Protein–RNA interactions for Protein: Q99613

EIF3C, Eukaryotic translation initiation factor 3 subunit C, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 913 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EIF3CQ99613 AL031963.3-201ENST00000606441 850 ntBASIC21.28■■□□□ 1
EIF3CQ99613 PARP1-210ENST00000629232 477 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
EIF3CQ99613 ENTPD8-204ENST00000472938 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
EIF3CQ99613 EARS2-206ENST00000563232 1709 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
EIF3CQ99613 FAM20B-201ENST00000263733 5984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
EIF3CQ99613 PRKCSH-209ENST00000589838 1898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
EIF3CQ99613 TTC19-201ENST00000261647 3002 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
EIF3CQ99613 ANKRD13D-216ENST00000514166 2138 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
EIF3CQ99613 CD55-203ENST00000367063 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
EIF3CQ99613 AHRR-204ENST00000506456 2350 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
EIF3CQ99613 MEN1-206ENST00000377321 2614 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
EIF3CQ99613 TGIF1-207ENST00000407501 1585 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.27■■□□□ 1
EIF3CQ99613 IRF7-203ENST00000397566 2051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
EIF3CQ99613 ZDHHC3-205ENST00000424952 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
EIF3CQ99613 ARHGAP8-204ENST00000389774 1725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
EIF3CQ99613 ITPKB-203ENST00000429204 6162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
EIF3CQ99613 CITED1-201ENST00000246139 1231 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
EIF3CQ99613 ZBTB7B-201ENST00000292176 2129 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
EIF3CQ99613 PRSS3-202ENST00000361005 966 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
EIF3CQ99613 BMP1-204ENST00000397814 836 ntTSL 4 BASIC21.27■■□□□ 1
EIF3CQ99613 CNN2P6-201ENST00000439038 900 ntBASIC21.27■■□□□ 1
EIF3CQ99613 BX890604.1-207ENST00000486571 904 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
EIF3CQ99613 AP001363.2-201ENST00000538101 391 ntTSL 3 BASIC21.27■■□□□ 1
EIF3CQ99613 AC016405.3-201ENST00000607710 860 ntBASIC21.27■■□□□ 1
EIF3CQ99613 WRNIP1-202ENST00000380769 3239 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
EIF3CQ99613 CDCA4-202ENST00000392590 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
EIF3CQ99613 RBM26-207ENST00000622611 5230 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
EIF3CQ99613 FAM212B-203ENST00000444059 1423 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
EIF3CQ99613 NECAB3-202ENST00000375238 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
EIF3CQ99613 MEN1-208ENST00000394374 3155 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
EIF3CQ99613 RMND5A-201ENST00000283632 6301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
EIF3CQ99613 FGFR1-238ENST00000532791 5590 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
EIF3CQ99613 GLS-201ENST00000320717 4834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
EIF3CQ99613 PCDHA4-201ENST00000378125 2328 ntTSL 5 BASIC21.27■□□□□ 0.99
EIF3CQ99613 LINC00315-201ENST00000441947 2323 ntTSL 5 BASIC21.27■□□□□ 0.99
EIF3CQ99613 DBNL-217ENST00000468694 2068 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.27■□□□□ 0.99
EIF3CQ99613 CLN3-240ENST00000631023 1586 ntTSL 5 BASIC21.27■□□□□ 0.99
EIF3CQ99613 KCNQ5-207ENST00000403813 6539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.27■□□□□ 0.99
EIF3CQ99613 BRAF-201ENST00000288602 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
EIF3CQ99613 LEF1-203ENST00000438313 1488 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
EIF3CQ99613 CARD9-201ENST00000371732 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
EIF3CQ99613 MFSD10-201ENST00000329687 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
EIF3CQ99613 ZNF598-204ENST00000563630 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
EIF3CQ99613 NAPSA-201ENST00000253719 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
EIF3CQ99613 BLACE-201ENST00000378120 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
EIF3CQ99613 FUZ-201ENST00000313777 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
EIF3CQ99613 MTHFS-201ENST00000258874 907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
EIF3CQ99613 VSX1-201ENST00000376707 943 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
EIF3CQ99613 VSX1-206ENST00000444511 1197 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
EIF3CQ99613 PET100-202ENST00000594797 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
