00000639195 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
MTRQ99707 TM7SF2-202ENST00000345348 1490 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
MTRQ99707 ZDHHC14-203ENST00000359775 7380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
MTRQ99707 ACBD4-204ENST00000431281 2026 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
MTRQ99707 HS3ST4-201ENST00000331351 3203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
MTRQ99707 AC007952.6-201ENST00000573168 2673 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
MTRQ99707 AC003957.1-201ENST00000625108 2673 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
MTRQ99707 HLA-G-202ENST00000376815 851 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
MTRQ99707 HLA-G-203ENST00000376818 1127 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
MTRQ99707 PRMT2-206ENST00000397638 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
MTRQ99707 AC098590.1-201ENST00000468126 897 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
MTRQ99707 ZNF529-AS1-202ENST00000475219 1033 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
MTRQ99707 MIR381HG-201ENST00000553692 425 ntTSL 3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
MTRQ99707 FDFT1-209ENST00000525900 1596 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
MTRQ99707 TINAGL1-201ENST00000271064 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
MTRQ99707 LRRC29-209ENST00000629962 1303 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
MTRQ99707 LGR4-202ENST00000389858 5163 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
MTRQ99707 PWWP2AP1-201ENST00000429776 2273 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
MTRQ99707 CD247-202ENST00000392122 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
MTRQ99707 NRM-203ENST00000376421 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
MTRQ99707 MRGPRE-201ENST00000389832 1409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
MTRQ99707 CYP2A7-201ENST00000291764 2128 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
MTRQ99707 AC010173.1-201ENST00000549023 1453 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
MTRQ99707 FAM110A-204ENST00000381941 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
MTRQ99707 ADAP1-216ENST00000539900 2178 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
MTRQ99707 DEDD2-204ENST00000595337 1894 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
MTRQ99707 ACOT2-204ENST00000613168 1553 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
MTRQ99707 STK25-204ENST00000405585 1643 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
MTRQ99707 MAZ-215ENST00000569978 567 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
MTRQ99707 AC233263.1-201ENST00000578059 224 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
MTRQ99707 MZF1-203ENST00000594234 2385 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
MTRQ99707 POLI-202ENST00000406285 2030 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
MTRQ99707 WEE1-202ENST00000450114 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
MTRQ99707 ANKRD2-201ENST00000298808 1350 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
MTRQ99707 TNFSF11-203ENST00000398795 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
MTRQ99707 OGG1-204ENST00000339511 1815 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
MTRQ99707 KRT16P6-202ENST00000425692 1426 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
MTRQ99707 GOLGA4-208ENST00000444882 1451 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
MTRQ99707 CYP21A2-222ENST00000435122 1914 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
MTRQ99707 HSPA8-202ENST00000453788 2004 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
MTRQ99707 TSPAN3-210ENST00000561277 1592 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
MTRQ99707 RNH1-203ENST00000397604 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
MTRQ99707 NDUFA8-201ENST00000373768 844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
MTRQ99707 NRXN2-203ENST00000377551 6373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
MTRQ99707 YWHAZ-209ENST00000419477 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
MTRQ99707 DNAJC27-AS1-204ENST00000428614 780 ntTSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
MTRQ99707 AL929601.1-201ENST00000551565 573 ntTSL 4 BASIC22.21■■□□□ 1.15
MTRQ99707 AC009065.4-203ENST00000562838 535 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
MTRQ99707 CD24-208ENST00000622315 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
MTRQ99707 ARRB2-216ENST00000574954 1348 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
MTRQ99707 RAB5C-202ENST00000393860 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
MTRQ99707 CAMKK2-206ENST00000402834 2051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
MTRQ99707 AKAP8L-201ENST00000397410 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
MTRQ99707 ST3GAL3-219ENST00000372374 2170 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
MTRQ99707 GOLGA2P11-201ENST00000562660 1621 ntBASIC22.2■■□□□ 1.15
MTRQ99707 ACOT2-205ENST00000622407 1604 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
MTRQ99707 TMEM8A-201ENST00000250930 2346 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.15
MTRQ99707 FAM57B-204ENST00000564806 1710 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
MTRQ99707 ZNF302-215ENST00000627982 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
MTRQ99707 ZBED3-201ENST00000255198 6172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
MTRQ99707 GTF3C5-203ENST00000372099 1999 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
MTRQ99707 SOCS2-201ENST00000340600 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
MTRQ99707 SLC6A11-202ENST00000454147 2794 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
MTRQ99707 COPS9-201ENST00000307266 759 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
MTRQ99707 HDAC1-201ENST00000373548 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
MTRQ99707 HOTAIRM1-203ENST00000429611 722 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
MTRQ99707 FAM163B-202ENST00000496132 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
MTRQ99707 COX6C-208ENST00000522940 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
MTRQ99707 AC009052.1-201ENST00000567090 298 ntTSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
MTRQ99707 CIRBP-213ENST00000587323 1092 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
MTRQ99707 EEF1D-225ENST00000529272 1311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
MTRQ99707 TNFRSF1A-201ENST00000162749 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
MTRQ99707 GPR35-201ENST00000319838 2249 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
MTRQ99707 PPP4R2-201ENST00000356692 4984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
MTRQ99707 AMDHD1-201ENST00000266736 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
MTRQ99707 MED25-201ENST00000312865 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
MTRQ99707 NETO1-207ENST00000583169 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
MTRQ99707 MYO1C-203ENST00000438665 4898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
MTRQ99707 EPS8L2-230ENST00000610855 1633 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
MTRQ99707 ISLR2-204ENST00000453268 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
MTRQ99707 LRRC42-203ENST00000371370 2037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
MTRQ99707 CDC42EP1-201ENST00000249014 2181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
MTRQ99707 AC116562.4-201ENST00000641316 2276 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
MTRQ99707 MFSD1-219ENST00000622669 2361 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
MTRQ99707 FLYWCH2-202ENST00000396958 1036 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
MTRQ99707 CCDC74B-203ENST00000409128 789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
MTRQ99707 LINC00708-201ENST00000428165 916 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
MTRQ99707 EGFEM1P-209ENST00000502332 728 ntTSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
MTRQ99707 DEDD2-205ENST00000596251 1183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
MTRQ99707 GORASP1-220ENST00000479927 1345 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
MTRQ99707 DHRS4-204ENST00000543741 1340 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
MTRQ99707 CDC42BPB-201ENST00000361246 6758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
MTRQ99707 RNASET2-214ENST00000620173 1391 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
MTRQ99707 ANKRD2-202ENST00000307518 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
MTRQ99707 SNCA-203ENST00000394986 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
MTRQ99707 LTBP3-201ENST00000301873 4443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
MTRQ99707 NTSR2-201ENST00000306928 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.3 ms