EIF3CQ99613 AL137784.2-201ENST00000607332 1000 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
EIF3CQ99613 AC092437.1-201ENST00000624794 1048 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
EIF3CQ99613 MEN1-209ENST00000394376 3034 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
EIF3CQ99613 CDCA7L-203ENST00000406877 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
EIF3CQ99613 GIT1-201ENST00000225394 3768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
EIF3CQ99613 CLN3-205ENST00000359984 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
EIF3CQ99613 ADORA2A-215ENST00000618076 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
EIF3CQ99613 CLDN14-202ENST00000399135 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
EIF3CQ99613 ETV7-206ENST00000615781 1776 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
EIF3CQ99613 SAMD14-203ENST00000503131 1938 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
EIF3CQ99613 AC093503.3-201ENST00000624917 2352 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
EIF3CQ99613 SIRT3-202ENST00000524564 1395 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
EIF3CQ99613 SAC3D1-205ENST00000531072 1362 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
EIF3CQ99613 CDC123-201ENST00000281141 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
EIF3CQ99613 ST3GAL4-205ENST00000449406 1669 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
EIF3CQ99613 SLC5A10-205ENST00000417251 1984 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
EIF3CQ99613 RBP4-201ENST00000371464 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
EIF3CQ99613 PLAC9-202ENST00000372267 472 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.25■□□□□ 0.99
EIF3CQ99613 KANSL1-AS1-201ENST00000398275 517 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
EIF3CQ99613 KRT8P20-201ENST00000423953 1409 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
EIF3CQ99613 CASP16P-201ENST00000428155 1433 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
EIF3CQ99613 AC005789.1-201ENST00000585411 297 ntTSL 3 BASIC21.25■□□□□ 0.99
EIF3CQ99613 PARD6A-203ENST00000602551 1171 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
EIF3CQ99613 MB21D1-202ENST00000370318 1917 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
EIF3CQ99613 RAB28-203ENST00000338176 1787 ntTSL 3 BASIC21.25■□□□□ 0.99
EIF3CQ99613 ROCK2-202ENST00000315872 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
EIF3CQ99613 GPR139-202ENST00000570682 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
EIF3CQ99613 BST1-202ENST00000382346 1993 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
EIF3CQ99613 OBSL1-204ENST00000404537 5841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
EIF3CQ99613 EEF1A2-201ENST00000217182 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
EIF3CQ99613 CRB2-202ENST00000373631 5550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
EIF3CQ99613 CIDEB-202ENST00000336557 2409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
EIF3CQ99613 FAM160A2-201ENST00000265978 3481 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
EIF3CQ99613 RPLP0-201ENST00000228306 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
EIF3CQ99613 NDUFS3-207ENST00000529276 558 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
EIF3CQ99613 SNRPA-201ENST00000243563 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
EIF3CQ99613 LDHD-202ENST00000450168 1966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
EIF3CQ99613 LYSMD4-202ENST00000344791 2885 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
EIF3CQ99613 PPFIA1-202ENST00000389547 4133 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
EIF3CQ99613 CHMP6-201ENST00000325167 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
EIF3CQ99613 LMAN1L-202ENST00000379709 1699 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
EIF3CQ99613 FAM213B-205ENST00000444521 2827 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
EIF3CQ99613 SPHK2-213ENST00000601712 1394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
EIF3CQ99613 AKNA-205ENST00000374079 2138 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
EIF3CQ99613 ZNF346-209ENST00000512315 1575 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
EIF3CQ99613 LHX8-202ENST00000356261 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
EIF3CQ99613 ARHGAP22-210ENST00000477708 1951 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
EIF3CQ99613 C5orf17-202ENST00000512559 1984 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
EIF3CQ99613 SLC34A3-202ENST00000538474 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
EIF3CQ99613 RBFOX1-215ENST00000553186 2196 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27 ms